Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472100
• Subject: NM_001297589.1
• Aligned Length: 1873
• Identities: 1399
• Gaps: 281

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------------ATGACCAC  8
                                                                              ||||||||
Sbjct    1  ATGATTTCACCTTCACTTGAACTGCTTCATTCAGGACTCTGCAAATTCCCTGAAGTAGAAGGAAAAATGACCAC  74

Query    9  ATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTG  82
            ||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATTCAAAGAGGCAGTGACATTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTG  148

Query   83  CCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATCAACCGTTC  156
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||
Sbjct  149  CCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTAGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTAGGGAATCAACCATTC  222

Query  157  CACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAA-GAAAAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGAGAAGGGA  229
            |||||||||||||.|||||| ||.|||||| |||||||||||||.||||..||||.|||.||||||||||||||
Sbjct  223  CACCAAGATACTTTCCACTT-CTTAGGGAAGGAAAAGTTTTGGAAGATGAAGACAACAAGCCAAAGAGAAGGGA  295

Query  230  ATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTCCTGCCAG  303
            |||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||
Sbjct  296  ATTCAGGAGGCAAGATCCAAATTGAGATGGAGACTGTTCCAGAAGCAGGACCACATGAAGAGTGGTCCTGTCAG  369

Query  304  CAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCAGGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGTTCTTTGA  377
            |||||.||||||||||||||||..|||.|||||||||||||..||||.||.|..||.|.||||||||||||..|
Sbjct  370  CAAATATGGGAACAAATTGCAAGTGACCTAACCAGGTCTCAAAACTCCATAAGGAACAGCTCTCAGTTCTTCAA  443

Query  378  AAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACCCACAATTCA--TACAGGACAGAAACCTTCCCAGGG  449
            |.|.|||||||||||||.||||.||||.|||.|||||.|.|.||.|||  |.||  |||||||||||.||   |
Sbjct  444  AGAAGGTGATGTCCCCTGCCAGATTGAGGCAAGACTATCTATAAGTCACGTGCA--ACAGAAACCTTACC---G  512

Query  450  TGG----GAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGAG  519
            |.|    ||| ||||||||||||||||||||||||.|..||||||||||||.|||.||.|.|.||||||.||||
Sbjct  513  TTGTAATGAA-TGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTTCTGTCTTTGATCTTCATCAACAATCACACTCAGGAGAG  585

Query  520  AAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTTACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCCA  593
            ||.|||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.|.||||.||||||.||||||||||||||||
Sbjct  586  AAATCTCATACATGTGGTGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACAGCCCAGCCCTTCATATTCATCAGAGAGTCCA  659

Query  594  CGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAGGAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCATC  667
            ..|||||||.|||..||.||.|||||||||||||||.||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  660  TATGGGAGAAAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTTAATCAGAGCTCACATCTGCAAACTCATC  733

Query  668  AGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACTT  741
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||..|.||||||||||||||
Sbjct  734  AGAGAGTCCATACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGGGCAATGTGGGAAAGGCTTCCATAGTAGATCAGCACTT  807

Query  742  AATGTTCATCATAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACATTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATGA  815
            |||||||||...|||||.||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||.||||||||||||||
Sbjct  808  AATGTTCATTGCAAATTGCACACAGGAGAGAAACCTTATAATTGTGAGGAATGTGGGAAAGCCTTCATTCATGA  881

Query  816  TTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACCT  889
            |||.||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  882  TTCACAGCTTCAAGAACATCAGAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGAGCT  955

Query  890  TCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACATGT  963
            ||..|.||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  956  TCCGTGTTAGATCAAGACTTAATAGGCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTCAGATGTGATACATGT  1029

Query  964  GATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGATG  1037
            |..||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||.||||||.||.||||.|||
Sbjct 1030  GGCAAGAACTTTCGTCAGAGATCAGCACTTAATAGTCATTCCATGGTCCACATAGAAGAGAAGCCATACAAATG  1103

Query 1038  TGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTTTATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAGAAAC  1111
            ||||||.||||||||||||||.|||.||||||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1104  TGAGCAATGTGGAAAAGGCTTCATTTGTAGGCGAGATTTTTGTAAGCATCAGATGGTCCACACAGGAGAGAAAC  1177

Query 1112  CATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAGT  1185
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1178  CATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGACCTTCAGATGGTCCTCATGTCTTTTGAACCATCAGCAAGTCCACAGT  1251

Query 1186  GGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACTGTCTTCCCATCAGAG  1259
            |||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||||||||||||
Sbjct 1252  GGACAAAAATCCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACGACGATCTTCCCATCAGAG  1325

Query 1260  ATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAATCTTGACT  1333
            ||||||||.|||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||.||||...|..|.|||..|||||||.|
Sbjct 1326  ATCCCACAATGGAGAAAAGCCATATAACTGTGAGGAGTGTGGTAAGGACTATAAAAGGAGGTTGGATCTTGAGT  1399

Query 1334  TGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGGCCTCA  1407
            |.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||.||||.||.|||||||.
Sbjct 1400  TTCACCAGAGGGTCCACACGGGTGAGAGACCCTATAATTGTAAGGAATGTGGCAAGAGCTTTGGCTGGGCCTCC  1473

Query 1408  AGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGAAAAAACCATTCAAATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTT--  1479
            .||.|||||||.|||.|||||||||||.|...|.|||||||.|||||||||||.||.|||||||||||..||  
Sbjct 1474  TGTCTTTTGAAACATCAGAGACTCCACAGTGGGGAAAAACCTTTCAAATGTGAAGAGTGTGGAAAGAGATTTAC  1547

Query 1480  -----GTACACAGGA---CATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGTGGGGAAAACCCATCCAAATGTGAG  1545
                 ||.||||  |   |||.|        |||.|.||.|..|.|||.|||.|||||.|.||.||||||||||
Sbjct 1548  TCAGAGTTCACA--ACTTCATTC--------CCATCAGACATGCCATACTGGAGAAAAGCTATACAAATGTGAG  1611

Query 1546  GATTGTGGGAGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGA----------------------------------TA  1585
            .|.||||.||...|.|||||.||....||.|||||.||                                  ||
Sbjct 1612  CAGTGTGAGAAGGGGTACAACAGTAAATTTAATCTTGACATGCACCAGAGGGTCCACGGGGGAGAGCGACCCTA  1685

Query 1586  TACTTTTA-----------------------------TCAT-TATTTCTAAATGACACA---------------  1614
            ||.||.||                             |||| |.|||     |||.|||               
Sbjct 1686  TAATTGTAAGGAATGTGGAAAGAGCTTTGGCTGGGCTTCATGTCTTT-----TGAAACATCAGAGACTCCACAG  1754

Query 1615  --------------------------------------------------------------------------  1614
                                                                                      
Sbjct 1755  TGGAGAAAAGCCATTGAAATCTGGAGTGTGGGAAGAGATCTACTCAGAATTCACAGCTTCATTTACATCAGTAA  1828

Query 1615  -----------------------  1614
                                   
Sbjct 1829  GTCTATGTGGGAGAAAAGCCATA  1851