Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472100
• Subject: NM_013360.2
• Aligned Length: 1614
• Identities: 1179
• Gaps: 261

Alignment

Query    1  ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT  74
            |||.|.|...||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAAAGCTCTACGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGATCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT  74

Query   75  GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct   75  GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTTGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTG-------  141

Query  149  AACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGA  222
                                                                                      
Sbjct  142  --------------------------------------------------------------------------  141

Query  223  GAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTC  296
                        |||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||.|..||
Sbjct  142  ------------GGAGGCAAGATCCAAACTGAGATGGAGACTGTTCCAGAAGCAGGAACACATGAAGAATTTTC  203

Query  297  CTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCAGGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGT  370
            ||||.|||||||.||||||||||||||||..|||||||||||||||||.||..|.|.|||||.|||||||||||
Sbjct  204  CTGCAAGCAAATTTGGGAACAAATTGCAAGTGACTTAACCAGGTCTCAAGATACCACCATAAGTAACTCTCAGT  277

Query  371  TCTTTGAAAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACCCACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCC  444
            |.||||||.|.|.|||...||||||||||.||.|||||.|||||.|.|||.||||.|||.||.|.|||||||.|
Sbjct  278  TATTTGAACAAGATGACAACCCCTCCCAGATTAAAGCAAGACTATCTACAGTTCACACAAGAGAAAAACCTTTC  351

Query  445  CAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGA  518
            |||||||..||.||||||||||.|||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct  352  CAGGGTGAAAATTGTAAACAGTTCTTCAGTGATGTTTCCTTCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATATTCAGGAGA  425

Query  519  GAAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTTACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCC  592
            |||||||.||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.||||||||||.||||
Sbjct  426  GAAGTCTCATACCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCCCTTCATATTCATCAGAGGGTCC  499

Query  593  ACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAGGAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCAT  666
            ||.||||||.||||..||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||
Sbjct  500  ACATGGGAGTGAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTTAGTCAGAGCTCACGTCTGCAAACTCAT  573

Query  667  CAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACT  740
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||..|||||||||||||
Sbjct  574  CAAAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACT  647

Query  741  TAATGTTCATCATAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACATTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATG  814
            |||.||||||...||||||||||...|||||||||||||.|.|||||||..||||||||||||.|||||.||..
Sbjct  648  TAAAGTTCATTGCAAATTACACATGAGAGAGAAACCTTATAATTGTGAGAAATGTGGGAAGGCTTTCATGCACA  721

Query  815  ATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACC  888
            |||.|||||||.||.|||||.|.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||.|
Sbjct  722  ATTTCCAGCTTCAGAAACATCACAGAATTCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGC  795

Query  889  TTCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACATG  962
            ||||.|.||||||||||                                                         
Sbjct  796  TTCTGTCTTAGGTCAAG---------------------------------------------------------  812

Query  963  TGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGAT  1036
                                       .||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct  813  ---------------------------TCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAAT  859

Query 1037  GTGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTTTATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAGAAA  1110
            .|||..|||.|||||.|||.||.||||.||||||||||||..|||||||||||.||.|.||.|..|||.|||||
Sbjct  860  CTGAAAAGTATGGAAGAGGTTTCATTGATAGGCTAGATTTGCATAAGCATCAGATGATTCATATGGGACAGAAA  933

Query 1111  CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||..||||||.||||||||||.
Sbjct  934  CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAAATGGTCCTCATATCTTTTGGTCCATCAACGAGTCCACAC  1007

Query 1185  TGGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACTGTCTTCCCATCAGA  1258
            ||||                                                                      
Sbjct 1008  TGGA----------------------------------------------------------------------  1011

Query 1259  GATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAATCTTGAC  1332
                          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||..|||.|||||....|||||||
Sbjct 1012  --------------GAAAAGCCATACAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTGAC  1071

Query 1333  TTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGGCCTC  1406
            ||.|||||.||...||||||||||||||||.|||||||.|||.|..|.||.|||||||.||||||.|..||.||
Sbjct 1072  TTCCACCATAGAACCCACACGGGAGAGAGATCTTATAACTGTGATAACTGCGGGAAGAGCTTTAGACATGCTTC  1145

Query 1407  AAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGAAAAAACCATTCAAATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTTG  1480
            .|||||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1146  TAGTATTTTGAATCATAAGAAACTCCACTGCCAAAGAAAGCCATTGAAATGTGAAGACTGTGGAAAGAGGCTTG  1219

Query 1481  TACACAGGACATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGTGGGGAAAACCCATCCAAATGTGAGGATTGTGGG  1554
            ||..|.||.|||||.||||||||||.|..||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1220  TATGCCGGTCATACTGTAAAGACCAACAAAGAGACCACAGTGGAGAAAACCCATCCAAATGTGAGGACTGTGGG  1293

Query 1555  AGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATACTTTTATCATTATTTCTAAATGACACA  1614
            |..||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|
Sbjct 1294  AAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACATA  1353