Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472100
• Subject: XM_005259208.3
• Aligned Length: 1614
• Identities: 1262
• Gaps: 168

Alignment

Query    1  ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT  74
            |||.|.|...||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAAAGCTCTACGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGATCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT  74

Query   75  GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTTGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC  148

Query  149  AACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGA  222
            ||||.|||||...||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||||||
Sbjct  149  AACCATTCCATGGAGATACTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGGTGATGGGGACAACAAGCCAAAGA  222

Query  223  GAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTC  296
            ||||||||||..|||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||.|..||
Sbjct  223  GAAGGGAATTTGGGAGGCAAGATCCAAACTGAGATGGAGACTGTTCCAGAAGCAGGAACACATGAAGAATTTTC  296

Query  297  CTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCAGGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGT  370
            ||||.|||||||.||||||||||||||||..|||||||||||||||||.||..|.|.|||||.|||||||||||
Sbjct  297  CTGCAAGCAAATTTGGGAACAAATTGCAAGTGACTTAACCAGGTCTCAAGATACCACCATAAGTAACTCTCAGT  370

Query  371  TCTTTGAAAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACCCACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCC  444
            |.||||||.|.|.|||...||||||||||.||.|||||.|||||.|.|||.||||.|||.||.|.|||||||.|
Sbjct  371  TATTTGAACAAGATGACAACCCCTCCCAGATTAAAGCAAGACTATCTACAGTTCACACAAGAGAAAAACCTTTC  444

Query  445  CAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGA  518
            |||||||..||.||||||||||.|||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct  445  CAGGGTGAAAATTGTAAACAGTTCTTCAGTGATGTTTCCTTCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATATTCAGGAGA  518

Query  519  GAAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTTACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCC  592
            |||||||.||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.||||||||||.||||
Sbjct  519  GAAGTCTCATACCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCCCTTCATATTCATCAGAGGGTCC  592

Query  593  ACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAGGAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCAT  666
            ||.||||||.||||..||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||
Sbjct  593  ACATGGGAGTGAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTTAGTCAGAGCTCACGTCTGCAAACTCAT  666

Query  667  CAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACT  740
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||..|||||||||||||
Sbjct  667  CAAAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACT  740

Query  741  TAATGTTCATCATAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACATTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATG  814
            |||.||||||...||||||||||...|||||||||||||.|.|||||||..||||||||||||.|||||.||..
Sbjct  741  TAAAGTTCATTGCAAATTACACATGAGAGAGAAACCTTATAATTGTGAGAAATGTGGGAAGGCTTTCATGCACA  814

Query  815  ATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACC  888
            |||.|||||||.||.|||||.|.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||.|
Sbjct  815  ATTTCCAGCTTCAGAAACATCACAGAATTCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGC  888

Query  889  TTCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACATG  962
            ||||.|.||||||||||                                                         
Sbjct  889  TTCTGTCTTAGGTCAAG---------------------------------------------------------  905

Query  963  TGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGAT  1036
                                       .||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct  906  ---------------------------TCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAAT  952

Query 1037  GTGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTTTATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAGAAA  1110
            .|||..|||.|||||.|||.||.||||.||||||||||||..|||||||||||.||.|.||.|..|||.|||||
Sbjct  953  CTGAAAAGTATGGAAGAGGTTTCATTGATAGGCTAGATTTGCATAAGCATCAGATGATTCATATGGGACAGAAA  1026

Query 1111  CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||..||||||.||||||||||.
Sbjct 1027  CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAAATGGTCCTCATATCTTTTGGTCCATCAACGAGTCCACAC  1100

Query 1185  TGGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACTGTCTTCCCATCAGA  1258
            ||||                                                                      
Sbjct 1101  TGGA----------------------------------------------------------------------  1104

Query 1259  GATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAATCTTGAC  1332
                          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||..|||.|||||....|||||||
Sbjct 1105  --------------GAAAAGCCATACAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTGAC  1164

Query 1333  TTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGGCCTC  1406
            ||.|||||.||...||||||||||||||||.|||||||.|||.|..|.||.|||||||.||||||.|..||.||
Sbjct 1165  TTCCACCATAGAACCCACACGGGAGAGAGATCTTATAACTGTGATAACTGCGGGAAGAGCTTTAGACATGCTTC  1238

Query 1407  AAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGAAAAAACCATTCAAATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTTG  1480
            .|||||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1239  TAGTATTTTGAATCATAAGAAACTCCACTGCCAAAGAAAGCCATTGAAATGTGAAGACTGTGGAAAGAGGCTTG  1312

Query 1481  TACACAGGACATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGTGGGGAAAACCCATCCAAATGTGAGGATTGTGGG  1554
            ||..|.||.|||||.||||||||||.|..||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1313  TATGCCGGTCATACTGTAAAGACCAACAAAGAGACCACAGTGGAGAAAACCCATCCAAATGTGAGGACTGTGGG  1386

Query 1555  AGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATACTTTTATCATTATTTCTAAATGACACA  1614
            |..||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|
Sbjct 1387  AAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACATA  1446