Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472100
• Subject: XM_011526907.3
• Aligned Length: 1789
• Identities: 1373
• Gaps: 185

Alignment

Query    1  ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT  74
            |||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCATGTTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACCGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT  74

Query   75  GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC  148
            ||||..|.||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  GGACGTTTCCCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTCATGCTGGAGAACTTCAGAAACCTGCTATCAGTGGGGCATC  148

Query  149  AACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGA  222
            |||..|.|||||.||||||||..|||||||.|||.|||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct  149  AACTTTCCCACCGAGATACTTTTCACTTCCAAAGAGAAGAAAAGTTTTGGATCATGGAGACAGCAACCCAAAGA  222

Query  223  GAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTC  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAACAGGACCACATGAAGAGTGGTC  296

Query  297  CTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCAGGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGT  370
            .||||||||||||||||||||||.|||||..||.|||||.||..||||.|||||   |||||.||.||||||||
Sbjct  297  TTGCCAGCAAATCTGGGAACAAACTGCAAGTGAGTTAACTAGACCTCAAGACTC---CATAAGTAGCTCTCAGT  367

Query  371  TCTTTGAAAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACCCACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCC  444
            |||....|.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.|.||||||.|.||||.|||.||||||.
Sbjct  368  TCTCCACACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGACGCAGGACTATCTATAATTCACATAGGAGAGACACCTTCT  441

Query  445  CAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGA  518
            .||..|||||||||||||.|.|.||||||||||||..|||||.|||||||||.|||.||.|||.||||||.|.|
Sbjct  442  GAGCATGGGAAGTGTAAAAAATTCTTCAGTGATGTCTCCATCCTTGATCTTCATCAACAATTACACTCAGGAAA  515

Query  519  GAAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTTACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCC  592
            ||..||..||||||||.||||||...|.||.||..|||||||.|.||||||||||..|.|||||||||.|||.|
Sbjct  516  GATATCCCATACATGTAATGAGTACAGGAAGAGATTCTGTTATAGCTCAGCTCTTTGTCTTCATCAGAAAGTTC  589

Query  593  ACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAGGAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCAT  666
            ||.||||||||||||.||.||.|||||||||||||.|.||||.|||||||||.|.||||||.||||||||||||
Sbjct  590  ACATGGGAGAGAAACGCTATAAGTGTGATGTGTGTAGTAAGGCATTTAGTCAGAACTCACAACTGCAAACTCAT  663

Query  667  CAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACT  740
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||.|.|
Sbjct  664  CAGAGAATCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAAGTTTCAGCCGTAGATCAGGAAT  737

Query  741  TAATGTTCATCATAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACATTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATG  814
            ..||||||||...|||||||||||||||||.||||||.|.||||||||||.|||||||||||||||||||||..
Sbjct  738  GTATGTTCATTGCAAATTACACACAGGAGAAAAACCTCATATTTGTGAGGAATGTGGGAAGGCCTTCATTCACA  811

Query  815  ATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACC  888
            |||||||||||..|||||||.|.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||.|
Sbjct  812  ATTCCCAGCTTCGGGAACATCAAAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTTATATATGTGGTAAGAGC  885

Query  889  TTCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCACA--CAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACA  960
            |||.||..|||.||||..|||||.||.|||||||||||.||||  ||  |||.|||.|||||||.||||||||.
Sbjct  886  TTCCATAGTAGATCAAATCTTAATAGGCATTCCATGGTCCACATGCA--AGAGAAATCATTTAGATGTGATACC  957

Query  961  TGTGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAG  1034
            |||..|||.||||||..|||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||..||||||||..||||.
Sbjct  958  TGTAGTAATAGCTTTGGTCAGAGATCAGCACTTAATAGTCATTGCATGGACCACACAAAAGAGAAACTATACAA  1031

Query 1035  ATGTGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTTTATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAGA  1108
            ||||||..|.|||||||...||||.|.|.||||||.||||.|||.||||||||||.|||.|||.||||||||.|
Sbjct 1032  ATGTGAAGAATGTGGAAGGAGCTTCACTTGTAGGCAAGATCTTTGTAAGCATCAGATGGACCATACAGGAGACA  1105

Query 1109  AACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCAC  1182
            ||||||||||||||||.|.||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||..|..||||||||.||||||
Sbjct 1106  AACCATATAATTGTAATGTATGTGGGAAGGGCTTCAGGTGGTCCTCATGTCTTTCAAGACATCAGCGGGTCCAC  1179

Query 1183  AGTGGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACTGTC--TTCCCAT  1254
            |.||||||||.||..|||||.||.||.|.||||||||||.|||||||||..||||||||  .|.|  |||.|||
Sbjct 1180  AATGGAGAAACAACATTCAAGTGCGACGGATGTGGGAAGAGATTTTATATGAATTCACA--GGGCCATTCACAT  1251

Query 1255  CAGAGATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAATCT  1328
            ||||||.||.|.||.|..|||.|.|..|||||||||.||.||||||||||||||||..|||.||||||||||||
Sbjct 1252  CAGAGAGCCTATAGAGAAGAAGAACTGTATAAATGTCAGAAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTTTAATCT  1325

Query 1329  TGACTTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGG  1402
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||.||..|||
Sbjct 1326  TGACTTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGAAAGAGCTTCAGGTGGG  1399

Query 1403  CCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCC--ACTGCCAGA-AAAAACCATT----------------------  1451
            |||||.|||||||||..|||||||||||||  ||||   || ||||||||||                      
Sbjct 1400  CCTCAGGTATTTTGAGACATAAGAGACTCCATACTG---GAGAAAAACCATTCAAATGTGAAGAGTGTGGGAAG  1470

Query 1452  --------------------------------------------------------------CAAATGTGAGGA  1463
                                                                          ||||||||||||
Sbjct 1471  AGGTTTACTGAGAATTCAAAACTTCGTTTCCATCAAAGAATTCACACTGGAGAAAAGCCTTACAAATGTGAGGA  1544

Query 1464  CTGTGGAAA-----------------------------------------------------------------  1472
            .||||||||                                                                 
Sbjct 1545  GTGTGGAAAGGGATTCAGATGGGCCTCAACTCATCTAACCCATCAAAGACTCCACAGCAGAGAAAAACTATTCC  1618

Query 1473  -----GAGGCTTGT--------------ACACAGGACATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGTGGGGAA  1527
                 ||||.||||              .|||||..|||.||.|.|||||||.|..||.|||.|.|||||.|||
Sbjct 1619  AATGTGAGGATTGTGGGAAGAGCAGTGAGCACAGTTCATGCCTTCAAGACCAACAAAGCGACCACAGTGGAGAA  1692

Query 1528  AACCCATCCAAATGTGAGGATTGTGGGAGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATACTTTTATCATTATT  1601
            ||..||||||||||||||||.|||||||..||||||.||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||
Sbjct 1693  AAAACATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACGAGAGGCGCTTGAATCTAGATATGATTTTATCATTATT  1766

Query 1602  TCTAAATGACACA  1614
            |.|||||||.|.|
Sbjct 1767  TTTAAATGATATA  1779