Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472100
• Subject: XM_011527285.2
• Aligned Length: 2118
• Identities: 1404
• Gaps: 504

Alignment

Query    1  ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT  74
            ||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct    1  ATGACCACGTTGAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGACGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAAGAGCTGAGGCTGCT  74

Query   75  GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC  148
            |||||.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACCTTGCCCAGAGGAAACTGTACCGAGAAGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC  148

Query  149  AACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGA  222
            ||.|..|||||..||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  149  AATCACTCCACAGAGATACTTTCCACTTCCTAAAGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCAAAGA  222

Query  223  GAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTC  296
            ||||||||||.|||||||||||||||||..|||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||..|.||.
Sbjct  223  GAAGGGAATTTAGGAGGCAAGATCCAAATGGAGATGGAGACTGTTTCAGAATCAGGAACACATGAAGGCTTGTT  296

Query  297  CTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCAGGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGT  370
            |.|.||.||||.|||||||||||||.|||..|||||||||||||.|||.|||||.||..||||.|.||.|||||
Sbjct  297  CAGTCATCAAACCTGGGAACAAATTTCAAGTGACTTAACCAGGTTTCAAGACTCCATGGTAAACAGCTTTCAGT  370

Query  371  TCTTTGAAAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACCCACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCC  444
            |||...||.|.|.||||.|.||||.|||||||||.|||||||||.|.|.||||||...|.|||||||||||||.
Sbjct  371  TCTCCAAACAAGATGATATGCCCTGCCAGGTTGATGCAGGACTATCTATAATTCACGTAAGACAGAAACCTTCT  444

Query  445  CAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGA  518
            .|||||.|||.|||||||.|||||||.||||||||..||.||.|||||||||.|||.||..||.|.|||..|||
Sbjct  445  GAGGGTAGGACGTGTAAAAAGTCCTTTAGTGATGTCTCCGTCCTTGATCTTCATCAACAACTACAGTCAAGAGA  518

Query  519  GAAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTTACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCC  592
            |||||||.|||||||||||||.||||||||.||..|||||||.|.|||||||||||.|.|||||||||||||.|
Sbjct  519  GAAGTCTCATACATGTGATGAATGTGGAAAGAGTTTCTGTTATAGCTCAGCTCTTCGTATTCATCAGAGAGTTC  592

Query  593  ACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAGGAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCAT  666
            ||.||||.||||||||||.||..||||||||||||||.||||||||.|.|||.||||||||||||||||.||||
Sbjct  593  ACATGGGGGAGAAACTCTATAATTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTCAATCAGAGCTCACATCTGCAAATTCAT  666

Query  667  CAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACT  740
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||.|||
Sbjct  667  CAGAGAATCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAGGCTTTAGTCGTAGATCAGGACT  740

Query  741  TAATGTTCATCATAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACATTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATG  814
            |.|||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.|.|||||||||..|||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTATGTTCATCGTAAATTACACACAGGAGTGAAACCTCATATTTGTGAGAAATGTGGGAAGGCCTTCATTCATG  814

Query  815  ATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACC  888
            |||||||||||.||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||.|
Sbjct  815  ATTCCCAGCTTCAGGAACATCAAAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGATATATGTTGTAAGAGC  888

Query  889  TTCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACATG  962
            |||..|..|||..|||..|||||.||.||||||||||||||||...||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  889  TTCCGTAGTAGAGCAAATCTTAATAGGCATTCCATGGTTCACATGCGAGAGAAACCATTCAGATGTGATACATG  962

Query  963  TGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGAT  1036
            ||.||||||||||..||.||.|||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  963  TGGTAAGAGCTTTGGTCTGAAATCAGCACTTAATAGTCATCGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACGGTACAAAT  1036

Query 1037  GTGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTTTATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAGAAA  1110
            |||||.|.|||||||||.||||.|||..|||||.||||.||||||||||||||.|.|.|||||||||.|||||.
Sbjct 1037  GTGAGGAATGTGGAAAACGCTTCATTTATAGGCAAGATCTTTATAAGCATCAGATAGACCACACAGGGGAGAAG  1110

Query 1111  CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAG  1184
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.|.||||..|..|||..||||||||||||
Sbjct 1111  CCATATAATTGTAAAGAATGTGGAAAGAGCTTCAGATGGGCCTCAGGTCTTTCAAGACATGTGCGAGTCCACAG  1184

Query 1185  TGGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACTGTCTTCCCATCAGA  1258
            ||||||.|.||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||.||.||||
Sbjct 1185  TGGAGAGACAACATTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACGTTATTCTCACCAGA  1258

Query 1259  GATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTA-----------TG---------  1312
            ||.|.||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||           ||         
Sbjct 1259  GAGCGCACAGTGGAGAAAAGCCATATAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACAAAAGGAGGTTGGATCTTGAC  1332

Query 1313  --------------------------------------------------------------------------  1312
                                                                                      
Sbjct 1333  TTTCATCAGAGGGTCCACAGAGGAGAGAAACCCTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTGGCTGGGCCTC  1406

Query 1313  -----------------------------------------------------------------------TTA  1315
                                                                                   |||
Sbjct 1407  GTGTCTTTTGAATCATCAGAGAATCCACAGTGGAGAAAAACCATTTAAATGTGAAGAATGTGGGAAAAGATTTA  1480

Query 1316  C-------------------------------------------------------------------------  1316
            |                                                                         
Sbjct 1481  CTCAGAATTCACAACTTTATACCCATCGTAGAGTCCACAGTGGAGAAAAACCATTCAAATGTGAAGAGTGTGGG  1554

Query 1317  --------------------------------------------------------------------------  1316
                                                                                      
Sbjct 1555  AAAAGATTTACTCAGAATTCACAACTTTATTCTCATCGCAGAGTCCACACTGGAGTAAAGCCATACAAATGTGA  1628

Query 1317  ------------------------TAAGTTTAATCTTGACTTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTT  1366
                                    ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1629  AGAGTGTGGGAAGGGCTTCAACAGTAAGTTTAATCTTGACATGCACCAGAGGGTCCACACCGGAGAGAGACCTT  1702

Query 1367  ATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCC--------  1432
            ||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct 1703  ATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCATGGTGAT  1776

Query 1433  ---------------------------------------ACTG-------------------CCA---------  1439
                                                   ||||                   |||         
Sbjct 1777  GAAAAGCCATTCAAATGTGAAGAGTGTGGGAAGAGATTTACTGAGAATTCACAGCTTCATTCCCATCAGAGGGT  1850

Query 1440  ---------GAAAAAACCATTCA---------------------------------------------------  1453
                     |.||||.||||.||                                                   
Sbjct 1851  TCACACTGGGGAAAAGCCATACAAATGTGAGAAGTGTGGAAAGAGCTTCAGATGGGCCTCAACTCATCTAACCC  1924

Query 1454  ---------------------------------AATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTTGTACACAGGACATAC  1494
                                             ||||||||||||||||.|||||..||||.|||||..|||.|
Sbjct 1925  ATCAGAGACTCCACAGTAGAGAAAAACTACTTCAATGTGAGGACTGTGGGAAGAGCATTGTGCACAGTTCATGC  1998

Query 1495  CGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGTGGGGAAAACCCATCCAAATGTGAGGATTGTGGGAGACGCTACAAGAG  1568
            |.|||||||||.|..||||||.|.|||||.||.||..||||.|||||||||||.|||||||..|||||||||||
Sbjct 1999  CTTAAAGACCAACAAAGAGACCAAAGTGGAGAGAAAACATCTAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAG  2072

Query 1569  GCGCTTGAATCTGGATATACTTTTATCATTATTTCTAAATGACACA  1614
            ||||||||||||.||||..|||||.|||||||||.|||||||||||
Sbjct 2073  GCGCTTGAATCTTGATACGCTTTTGTCATTATTTTTAAATGACACA  2118