Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472128
• Subject: NM_008076.3
• Aligned Length: 1470
• Identities: 1230
• Gaps: 75

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGTTAAGCCAGGGGGCATCTTGCCCATTAAAAGTCCCTGCACAGCTGCCTGTTGCATCATAGACATGTGCAG  74

Query    1  -ATGCCTTATTTTACAAGACTCATTTTGTTCTTGTTTTGCTTGATGGTTCTCGTGGAGAGCAGAAAACCCAAGA  73
             |||||||||||.|..||||||..||||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||||.||||.||
Sbjct   75  AATGCCTTATTTGATGAGACTCGCTTTGGTCTTGTTTTGCCTGATGGCTCTCGTGGAGAGCAGAAAGCCCAGGA  148

Query   74  GGAAGCGATGGACAGGGCAGGTGGAAATGCCCAAGCCAAGTCACTTATATAAGAAGAACCTTGATGTGACCAAG  147
            |||||.||||||||||||...||||||...||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGAAGAGATGGACAGGGCTTCTGGAAACATCCAAGCCAAGCCATTTGTATAAAAAGAACCTTGATGTGACCAAG  222

Query  148  ATCCGGAAGGGAAAGCCTCAGCAGCTTCTCAGAGTGGACGAGCACGACTTCAGCATGAGACCCGCCTTCGGAGG  221
            ||.|||...||||||||||.||..||.|||||.||.||.||.||||||||||.||||||.||.|||||.|||||
Sbjct  223  ATGCGGCCAGGAAAGCCTCGGCCTCTGCTCAGGGTAGAGGACCACGACTTCACCATGAGGCCAGCCTTTGGAGG  296

Query  222  CCCTGCCATCCCGGTGGGCGTGGACGTACAGGTGGAGAGCCTGGACAGCATCTCCGAGGTGGACATGGACTTCA  295
            |||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCCGCCATCCCTGTAGGTGTGGACGTGCAGGTGGAGAGTCTGGACAGCATCTCCGAGGTGGACATGGACTTCA  370

Query  296  CTATGACCCTGTACCTGCGGCATTACTGGAAGGATGAGAGGCTAGCTTTCTCCAGCGCCAGCAACAAGAGCATG  369
            |.||||||||.||||||.||||||||||||.|||.||||||||.||.|||.|||||..||||||||||||||||
Sbjct  371  CCATGACCCTATACCTGAGGCATTACTGGAGGGACGAGAGGCTGGCCTTCCCCAGCAGCAGCAACAAGAGCATG  444

Query  370  ACCTTCGATGGCCGGCTGGTGAAGAAGATCTGGGTCCCTGATGTCTTCTTTGTTCACTCCAAAAGATCGTTCAC  443
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||.|.||.||||.
Sbjct  445  ACCTTTGATGGCCGGCTGGTGAAGAAGATCTGGGTTCCTGATGTCTTCTTTGTGCACTCCAAACGCTCCTTCAT  518

Query  444  TCATGACACCACCACTGACAACATCATGCTGAGGGTGTTCCCAGATGGACACGTGCTGTACAGCATGAGGATTA  517
            .||.|||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  519  CCACGACACCACCACCGACAACATCATGCTGCGAGTGTTCCCCGATGGCCATGTGCTATACAGCATGAGGATTA  592

Query  518  CGGTCACTGCCATGTGCAACATGGACTTCAGCCACTTTCCCCTGGACTCCCAGACCTGTTCTTTGGAGCTGGAG  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  593  CGGTCACTGCCATGTGCAACATGGACTTCAGCCACTTTCCCCTGGATTCCCAGACCTGCTCTTTGGAGCTGGAG  666

Query  592  AGCTATGCCTATACAGATGAAGATCTAATGCTGTACTGGAAGAATGGGGATGAATCCCTAAAAACAGATGAGAA  665
            ||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||
Sbjct  667  AGCTATGCGTACACAGATGAAGATCTGATGCTGTACTGGAAGAACGGGGACGAGTCCCTGAAGACAGACGAGAA  740

Query  666  GATCTCCTTGTCTCAGTTTCTGATTCAGAAATTTCACACAACTTCCAGGCTGGCCTTCTACAGCAGCACTGGCT  739
            ||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GATCTCCTTGTCCCAGTTTCTGATCCAGAAGTTTCACACGACTTCCAGACTGGCCTTCTACAGCAGCACTGGCT  814

Query  740  GGTACAACCGTCTGTACATTAACTTCACGTTGCGTCGCCACATCTTCTTCTTCTTGCTCCAAACATATTTCCCT  813
            |||||||||||||||||||.||||||||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  815  GGTACAACCGTCTGTACATCAACTTCACTCTGCGTCGTCACATCTTCTTCTTCTTGCTCCAAACCTACTTCCCT  888

Query  814  GCCACTCTGATGGTCATGCTGTCCTGGGTGTCCTTCTGGATCGACCGCAGAGCTGTGCCTGCCAGAGTTTCACT  887
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct  889  GCCACCCTCATGGTCATGCTGTCCTGGGTGTCCTTCTGGATCGACCACAGAGCCGTGCCCGCCAGAGTCTCACT  962

Query  888  GGGTATCACGACGGTGCTGACCATGACCACCATCATCACGGGCGTGAATGCCTCCATGCCGCGCGTCTCCTACG  961
            |||.||||.||||||||||||||||.|.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||.
Sbjct  963  GGGCATCATGACGGTGCTGACCATGTCGACCATCATCACGGGTGTGAACGCCTCCATGCCCCGAGTGTCCTACA  1036

Query  962  TCAAGGCCGTGGACATCTACCTCTGGGTCAGCTTTGTGTTCGTGTTCCTCTCGGTGCTGGAGTATGCGGCTGTC  1035
            ||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 1037  TCCGGGCCGTGGACATCTACCTCTGGGTCAGCTTTGTGTTCGTCTTCCTCTCCGTGCTGGAGTACGCAGCTGTC  1110

Query 1036  AACTACCTGACCACCGTGCAGGAGCGCAAGGAACGGAAGCTGCGGGAGAAGTTCCCGTGCATGTGTGGAATGCT  1109
            ||||||||||||||..|||||||||..||||||||||||.|.|||||||||.|.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACTACCTGACCACACTGCAGGAGCAGAAGGAACGGAAGTTCCGGGAGAAGCTTCCATGCATGTGTGGAATGCT  1184

Query 1110  TCATTCAAAAACCATGATGCTGGATGGAAGCTACAGTGAGTCTGAGGCCAACAGCCTGGCTGGGTACCCCAGAA  1183
            ||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1185  TCATTCAAGGACCATGATGCTGGATGGAAGCTACAGTGAATCTGAGGCCAACAGCCTGGCTGGCTACCCAAGAA  1258

Query 1184  GCCATATCCTGACAGAAGAAGAAAGGCAAGACAAAATAGTGGTCCACCTGGGCCTGAGTGGTGAAGCCAACGCT  1257
            ||||.||.|||.|||||||||||||||.|||.||.||.|||||.||..|||.|||.|...|||||...|.|.|.
Sbjct 1259  GCCACATTCTGCCAGAAGAAGAAAGGCCAGATAACATCGTGGTTCATTTGGCCCTCAACAGTGAATTGACCTCC  1332

Query 1258  GCCAGAAAGAAGGGGCTTCTGAAGGGCCAGACGGGTTTTCGTATCTTCCAGAATACCCATGCCATTGACAAATA  1331
            .||||||||||.||.||||||||.|||||.|.||||.|....|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCCAGAAAGAAAGGCCTTCTGAAAGGCCAAATGGGTCTCTACATCTTCCAGAACACCCATGCCATTGACAAATA  1406

Query 1332  CTCTAGGTTGATATTCCCTGCCTCCTACATATTTTTCAACTTAATTTATTGGTCAGTGTTTTCC  1395
            |||.|||||||||||.|||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTCCAGGTTGATATTTCCTGCCTTCTACATAGTTTTCAACCTAATTTATTGGTCAGTGTTTTCC  1470