Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472128
• Subject: XM_006537616.2
• Aligned Length: 1403
• Identities: 1137
• Gaps: 118

Alignment

Query    1  ATGCCTTATTTTACAAGACTCATTTTGTTCTTGTTTTGCTTGATGGTTCTCGTGGAGAGCAGAAAACCCAAGAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAAGCGATGGACAGGGCAGGTGGAAATGCCCAAGCCAAGT--------CACTTATATAAGAAGAACCTTGATGT  140
                                                |.||        ||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------ATGTCTTTTGGCCATTTGTATAAAAAGAACCTTGATGT  38

Query  141  GACCAAGATCCGGAAGGGAAAGCCTCAGCAGCTTCTCAGAGTGGACGAGCACGACTTCAGCATGAGACCCGCCT  214
            |||||||||.|||...||||||||||.||..||.|||||.||.||.||.||||||||||.||||||.||.||||
Sbjct   39  GACCAAGATGCGGCCAGGAAAGCCTCGGCCTCTGCTCAGGGTAGAGGACCACGACTTCACCATGAGGCCAGCCT  112

Query  215  TCGGAGGCCCTGCCATCCCGGTGGGCGTGGACGTACAGGTGGAGAGCCTGGACAGCATCTCCGAGGTGGACATG  288
            |.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  113  TTGGAGGCCCCGCCATCCCTGTAGGTGTGGACGTGCAGGTGGAGAGTCTGGACAGCATCTCCGAGGTGGACATG  186

Query  289  GACTTCACTATGACCCTGTACCTGCGGCATTACTGGAAGGATGAGAGGCTAGCTTTCTCCAGCGCCAGCAACAA  362
            ||||||||.||||||||.||||||.||||||||||||.|||.||||||||.||.|||.|||||..|||||||||
Sbjct  187  GACTTCACCATGACCCTATACCTGAGGCATTACTGGAGGGACGAGAGGCTGGCCTTCCCCAGCAGCAGCAACAA  260

Query  363  GAGCATGACCTTCGATGGCCGGCTGGTGAAGAAGATCTGGGTCCCTGATGTCTTCTTTGTTCACTCCAAAAGAT  436
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||.|.|
Sbjct  261  GAGCATGACCTTTGATGGCCGGCTGGTGAAGAAGATCTGGGTTCCTGATGTCTTCTTTGTGCACTCCAAACGCT  334

Query  437  CGTTCACTCATGACACCACCACTGACAACATCATGCTGAGGGTGTTCCCAGATGGACACGTGCTGTACAGCATG  510
            |.||||..||.|||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  335  CCTTCATCCACGACACCACCACCGACAACATCATGCTGCGAGTGTTCCCCGATGGCCATGTGCTATACAGCATG  408

Query  511  AGGATTACGGTCACTGCCATGTGCAACATGGACTTCAGCCACTTTCCCCTGGACTCCCAGACCTGTTCTTTGGA  584
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  409  AGGATTACGGTCACTGCCATGTGCAACATGGACTTCAGCCACTTTCCCCTGGATTCCCAGACCTGCTCTTTGGA  482

Query  585  GCTGGAGAGCTATGCCTATACAGATGAAGATCTAATGCTGTACTGGAAGAATGGGGATGAATCCCTAAAAACAG  658
            |||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||||
Sbjct  483  GCTGGAGAGCTATGCGTACACAGATGAAGATCTGATGCTGTACTGGAAGAACGGGGACGAGTCCCTGAAGACAG  556

Query  659  ATGAGAAGATCTCCTTGTCTCAGTTTCTGATTCAGAAATTTCACACAACTTCCAGGCTGGCCTTCTACAGCAGC  732
            |.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  557  ACGAGAAGATCTCCTTGTCCCAGTTTCTGATCCAGAAGTTTCACACGACTTCCAGACTGGCCTTCTACAGCAGC  630

Query  733  ACTGGCTGGTACAACCGTCTGTACATTAACTTCACGTTGCGTCGCCACATCTTCTTCTTCTTGCTCCAAACATA  806
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  631  ACTGGCTGGTACAACCGTCTGTACATCAACTTCACTCTGCGTCGTCACATCTTCTTCTTCTTGCTCCAAACCTA  704

Query  807  TTTCCCTGCCACTCTGATGGTCATGCTGTCCTGGGTGTCCTTCTGGATCGACCGCAGAGCTGTGCCTGCCAGAG  880
            .|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||.|||||||
Sbjct  705  CTTCCCTGCCACCCTCATGGTCATGCTGTCCTGGGTGTCCTTCTGGATCGACCACAGAGCCGTGCCCGCCAGAG  778

Query  881  TTTCACTGGGTATCACGACGGTGCTGACCATGACCACCATCATCACGGGCGTGAATGCCTCCATGCCGCGCGTC  954
            |.||||||||.||||.||||||||||||||||.|.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct  779  TCTCACTGGGCATCATGACGGTGCTGACCATGTCGACCATCATCACGGGTGTGAACGCCTCCATGCCCCGAGTG  852

Query  955  TCCTACGTCAAGGCCGTGGACATCTACCTCTGGGTCAGCTTTGTGTTCGTGTTCCTCTCGGTGCTGGAGTATGC  1028
            ||||||.||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  853  TCCTACATCCGGGCCGTGGACATCTACCTCTGGGTCAGCTTTGTGTTCGTCTTCCTCTCCGTGCTGGAGTACGC  926

Query 1029  GGCTGTCAACTACCTGACCACCGTGCAGGAGCGCAAGGAACGGAAGCTGCGGGAGAAGTTCCCGTGCATGTGTG  1102
            .||||||||||||||||||||..|||||||||..||||||||||||.|.|||||||||.|.||.||||||||||
Sbjct  927  AGCTGTCAACTACCTGACCACACTGCAGGAGCAGAAGGAACGGAAGTTCCGGGAGAAGCTTCCATGCATGTGTG  1000

Query 1103  GAATGCTTCATTCAAAAACCATGATGCTGGATGGAAGCTACAGTGAGTCTGAGGCCAACAGCCTGGCTGGGTAC  1176
            |||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1001  GAATGCTTCATTCAAGGACCATGATGCTGGATGGAAGCTACAGTGAATCTGAGGCCAACAGCCTGGCTGGCTAC  1074

Query 1177  CCCAGAAGCCATATCCTGACAGAAGAAGAAAGGCAAGACAAAATAGTGGTCCACCTGGGCCTGAGTGGTGAAGC  1250
            ||.||||||||.||.|||.|||||||||||||||.|||.||.||.|||||.||..|||.|||.|...|||||..
Sbjct 1075  CCAAGAAGCCACATTCTGCCAGAAGAAGAAAGGCCAGATAACATCGTGGTTCATTTGGCCCTCAACAGTGAATT  1148

Query 1251  CAACGCTGCCAGAAAGAAGGGGCTTCTGAAGGGCCAGACGGGTTTTCGTATCTTCCAGAATACCCATGCCATTG  1324
            .|.|.|..||||||||||.||.||||||||.|||||.|.||||.|....|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1149  GACCTCCTCCAGAAAGAAAGGCCTTCTGAAAGGCCAAATGGGTCTCTACATCTTCCAGAACACCCATGCCATTG  1222

Query 1325  ACAAATACTCTAGGTTGATATTCCCTGCCTCCTACATATTTTTCAACTTAATTTATTGGTCAGTGTTTTCC  1395
            ||||||||||.|||||||||||.|||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1223  ACAAATACTCCAGGTTGATATTTCCTGCCTTCTACATAGTTTTCAACCTAATTTATTGGTCAGTGTTTTCC  1293