Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472489
• Subject: NM_001289606.1
• Aligned Length: 2853
• Identities: 2307
• Gaps: 312

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGACCGGGACAGGCAAGCACAAGCTGCTGAGTACTGGCCCAACAGAGCCATGGTCCATCCGAGAGAAGTT  74

Query    1  -------------------ATGAGAAGTGGCGATCAAAATTGGGTATCAGTTAGCAGAGCAATCAAGCCCTTTG  55
                               |||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTGTTTAGCATCTTCTGTCATGAGGAGTGGGGATCAGAACTGGGTATCAGTTAGCAGAGCAATCAAGCCCTTTG  148

Query   56  CAGAACCTGGCCGCCCTCCAGACTGGTTCTCTCAAAAACATTGTGCTTCCCAGTACTCGGAGCTTTTAGAGACC  129
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.
Sbjct  149  CAGAACCTGGCCGGCCTCCAGACTGGTTCTCTCAAAAACATTGTGCTTCTCAGTATTCTGAGCTCTTAGAGACT  222

Query  130  ACTGAGACACCAAAACGGAAACGAGGTGAAAAGGGAGAAGTGGTGGAAACTGTTGAAGATGTTATTGTTCGGAA  203
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  ACTGAGACTCCAAAACGGAAACGGGGTGAAAAAGGAGAAGTGGTAGAAACTGTTGAAGATGTTATTGTTCGCAA  296

Query  204  ATTGACTGCTGAGCGAGTTGAAGAACTAAAGAAAGTGATAAAGGAAACCCAGGAGAGATATAGACGGCTAAAGA  277
            |.|||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.||.|
Sbjct  297  ACTGACTGCTGAGAGAGTTGAAGAACTGAAGAAAGTCATAAAGGAGACACAGGAGAGATACAGGCGTCTGAAAA  370

Query  278  GAGATGCAGAACTAATTCAAGCTGGACACATGGACAGCAGACTGGATGAGCTTTGCAATGACATTGCAACGAAA  351
            ||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||
Sbjct  371  GAGATGCAGAACTAATCCAAGCCGGGCACATGGACAGCAGACTGGATGAGCTCTGCAATGACATTGCAATGAAA  444

Query  352  AAGAAATTGGAAGAAGAGGAGGCTGAAGTAAAGAGGAAGGCTACAGATGCTGCATACCAGGCTCGTCAAGCAGT  425
            ||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct  445  AAGAAATTGGAAGAGGAAGAGGCTGAAGTAAAAAGGAAGGCCACCGATGCTGCGTACCAGGCGCGACAAGCAGT  518

Query  426  AAAAACACCCCCCCGGAGGTTACCCACTGTGATGGTTCGCTCTCCTATAGATTCTGCCTCCCCAGGAGGTGATT  499
            .|||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAAACGCCTCCTCGAAGGTTACCGACTGTGATGGTCCGCTCTCCTGTAGACTCTGCCTCCCCAGGAGGTGATT  592

Query  500  ATCCACTTGGGGACTTGACTCCAACCACTATGGAAGAGGCTACCTCTGGGGTAACCCCCGGGACTTTGCCGAGT  573
            |.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                         
Sbjct  593  ACCCACTTGGAGACTTGACTCCAACCACTATGGAAGAGGCTACCTCTGG-------------------------  641

Query  574  ACCCCAGTCACCTCGTTTCCTGGGATTCCTGACACCCTTCCTCCAGGCTCTGCACCCTTAGAAGCCCCCATGAC  647
                                                                                      
Sbjct  642  --------------------------------------------------------------------------  641

Query  648  CCCAGTAACAGATGATTCACCCCAGAAAAAGATGCTTGGACAGAAAGCAACTCCACCCCCCTCCCCTCTGCTGT  721
                                                                                      
Sbjct  642  --------------------------------------------------------------------------  641

Query  722  CAGAGCTCTTGAAGAAGGGCAGCCTCCTGCCTACTAGCCCCAGACTGGTCAATGAGAGTGAAATGGCTGTGGCT  795
                                                          |||.|||||||||||||||.||||..|.
Sbjct  642  ----------------------------------------------GGTGAATGAGAGTGAAATGCCTGTACCC  669

Query  796  TCTGGCCACCTGAACAGTACAGGTGTCCTCCTGGAGGTAGGCGGGGTCCTTCCCATGATACATGGTGGGGAGAT  869
            .|||||||.||||||||.|||||.||.|||.||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  670  CCTGGCCATCTGAACAGCACAGGGGTTCTCTTGGAGGTAGGAGGGGTTCTTCCCATGATACATGGTGGGGAGAT  743

Query  870  ACAGCAAACACCCAATACTGTTGCAGCCTCCCCTGCTGCATCAGGTGCTCCCACTCTTTCCCGGCTTTTAGAAG  943
            |||||.||||.|||.|.||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  744  ACAGCCAACAACCAGTGCTGTGGCGGCCTCCCCGGCTGCCTCAGGTGCTCCCACTCTTTCCCGGCTTTTAGAAG  817

Query  944  CTGGTCCTACACAGTTCACCACACCTCTTGCTTCCTTCACTACTGTTGCCAGTGAGCCTCCAGTTAAACTTGTG  1017
            ||||.||.||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  818  CTGGGCCCACACAGTTCACCACTCCTCTTCCTTCCTTCACTACTGTTGCCAGTGAGCCGCCAGTTAAGCTTGTG  891

Query 1018  CCACCCCCTGTAGAGTCTGTGTCCCAAGCTACCATTGTCATGATGCCTGCGCTGCCAGCACCATCCTCTGCTCC  1091
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  892  CCACCCCCTGTAGAGTCTGTGTCCCAGGCTACCATTGTCATGATGCCCGCGCTGCCAGCACCATCCTCTGCTGC  965

Query 1092  GGCTGTCTCCACTACTGAAAGTGTAGCTCCAGTGAGTCAACCCGACAACTGTGTTCCCATGGAGGCTGTGGGGG  1165
            |||||||||||||.|||||||||.||||||||||||.||.||.||...||||||.|||.||||.||||||||||
Sbjct  966  GGCTGTCTCCACTTCTGAAAGTGGAGCTCCAGTGAGCCAGCCTGAGCCCTGTGTACCCCTGGAAGCTGTGGGGG  1039

Query 1166  ATCCACATACTGTGACTGTTTCCATGGACAGCAGTGAAATATCCATGATCATCAATTCTATCAAAGAAGAGTGT  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1040  ATCCACATACTGTGACTGTTTCCATGGATAGCAATGAAATCTCCATGATCATTAATTCCATCAAAGAAGAGTGT  1113

Query 1240  TTTCGATCAGGGGTAGCAGAGGCTCCTGTTGGATCAAAGGCTCCCAGCATAGATGGGAAGGAAGAATTAGATCT  1313
            ||.||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1114  TTCCGCTCAGGGGTAGCAGAGGCTCCTGGTGGATCAAAGGCTCCAAGCATAGATGGGAAGGAAGACTTGGATCT  1187

Query 1314  GGCTGAGAAGATGGATATTGCTGTGTCTTACACAGGTGAAGAGCTGGATTTTGAGACTGTTGGAGACATCATTG  1387
            .||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1188  AGCGGAGAAGATGGATATTGCTGTGTCTTACACAGGTGAAGAGTTGGACTTTGAAACAGTTGGAGACATCATTG  1261

Query 1388  CCATCATTGAGGACAAGGTAGATGATCATCCTGAAGTGCTGGATGTGGCAGCAGTGGAAGCAGCACTGTCATTT  1461
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||..|.||.||.
Sbjct 1262  CCATCATTGAGGACAAGGTGGATGATCACCCTGAAGTGCTGGATGTGGCAGCGGTAGAAGCGGCGTTATCGTTC  1335

Query 1462  TGTGAAGAAAATGATGATCCTCAGTCCCTGCCTGGCCCCTGGGAGCATCCTATCCAGCAGGAGCGGGACAAGCC  1535
            ||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1336  TGTGAAGAGAATGATGACCCTCAGTCCCTGCCTGGCCCCTGGGAGCACCCTATCCAGCAGGAGCGCGACAAGCC  1409

Query 1536  AGTACCTCTCCCTGCACCAGAAATGACGGTCAAGCAAGAGAGACTGGACTTTGAGGAAACGGAAAACAAGGGAA  1609
            |||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||.|.||||||||.||..
Sbjct 1410  AGTACCTCTGCCAGCACCAGAGATGACAGTCAAACAAGAGAGGCTAGACTTCGAGGAATCAGAAAACAAAGGGC  1483

Query 1610  TACATGAACTGGTGGACATCAGGGAGCCCAGTGCAGAGATCAAGGTGGAACCTGCAGAACCAGAGCCAGTCATT  1683
            |.|||||.|||||||||||||||||..||.|||..|||||.|||||||||||..||||.||||||||||.|||.
Sbjct 1484  TCCATGACCTGGTGGACATCAGGGATTCCGGTGTTGAGATTAAGGTGGAACCCACAGAGCCAGAGCCAGGCATG  1557

Query 1684  TCAGGAGCCGAAATAGTAGCTGGAGTTGTTCCAGCCACAAGTATGGAGCCACCAGAACTCAGGAGTCAGGACTT  1757
            ||.||.||.||.||||||||||||||||.|||||...|||||||||||||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct 1558  TCTGGGGCTGAGATAGTAGCTGGAGTTGGTCCAGTTCCAAGTATGGAGCCACCAGAACTCAGGAGTCAAGACTC  1631

Query 1758  AGATGAGGAACTGGGAAGTACTGCAGCTGGAGAGATTGTTGAAGCAGATGTTGCCATTGGGAAAGGCGATGAGA  1831
            ||||||.||||...|||||.|||||||||||||.||||.|||.|||||||.|.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 1632  AGATGAAGAACCTAGAAGTTCTGCAGCTGGAGACATTGGTGAGGCAGATGGTTCCAGTGGGAAAGGCGATGAGA  1705

Query 1832  CTCCACTTACAAATGTGAAGACAGAGGCATCCCCTGAAAGCATGTTGTCTCCATCACATGGCTCAAATCCCATT  1905
            ..||||||.||..||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 1706  GGCCACTTTCAGCTGTGAAGACAGAGGCATCCCCTGAGAGCATGTTGTCTCCATCACATGGCTCAAATCTTATT  1779

Query 1906  GAAGATCCTTTAGAGGCAGAGACTCAGCACAAGTTTGAAATGTCAGACTCATTGAAAGAAGAATCAGGGACTAT  1979
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1780  GAAGATCCTTTAGAGGCAGAGACTCAACACAAGTTTGAAATGTCAGACTCATTGAAAGAAGAATCAGGGACTAT  1853

Query 1980  TTTTGGAAGCCAGATAAAGGATGCCCCAGGTGAGGATGAGGAGGAAGATGGTGTCAGTGAAGCGGCCAGCCTAG  2053
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1854  TTTTGGAAGCCAGATAAAGGATGCCCCAGGTGACGATGAGGAAGAAGATGGAGTCAGTGAAGCAGCTAGCCTAG  1927

Query 2054  AGGAGCCTAAGGAAGAGGATCAAGGAGAAGGCTACTTGTCAGAAATGGATAATGAACCTCCTGTGAGCGAGAGT  2127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1928  AGGAGCCTAAGGAAGAGGATCAAGGAGAAGGCTATTTGTCTGAGATGGATAATGAGCCCCCTGTGAGTGAGAGT  2001

Query 2128  GATGATGGCTTCAGCATACACAATGCTACACTGCAGTCACACACACTGGCAGACTCCATCCCCAGCAGCCCTGC  2201
            |||||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2002  GATGATGGCTTTAGTATACATAACGCCACACTGCAGTCACACACTCTGGCAGACTCCATCCCAAGCAGCCCTGC  2075

Query 2202  TTCTTCACAGTTCTCTGTCTGTAGTGAGGATCAGGAAGCTATTCAGGCACAGAAAATTTGGAAGAAAGCCATCA  2275
            .||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2076  CTCCTCCCAGTTTTCCGTGTGCAGTGAAGATCAAGAAGCAATTCAGGCTCAGAAAATATGGAAGAAAGCCATCA  2149

Query 2276  TGCTTGTATGGAGAGCTGCAGCTAATCATAGGTATGCCAATGTCTTCCTGCAGCCTGTTACAGATGACATAGCA  2349
            |||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 2150  TGCTTGTATGGAGGGCTGCAGCAAATCATAGGTATGCCAATGTGTTCCTGCAACCTGTTACAGATGACATAGCT  2223

Query 2350  CCTGGCTACCACAGCATTGTGCAGAGGCCTATGGATTTGTCAACTATTAAGAAAAACATAGAAAATGGACTGAT  2423
            |||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2224  CCTGGTTACCATAGCATTGTACAGAGGCCTATGGATTTGTCAACTATAAAGAAAAACATTGAAAATGGACTGAT  2297

Query 2424  CCGAAGCACAGCTGAATTTCAGCGTGACATTATGCTGATGTTTCAGAATGCTGTAATGTACAATAGCTCAGACC  2497
            |||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2298  CCGAAGCACAGCTGAGTTTCAGCGTGACATCATGCTGATGTTTCAGAATGCTGTTATGTACAATAGCTCAGACC  2371

Query 2498  ATGATGTCTATCACATGGCAGTGGAGATGCAGCGAGATGTCTTGGAACAGATCCAGCAATTCTTGGCCACGCAG  2571
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2372  ATGATGTCTATCACATGGCAGTAGAGATGCAGAGAGATGTCTTGGAACAGATCCAGCAATTCTTGGCCACACAG  2445

Query 2572  TTGATTATGCAAACATCCGAGTCTGGGATCAGTGCTAAAAGTCTTCGAGGGAGAGATTCTACCCGCAAACAGGA  2645
            |||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 2446  TTGATTATGCAAACATCTGAGTCTGGAATCAGTGCTAAAAGTCTCCGGGGGAGAGACTCTACCCGAAAACAAGA  2519

Query 2646  TGCTTCAGAGAAGGACAGTGTCCCAATGGGCTCTCCTGCCTTCCTTCTCTCTCTCTTTGATGGAGGAACCAGGG  2719
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2520  TGCTTCAGAGAAGGACAGTGTCCCCATGGGCTCTCCTGCCTTCCTTCTCTCTCTCTTTGATGGGGGAACCAGGG  2593

Query 2720  GACGCCGCTGTGCCATTGAAGCAGATATGAAGATGAAAAAG  2760
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2594  GACGCCGCTGTGCCATTGAAGCAGATATGAAGATGAAGAAG  2634