Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472489
• Subject: NM_001300962.2
• Aligned Length: 2800
• Identities: 2471
• Gaps: 329

Alignment

Query    1  ----------------------------------------ATGAGAAGTGGCGATCAAAATTGGGTATCAGTTA  34
                                                    |||||||||||||||||||||||           
Sbjct    1  ATGGTCCATCCGAGAGAAGCTATGTTTAGCATCTTCTGTCATGAGAAGTGGCGATCAAAATTG-----------  63

Query   35  GCAGAGCAATCAAGCCCTTTGCAGAACCTGGCCGCCCTCCAGACTGGTTCTCTCAAAAACATTGTGCTTCCCAG  108
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct   64  -----------------------------------------------------------CATTGTGCTTCCCAG  78

Query  109  TACTCGGAGCTTTTAGAGACCACTGAGACACCAAAACGGAAACGAGGTGAAAAGGGAGAAGTGGTGGAAACTGT  182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   79  TACTCGGAGCTTTTAGAGACCACTGAGACACCAAAACGGAAACGAGGTGAAAAGGGAGAAGTGGTGGAAACTGT  152

Query  183  TGAAGATGTTATTGTTCGGAAATTGACTGCTGAGCGAGTTGAAGAACTAAAGAAAGTGATAAAGGAAACCCAGG  256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  153  TGAAGATGTTATTGTTCGGAAATTGACTGCTGAGCGAGTTGAAGAACTAAAGAAAGTGATAAAGGAAACCCAGG  226

Query  257  AGAGATATAGACGGCTAAAGAGAGATGCAGAACTAATTCAAGCTGGACACATGGACAGCAGACTGGATGAGCTT  330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  227  AGAGATATAGACGGCTAAAGAGAGATGCAGAACTAATTCAAGCTGGACACATGGACAGCAGACTGGATGAGCTT  300

Query  331  TGCAATGACATTGCAACGAAAAAGAAATTGGAAGAAGAGGAGGCTGAAGTAAAGAGGAAGGCTACAGATGCTGC  404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  TGCAATGACATTGCAACGAAAAAGAAATTGGAAGAAGAGGAGGCTGAAGTAAAGAGGAAGGCTACAGATGCTGC  374

Query  405  ATACCAGGCTCGTCAAGCAGTAAAAACACCCCCCCGGAGGTTACCCACTGTGATGGTTCGCTCTCCTATAGATT  478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  ATACCAGGCTCGTCAAGCAGTAAAAACACCCCCCCGGAGGTTACCCACTGTGATGGTTCGCTCTCCTATAGATT  448

Query  479  CTGCCTCCCCAGGAGGTGATTATCCACTTGGGGACTTGACTCCAACCACTATGGAAGAGGCTACCTCTGGGGTA  552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct  449  CTGCCTCCCCAGGAGGTGATTATCCACTTGGGGACTTGACTCCAACCACTATGGAAGAGGCTACCTCTGG----  518

Query  553  ACCCCCGGGACTTTGCCGAGTACCCCAGTCACCTCGTTTCCTGGGATTCCTGACACCCTTCCTCCAGGCTCTGC  626
                                                                                      
Sbjct  519  --------------------------------------------------------------------------  518

Query  627  ACCCTTAGAAGCCCCCATGACCCCAGTAACAGATGATTCACCCCAGAAAAAGATGCTTGGACAGAAAGCAACTC  700
                                                                                      
Sbjct  519  --------------------------------------------------------------------------  518

Query  701  CACCCCCCTCCCCTCTGCTGTCAGAGCTCTTGAAGAAGGGCAGCCTCCTGCCTACTAGCCCCAGACTGGTCAAT  774
                                                                               |||||||
Sbjct  519  -------------------------------------------------------------------GGTCAAT  525

Query  775  GAGAGTGAAATGGCTGTGGCTTCTGGCCACCTGAACAGTACAGGTGTCCTCCTGGAGGTAGGCGGGGTCCTTCC  848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  526  GAGAGTGAAATGGCTGTGGCTTCTGGCCACCTGAACAGTACAGGTGTCCTCCTGGAGGTAGGCGGGGTCCTTCC  599

Query  849  CATGATACATGGTGGGGAGATACAGCAAACACCCAATACTGTTGCAGCCTCCCCTGCTGCATCAGGTGCTCCCA  922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  600  CATGATACATGGTGGGGAGATACAGCAAACACCCAATACTGTTGCAGCCTCCCCTGCTGCATCAGGTGCTCCCA  673

Query  923  CTCTTTCCCGGCTTTTAGAAGCTGGTCCTACACAGTTCACCACACCTCTTGCTTCCTTCACTACTGTTGCCAGT  996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  674  CTCTTTCCCGGCTTTTAGAAGCTGGTCCTACACAGTTCACCACACCTCTTGCTTCCTTCACTACTGTTGCCAGT  747

Query  997  GAGCCTCCAGTTAAACTTGTGCCACCCCCTGTAGAGTCTGTGTCCCAAGCTACCATTGTCATGATGCCTGCGCT  1070
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  748  GAGCCTCCAGTTAAACTTGTGCCACCCCCTGTAGAGTCTGTGTCCCAAGCTACCATTGTCATGATGCCTGCGCT  821

Query 1071  GCCAGCACCATCCTCTGCTCCGGCTGTCTCCACTACTGAAAGTGTAGCTCCAGTGAGTCAACCCGACAACTGTG  1144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  822  GCCAGCACCATCCTCTGCTCCGGCTGTCTCCACTACTGAAAGTGTAGCTCCAGTGAGTCAACCCGACAACTGTG  895

Query 1145  TTCCCATGGAGGCTGTGGGGGATCCACATACTGTGACTGTTTCCATGGACAGCAGTGAAATATCCATGATCATC  1218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  896  TTCCCATGGAGGCTGTGGGGGATCCACATACTGTGACTGTTTCCATGGACAGCAGTGAAATATCCATGATCATC  969

Query 1219  AATTCTATCAAAGAAGAGTGTTTTCGATCAGGGGTAGCAGAGGCTCCTGTTGGATCAAAGGCTCCCAGCATAGA  1292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  970  AATTCTATCAAAGAAGAGTGTTTTCGATCAGGGGTAGCAGAGGCTCCTGTTGGATCAAAGGCTCCCAGCATAGA  1043

Query 1293  TGGGAAGGAAGAATTAGATCTGGCTGAGAAGATGGATATTGCTGTGTCTTACACAGGTGAAGAGCTGGATTTTG  1366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1044  TGGGAAGGAAGAATTAGATCTGGCTGAGAAGATGGATATTGCTGTGTCTTACACAGGTGAAGAGCTGGATTTTG  1117

Query 1367  AGACTGTTGGAGACATCATTGCCATCATTGAGGACAAGGTAGATGATCATCCTGAAGTGCTGGATGTGGCAGCA  1440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1118  AGACTGTTGGAGACATCATTGCCATCATTGAGGACAAGGTAGATGATCATCCTGAAGTGCTGGATGTGGCAGCA  1191

Query 1441  GTGGAAGCAGCACTGTCATTTTGTGAAGAAAATGATGATCCTCAGTCCCTGCCTGGCCCCTGGGAGCATCCTAT  1514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1192  GTGGAAGCAGCACTGTCATTTTGTGAAGAAAATGATGATCCTCAGTCCCTGCCTGGCCCCTGGGAGCATCCTAT  1265

Query 1515  CCAGCAGGAGCGGGACAAGCCAGTACCTCTCCCTGCACCAGAAATGACGGTCAAGCAAGAGAGACTGGACTTTG  1588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1266  CCAGCAGGAGCGGGACAAGCCAGTACCTCTCCCTGCACCAGAAATGACGGTCAAGCAAGAGAGACTGGACTTTG  1339

Query 1589  AGGAAACGGAAAACAAGGGAATACATGAACTGGTGGACATCAGGGAGCCCAGTGCAGAGATCAAGGTGGAACCT  1662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1340  AGGAAACGGAAAACAAGGGAATACATGAACTGGTGGACATCAGGGAGCCCAGTGCAGAGATCAAGGTGGAACCT  1413

Query 1663  GCAGAACCAGAGCCAGTCATTTCAGGAGCCGAAATAGTAGCTGGAGTTGTTCCAGCCACAAGTATGGAGCCACC  1736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1414  GCAGAACCAGAGCCAGTCATTTCAGGAGCCGAAATAGTAGCTGGAGTTGTTCCAGCCACAAGTATGGAGCCACC  1487

Query 1737  AGAACTCAGGAGTCAGGACTTAGATGAGGAACTGGGAAGTACTGCAGCTGGAGAGATTGTTGAAGCAGATGTTG  1810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1488  AGAACTCAGGAGTCAGGACTTAGATGAGGAACTGGGAAGTACTGCAGCTGGAGAGATTGTTGAAGCAGATGTTG  1561

Query 1811  CCATTGGGAAAGGCGATGAGACTCCACTTACAAATGTGAAGACAGAGGCATCCCCTGAAAGCATGTTGTCTCCA  1884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1562  CCATTGGGAAAGGCGATGAGACTCCACTTACAAATGTGAAGACAGAGGCATCCCCTGAAAGCATGTTGTCTCCA  1635

Query 1885  TCACATGGCTCAAATCCCATTGAAGATCCTTTAGAGGCAGAGACTCAGCACAAGTTTGAAATGTCAGACTCATT  1958
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1636  TCACATGGCTCAAATCCCATTGAAGATCCTTTAGAGGCAGAGACTCAGCACAAGTTTGAAATGTCAGACTCATT  1709

Query 1959  GAAAGAAGAATCAGGGACTATTTTTGGAAGCCAGATAAAGGATGCCCCAGGTGAGGATGAGGAGGAAGATGGTG  2032
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1710  GAAAGAAGAATCAGGGACTATTTTTGGAAGCCAGATAAAGGATGCCCCAGGTGAGGATGAGGAGGAAGATGGTG  1783

Query 2033  TCAGTGAAGCGGCCAGCCTAGAGGAGCCTAAGGAAGAGGATCAAGGAGAAGGCTACTTGTCAGAAATGGATAAT  2106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1784  TCAGTGAAGCGGCCAGCCTAGAGGAGCCTAAGGAAGAGGATCAAGGAGAAGGCTACTTGTCAGAAATGGATAAT  1857

Query 2107  GAACCTCCTGTGAGCGAGAGTGATGATGGCTTCAGCATACACAATGCTACACTGCAGTCACACACACTGGCAGA  2180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1858  GAACCTCCTGTGAGCGAGAGTGATGATGGCTTCAGCATACACAATGCTACACTGCAGTCACACACACTGGCAGA  1931

Query 2181  CTCCATCCCCAGCAGCCCTGCTTCTTCACAGTTCTCTGTCTGTAGTGAGGATCAGGAAGCTATTCAGGCACAGA  2254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1932  CTCCATCCCCAGCAGCCCTGCTTCTTCACAGTTCTCTGTCTGTAGTGAGGATCAGGAAGCTATTCAGGCACAGA  2005

Query 2255  AAATTTGGAAGAAAGCCATCATGCTTGTATGGAGAGCTGCAGCTAATCATAGGTATGCCAATGTCTTCCTGCAG  2328
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2006  AAATTTGGAAGAAAGCCATCATGCTTGTATGGAGAGCTGCAGCTAATCATAGGTATGCCAATGTCTTCCTGCAG  2079

Query 2329  CCTGTTACAGATGACATAGCACCTGGCTACCACAGCATTGTGCAGAGGCCTATGGATTTGTCAACTATTAAGAA  2402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2080  CCTGTTACAGATGACATAGCACCTGGCTACCACAGCATTGTGCAGAGGCCTATGGATTTGTCAACTATTAAGAA  2153

Query 2403  AAACATAGAAAATGGACTGATCCGAAGCACAGCTGAATTTCAGCGTGACATTATGCTGATGTTTCAGAATGCTG  2476
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2154  AAACATAGAAAATGGACTGATCCGAAGCACAGCTGAATTTCAGCGTGACATTATGCTGATGTTTCAGAATGCTG  2227

Query 2477  TAATGTACAATAGCTCAGACCATGATGTCTATCACATGGCAGTGGAGATGCAGCGAGATGTCTTGGAACAGATC  2550
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2228  TAATGTACAATAGCTCAGACCATGATGTCTATCACATGGCAGTGGAGATGCAGCGAGATGTCTTGGAACAGATC  2301

Query 2551  CAGCAATTCTTGGCCACGCAGTTGATTATGCAAACATCCGAGTCTGGGATCAGTGCTAAAAGTCTTCGAGGGAG  2624
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2302  CAGCAATTCTTGGCCACGCAGTTGATTATGCAAACATCCGAGTCTGGGATCAGTGCTAAAAGTCTTCGAGGGAG  2375

Query 2625  AGATTCTACCCGCAAACAGGATGCTTCAGAGAAGGACAGTGTCCCAATGGGCTCTCCTGCCTTCCTTCTCTCTC  2698
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2376  AGATTCTACCCGCAAACAGGATGCTTCAGAGAAGGACAGTGTCCCAATGGGCTCTCCTGCCTTCCTTCTCTCTC  2449

Query 2699  TCTTTGATGGAGGAACCAGGGGACGCCGCTGTGCCATTGAAGCAGATATGAAGATGAAAAAG  2760
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2450  TCTTTGATGGAGGAACCAGGGGACGCCGCTGTGCCATTGAAGCAGATATGAAGATGAAAAAG  2511