Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000472489
- Subject:
- NM_001300966.2
- Aligned Length:
- 2760
- Identities:
- 2271
- Gaps:
- 489
Alignment
Query 1 ATGAGAAGTGGCGATCAAAATTGGGTATCAGTTAGCAGAGCAATCAAGCCCTTTGCAGAACCTGGCCGCCCTCC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AGACTGGTTCTCTCAAAAACATTGTGCTTCCCAGTACTCGGAGCTTTTAGAGACCACTGAGACACCAAAACGGA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AACGAGGTGAAAAGGGAGAAGTGGTGGAAACTGTTGAAGATGTTATTGTTCGGAAATTGACTGCTGAGCGAGTT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GAAGAACTAAAGAAAGTGATAAAGGAAACCCAGGAGAGATATAGACGGCTAAAGAGAGATGCAGAACTAATTCA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AGCTGGACACATGGACAGCAGACTGGATGAGCTTTGCAATGACATTGCAACGAAAAAGAAATTGGAAGAAGAGG 370
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------------ATGAGCTTTGCAATGACATT-----GAAAAAGAAATTGGAAGAAGAGG 43
Query 371 AGGCTGAAGTAAAGAGGAAGGCTACAGATGCTGCATACCAGGCTCGTCAAGCAGTAAAAACACCCCCCCGGAGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 44 AGGCTGAAGTAAAGAGGAAGGCTACAGATGCTGCATACCAGGCTCGTCAAGCAGTAAAAACACCCCCCCGGAGG 117
Query 445 TTACCCACTGTGATGGTTCGCTCTCCTATAGATTCTGCCTCCCCAGGAGGTGATTATCCACTTGGGGACTTGAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 118 TTACCCACTGTGATGGTTCGCTCTCCTATAGATTCTGCCTCCCCAGGAGGTGATTATCCACTTGGGGACTTGAC 191
Query 519 TCCAACCACTATGGAAGAGGCTACCTCTGGGGTAACCCCCGGGACTTTGCCGAGTACCCCAGTCACCTCGTTTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 192 TCCAACCACTATGGAAGAGGCTACCTCTGGGGTAACCCCCGGGACTTTGCCGAGTACCCCAGTCACCTCGTTTC 265
Query 593 CTGGGATTCCTGACACCCTTCCTCCAGGCTCTGCACCCTTAGAAGCCCCCATGACCCCAGTAACAGATGATTCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 266 CTGGGATTCCTGACACCCTTCCTCCAGGCTCTGCACCCTTAGAAGCCCCCATGACCCCAGTAACAGATGATTCA 339
Query 667 CCCCAGAAAAAGATGCTTGGACAGAAAGCAACTCCACCCCCCTCCCCTCTGCTGTCAGAGCTCTTGAAGAAGGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 340 CCCCAGAAAAAGATGCTTGGACAGAAAGCAACTCCACCCCCCTCCCCTCTGCTGTCAGAGCTCTTGAAGAAGGG 413
Query 741 CAGCCTCCTGCCTACTAGCCCCAGACTGGTCAATGAGAGTGAAATGGCTGTGGCTTCTGGCCACCTGAACAGTA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414 CAGCCTCCTGCCTACTAGCCCCAGACTGGTCAATGAGAGTGAAATGGCTGTGGCTTCTGGCCACCTGAACAGTA 487
Query 815 CAGGTGTCCTCCTGGAGGTAGGCGGGGTCCTTCCCATGATACATGGTGGGGAGATACAGCAAACACCCAATACT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 488 CAGGTGTCCTCCTGGAGGTAGGCGGGGTCCTTCCCATGATACATGGTGGGGAGATACAGCAAACACCCAATACT 561
Query 889 GTTGCAGCCTCCCCTGCTGCATCAGGTGCTCCCACTCTTTCCCGGCTTTTAGAAGCTGGTCCTACACAGTTCAC 962
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 562 GTTGCAGCCTCCCCTGCTGCATC--------------------------------------------------- 584
Query 963 CACACCTCTTGCTTCCTTCACTACTGTTGCCAGTGAGCCTCCAGTTAAACTTGTGCCACCCCCTGTAGAGTCTG 1036
||||||||
Sbjct 585 ------------------------------------------------------------------AGAGTCTG 592
Query 1037 TGTCCCAAGCTACCATTGTCATGATGCCTGCGCTGCCAGCACCATCCTCTGCTCCGGCTGTCTCCACTACTGAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGTCCCAAGCTACCATTGTCATGATGCCTGCGCTGCCAGCACCATCCTCTGCTCCGGCTGTCTCCACTACTGAA 666
Query 1111 AGTGTAGCTCCAGTGAGTCAACCCGACAACTGTGTTCCCATGGAGGCTGTGGGGGATCCACATACTGTGACTGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGTGTAGCTCCAGTGAGTCAACCCGACAACTGTGTTCCCATGGAGGCTGTGGGGGATCCACATACTGTGACTGT 740
Query 1185 TTCCATGGACAGCAGTGAAATATCCATGATCATCAATTCTATCAAAGAAGAGTGTTTTCGATCAGGGGTAGCAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTCCATGGACAGCAGTGAAATATCCATGATCATCAATTCTATCAAAGAAGAGTGTTTTCGATCAGGGGTAGCAG 814
Query 1259 AGGCTCCTGTTGGATCAAAGGCTCCCAGCATAGATGGGAAGGAAGAATTAGATCTGGCTGAGAAGATGGATATT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGGCTCCTGTTGGATCAAAGGCTCCCAGCATAGATGGGAAGGAAGAATTAGATCTGGCTGAGAAGATGGATATT 888
Query 1333 GCTGTGTCTTACACAGGTGAAGAGCTGGATTTTGAGACTGTTGGAGACATCATTGCCATCATTGAGGACAAGGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCTGTGTCTTACACAGGTGAAGAGCTGGATTTTGAGACTGTTGGAGACATCATTGCCATCATTGAGGACAAGGT 962
Query 1407 AGATGATCATCCTGAAGTGCTGGATGTGGCAGCAGTGGAAGCAGCACTGTCATTTTGTGAAGAAAATGATGATC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGATGATCATCCTGAAGTGCTGGATGTGGCAGCAGTGGAAGCAGCACTGTCATTTTGTGAAGAAAATGATGATC 1036
Query 1481 CTCAGTCCCTGCCTGGCCCCTGGGAGCATCCTATCCAGCAGGAGCGGGACAAGCCAGTACCTCTCCCTGCACCA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTCAGTCCCTGCCTGGCCCCTGGGAGCATCCTATCCAGCAGGAGCGGGACAAGCCAGTACCTCTCCCTGCACCA 1110
Query 1555 GAAATGACGGTCAAGCAAGAGAGACTGGACTTTGAGGAAACGGAAAACAAGGGAATACATGAACTGGTGGACAT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAAATGACGGTCAAGCAAGAGAGACTGGACTTTGAGGAAACGGAAAACAAGGGAATACATGAACTGGTGGACAT 1184
Query 1629 CAGGGAGCCCAGTGCAGAGATCAAGGTGGAACCTGCAGAACCAGAGCCAGTCATTTCAGGAGCCGAAATAGTAG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAGGGAGCCCAGTGCAGAGATCAAGGTGGAACCTGCAGAACCAGAGCCAGTCATTTCAGGAGCCGAAATAGTAG 1258
Query 1703 CTGGAGTTGTTCCAGCCACAAGTATGGAGCCACCAGAACTCAGGAGTCAGGACTTAGATGAGGAACTGGGAAGT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTGGAGTTGTTCCAGCCACAAGTATGGAGCCACCAGAACTCAGGAGTCAGGACTTAGATGAGGAACTGGGAAGT 1332
Query 1777 ACTGCAGCTGGAGAGATTGTTGAAGCAGATGTTGCCATTGGGAAAGGCGATGAGACTCCACTTACAAATGTGAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACTGCAGCTGGAGAGATTGTTGAAGCAGATGTTGCCATTGGGAAAGGCGATGAGACTCCACTTACAAATGTGAA 1406
Query 1851 GACAGAGGCATCCCCTGAAAGCATGTTGTCTCCATCACATGGCTCAAATCCCATTGAAGATCCTTTAGAGGCAG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GACAGAGGCATCCCCTGAAAGCATGTTGTCTCCATCACATGGCTCAAATCCCATTGAAGATCCTTTAGAGGCAG 1480
Query 1925 AGACTCAGCACAAGTTTGAAATGTCAGACTCATTGAAAGAAGAATCAGGGACTATTTTTGGAAGCCAGATAAAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGACTCAGCACAAGTTTGAAATGTCAGACTCATTGAAAGAAGAATCAGGGACTATTTTTGGAAGCCAGATAAAG 1554
Query 1999 GATGCCCCAGGTGAGGATGAGGAGGAAGATGGTGTCAGTGAAGCGGCCAGCCTAGAGGAGCCTAAGGAAGAGGA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GATGCCCCAGGTGAGGATGAGGAGGAAGATGGTGTCAGTGAAGCGGCCAGCCTAGAGGAGCCTAAGGAAGAGGA 1628
Query 2073 TCAAGGAGAAGGCTACTTGTCAGAAATGGATAATGAACCTCCTGTGAGCGAGAGTGATGATGGCTTCAGCATAC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TCAAGGAGAAGGCTACTTGTCAGAAATGGATAATGAACCTCCTGTGAGCGAGAGTGATGATGGCTTCAGCATAC 1702
Query 2147 ACAATGCTACACTGCAGTCACACACACTGGCAGACTCCATCCCCAGCAGCCCTGCTTCTTCACAGTTCTCTGTC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACAATGCTACACTGCAGTCACACACACTGGCAGACTCCATCCCCAGCAGCCCTGCTTCTTCACAGTTCTCTGTC 1776
Query 2221 TGTAGTGAGGATCAGGAAGCTATTCAGGCACAGAAAATTTGGAAGAAAGCCATCATGCTTGTATGGAGAGCTGC 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TGTAGTGAGGATCAGGAAGCTATTCAGGCACAGAAAATTTGGAAGAAAGCCATCATGCTTGTATGGAGAGCTGC 1850
Query 2295 AGCTAATCATAGGTATGCCAATGTCTTCCTGCAGCCTGTTACAGATGACATAGCACCTGGCTACCACAGCATTG 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AGCTAATCATAGGTATGCCAATGTCTTCCTGCAGCCTGTTACAGATGACATAGCACCTGGCTACCACAGCATTG 1924
Query 2369 TGCAGAGGCCTATGGATTTGTCAACTATTAAGAAAAACATAGAAAATGGACTGATCCGAAGCACAGCTGAATTT 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TGCAGAGGCCTATGGATTTGTCAACTATTAAGAAAAACATAGAAAATGGACTGATCCGAAGCACAGCTGAATTT 1998
Query 2443 CAGCGTGACATTATGCTGATGTTTCAGAATGCTGTAATGTACAATAGCTCAGACCATGATGTCTATCACATGGC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CAGCGTGACATTATGCTGATGTTTCAGAATGCTGTAATGTACAATAGCTCAGACCATGATGTCTATCACATGGC 2072
Query 2517 AGTGGAGATGCAGCGAGATGTCTTGGAACAGATCCAGCAATTCTTGGCCACGCAGTTGATTATGCAAACATCCG 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGTGGAGATGCAGCGAGATGTCTTGGAACAGATCCAGCAATTCTTGGCCACGCAGTTGATTATGCAAACATCCG 2146
Query 2591 AGTCTGGGATCAGTGCTAAAAGTCTTCGAGGGAGAGATTCTACCCGCAAACAGGATGCTTCAGAGAAGGACAGT 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 AGTCTGGGATCAGTGCTAAAAGTCTTCGAGGGAGAGATTCTACCCGCAAACAGGATGCTTCAGAGAAG------ 2214
Query 2665 GTCCCAATGGGCTCTCCTGCCTTCCTTCTCTCTCTCTTTGATGGAGGAACCAGGGGACGCCGCTGTGCCATTGA 2738
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2215 ---------------------------------------GATGGAGGAACCAGGGGACGCCGCTGTGCCATTGA 2249
Query 2739 AGCAGATATGAAGATGAAAAAG 2760
||||||||||||||||||||||
Sbjct 2250 AGCAGATATGAAGATGAAAAAG 2271