Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000472489
- Subject:
- XM_006526359.3
- Aligned Length:
- 2853
- Identities:
- 1855
- Gaps:
- 810
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGACCGGGACAGGCAAGCACAAGCTGCTGAGTACTGGCCCAACAGAGCCATGGTCCATCCGAGAGAAGTT 74
Query 1 -------------------ATGAGAAGTGGCGATCAAAATTGGGTATCAGTTAGCAGAGCAATCAAGCCCTTTG 55
|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GTGTTTAGCATCTTCTGTCATGAGGAGTGGGGATCAGAACTGGGTATCAGTTAGCAGAGCAATCAAGCCCTTTG 148
Query 56 CAGAACCTGGCCGCCCTCCAGACTGGTTCTCTCAAAAACATTGTGCTTCCCAGTACTCGGAGCTTTTAGAGACC 129
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.
Sbjct 149 CAGAACCTGGCCGGCCTCCAGACTGGTTCTCTCAAAAACATTGTGCTTCTCAGTATTCTGAGCTCTTAGAGACT 222
Query 130 ACTGAGACACCAAAACGGAAACGAGGTGAAAAGGGAGAAGTGGTGGAAACTGTTGAAGATGTTATTGTTCGGAA 203
||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 ACTGAGACTCCAAAACGGAAACGGGGTGAAAAAGGAGAAGTGGTAGAAACTGTTGAAGATGTTATTGTTCGCAA 296
Query 204 ATTGACTGCTGAGCGAGTTGAAGAACTAAAGAAAGTGATAAAGGAAACCCAGGAGAGATATAGACGGCTAAAGA 277
|.|||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.||.|
Sbjct 297 ACTGACTGCTGAGAGAGTTGAAGAACTGAAGAAAGTCATAAAGGAGACACAGGAGAGATACAGGCGTCTGAAAA 370
Query 278 GAGATGCAGAACTAATTCAAGCTGGACACATGGACAGCAGACTGGATGAGCTTTGCAATGACATTGCAACGAAA 351
||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||
Sbjct 371 GAGATGCAGAACTAATCCAAGCCGGGCACATGGACAGCAGACTGGATGAGCTCTGCAATGACATTGCAATGAAA 444
Query 352 AAGAAATTGGAAGAAGAGGAGGCTGAAGTAAAGAGGAAGGCTACAGATGCTGCATACCAGGCTCGTCAAGCAGT 425
||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 445 AAGAAATTGGAAGAGGAAGAGGCTGAAGTAAAAAGGAAGGCCACCGATGCTGCGTACCAGGCGCGACAAGCAGT 518
Query 426 AAAAACACCCCCCCGGAGGTTACCCACTGTGATGGTTCGCTCTCCTATAGATTCTGCCTCCCCAGGAGGTGATT 499
.|||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAAAACGCCTCCTCGAAGGTTACCGACTGTGATGGTCCGCTCTCCTGTAGACTCTGCCTCCCCAGGAGGTGATT 592
Query 500 ATCCACTTGGGGACTTGACTCCAACCACTATGGAAGAGGCTACCTCTGGGGTAACCCCCGGGACTTTGCCGAGT 573
|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 593 ACCCACTTGGAGACTTGACTCCAACCACTATGGAAGAGGCTACCTCTGGGGTAACCCCTGGGACTTTGCCGAGT 666
Query 574 ACCCCAGTCACCTCGTTTCCTGGGATTCCTGACACCCTTCCTCCAGGCTCTGCACCCTTAGAAGCCCCCATGAC 647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACCCCAGTCACCTCGTTTCCTGGGATTCCTGACACCCTTCCTCCAGGCTCTGCACCCTTAGAAGCCCCCATGAC 740
Query 648 CCCAGTAACAGATGATTCACCCCAGAAAAAGATGCTTGGACAGAAAGCAACTCCACCCCCCTCCCCTCTGCTGT 721
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCCAATAACAGATGATTCACCCCAGAAAAAGATGCTTGGACAGAAAGCAACTCCACCCCCCTCCCCTCTGCTGT 814
Query 722 CAGAGCTCTTGAAGAAGGGCAGCCTCCTGCCTACTAGCCCCAGACTGGTCAATGAGAGTGAAATGGCTGTGGCT 795
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||..|.
Sbjct 815 CAGAGCTCTTGAAGAAGGGCAGCCTCCTGCCTACTAGCCCCAGACTGGTGAATGAGAGTGAAATGCCTGTACCC 888
Query 796 TCTGGCCACCTGAACAGTACAGGTGTCCTCCTGGAGGTAGGCGGGGTCCTTCCCATGATACATGGTGGGGAGAT 869
.|||||||.||||||||.|||||.||.|||.||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCTGGCCATCTGAACAGCACAGGGGTTCTCTTGGAGGTAGGAGGGGTTCTTCCCATGATACATGGTGGGGAGAT 962
Query 870 ACAGCAAACACCCAATACTGTTGCAGCCTCCCCTGCTGCATCAGGTGCTCCCACTCTTTCCCGGCTTTTAGAAG 943
|||||.||||.|||.|.||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACAGCCAACAACCAGTGCTGTGGCGGCCTCCCCGGCTGCCTCAGGTGCTCCCACTCTTTCCCGGCTTTTAGAAG 1036
Query 944 CTGGTCCTACACAGTTCACCACACCTCTTGCTTCCTTCACTACTGTTGCCAGTGAGCCTCCAGTTAAACTTGTG 1017
||||.||.||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1037 CTGGGCCCACACAGTTCACCACTCCTCTTCCTTCCTTCACTACTGTTGCCAGTGAGCCGCCAGTTAAGCTTGTG 1110
Query 1018 CCACCCCCTGTAGAGTCTGTGTCCCAAGCTACCATTGTCATGATGCCTGCGCTGCCAGCACCATCCTCTGCTCC 1091
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1111 CCACCCCCTGTAGAGTCTGTGTCCCAGGCTACCATTGTCATGATGCCCGCGCTGCCAGCACCATCCTCTGCTGC 1184
Query 1092 GGCTGTCTCCACTACTGAAAGTGTAGCTCCAGTGAGTCAACCCGACAACTGTGTTCCCATGGAGGCTGTGGGGG 1165
|||||||||||||.|||||||||.||||||||||||.||.||.||...||||||.|||.||||.||||||||||
Sbjct 1185 GGCTGTCTCCACTTCTGAAAGTGGAGCTCCAGTGAGCCAGCCTGAGCCCTGTGTACCCCTGGAAGCTGTGGGGG 1258
Query 1166 ATCCACATACTGTGACTGTTTCCATGGACAGCAGTGAAATATCCATGATCATCAATTCTATCAAAGAAGAGTGT 1239
||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1259 ATCCACATACTGTGACTGTTTCCATGGATAGCAATGAAATCTCCATGATCATTAATTCCATCAAAGAAGAGTGT 1332
Query 1240 TTTCGATCAGGGGTAGCAGAGGCTCCTGTTGGATCAAAGGCTCCCAGCATAGATGGGAAGGAAGAATTAGATCT 1313
||.||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1333 TTCCGCTCAGGGGTAGCAGAGGCTCCTGGTGGATCAAAGGCTCCAAGCATAGATGGGAAGGAAGACTTGGATCT 1406
Query 1314 GGCTGAGAAGATGGATATTGCTGTGTCTTACACAGGTGAAGAGCTGGATTTTGAGACTGTTGGAGACATCATTG 1387
.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGCGGAGAAGATGGATATTGCTGTGTCTTACACAGGTGAAGAGTTGGACTTTGAAACAGTTGGAGACATCATTG 1480
Query 1388 CCATCATTGAGGACAAGGTAGATGATCATCCTGAAGTGCTGGATGTGGCAGCAGTGGAAGCAGCACTGTCATTT 1461
|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||..|.||.||.
Sbjct 1481 CCATCATTGAGGACAAGGTGGATGATCACCCTGAAGTGCTGGATGTGGCAGCGGTAGAAGCGGCGTTATCGTTC 1554
Query 1462 TGTGAAGAAAATGATGATCCTCAGTCCCTGCCTGGCCCCTGGGAGCATCCTATCCAGCAGGAGCGGGACAAGCC 1535
||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1555 TGTGAAGAGAATGATGACCCTCAGTCCCTGCCTGGCCCCTGGGAGCACCCTATCCAGCAGGAGCGCGACAAGCC 1628
Query 1536 AGTACCTCTCCCTGCACCAGAAATGACGGTCAAGCAAGAGAGACTGGACTTTGAGGAAACGGAAAACAAGGGAA 1609
|||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||.|.||||||||.||..
Sbjct 1629 AGTACCTCTGCCAGCACCAGAGATGACAGTCAAACAAGAGAGGCTAGACTTCGAGGAATCAGAAAACAAAGGGC 1702
Query 1610 TACATGAACTGGTGGACATCAGGGAGCCCAGTGCAGAGATCAAGGTGGAACCTGCAGAACCAGAGCCAGTCATT 1683
|.|||||.|||||||||||||||||..||.|||..|||||.|||||||||||..||||.||||||||||.|||.
Sbjct 1703 TCCATGACCTGGTGGACATCAGGGATTCCGGTGTTGAGATTAAGGTGGAACCCACAGAGCCAGAGCCAGGCATG 1776
Query 1684 TCAGGAGCCGAAATAGTAGCTGGAGTTGTTCCAGCCACAAGTATGGAGCCACCAGAACTCAGGAGTCAGGACTT 1757
||.||.||.||.||||||||||||||||.|||||...|||||||||||||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct 1777 TCTGGGGCTGAGATAGTAGCTGGAGTTGGTCCAGTTCCAAGTATGGAGCCACCAGAACTCAGGAGTCAAGACTC 1850
Query 1758 AGATGAGGAACTGGGAAGTACTGCAGCTGGAGAGATTGTTGAAGCAGATGTTGCCATTGGGAAAGGCGATGAGA 1831
||||||.||||...|||||.|||||||||||||.||||.|||.|||||||.|.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 1851 AGATGAAGAACCTAGAAGTTCTGCAGCTGGAGACATTGGTGAGGCAGATGGTTCCAGTGGGAAAGGCGATGAGA 1924
Query 1832 CTCCACTTACAAATGTGAAGACAGAGGCATCCCCTGAAAGCATGTTGTCTCCATCACATGGCTCAAATCCCATT 1905
..||||||.||..||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 1925 GGCCACTTTCAGCTGTGAAGACAGAGGCATCCCCTGAGAGCATGTTGTCTCCATCACATGGCTCAAATCTTATT 1998
Query 1906 GAAGATCCTTTAGAGGCAGAGACTCAGCACAAGTTTGAAATGTCAGACTCATTGAAAGAAGAATCAGGGACTAT 1979
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GAAGATCCTTTAGAGGCAGAGACTCAACACAAGTTTGAAATGTCAGACTCATTGAAAGAAGAATCAGGGACTAT 2072
Query 1980 TTTTGGAAGCCAGATAAAGGATGCCCCAGGTGAGGATGAGGAGGAAGATGGTGTCAGTGAAGCGGCCAGCCTAG 2053
||||||||||||||||||||.| ||| ||.|..|.||| ||
Sbjct 2073 TTTTGGAAGCCAGATAAAGGGT----CAG----------------AGTTCCTTTCA----------------AG 2110
Query 2054 AGGAGCCTAAGGAAGAGGATCAAGGAGAAGGCTACTTGTCAGAAATGGATAATGAACCTCCTGTGAGCGAGAGT 2127
|| |||||.||| |||| || ||.| ||||.
Sbjct 2111 AG------------------CAAGGGGAA-----------AGAA--GG--AACG--CCTCT------------- 2136
Query 2128 GATGATGGCTTCAGCATACACAATGCTACACTGCAGTCACACACACTGGCAGACTCCATCCCCAGCAGCCCTGC 2201
Sbjct 2137 -------------------------------------------------------------------------- 2136
Query 2202 TTCTTCACAGTTCTCTGTCTGTAGTGAGGATCAGGAAGCTATTCAGGCACAGAAAATTTGGAAGAAAGCCATCA 2275
Sbjct 2137 -------------------------------------------------------------------------- 2136
Query 2276 TGCTTGTATGGAGAGCTGCAGCTAATCATAGGTATGCCAATGTCTTCCTGCAGCCTGTTACAGATGACATAGCA 2349
Sbjct 2137 -------------------------------------------------------------------------- 2136
Query 2350 CCTGGCTACCACAGCATTGTGCAGAGGCCTATGGATTTGTCAACTATTAAGAAAAACATAGAAAATGGACTGAT 2423
Sbjct 2137 -------------------------------------------------------------------------- 2136
Query 2424 CCGAAGCACAGCTGAATTTCAGCGTGACATTATGCTGATGTTTCAGAATGCTGTAATGTACAATAGCTCAGACC 2497
Sbjct 2137 -------------------------------------------------------------------------- 2136
Query 2498 ATGATGTCTATCACATGGCAGTGGAGATGCAGCGAGATGTCTTGGAACAGATCCAGCAATTCTTGGCCACGCAG 2571
Sbjct 2137 -------------------------------------------------------------------------- 2136
Query 2572 TTGATTATGCAAACATCCGAGTCTGGGATCAGTGCTAAAAGTCTTCGAGGGAGAGATTCTACCCGCAAACAGGA 2645
Sbjct 2137 -------------------------------------------------------------------------- 2136
Query 2646 TGCTTCAGAGAAGGACAGTGTCCCAATGGGCTCTCCTGCCTTCCTTCTCTCTCTCTTTGATGGAGGAACCAGGG 2719
Sbjct 2137 -------------------------------------------------------------------------- 2136
Query 2720 GACGCCGCTGTGCCATTGAAGCAGATATGAAGATGAAAAAG 2760
Sbjct 2137 ----------------------------------------- 2136