Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000472489
- Subject:
- XM_011247042.1
- Aligned Length:
- 2805
- Identities:
- 2307
- Gaps:
- 264
Alignment
Query 1 ----------------------------------------ATGAGAAGTGGCGATCAAAA-----TTGGGTATC 29
|||||.|||||.|||||.|| |.|||||||
Sbjct 1 ATGGTCCATCCGAGAGAAGTTGTGTTTAGCATCTTCTGTCATGAGGAGTGGGGATCAGAACTGGTTAGGGTATC 74
Query 30 AGTTAGCAGAGCAATCAAGCCCTTTGCAGAACCTGGCCGCCCTCCAGACTGGTTCTCTCAAAAACATTGTGCTT 103
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGTTAGCAGAGCAATCAAGCCCTTTGCAGAACCTGGCCGGCCTCCAGACTGGTTCTCTCAAAAACATTGTGCTT 148
Query 104 CCCAGTACTCGGAGCTTTTAGAGACCACTGAGACACCAAAACGGAAACGAGGTGAAAAGGGAGAAGTGGTGGAA 177
|.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 149 CTCAGTATTCTGAGCTCTTAGAGACTACTGAGACTCCAAAACGGAAACGGGGTGAAAAAGGAGAAGTGGTAGAA 222
Query 178 ACTGTTGAAGATGTTATTGTTCGGAAATTGACTGCTGAGCGAGTTGAAGAACTAAAGAAAGTGATAAAGGAAAC 251
|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 223 ACTGTTGAAGATGTTATTGTTCGCAAACTGACTGCTGAGAGAGTTGAAGAACTGAAGAAAGTCATAAAGGAGAC 296
Query 252 CCAGGAGAGATATAGACGGCTAAAGAGAGATGCAGAACTAATTCAAGCTGGACACATGGACAGCAGACTGGATG 325
.|||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACAGGAGAGATACAGGCGTCTGAAAAGAGATGCAGAACTAATCCAAGCCGGGCACATGGACAGCAGACTGGATG 370
Query 326 AGCTTTGCAATGACATTGCAACGAAAAAGAAATTGGAAGAAGAGGAGGCTGAAGTAAAGAGGAAGGCTACAGAT 399
||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 371 AGCTCTGCAATGACATTGCAATGAAAAAGAAATTGGAAGAGGAAGAGGCTGAAGTAAAAAGGAAGGCCACCGAT 444
Query 400 GCTGCATACCAGGCTCGTCAAGCAGTAAAAACACCCCCCCGGAGGTTACCCACTGTGATGGTTCGCTCTCCTAT 473
|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||.|
Sbjct 445 GCTGCGTACCAGGCGCGACAAGCAGTGAAAACGCCTCCTCGAAGGTTACCGACTGTGATGGTCCGCTCTCCTGT 518
Query 474 AGATTCTGCCTCCCCAGGAGGTGATTATCCACTTGGGGACTTGACTCCAACCACTATGGAAGAGGCTACCTCTG 547
|||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGACTCTGCCTCCCCAGGAGGTGATTACCCACTTGGAGACTTGACTCCAACCACTATGGAAGAGGCTACCTCTG 592
Query 548 GGGTAACCCCCGGGACTTTGCCGAGTACCCCAGTCACCTCGTTTCCTGGGATTCCTGACACCCTTCCTCCAGGC 621
|
Sbjct 593 G------------------------------------------------------------------------- 593
Query 622 TCTGCACCCTTAGAAGCCCCCATGACCCCAGTAACAGATGATTCACCCCAGAAAAAGATGCTTGGACAGAAAGC 695
Sbjct 594 -------------------------------------------------------------------------- 593
Query 696 AACTCCACCCCCCTCCCCTCTGCTGTCAGAGCTCTTGAAGAAGGGCAGCCTCCTGCCTACTAGCCCCAGACTGG 769
||
Sbjct 594 ------------------------------------------------------------------------GG 595
Query 770 TCAATGAGAGTGAAATGGCTGTGGCTTCTGGCCACCTGAACAGTACAGGTGTCCTCCTGGAGGTAGGCGGGGTC 843
|.|||||||||||||||.||||..|..|||||||.||||||||.|||||.||.|||.||||||||||.|||||.
Sbjct 596 TGAATGAGAGTGAAATGCCTGTACCCCCTGGCCATCTGAACAGCACAGGGGTTCTCTTGGAGGTAGGAGGGGTT 669
Query 844 CTTCCCATGATACATGGTGGGGAGATACAGCAAACACCCAATACTGTTGCAGCCTCCCCTGCTGCATCAGGTGC 917
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||.|.||||.||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 670 CTTCCCATGATACATGGTGGGGAGATACAGCCAACAACCAGTGCTGTGGCGGCCTCCCCGGCTGCCTCAGGTGC 743
Query 918 TCCCACTCTTTCCCGGCTTTTAGAAGCTGGTCCTACACAGTTCACCACACCTCTTGCTTCCTTCACTACTGTTG 991
||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 744 TCCCACTCTTTCCCGGCTTTTAGAAGCTGGGCCCACACAGTTCACCACTCCTCTTCCTTCCTTCACTACTGTTG 817
Query 992 CCAGTGAGCCTCCAGTTAAACTTGTGCCACCCCCTGTAGAGTCTGTGTCCCAAGCTACCATTGTCATGATGCCT 1065
||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 818 CCAGTGAGCCGCCAGTTAAGCTTGTGCCACCCCCTGTAGAGTCTGTGTCCCAGGCTACCATTGTCATGATGCCC 891
Query 1066 GCGCTGCCAGCACCATCCTCTGCTCCGGCTGTCTCCACTACTGAAAGTGTAGCTCCAGTGAGTCAACCCGACAA 1139
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||.||.||.||...
Sbjct 892 GCGCTGCCAGCACCATCCTCTGCTGCGGCTGTCTCCACTTCTGAAAGTGGAGCTCCAGTGAGCCAGCCTGAGCC 965
Query 1140 CTGTGTTCCCATGGAGGCTGTGGGGGATCCACATACTGTGACTGTTTCCATGGACAGCAGTGAAATATCCATGA 1213
||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||||
Sbjct 966 CTGTGTACCCCTGGAAGCTGTGGGGGATCCACATACTGTGACTGTTTCCATGGATAGCAATGAAATCTCCATGA 1039
Query 1214 TCATCAATTCTATCAAAGAAGAGTGTTTTCGATCAGGGGTAGCAGAGGCTCCTGTTGGATCAAAGGCTCCCAGC 1287
||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||
Sbjct 1040 TCATTAATTCCATCAAAGAAGAGTGTTTCCGCTCAGGGGTAGCAGAGGCTCCTGGTGGATCAAAGGCTCCAAGC 1113
Query 1288 ATAGATGGGAAGGAAGAATTAGATCTGGCTGAGAAGATGGATATTGCTGTGTCTTACACAGGTGAAGAGCTGGA 1361
|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1114 ATAGATGGGAAGGAAGACTTGGATCTAGCGGAGAAGATGGATATTGCTGTGTCTTACACAGGTGAAGAGTTGGA 1187
Query 1362 TTTTGAGACTGTTGGAGACATCATTGCCATCATTGAGGACAAGGTAGATGATCATCCTGAAGTGCTGGATGTGG 1435
.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1188 CTTTGAAACAGTTGGAGACATCATTGCCATCATTGAGGACAAGGTGGATGATCACCCTGAAGTGCTGGATGTGG 1261
Query 1436 CAGCAGTGGAAGCAGCACTGTCATTTTGTGAAGAAAATGATGATCCTCAGTCCCTGCCTGGCCCCTGGGAGCAT 1509
||||.||.|||||.||..|.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1262 CAGCGGTAGAAGCGGCGTTATCGTTCTGTGAAGAGAATGATGACCCTCAGTCCCTGCCTGGCCCCTGGGAGCAC 1335
Query 1510 CCTATCCAGCAGGAGCGGGACAAGCCAGTACCTCTCCCTGCACCAGAAATGACGGTCAAGCAAGAGAGACTGGA 1583
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||
Sbjct 1336 CCTATCCAGCAGGAGCGCGACAAGCCAGTACCTCTGCCAGCACCAGAGATGACAGTCAAACAAGAGAGGCTAGA 1409
Query 1584 CTTTGAGGAAACGGAAAACAAGGGAATACATGAACTGGTGGACATCAGGGAGCCCAGTGCAGAGATCAAGGTGG 1657
|||.||||||.|.||||||||.||..|.|||||.|||||||||||||||||..||.|||..|||||.|||||||
Sbjct 1410 CTTCGAGGAATCAGAAAACAAAGGGCTCCATGACCTGGTGGACATCAGGGATTCCGGTGTTGAGATTAAGGTGG 1483
Query 1658 AACCTGCAGAACCAGAGCCAGTCATTTCAGGAGCCGAAATAGTAGCTGGAGTTGTTCCAGCCACAAGTATGGAG 1731
||||..||||.||||||||||.|||.||.||.||.||.||||||||||||||||.|||||...|||||||||||
Sbjct 1484 AACCCACAGAGCCAGAGCCAGGCATGTCTGGGGCTGAGATAGTAGCTGGAGTTGGTCCAGTTCCAAGTATGGAG 1557
Query 1732 CCACCAGAACTCAGGAGTCAGGACTTAGATGAGGAACTGGGAAGTACTGCAGCTGGAGAGATTGTTGAAGCAGA 1805
||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||...|||||.|||||||||||||.||||.|||.|||||
Sbjct 1558 CCACCAGAACTCAGGAGTCAAGACTCAGATGAAGAACCTAGAAGTTCTGCAGCTGGAGACATTGGTGAGGCAGA 1631
Query 1806 TGTTGCCATTGGGAAAGGCGATGAGACTCCACTTACAAATGTGAAGACAGAGGCATCCCCTGAAAGCATGTTGT 1879
||.|.|||.|||||||||||||||||..||||||.||..||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1632 TGGTTCCAGTGGGAAAGGCGATGAGAGGCCACTTTCAGCTGTGAAGACAGAGGCATCCCCTGAGAGCATGTTGT 1705
Query 1880 CTCCATCACATGGCTCAAATCCCATTGAAGATCCTTTAGAGGCAGAGACTCAGCACAAGTTTGAAATGTCAGAC 1953
|||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1706 CTCCATCACATGGCTCAAATCTTATTGAAGATCCTTTAGAGGCAGAGACTCAACACAAGTTTGAAATGTCAGAC 1779
Query 1954 TCATTGAAAGAAGAATCAGGGACTATTTTTGGAAGCCAGATAAAGGATGCCCCAGGTGAGGATGAGGAGGAAGA 2027
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1780 TCATTGAAAGAAGAATCAGGGACTATTTTTGGAAGCCAGATAAAGGATGCCCCAGGTGACGATGAGGAAGAAGA 1853
Query 2028 TGGTGTCAGTGAAGCGGCCAGCCTAGAGGAGCCTAAGGAAGAGGATCAAGGAGAAGGCTACTTGTCAGAAATGG 2101
|||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1854 TGGAGTCAGTGAAGCAGCTAGCCTAGAGGAGCCTAAGGAAGAGGATCAAGGAGAAGGCTATTTGTCTGAGATGG 1927
Query 2102 ATAATGAACCTCCTGTGAGCGAGAGTGATGATGGCTTCAGCATACACAATGCTACACTGCAGTCACACACACTG 2175
|||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1928 ATAATGAGCCCCCTGTGAGTGAGAGTGATGATGGCTTTAGTATACATAACGCCACACTGCAGTCACACACTCTG 2001
Query 2176 GCAGACTCCATCCCCAGCAGCCCTGCTTCTTCACAGTTCTCTGTCTGTAGTGAGGATCAGGAAGCTATTCAGGC 2249
||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 2002 GCAGACTCCATCCCAAGCAGCCCTGCCTCCTCCCAGTTTTCCGTGTGCAGTGAAGATCAAGAAGCAATTCAGGC 2075
Query 2250 ACAGAAAATTTGGAAGAAAGCCATCATGCTTGTATGGAGAGCTGCAGCTAATCATAGGTATGCCAATGTCTTCC 2323
.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2076 TCAGAAAATATGGAAGAAAGCCATCATGCTTGTATGGAGGGCTGCAGCAAATCATAGGTATGCCAATGTGTTCC 2149
Query 2324 TGCAGCCTGTTACAGATGACATAGCACCTGGCTACCACAGCATTGTGCAGAGGCCTATGGATTTGTCAACTATT 2397
||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2150 TGCAACCTGTTACAGATGACATAGCTCCTGGTTACCATAGCATTGTACAGAGGCCTATGGATTTGTCAACTATA 2223
Query 2398 AAGAAAAACATAGAAAATGGACTGATCCGAAGCACAGCTGAATTTCAGCGTGACATTATGCTGATGTTTCAGAA 2471
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2224 AAGAAAAACATTGAAAATGGACTGATCCGAAGCACAGCTGAGTTTCAGCGTGACATCATGCTGATGTTTCAGAA 2297
Query 2472 TGCTGTAATGTACAATAGCTCAGACCATGATGTCTATCACATGGCAGTGGAGATGCAGCGAGATGTCTTGGAAC 2545
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2298 TGCTGTTATGTACAATAGCTCAGACCATGATGTCTATCACATGGCAGTAGAGATGCAGAGAGATGTCTTGGAAC 2371
Query 2546 AGATCCAGCAATTCTTGGCCACGCAGTTGATTATGCAAACATCCGAGTCTGGGATCAGTGCTAAAAGTCTTCGA 2619
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 2372 AGATCCAGCAATTCTTGGCCACACAGTTGATTATGCAAACATCTGAGTCTGGAATCAGTGCTAAAAGTCTCCGG 2445
Query 2620 GGGAGAGATTCTACCCGCAAACAGGATGCTTCAGAGAAGGACAGTGTCCCAATGGGCTCTCCTGCCTTCCTTCT 2693
||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2446 GGGAGAGACTCTACCCGAAAACAAGATGCTTCAGAGAAGGACAGTGTCCCCATGGGCTCTCCTGCCTTCCTTCT 2519
Query 2694 CTCTCTCTTTGATGGAGGAACCAGGGGACGCCGCTGTGCCATTGAAGCAGATATGAAGATGAAAAAG 2760
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2520 CTCTCTCTTTGATGGGGGAACCAGGGGACGCCGCTGTGCCATTGAAGCAGATATGAAGATGAAGAAG 2586