Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472530
• Subject: XM_006506708.3
• Aligned Length: 2145
• Identities: 1744
• Gaps: 120

Alignment

Query    1  ------------------------------ATGG------CGGCAGCTACGGGGGATCCTGGACTCTCTAAACT  38
                                          .|||      |.|.|||.|.||||||.||||||||..|.||..|
Sbjct    1  ATGCAGGGTGGGTGGGGGCAAGAGATCAGGCTGGTAAGAACAGTAGCCATGGGGGACCCTGGACTGGCCAAGTT  74

Query   39  GCAGTTTGCCCCTTTTAGTAGTGCCTTGGATGTTGGGTTTTGGCATGAGTTGACCCAGAAGAAGCTGAACGAGT  112
            ||||||.|||||.||||.|||||||.||||.|||||.||.|||||.||..||||||||||||||.|||||||||
Sbjct   75  GCAGTTCGCCCCCTTTAATAGTGCCCTGGACGTTGGCTTCTGGCACGAACTGACCCAGAAGAAGTTGAACGAGT  148

Query  113  ATCGGCTGGATGAAGCTCCCAAGGACATTAAGGGTTATTACTACAATGGTGACTCTGCTGGGCTGCCAGCTCGC  186
            |.||.|||||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.|||
Sbjct  149  ACCGCCTGGACGAGGCACCCAAAGACATCAAGGGCTATTACTACAATGGTGACTCTGCTGGTCTGCCCACCCGC  222

Query  187  TTAACATTGGAGTTCAGTGCTTTTGACATGAGTGCTCCCACCCCAGCCCGTTGCTGCCCAGCTATTGGAACACT  260
            ||.||.|||||||||||||||||||||||||||||..||||.||.||||..||||||||.||.||.|||||.||
Sbjct  223  TTGACGTTGGAGTTCAGTGCTTTTGACATGAGTGCCTCCACGCCTGCCCACTGCTGCCCGGCCATGGGAACCCT  296

Query  261  GTATAACACCAACACACTCGAGTCTTTCAAGACTGCAGATAAGAAGCTCCTTTTGGAACAAGCAGCAAATGAGA  334
            |.|.||||||||||||||.|||.||||.|||||.|||||.||||||||||||.||||.||..||||||||||||
Sbjct  297  GCACAACACCAACACACTTGAGGCTTTTAAGACAGCAGACAAGAAGCTCCTTCTGGAGCAGTCAGCAAATGAGA  370

Query  335  TATGGGAATCCATAAAATCAGGCACTGCTCTTGAAAACCCTGTACTCCTCAACAAGTTCCTCCTCTTGACATTT  408
            |.||||||.|||||||.|||||..|||||||.||||||||..|.||||||||||||||.||.|||.||||.||.
Sbjct  371  TCTGGGAAGCCATAAAGTCAGGTGCTGCTCTCGAAAACCCCATGCTCCTCAACAAGTTTCTGCTCCTGACCTTC  444

Query  409  GCAGATCTAAAGAAGTACCACTTCTACTATTGGTTTTGCTATCCTGCCCTCTGTCTTCCAGAGAGTTTACCTCT  482
            ||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||..||.||||||||||||||.|||||..|.|||||
Sbjct  445  GCGGACCTAAAGAAGTACCACTTCTACTACTGGTTTTGCTGCCCCGCCCTCTGTCTTCCTGAGAGCATCCCTCT  518

Query  483  CATTCAGGGGCCAGTGGGTTTGGATCAAAGGTTTTCACTAAAACAGATTGAAGCACTAGAGTGTGCATATGATA  556
            .||.|.|||.||.|||.|.||||||||||||.||||||.|||||||||..|.||.||.|||..|||.||||||.
Sbjct  519  AATCCGGGGACCTGTGAGCTTGGATCAAAGGCTTTCACCAAAACAGATCCAGGCCCTGGAGCATGCCTATGATG  592

Query  557  ATCTTTGTCAAACAGAAGGAGTCACAGCTCTTCCTTACTTCTTAATCAAGTATGATGAGAACATGGTGCTGGTT  630
            ||||.||||.|.|.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||.|||||||.|||||..|||..||.|||||.
Sbjct  593  ATCTGTGTCGAGCCGAAGGCGTCACGGCCCTGCCCTACTTCTTATTCAAGTACGATGACGACACTGTTCTGGTC  666

Query  631  TCCTTGCTTAAACACTACAGTGATTTCTTCCAAGGTCAAAGGACGAAGATAACAATTGGTGTATATGATCCCTG  704
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||.||||||||
Sbjct  667  TCCTTGCTCAAACACTACAGTGATTTCTTCCAAGGTCAAAGGACAAAGATAACAGTTGGTGTGTACGATCCCTG  740

Query  705  TAACTTAGCCCAGTACCCTGGATGGCCTTTGAGGAATTTTTTGGTCCTAGCAGCCCACAGATGGAGTAGCAGTT  778
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..||||||
Sbjct  741  TAACCTAGCCCAGTACCCTGGATGGCCTTTGAGGAATTTTTTGGTCCTGGCAGCCCACAGATGGAGCGGCAGTT  814

Query  779  TCCAGTCTGTTGAAGTTGTTTGCTTCCGTGACCGTACCATGCAGGGGGCGAGAGACGTTGCCCACAGCATCATC  852
            |||||||.||||||||..|.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||..|.||.|||||||||
Sbjct  815  TCCAGTCCGTTGAAGTCCTCTGCTTTCGGGACCGCACCATGCAGGGAGCTAGAGACGTGACACATAGCATCATC  888

Query  853  TTCGAAGTGAAGCTTCCAGAAATGGCATTTAGCCCAGATTGTCCTAAAGCAGTTGGATGGGAAAAGAACCAGAA  926
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  889  TTTGAAGTGAAACTTCCAGAAATGGCATTTAGCCCAGATTGTCCTAAAGCTGTTGGCTGGGAGAAGAACCAGAA  962

Query  927  AGGAGGCATGGGACCAAGGATGGTGAACCTCAGTGAATGTATGGACCCTAAAAGGTTAGCTGAGTCATCAGTGG  1000
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||.|.|||||||||||.||||
Sbjct  963  AGGAGGCATGGGTCCGAGGATGGTGAACCTCAGTGGATGTATGGACCCCAAAAGGCTGGCTGAGTCATCTGTGG  1036

Query 1001  ATCTAAATCTCAAACTGATGTGTTGGAGATTGGTTCCTACTTTAGACTTGGACAAGGTTGTGTCTGTCAAATGT  1074
            ||||.||||||||.||||||||.|||.|||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1037  ATCTGAATCTCAAGCTGATGTGCTGGCGATTGGTCCCCACCTTGGACTTGGACAAGGTCGTGTCTGTCAAGTGC  1110

Query 1075  CTGCTGCTTGGAGCCGGCACCTTGGGTTGCAATGTAGCTAGGACGTTGATGGGTTGGGGCGTGAGACACATCAC  1148
            ||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||..|||||||.||||||||.|||||..||||
Sbjct 1111  CTGCTGCTGGGAGCTGGTACCTTGGGGTGTAATGTGGCTAGGACACTGATGGGCTGGGGCGTCAGACATGTCAC  1184

Query 1149  ATTTGTGGACAATGCCAAGATCTCCTACTCCAATCCTGTGAGGCAGCCTCTCTATGAGTTTGAAGATTGCCTAG  1222
            .||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1185  CTTTGTGGATAACGCCAAGATCTCCTACTCCAATCCCGTGAGGCAGCCTCTGTATGAATTTGAAGATTGTCTAG  1258

Query 1223  GGGGTGGTAAGCCCAAGGCTCTGGCAGCAGCGGACCGGCTCCAGAAAATATTCCCCGGTGTGAATGCCAGAGGA  1296
            |||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 1259  GGGGTGGCAAGCCCAAGGCCCTGGCTGCAGCAGAGCGGCTACAGAAAATATTTCCCGGAGTGAATGCCAGAGGG  1332

Query 1297  TTCAACATGAGCATACCTATGCCTGGGCATCCAGTGAACTTCTCCAGTGTCACTCTGGAGCAAGCCCGCAGAGA  1370
            ||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||....|||||..|||||||.|||||||||||
Sbjct 1333  TTCAACATGAGCATCCCCATGCCAGGACACCCTGTGAACTTCTCTGACGTCACGATGGAGCAGGCCCGCAGAGA  1406

Query 1371  TGTGGAGCAACTGGAGCAGCTCATCGAAAGCCATGATGTCGTCTTCCTATTGATGGACACCAGGGAGAGCCGGT  1444
            |||||||||.||||||||||||||.||.|.||||||||||.|||||||..|.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGTGGAGCAGCTGGAGCAGCTCATTGATAACCATGATGTCATCTTCCTGCTAATGGACACCAGGGAGAGCCGGT  1480

Query 1445  GGCTTCCTGCCGTCATTGCTGCAAGCAAGAGAAAGCTGGTCATCAATGCTGCTTTGGGATTTGACACATTTGTT  1518
            ||||||||.|.||.|||||.||.||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1481  GGCTTCCTACTGTTATTGCAGCCAGCAAGCGAAAGCTGGTCATCAACGCTGCCTTGGGGTTTGATACCTTTGTT  1554

Query 1519  GTCATGAGACATGGTCTGAAGAAACCAAAGCAGCAAGGAGCTGGGGACTTGTGTCCAAACCACCCTGTGGCATC  1592
            ||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.|||.|.||.||||.|||.|.|||.|||.|
Sbjct 1555  GTCATGAGACATGGCCTGAAGAAACCCAAGCAGCAGGGAGCCGGAGACCTCTGCCCAAGCCATCTTGTAGCACC  1628

Query 1593  TGCTGACCTCCTGGGCTCATCGCTTTTTGCCAACATCCCTGGTTACAAGCTTGGCTGCTACTTCTGCAATGATG  1666
            ||||||   |||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGCTGA---CCTGGGCTCCTCACTTTTTGCCAACATCCCTGGATACAAGCTTGGCTGCTACTTCTGCAATGATG  1699

Query 1667  TGGTGGCCCCAGGAGATTCAACCAGAGACCGGACCTTGGACCAGCAGTGCACTGTGAGTCGTCCAGGACTGGCC  1740
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1700  TGGTGGCTCCAGGAGATTCAACCAGAGACCGGACTCTGGACCAGCAGTGCACAGTGAGCCGCCCAGGCCTGGCC  1773

Query 1741  GTGATTGCAGGAGCCCTGGCCGTGGAATTGATGGTATCTGTTTTGCAGCATCCAGAAGGGGGCTATGCCATTGC  1814
            |||||||||||.||||||||.|||||..|||||||.|||||..||||||||||.||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1774  GTGATTGCAGGTGCCCTGGCTGTGGAGCTGATGGTCTCTGTCCTGCAGCATCCTGAGGGGGGCTACGCCATCGC  1847

Query 1815  CAGCAGCAGTGACGATCGGATGAATGAGCCTCCAACCTCTCTTGGGCTTGTGCCTCACCAG-------------  1875
            ||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||             
Sbjct 1848  CAGCAGCAGTGATGACCGCATGAATGAGCCTCCCACCTCGCTGGGACTTGTGCCTCACCAGATCCGGGGTTTTC  1921

Query 1876  --------------------------------------------------------------------GTTCTT  1881
                                                                                ||||||
Sbjct 1922  TGTCACGGTTCGATAATGTTCTTCCTGTCAGCCTGGCATTTGATAAATGTACAGCCTGTTCACCCAAAGTTCTT  1995

Query 1882  GATCAATATGAACGAGAAGGATTTAACTTCCTAGCCAAGGTGTTTAATTCTTCACATTCCTTCTTAGAAGACTT  1955
            |||||.||.||.|||||||||||.|.|||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996  GATCAGTACGAGCGAGAAGGATTCACCTTCCTAGCGAAGGTTTTTAACTCCTCACATTCCTTCTTAGAAGACTT  2069

Query 1956  GACTGGTCTTACATTGCTGCATCAAGAAACCCAAGCTGCTGAGATCTGGGACATGAGCGATGATGAGACCATC  2028
            |||.||||||||..||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||..||
Sbjct 2070  GACCGGTCTTACCCTGCTCCATCAAGAGACCCAAGCTGCTGAGATCTGGGACATGAGTGACGAGGAGACTGTC  2142