Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472530
• Subject: XM_006506710.3
• Aligned Length: 2109
• Identities: 1736
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  ATGGCGGCAGCTACGGGGGATCCTGGACTCTCTAAACTGCAGTTTGCCCCTTTTAGTAGTGCCTTGGATGTTGG  74
                        |.||||||.||||||||..|.||..|||||||.|||||.||||.|||||||.||||.|||||
Sbjct    1  ------------ATGGGGGACCCTGGACTGGCCAAGTTGCAGTTCGCCCCCTTTAATAGTGCCCTGGACGTTGG  62

Query   75  GTTTTGGCATGAGTTGACCCAGAAGAAGCTGAACGAGTATCGGCTGGATGAAGCTCCCAAGGACATTAAGGGTT  148
            .||.|||||.||..||||||||||||||.||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct   63  CTTCTGGCACGAACTGACCCAGAAGAAGTTGAACGAGTACCGCCTGGACGAGGCACCCAAAGACATCAAGGGCT  136

Query  149  ATTACTACAATGGTGACTCTGCTGGGCTGCCAGCTCGCTTAACATTGGAGTTCAGTGCTTTTGACATGAGTGCT  222
            |||||||||||||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  137  ATTACTACAATGGTGACTCTGCTGGTCTGCCCACCCGCTTGACGTTGGAGTTCAGTGCTTTTGACATGAGTGCC  210

Query  223  CCCACCCCAGCCCGTTGCTGCCCAGCTATTGGAACACTGTATAACACCAACACACTCGAGTCTTTCAAGACTGC  296
            .||||.||.||||..||||||||.||.||.|||||.|||.|.||||||||||||||.|||.||||.|||||.||
Sbjct  211  TCCACGCCTGCCCACTGCTGCCCGGCCATGGGAACCCTGCACAACACCAACACACTTGAGGCTTTTAAGACAGC  284

Query  297  AGATAAGAAGCTCCTTTTGGAACAAGCAGCAAATGAGATATGGGAATCCATAAAATCAGGCACTGCTCTTGAAA  370
            |||.||||||||||||.||||.||..|||||||||||||.||||||.|||||||.|||||..|||||||.||||
Sbjct  285  AGACAAGAAGCTCCTTCTGGAGCAGTCAGCAAATGAGATCTGGGAAGCCATAAAGTCAGGTGCTGCTCTCGAAA  358

Query  371  ACCCTGTACTCCTCAACAAGTTCCTCCTCTTGACATTTGCAGATCTAAAGAAGTACCACTTCTACTATTGGTTT  444
            ||||..|.||||||||||||||.||.|||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  359  ACCCCATGCTCCTCAACAAGTTTCTGCTCCTGACCTTCGCGGACCTAAAGAAGTACCACTTCTACTACTGGTTT  432

Query  445  TGCTATCCTGCCCTCTGTCTTCCAGAGAGTTTACCTCTCATTCAGGGGCCAGTGGGTTTGGATCAAAGGTTTTC  518
            ||||..||.||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.|.|||.||.|||.|.||||||||||||.||||
Sbjct  433  TGCTGCCCCGCCCTCTGTCTTCCTGAGAGCATCCCTCTAATCCGGGGACCTGTGAGCTTGGATCAAAGGCTTTC  506

Query  519  ACTAAAACAGATTGAAGCACTAGAGTGTGCATATGATAATCTTTGTCAAACAGAAGGAGTCACAGCTCTTCCTT  592
            ||.|||||||||..|.||.||.|||..|||.||||||.||||.||||.|.|.|||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct  507  ACCAAAACAGATCCAGGCCCTGGAGCATGCCTATGATGATCTGTGTCGAGCCGAAGGCGTCACGGCCCTGCCCT  580

Query  593  ACTTCTTAATCAAGTATGATGAGAACATGGTGCTGGTTTCCTTGCTTAAACACTACAGTGATTTCTTCCAAGGT  666
            ||||||||.|||||||.|||||..|||..||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  581  ACTTCTTATTCAAGTACGATGACGACACTGTTCTGGTCTCCTTGCTCAAACACTACAGTGATTTCTTCCAAGGT  654

Query  667  CAAAGGACGAAGATAACAATTGGTGTATATGATCCCTGTAACTTAGCCCAGTACCCTGGATGGCCTTTGAGGAA  740
            ||||||||.|||||||||.|||||||.||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  655  CAAAGGACAAAGATAACAGTTGGTGTGTACGATCCCTGTAACCTAGCCCAGTACCCTGGATGGCCTTTGAGGAA  728

Query  741  TTTTTTGGTCCTAGCAGCCCACAGATGGAGTAGCAGTTTCCAGTCTGTTGAAGTTGTTTGCTTCCGTGACCGTA  814
            ||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||.||||||||..|.|||||.||.|||||.|
Sbjct  729  TTTTTTGGTCCTGGCAGCCCACAGATGGAGCGGCAGTTTCCAGTCCGTTGAAGTCCTCTGCTTTCGGGACCGCA  802

Query  815  CCATGCAGGGGGCGAGAGACGTTGCCCACAGCATCATCTTCGAAGTGAAGCTTCCAGAAATGGCATTTAGCCCA  888
            ||||||||||.||.||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  803  CCATGCAGGGAGCTAGAGACGTGACACATAGCATCATCTTTGAAGTGAAACTTCCAGAAATGGCATTTAGCCCA  876

Query  889  GATTGTCCTAAAGCAGTTGGATGGGAAAAGAACCAGAAAGGAGGCATGGGACCAAGGATGGTGAACCTCAGTGA  962
            ||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||.
Sbjct  877  GATTGTCCTAAAGCTGTTGGCTGGGAGAAGAACCAGAAAGGAGGCATGGGTCCGAGGATGGTGAACCTCAGTGG  950

Query  963  ATGTATGGACCCTAAAAGGTTAGCTGAGTCATCAGTGGATCTAAATCTCAAACTGATGTGTTGGAGATTGGTTC  1036
            ||||||||||||.||||||.|.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||.|||||||.|
Sbjct  951  ATGTATGGACCCCAAAAGGCTGGCTGAGTCATCTGTGGATCTGAATCTCAAGCTGATGTGCTGGCGATTGGTCC  1024

Query 1037  CTACTTTAGACTTGGACAAGGTTGTGTCTGTCAAATGTCTGCTGCTTGGAGCCGGCACCTTGGGTTGCAATGTA  1110
            |.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.
Sbjct 1025  CCACCTTGGACTTGGACAAGGTCGTGTCTGTCAAGTGCCTGCTGCTGGGAGCTGGTACCTTGGGGTGTAATGTG  1098

Query 1111  GCTAGGACGTTGATGGGTTGGGGCGTGAGACACATCACATTTGTGGACAATGCCAAGATCTCCTACTCCAATCC  1184
            ||||||||..|||||||.||||||||.|||||..||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099  GCTAGGACACTGATGGGCTGGGGCGTCAGACATGTCACCTTTGTGGATAACGCCAAGATCTCCTACTCCAATCC  1172

Query 1185  TGTGAGGCAGCCTCTCTATGAGTTTGAAGATTGCCTAGGGGGTGGTAAGCCCAAGGCTCTGGCAGCAGCGGACC  1258
            .||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|
Sbjct 1173  CGTGAGGCAGCCTCTGTATGAATTTGAAGATTGTCTAGGGGGTGGCAAGCCCAAGGCCCTGGCTGCAGCAGAGC  1246

Query 1259  GGCTCCAGAAAATATTCCCCGGTGTGAATGCCAGAGGATTCAACATGAGCATACCTATGCCTGGGCATCCAGTG  1332
            ||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct 1247  GGCTACAGAAAATATTTCCCGGAGTGAATGCCAGAGGGTTCAACATGAGCATCCCCATGCCAGGACACCCTGTG  1320

Query 1333  AACTTCTCCAGTGTCACTCTGGAGCAAGCCCGCAGAGATGTGGAGCAACTGGAGCAGCTCATCGAAAGCCATGA  1406
            ||||||||....|||||..|||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|.||||||
Sbjct 1321  AACTTCTCTGACGTCACGATGGAGCAGGCCCGCAGAGATGTGGAGCAGCTGGAGCAGCTCATTGATAACCATGA  1394

Query 1407  TGTCGTCTTCCTATTGATGGACACCAGGGAGAGCCGGTGGCTTCCTGCCGTCATTGCTGCAAGCAAGAGAAAGC  1480
            ||||.|||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||.||.||||||.||||||
Sbjct 1395  TGTCATCTTCCTGCTAATGGACACCAGGGAGAGCCGGTGGCTTCCTACTGTTATTGCAGCCAGCAAGCGAAAGC  1468

Query 1481  TGGTCATCAATGCTGCTTTGGGATTTGACACATTTGTTGTCATGAGACATGGTCTGAAGAAACCAAAGCAGCAA  1554
            ||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1469  TGGTCATCAACGCTGCCTTGGGGTTTGATACCTTTGTTGTCATGAGACATGGCCTGAAGAAACCCAAGCAGCAG  1542

Query 1555  GGAGCTGGGGACTTGTGTCCAAACCACCCTGTGGCATCTGCTGACCTCCTGGGCTCATCGCTTTTTGCCAACAT  1628
            |||||.||.|||.|.||.||||.|||.|.|||.|||.|||||||   |||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1543  GGAGCCGGAGACCTCTGCCCAAGCCATCTTGTAGCACCTGCTGA---CCTGGGCTCCTCACTTTTTGCCAACAT  1613

Query 1629  CCCTGGTTACAAGCTTGGCTGCTACTTCTGCAATGATGTGGTGGCCCCAGGAGATTCAACCAGAGACCGGACCT  1702
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 1614  CCCTGGATACAAGCTTGGCTGCTACTTCTGCAATGATGTGGTGGCTCCAGGAGATTCAACCAGAGACCGGACTC  1687

Query 1703  TGGACCAGCAGTGCACTGTGAGTCGTCCAGGACTGGCCGTGATTGCAGGAGCCCTGGCCGTGGAATTGATGGTA  1776
            ||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||..|||||||.
Sbjct 1688  TGGACCAGCAGTGCACAGTGAGCCGCCCAGGCCTGGCCGTGATTGCAGGTGCCCTGGCTGTGGAGCTGATGGTC  1761

Query 1777  TCTGTTTTGCAGCATCCAGAAGGGGGCTATGCCATTGCCAGCAGCAGTGACGATCGGATGAATGAGCCTCCAAC  1850
            |||||..||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 1762  TCTGTCCTGCAGCATCCTGAGGGGGGCTACGCCATCGCCAGCAGCAGTGATGACCGCATGAATGAGCCTCCCAC  1835

Query 1851  CTCTCTTGGGCTTGTGCCTCACCAG-------------------------------------------------  1875
            |||.||.||.|||||||||||||||                                                 
Sbjct 1836  CTCGCTGGGACTTGTGCCTCACCAGATCCGGGGTTTTCTGTCACGGTTCGATAATGTTCTTCCTGTCAGCCTGG  1909

Query 1876  --------------------------------GTTCTTGATCAATATGAACGAGAAGGATTTAACTTCCTAGCC  1917
                                            |||||||||||.||.||.|||||||||||.|.|||||||||.
Sbjct 1910  CATTTGATAAATGTACAGCCTGTTCACCCAAAGTTCTTGATCAGTACGAGCGAGAAGGATTCACCTTCCTAGCG  1983

Query 1918  AAGGTGTTTAATTCTTCACATTCCTTCTTAGAAGACTTGACTGGTCTTACATTGCTGCATCAAGAAACCCAAGC  1991
            |||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||..||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1984  AAGGTTTTTAACTCCTCACATTCCTTCTTAGAAGACTTGACCGGTCTTACCCTGCTCCATCAAGAGACCCAAGC  2057

Query 1992  TGCTGAGATCTGGGACATGAGCGATGATGAGACCATC  2028
            |||||||||||||||||||||.||.||.|||||..||
Sbjct 2058  TGCTGAGATCTGGGACATGAGTGACGAGGAGACTGTC  2094