Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000472635
- Subject:
- NM_001290375.1
- Aligned Length:
- 1155
- Identities:
- 986
- Gaps:
- 69
Alignment
Query 1 ATGGCCCGGGAGAACGGCGAGAGCAGCTCCTCCTGGAAAAAGCAAGCTGAAGACATCAAGAAGATCTTCGAGTT 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCCGGGAGAACGGCGAGAGCAGCTCCTCCTGGAAAAAGCAAGCAGAAGACATTAAGAAGATCTTCGAGTT 74
Query 75 CAAAGAGACCCTCGGAACCGGGGCCTTTTCCGAAGTGGTTTTAGCTGAAGAGAAGGCAACTGGCAAGCTCTTTG 148
|||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.|
Sbjct 75 CAAGGAGACCCTCGGAACTGGGGCCTTTTCTGAAGTTGTTTTAGCCGAGGAGAAAGCTACTGGGAAGCTCTTCG 148
Query 149 CTGTGAAGTGTATCCCTAAGAAGGCGCTGAAGGGCAAGGAAAGCAGCATAGAGAATGAGATAGCCGTCCTGAGA 222
|.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct 149 CAGTGAAGTGCATCCCGAAGAAGGCGCTGAAGGGCAAGGAGAGCAGCATCGAGAACGAGATTGCCGTGCTTAGA 222
Query 223 AAGATTAAGCATGAAAATATTGTTGCCCTGGAAGACATTTATGAAAGCCCAAATCACCTGTACTTGGTCATGCA 296
|||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||
Sbjct 223 AAGATTAAGCATGAAAACATTGTTGCCTTGGAAGATATTTATGAAAGCCCAAATCACCTCTACCTGGTCATGCA 296
Query 297 GCTGGTGTCCGGTGGAGAGCTGTTTGACCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTATACAGAGAAGGATGCCAGCACTC 370
.||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 ACTTGTGTCTGGTGGAGAACTCTTCGATCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTACACAGAGAAAGATGCCAGCACTC 370
Query 371 TGATCCGCCAAGTCTTGGACGCCGTGTACTATCTCCACAGAATGGGCATCGTCCACAGAGACCTCAAGCCCGAA 444
|.||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 371 TCATCCGCCAGGTCCTGGATGCCGTATACTATCTCCACAGAATGGGCATTGTCCACAGGGACCTCAAGCCGGAG 444
Query 445 AATCTCTTGTACTACAGTCAAGATGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGATTGTCAAAAATGGAGGG 518
||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 445 AATCTCTTATACTACAGTCAAGACGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGCTTGTCGAAAATGGAGGG 518
Query 519 CAAAGGAGATGTGATGTCCACTGCCTGTGGAACTCCAGGCTATGTCGCTCCTGAAGTCCTCGCCCAGAAACCTT 592
|||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct 519 CAAAGGAGATGTGATGTCCACGGCCTGCGGGACCCCAGGCTATGTTGCTCCGGAAGTTCTCGCCCAGAAACCGT 592
Query 593 ACAGCAAAGCCGTTGACTGCTGGTCCATCGGAGTGATTGCCTACATCTTGCTCTGCGGCTACCCTCCTTTTTAT 666
||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 593 ACAGCAAAGCTGTGGACTGCTGGTCCATCGGGGTGATCGCCTATATCTTGCTCTGTGGTTACCCTCCTTTTTAT 666
Query 667 GATGAAAATGACTCCAAGCTCTTTGAGCAGATCCTCAAGGCGGAATATGAGTTTGACTCTCCCTACTGGGATGA 740
||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 667 GATGAAAATGACTCGAAGCTGTTTGAACAGATCCTCAAGGCAGAATATGAGTTTGATTCCCCCTACTGGGATGA 740
Query 741 CATCTCCGACTCTGCAAAAGACTTCATTCGGAACCTGATGGAGAAGGACCCGAATAAAAGATACACGTGTGAGC 814
|||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 741 CATCTCCGACTCTGCCAAAGACTTCATTCGGAATCTGATGGAGAAAGACCCAAATAAAAGATACACTTGTGAGC 814
Query 815 AGGCAGCTCGGCACCCATGGATCGCTGGTGACACAGCCCTCAACAAAAACATCCACGAGTCCGTCAGCGCCCAG 888
||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||.||.|||||.||||||
Sbjct 815 AGGCAGCTCGACACCCATGGATTGCTGGTGACACAGCCCTTAGCAAAAACATTCACGAATCTGTCAGTGCCCAG 888
Query 889 ATCCGGAAAAACTTTGCCAAGAGCAAATGGAGACAAGCATTTAATGCCACGGCCGTCGTGAGACATATGAGAAA 962
||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||.|.|.
Sbjct 889 ATCCGGAAGAATTTTGCAAAGAGCAAATGGAGACAAGCGTTTAACGCCACGGCAGTCGTGAGACATATGCGGAG 962
Query 963 ACTACACCTCGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAATGCAAGTGTTTCGAGCAGCCTCAGTTTGGCCAGCCAAAAAG 1036
.||.||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCTCCAGCTTGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAA----------------------------------------- 995
Query 1037 ACTGTCTGGCACCTTCCACGCTCTGTAGTTTCATTTCTTCTTCGTCGGGGGTCTCAGGAGTTGGAGCCGAGCGG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|||.||
Sbjct 996 --TGTCTGGCACCTTCCACGCTCTGTAGTTTCCTTTCTTCTTCGTCGGGGGTCGCAGGAGTCGGAGCTGAGAGG 1067
Query 1111 AGACCCAGGCCCACCACTGTGACGGCAGTGCACTCTGGAAGCAAG 1155
|||||||||||||||||||
Sbjct 1068 AGACCCAGGCCCACCACTG-------------------------- 1086