Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472635
• Subject: NM_001290376.1
• Aligned Length: 1168
• Identities: 997
• Gaps: 50

Alignment

Query    1  ATGGCCCGGGAGAACGGCGAGAG--------CAGCTCCTCCTGGAAAAAGCA-----AGCTGAAGACATCAAGA  61
                         |.|||| |||        ..|.||||.|| .|||...||     |||||.|.|.|      
Sbjct    1  -------------ATGGCG-GAGTTTGTGTCTTGGTCCTGCT-TAAATTTCAGATGGAGCTGGATAAA------  53

Query   62  AGATCTTCGAGTTCAAAGAGACCCTCGGAACCGGGGCCTTTTCCGAAGTGGTTTTAGCTGAAGAGAAGGCAACT  135
                    |.|||| .|||.||       |..|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct   54  --------GGGTTC-CAGAAAC-------AGTGGGGCCTTTTCTGAAGTTGTTTTAGCCGAGGAGAAAGCTACT  111

Query  136  GGCAAGCTCTTTGCTGTGAAGTGTATCCCTAAGAAGGCGCTGAAGGGCAAGGAAAGCAGCATAGAGAATGAGAT  209
            ||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct  112  GGGAAGCTCTTCGCAGTGAAGTGCATCCCGAAGAAGGCGCTGAAGGGCAAGGAGAGCAGCATCGAGAACGAGAT  185

Query  210  AGCCGTCCTGAGAAAGATTAAGCATGAAAATATTGTTGCCCTGGAAGACATTTATGAAAGCCCAAATCACCTGT  283
            .|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  186  TGCCGTGCTTAGAAAGATTAAGCATGAAAACATTGTTGCCTTGGAAGATATTTATGAAAGCCCAAATCACCTCT  259

Query  284  ACTTGGTCATGCAGCTGGTGTCCGGTGGAGAGCTGTTTGACCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTATACAGAGAAG  357
            ||.||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  260  ACCTGGTCATGCAACTTGTGTCTGGTGGAGAACTCTTCGATCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTACACAGAGAAA  333

Query  358  GATGCCAGCACTCTGATCCGCCAAGTCTTGGACGCCGTGTACTATCTCCACAGAATGGGCATCGTCCACAGAGA  431
            ||||||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  334  GATGCCAGCACTCTCATCCGCCAGGTCCTGGATGCCGTATACTATCTCCACAGAATGGGCATTGTCCACAGGGA  407

Query  432  CCTCAAGCCCGAAAATCTCTTGTACTACAGTCAAGATGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGATTGT  505
            |||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  408  CCTCAAGCCGGAGAATCTCTTATACTACAGTCAAGACGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGCTTGT  481

Query  506  CAAAAATGGAGGGCAAAGGAGATGTGATGTCCACTGCCTGTGGAACTCCAGGCTATGTCGCTCCTGAAGTCCTC  579
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct  482  CGAAAATGGAGGGCAAAGGAGATGTGATGTCCACGGCCTGCGGGACCCCAGGCTATGTTGCTCCGGAAGTTCTC  555

Query  580  GCCCAGAAACCTTACAGCAAAGCCGTTGACTGCTGGTCCATCGGAGTGATTGCCTACATCTTGCTCTGCGGCTA  653
            |||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||
Sbjct  556  GCCCAGAAACCGTACAGCAAAGCTGTGGACTGCTGGTCCATCGGGGTGATCGCCTATATCTTGCTCTGTGGTTA  629

Query  654  CCCTCCTTTTTATGATGAAAATGACTCCAAGCTCTTTGAGCAGATCCTCAAGGCGGAATATGAGTTTGACTCTC  727
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct  630  CCCTCCTTTTTATGATGAAAATGACTCGAAGCTGTTTGAACAGATCCTCAAGGCAGAATATGAGTTTGATTCCC  703

Query  728  CCTACTGGGATGACATCTCCGACTCTGCAAAAGACTTCATTCGGAACCTGATGGAGAAGGACCCGAATAAAAGA  801
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  704  CCTACTGGGATGACATCTCCGACTCTGCCAAAGACTTCATTCGGAATCTGATGGAGAAAGACCCAAATAAAAGA  777

Query  802  TACACGTGTGAGCAGGCAGCTCGGCACCCATGGATCGCTGGTGACACAGCCCTCAACAAAAACATCCACGAGTC  875
            |||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||.||
Sbjct  778  TACACTTGTGAGCAGGCAGCTCGACACCCATGGATTGCTGGTGACACAGCCCTTAGCAAAAACATTCACGAATC  851

Query  876  CGTCAGCGCCCAGATCCGGAAAAACTTTGCCAAGAGCAAATGGAGACAAGCATTTAATGCCACGGCCGTCGTGA  949
            .|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct  852  TGTCAGTGCCCAGATCCGGAAGAATTTTGCAAAGAGCAAATGGAGACAAGCGTTTAACGCCACGGCAGTCGTGA  925

Query  950  GACATATGAGAAAACTACACCTCGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAATGCAAGTGTTTCGAGCAGCCTCAGTTTG  1023
            ||||||||.|.|..||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.||||||||||
Sbjct  926  GACATATGCGGAGGCTCCAGCTTGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAATGCAAGTGTCTCAAGCAACCTCAGTTTG  999

Query 1024  GCCAGCCAAAAAGACTGTCTGGCACCTTCCACGCTCTGTAGTTTCATTTCTTCTTCGTCGGGGGTCTCAGGAGT  1097
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1000  GCCAGCCAAAAAGATTGTCTGGCACCTTCCACGCTCTGTAGTTTCCTTTCTTCTTCGTCGGGGGTCGCAGGAGT  1073

Query 1098  TGGAGCCGAGCGGAGACCCAGGCCCACCACTGTGACGGCAGTGCACTCTGGAAGCAAG  1155
            .|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||..|||.||||.|||||||||||
Sbjct 1074  CGGAGCTGAGAGGAGACCCAGGCCCACCACTGTGACAACAGGGCACACTGGAAGCAAG  1131