Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472792
• Subject: NM_013743.2
• Aligned Length: 1238
• Identities: 1070
• Gaps: 7

Alignment

Query    1  ATGAAGGCGGCCCGCTTCGTGCTGCGCAGCGCTGGCTCGCTCAACGGCGCCGGCCTGGTGCCCCGAGAGGTGGA  74
            ||||||||.||||||||||||.||||||||||..|||||||.|.|.|||||.|||||||.|||.|.|||||.||
Sbjct    1  ATGAAGGCAGCCCGCTTCGTGATGCGCAGCGCCAGCTCGCTGAGCAGCGCCAGCCTGGTCCCCAGGGAGGTCGA  74

Query   75  GCATTTCTCGCGCTACAGCCCGTCCCCGCTGTCCATGAAGCAGCTACTGGACTTTGGTTCAGAAAATGCATGTG  148
            ||..|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct   75  GCTGTTCTCCCGCTACAGCCCGTCCCCGCTGTCCATGAAGCAGCTGCTGGACTTTGGTTCAGAAAATGCCTGTG  148

Query  149  AAAGAACTTCTTTTGCATTTTTGCGACAAGAATTGCCTGTGAGACTCGCCAACATTCTGAAGGAAATTGATATC  222
            |||||||.||.|||||.|||.||||.|||||..||||.||..|.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||
Sbjct  149  AAAGAACGTCCTTTGCTTTTCTGCGGCAAGAGCTGCCCGTCCGCCTGGCCAATATCCTGAAGGAGATTGACATC  222

Query  223  CT-CCCGACC-CAATTAGTAAATACCTCTTCAGTGCAATTGGTTAAAAGCTGGTATATACAGAGCCTGATGGAT  294
            || ||.|||| |  |||||.||.||..||||.|||||..||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  223  CTGCCTGACCGC--TTAGTGAACACTCCTTCGGTGCAGCTGGTGAAGAGCTGGTATATCCAGAGCCTGATGGAT  294

Query  295  TTGGTGGAATTCCATGAGAAAAGCCCAGATGACCAGAAAGCATTATCAGACTTTGTAGATACACTCATCAAAGT  368
            ||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||..|.|||||.||||||||.||.||..|||||||
Sbjct  295  TTGGTGGAGTTCCATGAGAAGAGCCCAGAAGACCAGAAAGCCCTGTCAGAGTTTGTAGACACGCTGGTCAAAGT  368

Query  369  TCGAAATAGACACCATAATGTAGTCCCTACAATGGCACAAGGAATCATAGAGTATAAAGATGCCTGTACAGTTG  442
            ||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|.|||||||||||..||||.|||||.|
Sbjct  369  TCGAAACAGACATCATAATGTGGTCCCTACAATGGCTCAAGGCATCCTGGAGTATAAAGACACCTGCACAGTGG  442

Query  443  ACCCAGTCACCAATCAAAATCTTCAATATTTCTTGGATCGATTTTACATGAACCGTATTTCTACTCGGATGCTG  516
            ||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  443  ACCCCGTTACCAATCAAAATCTTCAGTATTTTTTAGACCGGTTTTACATGAACCGCATTTCTACTCGGATGCTC  516

Query  517  ATGAACCAGCACATTCTTATATTTAGTGACTCACAGACAGGAAACCCAAGCCACATTGGAAGCATTGATCCTAA  590
            |||||.||||||||.||.|||||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||
Sbjct  517  ATGAATCAGCACATCCTCATATTCAGTGACTCAAAGACGGGAAACCCAAGCCACATTGGAAGTATCGACCCAAA  590

Query  591  CTGTGATGTGGTAGCAGTGGTCCAAGATGCCTTTGAGTGTTCAAGGATGCTCTGTGATCAGTATTATTTATCAT  664
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.|||||||||.||.|||||||||.||.|||
Sbjct  591  CTGTGATGTGGTAGCAGTAGTCCAAGATGCCTTTGAGTGTGCAAAGATGCTCTGCGACCAGTATTATCTAACAT  664

Query  665  CTCCAGAATTAAAGCTTACACAAGTGAATGGAAAATTTCCAGACCAACCAATTCACATCGTGTATGTTCCTTCT  738
            |.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.|||||.|||||.||||||||.
Sbjct  665  CGCCAGAATTAAACCTCACACAAGTCAATGGAAAATTTCCAGGCCAACCAATCCACATTGTGTACGTTCCTTCA  738

Query  739  CACCTCCATCATATGCTCTTTGAACTATTTAAGAATGCAATGCGGGCAACAGTTGAACACCAGGAAAATCAGCC  812
            |||||.||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||.||||.||.||.||.||.||.|||||.|..||
Sbjct  739  CACCTTCACCACATGCTCTTCGAACTCTTCAAGAATGCCATGAGGGCCACGGTCGAGCATCAAGAAAACCGTCC  812

Query  813  TTCCCTTACACCAATAGAGGTTATTGTTGTCTTGGGAAAAGAAGACCTTACCATTAAGATTTCAGACAGAGGAG  886
            ||||.|.||.|||.||||||..|.|||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||.||||||
Sbjct  813  TTCCTTGACCCCAGTAGAGGCCACTGTCGTCTTGGGAAAAGAAGACCTTACAATCAAGATTTCTGACCGAGGAG  886

Query  887  GTGGTGTTCCCCTGAGAATTATTGACCGCCTCTTTAGTTATACATACTCCACTGCACCAACGCCTGTGATGGAT  960
            |.||||||||.|||||.||||.||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct  887  GCGGTGTTCCTCTGAGGATTACTGACCGCCTCTTTAGTTACACGTACTCCACTGCTCCAACACCTGTGATGGAC  960

Query  961  AATTCCCGGAATGCTCCTTTGGCTGGTTTTGGTTACGGCTTGCCAATTTCTCGTCTGTATGCCAAGTACTTTCA  1034
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct  961  AATTCCCGGAATGCCCCTTTGGCTGGTTTTGGTTATGGCTTGCCAATTTCTCGTCTCTACGCCAAGTATTTTCA  1034

Query 1035  AGGAGATCTGAATCTCTACTCTTTATCAGGATATGGAACAGATGCTATCATCTACTTAAAGGCTTTGTCTTCTG  1108
            ||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1035  AGGAGATCTGAATCTCTACTCTATGTCAGGTTATGGGACAGACGCTATCATCTACTTAAAGGCTTTATCTTCTG  1108

Query 1109  AGTCTATAGAAAAACTTCCAGTTTTTAACAAGTCAGCCTTCAAACATTATCAGATGAGCTCTGAGGCTGATGAC  1182
            |||||.|||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1109  AGTCTGTAGAAAAGCTCCCAGTCTTTAACAAGTCAGCCTTCAAACATTATCAGATGAGCTCCGAAGCTGATGAC  1182

Query 1183  TGGTGTATCCCAAGCAGGGAACCAAAGAACCTGGCAAA--AGAAG-GGGCCATG  1233
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||  ||||| .|||..||
Sbjct 1183  TGGTGTATCCCAAGCAGGGAACCGAAGAACCTGGCGAAGGAGAAGCTGGCAGTG  1236