Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472931
• Subject: NM_003831.5
• Aligned Length: 1562
• Identities: 1544
• Gaps: 7

Alignment

Query    1  ATGGATCTGGTAGGAGTGGCATCGCCTGAGCCCGGGACGGCAGCGGCCTGGGGACCCAGCAAGTGTCCATGGGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATCTGGTAGGAGTGGCATCGCCTGAGCCCGGGACGGCAGCGGCCTGGGGACCCAGCAAGTGTCCATGGGC  74

Query   75  TATTCCTCAAAATACAATATCTTGTTCTTTGGCTGATGTAATGAGTGAACAGCTGGCCAAAGAATTGCAGTTAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TATTCCTCAAAATACAATATCTTGTTCTTTGGCTGATGTAATGAGTGAACAGCTGGCCAAAGAATTGCAGTTAG  148

Query  149  AAGAAGAAGCTGCCGTTTTTCCTGAAGTTGCTGTTGCTGAAGGACCATTTATTACTGGAGAAAACATTGATACT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGAAGAAGCTGCCGTTTTTCCTGAAGTTGCTGTTGCTGAAGGACCATTTATTACTGGAGAAAACATTGATACT  222

Query  223  TCCAGTGACCTTATGCTGGCTCAGATGCTACAGATGGAATATGACAGAGAATATGATGCACAGCTTAGGCGTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCAGTGACCTTATGCTGGCTCAGATGCTACAGATGGAATATGACAGAGAATATGATGCACAGCTTAGGCGTGA  296

Query  297  AGAAAAAAAATTCAATGGAGATAGCAAAGTTTCCATTTCCTTTGAAAATTATCGAAAAGTGCATCCTTATGAAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAAAAAAAATTCAATGGAGATAGCAAAGTTTCCATTTCCTTTGAAAATTATCGAAAAGTGCATCCTTATGAAG  370

Query  371  ACAGCGATAGCTCTGAAGATGAGGTTGACTGGCAGGATACTCGTGATGATCCCTACAGACCAGCAAAACCGGTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAGCGATAGCTCTGAAGATGAGGTTGACTGGCAGGATACTCGTGATGATCCCTACAGACCAGCAAAACCGGTT  444

Query  445  CCCACTCCTAAAAAGGGCTTTATTGGAAAAGGAAAAGATATCACCACCAAACATGATGAAGTAGTATGTGGGAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCACTCCTAAAAAGGGCTTTATTGGAAAAGGAAAAGATATCACCACCAAACATGATGAAGTAGTATGTGGGAG  518

Query  519  AAAGAACACAGCAAGAATGGAAAATTTTGCACCTGAGTTTCAGGTAGGAGATGGAATTGGAATGGATTTAAAAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAAGAACACAGCAAGAATGGAAAATTTTGCACCTGAGTTTCAGGTAGGAGATGGAATTGGAATGGATTTAAAAC  592

Query  593  TATCAAACCATGTTTTCAATGCTTTAAAACAACATGCCTACTCAGAAGAACGTCGAAGTGCCCGCCTACATGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TATCAAACCATGTTTTCAATGCTTTAAAACAACATGCCTACTCAGAAGAACGTCGAAGTGCCCGCCTACATGAG  666

Query  667  AAAAAGGAGCATTCTACAGCAGAAAAAGCAGTTGATCCTAAGACACGTTTACTTATGTATAAAATGGTCAACTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAAAGGAGCATTCTACAGCAGAAAAAGCAGTTGATCCTAAGACACGTTTACTTATGTATAAAATGGTCAACTC  740

Query  741  TGGAATGTT-GAGACANTCACNGGNTGTTATTAGTNCAGNAAAGNNNTCTTGTTGTTCTTTCATGCATATGGAG  813
            ||||||||| ||||||.||||.||.|| |||||||.|||.||||...|| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGAATGTTGGAGACAATCACTGGCTG-TATTAGTACAGGAAAGGAGTC-TGTTG-TCTTTCATGCATATGGAG  811

Query  814  GGAGCATGGAGGATGAAAAGGANGATTGTAAAGGTTATACTTACAGAATGTGCCATCAAGGTATTTAAAACAAC  887
            ||||||||||||||||||||||.|||.||||| |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  GGAGCATGGAGGATGAAAAGGAAGATAGTAAA-GTTATACCTACAGAATGTGCCATCAAGGTATTTAAAACAAC  884

Query  888  CCTTAAATG-ATTTAAGAATCGTGACAAATATATTAAAGATGATTTCAGGTTTAAAGATCGCTTCAGTAAACTA  960
            |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  885  CCTT-AATGAATTTAAGAATCGTGACAAATATATTAAAGATGATTTCAGGTTTAAAGATCGCTTCAGTAAACTA  957

Query  961  AATCCACGTAAGATCATCCGCATGTGGGCAGAAAAAGAAATGCACAATCTCGCAAGAATGCAGAGAGCTGGAAT  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  958  AATCCACGTAAGATCATCCGCATGTGGGCAGAAAAAGAAATGCACAATCTCGCAAGAATGCAGAGAGCTGGAAT  1031

Query 1035  TCCTTGTCCAACAGTTGTACTACTGAAGAAACACATTTTAGTTATGTCTTTTATTGGCCATGATCAAGTTCCAG  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032  TCCTTGTCCAACAGTTGTACTACTGAAGAAACACATTTTAGTTATGTCTTTTATTGGCCATGATCAAGTTCCAG  1105

Query 1109  CCCCTAAATTAAAAGAAGTAAAGCTCAATAGTGAAGAAATGAAAGAAGCCTACTATCAAACTCTTCATTTGATG  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106  CCCCTAAATTAAAAGAAGTAAAGCTCAATAGTGAAGAAATGAAAGAAGCCTACTATCAAACTCTTCATTTGATG  1179

Query 1183  CGGCAGTTATATCATGAATGTACGCTTGTCCATGCTGACCTCAGTGAGTATAACATGCTGTGGCATGCTGGAAA  1256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180  CGGCAGTTATATCATGAATGTACGCTTGTCCATGCTGACCTCAGTGAGTATAACATGCTGTGGCATGCTGGAAA  1253

Query 1257  GGTCTGGTTGATCGATGTCAGTCAGTCAGTAGAACCTACCCACCCTCACGGCCTGGAGTTCTTGTTCCGGGACT  1330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254  GGTCTGGTTGATCGATGTCAGTCAGTCAGTAGAACCTACCCACCCTCACGGCCTGGAGTTCTTGTTCCGGGACT  1327

Query 1331  GCAGGAATGTCTCGCAGTTTTTCCAGAAAGGAGGAGTCAAGGAAGCCCTTAGTGAACGAGAACTCTTCAATGCT  1404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328  GCAGGAATGTCTCGCAGTTTTTCCAGAAAGGAGGAGTCAAGGAAGCCCTTAGTGAACGAGAACTCTTCAATGCT  1401

Query 1405  GTTTCAGGCTTAAACATCACAGCAGATAATGAAGCTGATTTTTTAGCTGAGATAGAAGCTTTGGAGAAAATGAA  1478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1402  GTTTCAGGCTTAAACATCACAGCAGATAATGAAGCTGATTTTTTAGCTGAGATAGAAGCTTTGGAGAAAATGAA  1475

Query 1479  TGAAGATCACGTTCAGAAGAATGGAAGGAAAGCTGCTTCATTTTTGAAAGATGATGGAGACCCACCACTACTAT  1552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476  TGAAGATCACGTTCAGAAGAATGGAAGGAAAGCTGCTTCATTTTTGAAAGATGATGGAGACCCACCACTACTAT  1549

Query 1553  ATGATGAA  1560
            ||||||||
Sbjct 1550  ATGATGAA  1557