Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472931
• Subject: NM_024182.4
• Aligned Length: 1562
• Identities: 1390
• Gaps: 7

Alignment

Query    1  ATGGATCTGGTAGGAGTGGCATCGCCTGAGCCCGGGACGGCAGCGGCCTGGGGACCCAGCAAGTGTCCATGGGC  74
            |||||||||||.||||||.|.|||||||||||.|||.|.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGATCTGGTCGGAGTGTCTTCGCCTGAGCCAGGGCCCGCAGCAGCTTGGGGACCCAGTAAGTGCCCATGGGC  74

Query   75  TATTCCTCAAAATACAATATCTTGTTCTTTGGCTGATGTAATGAGTGAACAGCTGGCCAAAGAATTGCAGTTAG  148
            ||..||||||||.|||.||||.|||||..||.|.||.||.||||||||..|||||||.|||||..|||||||.|
Sbjct   75  TACCCCTCAAAACACAGTATCCTGTTCACTGACCGAGGTGATGAGTGAGGAGCTGGCTAAAGAGCTGCAGTTGG  148

Query  149  AAGAAGAAGCTGCCGTTTTTCCTGAAGTTGCTGTTGCTGAAGGACCATTTATTACTGGAGAAAACATTGATACT  222
            ||||||||||.||.|.|||.||||||||||.||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  AAGAAGAAGCGGCTGCTTTCCCTGAAGTTGTTGTTGCTGAAGGACCATTCATTTCTGGAGAAAACATTGACACT  222

Query  223  TCCAGTGACCTTATGCTGGCTCAGATGCTACAGATGGAATATGACAGAGAATATGATGCACAGCTTAGGCGTGA  296
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCAGTGACCTAATGCTGGCTCAGATGCTACAGATGGAATTTGACAGAGAATATGATGCACAGCTTAGGCGTGA  296

Query  297  AGAAAAAAAATTCAATGGAGATAGCAAAGTTTCCATTTCCTTTGAAAATTATCGAAAAGTGCATCCTTATGAAG  370
            .|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||.|||||
Sbjct  297  GGAAAAGAAGTTCAATGGTGATAGCAAAGTTTCCATTTCGTTTGAAAACTATCGCAAAGTTCATCCTTTTGAAG  370

Query  371  ACAGCGATAGCTCTGAAGATGAGGTTGACTGGCAGGATACTCGTGATGATCCCTACAGACCAGCAAAACCGGTT  444
            ||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||..||
Sbjct  371  ACAGTGACAGCTCTGAAGACGAGGTTGACTGGCAGGACACTCGAGACGATCCCTACAGACCAGCAAAGCCAATT  444

Query  445  CCCACTCCTAAAAAGGGCTTTATTGGAAAAGGAAAAGATATCACCACCAAACATGATGAAGTAGTATGTGGGAG  518
            ||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  445  CCTACTCCCAAAAAGGGTTTTATTGGAAAAGGAAAAGACATCACCACCAAGCATGATGAAGTAGTATGTGGAAG  518

Query  519  AAAGAACACAGCAAGAATGGAAAATTTTGCACCTGAGTTTCAGGTAGGAGATGGAATTGGAATGGATTTAAAAC  592
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||||..|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  GAAGAACACAGCAAGAATGGAAAATTTTGCCCCTGGCTTTCAGGTAGGGGATGGAATTGGAATGGATTTGAAAC  592

Query  593  TATCAAACCATGTTTTCAATGCTTTAAAACAACATGCCTACTCAGAAGAACGTCGAAGTGCCCGCCTACATGAG  666
            ||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct  593  TATCCAACCACGTTTTTAATGCCTTAAAACAACACGCCTACTCAGAAGAGCGTCGGAGTGCCCGTCTACACGAG  666

Query  667  AAAAAGGAGCATTCTACAGCAGAAAAAGCAGTTGATCCTAAGACACGTTTACTTATGTATAAAATGGTCAACTC  740
            ||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGAAGGAACATTCTACCGCTGAAAAAGCAGTTGATCCTAAGACACGCTTACTTATGTATAAAATGGTCAACTC  740

Query  741  TGGAATGTT-GAGACANTCACNGGNTGTTATTAGTNCAGNAAAGNNNTCTTGTTGTTCTTTCATGCATATGGAG  813
            ||||||||| ||||||.||||.||.|| |||||||.|||.||||...|| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGAATGTTGGAGACAATCACTGGCTG-TATTAGTACAGGAAAGGAATC-TGTTG-TCTTTCATGCATATGGAG  811

Query  814  GGAGCATGGAGGATGAAAAGGANGATTGTAAAGGTTATACTTACAGAATGTGCCATCAAGGTATTTAAAACAAC  887
            |||||.||||||||||||||||.|||.||||| |.|||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  GGAGCCTGGAGGATGAAAAGGAAGATGGTAAA-GCTATACCAACAGAATGTGCCATCAAGGTATTTAAAACAAC  884

Query  888  CCTTAAATGA-TTTAAGAATCGTGACAAATATATTAAAGATGATTTCAGGTTTAAAGATCGCTTCAGTAAACTA  960
            |||| ||||| |||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  885  CCTT-AATGAGTTTAAGAATCGTGACAAGTACATTAAAGATGATTTCAGGTTTAAAGATCGCTTCAGTAAACTA  957

Query  961  AATCCACGTAAGATCATCCGCATGTGGGCAGAAAAAGAAATGCACAATCTCGCAAGAATGCAGAGAGCTGGAAT  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||||..||||||||
Sbjct  958  AATCCACGTAAGATCATCCGCATGTGGGCAGAGAAAGAAATGCACAATCTTACAAGAATGCAGAAGGCTGGAAT  1031

Query 1035  TCCTTGTCCAACAGTTGTACTACTGAAGAAACACATTTTAGTTATGTCTTTTATTGGCCATGATCAAGTTCCAG  1108
            |||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032  TCCTTGTCCAACAGTTGTACTGCTTAAGAAGCACATTTTAGTTATGTCTTTCATTGGCCATGATCAAGTTCCAG  1105

Query 1109  CCCCTAAATTAAAAGAAGTAAAGCTCAATAGTGAAGAAATGAAAGAAGCCTACTATCAAACTCTTCATTTGATG  1182
            |||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1106  CCCCTAAATTAAAAGAAGTAAAGCTTAGTAATGAAGAAATGAAAGATGCCTACTATCAGACTCTTCATTTGATG  1179

Query 1183  CGGCAGTTATATCATGAATGTACGCTTGTCCATGCTGACCTCAGTGAGTATAACATGCTGTGGCATGCTGGAAA  1256
            |.|||.||||||.|.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||.||
Sbjct 1180  CAGCAATTATATAACGAATGTACCCTTGTGCATGCTGACCTCAGCGAGTATAACATGTTGTGGCATGCTGGGAA  1253

Query 1257  GGTCTGGTTGATCGATGTCAGTCAGTCAGTAGAACCTACCCACCCTCACGGCCTGGAGTTCTTGTTCCGGGACT  1330
            ||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1254  GGTCTGGTTGATTGACGTCAGTCAGTCGGTAGAGCCAACCCATCCTCATGGCCTGGAGTTCTTATTCCGTGACT  1327

Query 1331  GCAGGAATGTCTCGCAGTTTTTCCAGAAAGGAGGAGTCAAGGAAGCCCTTAGTGAACGAGAACTCTTCAATGCT  1404
            |.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|.|||||||||.|.||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 1328  GTAGGAATGTTTCACAGTTCTTCCAGAAAGGAGGAGTAACGGAAGCCCTCAATGAACGGGAGCTGTTCAATGCT  1401

Query 1405  GTTTCAGGCTTAAACATCACAGCAGATAATGAAGCTGATTTTTTAGCTGAGATAGAAGCTTTGGAGAAAATGAA  1478
            |||||.|||.|.||||||.|.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1402  GTTTCTGGCCTGAACATCTCGGCAGACAATGAAGCTGATTTCTTAGCTGAGATAGAAGCTTTGGAGAAGATGAA  1475

Query 1479  TGAAGATCACGTTCAGAAGAATGGAAGGAAAGCTGCTTCATTTTTGAAAGATGATGGAGACCCACCACTACTAT  1552
            ||||||||||.||||||||||.||.||||||||.||.||.|||.||||||||||||||..||||||..|.||.|
Sbjct 1476  TGAAGATCACATTCAGAAGAACGGGAGGAAAGCAGCCTCGTTTCTGAAAGATGATGGAAGCCCACCTGTGCTGT  1549

Query 1553  ATGATGAA  1560
            .||..||.
Sbjct 1550  CTGCCGAC  1557