Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000472957
- Subject:
- NM_001038499.1
- Aligned Length:
- 1719
- Identities:
- 1505
- Gaps:
- 12
Alignment
Query 1 ATGCACACCCTCACTGGCTTCTCCCTGGTCAGCCTGCTCAGCTTCGGCTACCTGTCCTGGGACTGGGCCAAGCC 74
|||||..|.|||.|.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1 ATGCATGCTCTCTCAGGATTCTCCCTGGTCAGCCTACTCAGCTTGGGCTACCTGTCCTGGGATTGGGCTAAGCC 74
Query 75 GAGCTTCGTGGCCGACGGGCCCGGGGAGGCTGGCGAGCAGCCCTCGGCCGCTCCGCCCCAGCCTCCCCACATCA 148
..||.|.|||||.||.|||||.|..|||||||||||.|||||.||||..|||||.||.||||||||.|||||.|
Sbjct 75 CGGCCTTGTGGCTGATGGGCCTGCCGAGGCTGGCGATCAGCCTTCGGTGGCTCCACCGCAGCCTCCACACATTA 148
Query 149 TCTTCATCCTCACGGACGACCAAGGCTACCACGACGTGGGCTACCATGGTTCAGATATCGAGACCCCTACGCTG 222
|||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 TCTTCATCCTCACCGACGACCAAGGGTACCACGACGTGGGATACCATGGCTCGGATATCGAGACCCCAACGCTG 222
Query 223 GACAGGCTGGCGGCCAAGGGGGTCAAGTTGGAGAATTATTACATCCAGCCCATCTGCACGCCTTCGCGGAGCCA 296
|||.||||.||.||..||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||.||||.||
Sbjct 223 GACCGGCTAGCAGCTGAGGGCGTCAAACTGGAGAATTATTACATCCAGCCCATATGTACACCTTCGAGGAGTCA 296
Query 297 GCTCCTCACTGGCAGGTACCAGATCCACACAGGACTCCAGCATTCCATCATCCGCCCACAGCAGCCCAACTGCC 370
.||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||||.||||||||||||.|
Sbjct 297 ACTCCTCACCGGCAGGTACCAGATCCATACAGGATTGCAGCACTCCATTATCCGCCCACGGCAGCCCAACTGTC 370
Query 371 TGCCCCTGGACCAGGTGACACTGCCACAGAAGCTGCAGGAGGCAGGTTATTCCACCCATATGGTGGGCAAGTGG 444
|||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 371 TGCCCCTGGACCAGGTGACGCTGCCCCAGAAGCTACAGGAGGCAGGCTACTCCACCCACATGGTGGGCAAGTGG 444
Query 445 CACCTGGGCTTCTACCGGAAGGAGTGTCTGCCCACCCGTCGGGGCTTCGACACCTTCCTGGGCTCGCTCACGGG 518
||.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 445 CATCTGGGCTTCTACCGGAAGGAGTGCTTGCCTACCCGCCGGGGCTTCGACACCTTCCTGGGTTCCCTCACAGG 518
Query 519 CAATGTGGACTATTACACCTATGACAACTGTGATGGCCCAGGCGTGTGCGGCTTCGACCTGCACGAGGGTGAGA 592
|||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAATGTGGATTACTACACCTACGACAACTGTGATGGCCCAGGGGTTTGTGGGTTTGACCTGCACGAGGGTGAGA 592
Query 593 ATGTGGCCTGGGGGCTCAGCGGCCAGTACTCCACTATGCTTTACGCCCAGCGCGCCAGCCATATCCTGGCCAGC 666
..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 593 GCGTGGCCTGGGGGCTCAGCGGCCAGTACTCCACTATGCTCTACGCTCAGCGTGCAAGCCACATCCTGGCCAGC 666
Query 667 CACAGCCCTCAGCGTCCCCTCTTCCTCTATGTGGCCTTCCAGGCAGTACACACACCCCTGCAGTCCCCTCGTGA 740
||||..||.|||..|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct 667 CACAATCCCCAGAATCCCCTCTTTCTCTATGTGGCCTTCCAGGCAGTACACACGCCCCTACAGTCACCTCGAGA 740
Query 741 GTACCTGTACCGCTACCGCACCATGGGCAATGTGGCCCGGCGGAAGTACGCGGCCATGGTGACCTGCATGGATG 814
.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 741 ATACCTATACCGCTACCGCACGATGGGCAACGTAGCACGGCGCAAGTACGCAGCCATGGTGACCTGCATGGACG 814
Query 815 AGGCTGTGCGCAACATCACCTGGGCCCTCAAGCGCTACGGTTTCTACAACAACAGTGTCATCATCTTCTCCAGT 888
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 815 AGGCTGTGCGTAACATCACCTGGGCCCTCAAGCGCTATGGTTTCTATAACAACAGTGTCATTATCTTCTCCAGT 888
Query 889 GACAATGGTGGCCAGACTTTCTCGGGGGGCAGCAACTGGCCGCTCCGAGGACGCAAGGGCACTTATTGGGAAGG 962
|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 889 GACAATGGTGGCCAGACCTTCTCAGGGGGTAGCAACTGGCCCCTTCGAGGACGCAAGGGTACTTACTGGGAAGG 962
Query 963 TGGCGTGCGGGGCCTAGGCTTTGTCCACAGTCCCCTGCTCAAGCGAAAGCAACGGACAAGCCGGGCACTGATGC 1036
|||.|||.|||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||..||||..||||||.||.|||||.|||.|.|
Sbjct 963 TGGTGTGAGGGGCCTGGGTTTTGTCCACAGCCCACTGCTCAAGAAAAAGAGACGGACCAGTCGGGCCCTGGTCC 1036
Query 1037 ACATCACTGACTGGTACCCGACCCTGGTGGGTCTGGCAGGTGGTACCACCTCAGCAGCCGATGGGCTAGATGGC 1110
|.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1037 ATATCACAGACTGGTACCCAACACTGGTGGGTCTGGCAGGCGGTACTACATCAGCAGCTGATGGGCTGGATGGC 1110
Query 1111 TACGACGTGTGGCCGGCCATCAGCGAGGGCCGGGCCTCACCACGCACGGAGATCCTGCACAACATTGACCCACT 1184
||.||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1111 TATGATGTATGGCCAGCCATTAGTGAGGGCCGGGCCTCACCACGCACAGAGATCCTACACAACATCGACCCCCT 1184
Query 1185 CTACAACCATGCCCAGCATGGCTCCCTGGAGGGCGGCTTTGGCATCTGGAACACCGCCGTGCAGGCTGCCATCC 1258
||||||||||||||.||||||.|||.|||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 1185 CTACAACCATGCCCGGCATGGATCCTTGGAGGGTGGCTTTGGGATCTGGAATACAGCAGTGCAGGCTGCTATCC 1258
Query 1259 GCGTGGGTGAGTGGAAGCTGCTGACAGGAGACCCCGGCTATGGCGATTGGATCCCACCGCAGACACTGGCCACC 1332
|.||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||.||
Sbjct 1259 GAGTTGGGGAGTGGAAGCTGCTCACTGGAGACCCAGGCTATGGTGACTGGATTCCACCTCAGACACTGGCCTCC 1332
Query 1333 TTCCCGGGTAGCTGGTGGAACCTGGAACGAATGGCCAGTGTCCGCCAGGCCGTGTGGCTCTTCAACATCAGTGC 1406
|||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||..||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333 TTCCCTGGCAGCTGGTGGAACCTGGAGCGGATGGCCAGCATCCGCCAGGCTGTGTGGCTCTTTAACATCAGTGC 1406
Query 1407 TGACCCTTATGAACGGGAGGACCTGGCTGGCCAGCGGCCTGATGTGGTCCGCACCCTGCTGGCTCGCCTGGCCG 1480
|||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1407 TGACCCTTACGAACGAGAGGACCTGGCTGGCCAGCGACCCGATGTAGTCCGCACCCTTCTGGCTCGCCTGGCTG 1480
Query 1481 AATATAACCGCACAGCCATCCCGGTACGCTACCCAGCTGAGAACCCCCGGGCTCATCCTGACTTTAATGGGGGT 1554
|.||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||.||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ATTATAACCGTACTGCCATCCCCGTGCGTTACCCAGCTGCGAACCCTCGGGCCCATCCTGACTTTAATGGGGGT 1554
Query 1555 GCTTGGGGGCCCTGGGCCAGT---GATGAGGAAGAGGAGGAAGAGGAAG-GGAGG--------GCTCGAAGCTT 1616
||||||||||||||||||||| ||.||||||||||||||.||||||| ||||| |||.||||.||
Sbjct 1555 GCTTGGGGGCCCTGGGCCAGTGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGGCAGAGCTAGAAGTTT 1628
Query 1617 CTCCCGGGGTCGTCGCAAGAAAAAATGCAAGATTTGCAAGCTTCGATCCTTTTTCCGTAAACTCAACACCAGGC 1690
||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1629 CTCCCGGGGTCGCCGCAAGAAGAAATGCAAGATTTGCAAGCTTCGATCTTTTTTCCGTAAACTCAATACCAGGC 1702
Query 1691 TAATGTCCCAACGGATC 1707
|.||||||||.||||||
Sbjct 1703 TGATGTCCCACCGGATC 1719