Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000473040
- Subject:
- NM_001287437.2
- Aligned Length:
- 2527
- Identities:
- 1486
- Gaps:
- 1037
Alignment
Query 1 ATGAAACGAGGTCGCCTTCCCAGCAGCAGTGAGGATTCTGACGACAATGGCAGCCTGTCAACTACTTGGTCCCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAACGAGGTCGCCTTCCCAGCAGCAGTGAGGATTCTGACGACAATGGCAGCCTGTCAACTACTTGGTCCCA 74
Query 75 GAATTCCCGATCCCAGCATAGGAGAAGCTCCTGCTCCAGACATGAAGATCGAAAGCCTTCAGAGGTGTTTAGGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAATTCCCGATCCCAGCATAGGAGAAGCTCCTGCTCCAGACATGAAGATCGAAAGCCTTCAGAGGTGTTTAGGA 148
Query 149 CAGACCTGATCACTGCCATGAAGTTGCATGACTCCTACCAGCTGAATCCGGATGAGTACTATGTGTTGGCAGAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAGACCTGATCACTGCCATGAAGTTGCATGACTCCTACCAGCTGAATCCGGATGAGTACTATGTGTTGGCAGAT 222
Query 223 CCCTGGAGACAGGAATGGGAGAAAGGGGTCCAGGTGCCTGTGAGCCCGGGGACCATCCCTCAGCCTGTGGCCAG 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCCTGGAGACAGGAATGGGAGAAAGGGGTCCAGGTGCCTGTGAGCCCGGGGACCATCCCTCAGCCTGTGGC--- 293
Query 297 GGTTGTGTCTGAAGAGAAATCCCTCATGTTCATCAGGCCCAAGAAGTACATCGTGTCATCAGGCTCTGAGCCTC 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 ---------------------------------CAGGCCCAAGAAGTACATCGTGTCATCAGGCTCTGAGCCTC 334
Query 371 CCGAGTTGGGCTATGTGGACATCCGGACGCTGGCTGACAGCGTGTGTCGCTATGACCTCAATGACATGGATGCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 335 CCGAGTTGGGCTATGTGGACATCCGGACGCTGGCTGACAGCGTGTGTCGCTATGACCTCAATGACATGGATGCT 408
Query 445 GCATGGCTGGAACTGACCAATGAAGAATTTAAGGAGATGGGAATGCCTGAACTAGATGAATACACCATGGAGAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 409 GCATGGCTGGAACTGACCAATGAAGAATTTAAGGAGATGGGAATGCCTGAACTAGATGAATACACCATGGAGAG 482
Query 519 GGTCCTAGAGGAATTTGAGCAGCGATGCTACGACAATATGAATCATGCCATAGAGACTGAGGAAGGCCTGGGGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 483 GGTCCTAGAGGAATTTGAGCAGCGATGCTACGACAATATGAATCATGCCATAGAGACTGAGGAAGGCCTGGGGA 556
Query 593 TCGAATATGATGAAGATGTTGTCTGTGATGTCTGCCAGTCTCCTGATGGTGAGGACGGCAATGAGATGGTGTTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 TCGAATATGATGAAGATGTTGTCTGTGATGTCTGCCAGTCTCCTGATGGTGAGGACGGCAATGAGATGGTGTTC 630
Query 667 TGTGACAAATGCAACATCTGTGTGCACCAGGCCTGTTATGGAATCCTCAAGGTACCAGAGGGCAGCTGGCTGTG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 631 TGTGACAAATGCAACATCTGTGTGCACCAGGCCTGTTATGGAATCCTCAAGGTACCAGAGGGCAGCTGGCTGTG 704
Query 741 CCGGACATGTGCCCTGGGGGTTCAGCCAAAATGTCTGCTGTGTCCGAAGAAGGGTGGAGCTATGAAGCCCACCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 705 CCGGACATGTGCCCTGGGGGTTCAGCCAAAATGTCTGCTGTGTCCGAAGAAGGGTGGAGCTATGAAGCCCACCC 778
Query 815 GTAGCGGAACCAAGTGGGTCCACGTTAGCTGTGCTCTGTGGATCCCTGAGGTGAGCATTGGCAGCCCAGAGAAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 GTAGCGGAACCAAGTGGGTCCACGTTAGCTGTGCTCTGTGGATCCCTGAGGTGAGCATTGGCAGCCCAGAGAAG 852
Query 889 ATGGAGCCCATCACCAAGGTGTCACACATTCCCAGCAGCCGGTGGGCGCTAGTGTGCAGCCTCTGCAATGAGAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 853 ATGGAGCCCATCACCAAGGTGTCACACATTCCCAGCAGCCGGTGGGCGCTAGTGTGCAGCCTCTGCAATGAGAA 926
Query 963 GTTTGGGGCCTCTATACAGTGCTCTGTGAAGAACTGCCGCACAGCCTTCCATGTGACCTGTGCTTTTGACCGGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 927 GTTTGGGGCCTCTATACAGTGCTCTGTGAAGAACTGCCGCACAGCCTTCCATGTGACCTGTGCTTTTGACCGGG 1000
Query 1037 GCCTGGAGATGAAGACCATCTTAGCAGAGAATGATGAAGTCAAGTTCAAGTCCTATTGCCCAAAGCACAGCTCA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001 GCCTGGAGATGAAGACCATCTTAGCAGAGAATGATGAAGTCAAGTTCAAGTCCTATTGCCCAAAGCACAGCTCA 1074
Query 1111 CATAGGAAACCCGAGGAGAGTCTTGGCAAGGGGGCTGCACAGGAGAATGGGGCCCCTGAGTGTTCCCCCCGGAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 CATAGGAAACCCGAGGAGAGTCTTGGCAAGGGGGCTGCACAGGAGAATGGGGCCCCTGAGTGTTCCCCCCGGAA 1148
Query 1185 TCCGCTGGAGCCCTTTGCCAGCCTTGAGCAGAACCGGGAGGAGGCCCACCGGGTGAGTGTCCGTAAGCAGAAGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149 TCCGCTGGAGCCCTTTGCCAGCCTTGAGCAGAACCGGGAGGAGGCCCACCGGGTGAGTGTCCGTAAGCAGAAGC 1222
Query 1259 TGCAGCAGTTGGAGGATGAGTTCTACACCTTCGTCAACCTGCTGGATGTTGCCAGGGCTCTGCGGCTGCCTGAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1223 TGCAGCAGTTGGAGGATGAGTTCTACACCTTCGTCAACCTGCTGGATGTTGCCAGGGCTCTGCGGCTGCCTGAG 1296
Query 1333 GAAGTAGTGGATTTCCTGTACCAGTACTGGAAGTTGAAGAGGAAGGTCAACTTCAACAAGCCCCTGATCACCCC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1297 GAAGTAGTGGATTTCCTGTACCAGTACTGGAAGTTGAAGAGGAAGGTCAACTTCAACAAGCCCCTGATCACCCC 1370
Query 1407 AAAGAAAGATGAAGAGGACAATCTAGCCAAGCGGGAGCAGGATGTCTTATTTAGGAGGCTGCAGCTGTTCACGC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1371 AAAGAAAGATGAAGAGGACAATCTAGCCAAGCGGGAGCAGGATGTCTTATTTAGGAGGCTGCAGCTGTTCACGC 1444
Query 1481 ACCTGCGGCAGGACCTGGAGAGGGT----AA--TGATTGACA--CTGACACC------------TTA------- 1527
||||||||||||||||||||||||| || |.|.|.||| .|||| || |||
Sbjct 1445 ACCTGCGGCAGGACCTGGAGAGGGTTCGGAACCTCACTTACATGGTGAC-CCGCAGGGAAAAGATTAAACGGTC 1517
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 1518 TGTGTGCAAAGTCCAGGAACAGATATTCAATCTTTACACTAAGCTTTTGGAGCAAGAAAGAGTTTCAGGTGTGC 1591
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 1592 CTTCTTCCTGCTCCTCCTCCTCACTGGAAAACATGCTTTTGTTTAACAGTCCTTCTGTTGGCCCTGATGCTCCC 1665
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 1666 AAGATAGAGGACTTGAAGTGGCATTCTGCATTCTTCAGAAAACAAATGGGTACTTCCTTGGTTCATTCGCTGAA 1739
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 1740 AAAGCCCCATAAGCGAGATCCTTTGCAGAATAGCCCTGGAAGTGAAGGCAAAACCCTGCTGAAGCAGCCAGACC 1813
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 1814 TGTGTGGTAGAAGGGAGGGGATGGTGGTCCCAGAGAGCTTTTTGGGTTTAGAAAAGACCTTTGCAGAAGCACGT 1887
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 1888 CTCATATCAGCACAACAGAAAAATGGTGTGGTGATGCCAGACCATGGGAAAAGAAGAGACAATCGTTTTCATTG 1961
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 1962 TGATCTCATTAAAGGAGACTTAAAGGACAAATCTTTTAAACAGAGTCACAAGCCTCTCAGGTCCACAGATGTGT 2035
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 2036 CCCAGAGGCATCTGGACAACACAAGAGCTGCCACCTCCCCTGGAGTGGGGCAGTCAGCACCTGGCACAAGGAAG 2109
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 2110 GAGATAGTGCCCAAGTGCAATGGCTCCCTAATCAAAGTAAACTATAATCAGACTGCAGTCAAAGTGCCTACAAC 2183
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 2184 ACCTGCCAGCCCAGTGAAAAACTGGGGAGGATTCCGGATTCCAAAGAAGGGGGAACGGCAGCAGCAGGGAGAGG 2257
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 2258 CCCACGATGGGGCCTGCCACCAGCACTCAGACTACCCATATTTGGGCTTAGGCCGAGTTCCAGCCAAGGAAAGG 2331
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 2332 GCAAAAAGCAAATTAAAATCCGACAATGAGAATGACGGGTATGTCCCCGATGTGGAAATGAGTGACTCAGAGAG 2405
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 2406 TGAGGCATCAGAAAAGAAATGTATACACACCAGCAGCACTATCAGCAGAAGGACAGACATTATCAGGAGAAGCA 2479
Query 1528 ----------- 1527
Sbjct 2480 TCTTGGCTTCT 2490
