Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000473040
- Subject:
- NM_001287443.1
- Aligned Length:
- 2527
- Identities:
- 1522
- Gaps:
- 1001
Alignment
Query 1 ATGAAACGAGGTCGCCTTCCCAGCAGCAGTGAGGATTCTGACGACAATGGCAGCCTGTCAACTACTTGGTCCCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAACGAGGTCGCCTTCCCAGCAGCAGTGAGGATTCTGACGACAATGGCAGCCTGTCAACTACTTGGTCCCA 74
Query 75 GAATTCCCGATCCCAGCATAGGAGAAGCTCCTGCTCCAGACATGAAGATCGAAAGCCTTCAGAGGTGTTTAGGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAATTCCCGATCCCAGCATAGGAGAAGCTCCTGCTCCAGACATGAAGATCGAAAGCCTTCAGAGGTGTTTAGGA 148
Query 149 CAGACCTGATCACTGCCATGAAGTTGCATGACTCCTACCAGCTGAATCCGGATGAGTACTATGTGTTGGCAGAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAGACCTGATCACTGCCATGAAGTTGCATGACTCCTACCAGCTGAATCCGGATGAGTACTATGTGTTGGCAGAT 222
Query 223 CCCTGGAGACAGGAATGGGAGAAAGGGGTCCAGGTGCCTGTGAGCCCGGGGACCATCCCTCAGCCTGTGGCCAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCCTGGAGACAGGAATGGGAGAAAGGGGTCCAGGTGCCTGTGAGCCCGGGGACCATCCCTCAGCCTGTGGCCAG 296
Query 297 GGTTGTGTCTGAAGAGAAATCCCTCATGTTCATCAGGCCCAAGAAGTACATCGTGTCATCAGGCTCTGAGCCTC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGTTGTGTCTGAAGAGAAATCCCTCATGTTCATCAGGCCCAAGAAGTACATCGTGTCATCAGGCTCTGAGCCTC 370
Query 371 CCGAGTTGGGCTATGTGGACATCCGGACGCTGGCTGACAGCGTGTGTCGCTATGACCTCAATGACATGGATGCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCGAGTTGGGCTATGTGGACATCCGGACGCTGGCTGACAGCGTGTGTCGCTATGACCTCAATGACATGGATGCT 444
Query 445 GCATGGCTGGAACTGACCAATGAAGAATTTAAGGAGATGGGAATGCCTGAACTAGATGAATACACCATGGAGAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCATGGCTGGAACTGACCAATGAAGAATTTAAGGAGATGGGAATGCCTGAACTAGATGAATACACCATGGAGAG 518
Query 519 GGTCCTAGAGGAATTTGAGCAGCGATGCTACGACAATATGAATCATGCCATAGAGACTGAGGAAGGCCTGGGGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGTCCTAGAGGAATTTGAGCAGCGATGCTACGACAATATGAATCATGCCATAGAGACTGAGGAAGGCCTGGGGA 592
Query 593 TCGAATATGATGAAGATGTTGTCTGTGATGTCTGCCAGTCTCCTGATGGTGAGGACGGCAATGAGATGGTGTTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCGAATATGATGAAGATGTTGTCTGTGATGTCTGCCAGTCTCCTGATGGTGAGGACGGCAATGAGATGGTGTTC 666
Query 667 TGTGACAAATGCAACATCTGTGTGCACCAGGCCTGTTATGGAATCCTCAAGGTACCAGAGGGCAGCTGGCTGTG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TGTGACAAATGCAACATCTGTGTGCACCAGGCCTGTTATGGAATCCTCAAGGTACCAGAGGGCAGCTGGCTGTG 740
Query 741 CCGGACATGTGCCCTGGGGGTTCAGCCAAAATGTCTGCTGTGTCCGAAGAAGGGTGGAGCTATGAAGCCCACCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCGGACATGTGCCCTGGGGGTTCAGCCAAAATGTCTGCTGTGTCCGAAGAAGGGTGGAGCTATGAAGCCCACCC 814
Query 815 GTAGCGGAACCAAGTGGGTCCACGTTAGCTGTGCTCTGTGGATCCCTGAGGTGAGCATTGGCAGCCCAGAGAAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTAGCGGAACCAAGTGGGTCCACGTTAGCTGTGCTCTGTGGATCCCTGAGGTGAGCATTGGCAGCCCAGAGAAG 888
Query 889 ATGGAGCCCATCACCAAGGTGTCACACATTCCCAGCAGCCGGTGGGCGCTAGTGTGCAGCCTCTGCAATGAGAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATGGAGCCCATCACCAAGGTGTCACACATTCCCAGCAGCCGGTGGGCGCTAGTGTGCAGCCTCTGCAATGAGAA 962
Query 963 GTTTGGGGCCTCTATACAGTGCTCTGTGAAGAACTGCCGCACAGCCTTCCATGTGACCTGTGCTTTTGACCGGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GTTTGGGGCCTCTATACAGTGCTCTGTGAAGAACTGCCGCACAGCCTTCCATGTGACCTGTGCTTTTGACCGGG 1036
Query 1037 GCCTGGAGATGAAGACCATCTTAGCAGAGAATGATGAAGTCAAGTTCAAGTCCTATTGCCCAAAGCACAGCTCA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCCTGGAGATGAAGACCATCTTAGCAGAGAATGATGAAGTCAAGTTCAAGTCCTATTGCCCAAAGCACAGCTCA 1110
Query 1111 CATAGGAAACCCGAGGAGAGTCTTGGCAAGGGGGCTGCACAGGAGAATGGGGCCCCTGAGTGTTCCCCCCGGAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CATAGGAAACCCGAGGAGAGTCTTGGCAAGGGGGCTGCACAGGAGAATGGGGCCCCTGAGTGTTCCCCCCGGAA 1184
Query 1185 TCCGCTGGAGCCCTTTGCCAGCCTTGAGCAGAACCGGGAGGAGGCCCACCGGGTGAGTGTCCGTAAGCAGAAGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCCGCTGGAGCCCTTTGCCAGCCTTGAGCAGAACCGGGAGGAGGCCCACCGGGTGAGTGTCCGTAAGCAGAAGC 1258
Query 1259 TGCAGCAGTTGGAGGATGAGTTCTACACCTTCGTCAACCTGCTGGATGTTGCCAGGGCTCTGCGGCTGCCTGAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGCAGCAGTTGGAGGATGAGTTCTACACCTTCGTCAACCTGCTGGATGTTGCCAGGGCTCTGCGGCTGCCTGAG 1332
Query 1333 GAAGTAGTGGATTTCCTGTACCAGTACTGGAAGTTGAAGAGGAAGGTCAACTTCAACAAGCCCCTGATCACCCC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAAGTAGTGGATTTCCTGTACCAGTACTGGAAGTTGAAGAGGAAGGTCAACTTCAACAAGCCCCTGATCACCCC 1406
Query 1407 AAAGAAAGATGAAGAGGACAATCTAGCCAAGCGGGAGCAGGATGTCTTATTTAGGAGGCTGCAGCTGTTCACGC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AAAGAAAGATGAAGAGGACAATCTAGCCAAGCGGGAGCAGGATGTCTTATTTAGGAGGCTGCAGCTGTTCACGC 1480
Query 1481 ACCTGCGGCAGGACCTGGAGAGGGT----AA--TGATTGACA--CTGACACC------------TTA------- 1527
||||||||||||||||||||||||| || |.|.|.||| .|||| || |||
Sbjct 1481 ACCTGCGGCAGGACCTGGAGAGGGTTCGGAACCTCACTTACATGGTGAC-CCGCAGGGAAAAGATTAAACGGTC 1553
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 1554 TGTGTGCAAAGTCCAGGAACAGATATTCAATCTTTACACTAAGCTTTTGGAGCAAGAAAGAGTTTCAGGTGTGC 1627
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 1628 CTTCTTCCTGCTCCTCCTCCTCACTGGAAAACATGCTTTTGTTTAACAGTCCTTCTGTTGGCCCTGATGCTCCC 1701
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 1702 AAGATAGAGGACTTGAAGTGGCATTCTGCATTCTTCAGAAAACAAATGGGTACTTCCTTGGTTCATTCGCTGAA 1775
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 1776 AAAGCCCCATAAGCGAGATCCTTTGCAGAATAGCCCTGGAAGTGAAGGCAAAACCCTGCTGAAGCAGCCAGACC 1849
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 1850 TGTGTGGTAGAAGGGAGGGGATGGTGGTCCCAGAGAGCTTTTTGGGTTTAGAAAAGACCTTTGCAGAAGCACGT 1923
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 1924 CTCATATCAGCACAACAGAAAAATGGTGTGGTGATGCCAGACCATGGGAAAAGAAGAGACAATCGTTTTCATTG 1997
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 1998 TGATCTCATTAAAGGAGACTTAAAGGACAAATCTTTTAAACAGAGTCACAAGCCTCTCAGGTCCACAGATGTGT 2071
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 2072 CCCAGAGGCATCTGGACAACACAAGAGCTGCCACCTCCCCTGGAGTGGGGCAGTCAGCACCTGGCACAAGGAAG 2145
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 2146 GAGATAGTGCCCAAGTGCAATGGCTCCCTAATCAAAGTAAACTATAATCAGACTGCAGTCAAAGTGCCTACAAC 2219
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 2220 ACCTGCCAGCCCAGTGAAAAACTGGGGAGGATTCCGGATTCCAAAGAAGGGGGAACGGCAGCAGCAGGGAGAGG 2293
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 2294 CCCACGATGGGGCCTGCCACCAGCACTCAGACTACCCATATTTGGGCTTAGGCCGAGTTCCAGCCAAGGAAAGG 2367
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 2368 GCAAAAAGCAAATTAAAATCCGACAATGAGAATGACGGGTATGTCCCCGATGTGGAAATGAGTGACTCAGAGAG 2441
Query 1528 -------------------------------------------------------------------------- 1527
Sbjct 2442 TGAGGCATCAGAAAAGAAATGTATACACACCAGCAGCACTATCAGCAGAAGGACAGACATTATCAGGAGAAGCA 2515
Query 1528 ----------- 1527
Sbjct 2516 TCTTGGCTTCT 2526
