Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473400
• Subject: NM_001310456.1
• Aligned Length: 1386
• Identities: 1223
• Gaps: 45

Alignment

Query    1  ----------ATGGATCGGATGAAGA---AGATCA---------AACGGCAGCTGTCAATGACACTC---AGCT  49
                      ||||||..||||||||   |.||.|         ||.|..|| |||...||  ||||   ||..
Sbjct    1  ATGTACACAAATGGATACGATGAAGAAATATATTATATTGGGGGAAAGAGAG-TGTTCTTG--ACTCCAAAGGC  71

Query   50  CTG-----------------CACCAGAGATTGTGCACGAGGACTTGAAGATGGGGTCTGATGGGGAGAGTGACC  106
            |||                 |.|||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct   72  CTGGCCTTTCCCTCTCCCCACCCCAGAGATTGTGCACGAGGACATGAAGATGGGATCTGATGGGGAGAGTGACC  145

Query  107  AGGCTTCAGCCACGTCCTCGGATGAGGTGCAGTCTCCAGTGAGAGTGCGTATGCGCAACCATCCCCCACGCAAG  180
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  146  AGGCTTCAGCCACATCCTCAGATGAGGTGCAGTCTCCAGTGAGAGTGCGCATGCGCAACCACCCCCCACGCAAG  219

Query  181  ATCTCCACTGAGGACATCAACAAGCGCCTATCACTACCAGCTGACATCCGGCTGCCTGAGGGCTACCTGGAGAA  254
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  220  ATCTCCACTGAGGACATCAACAAACGCCTGTCACTACCAGCTGACATACGGCTGCCTGAGGGCTACCTTGAGAA  293

Query  255  GCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGACAAGCCCCTCAGCCGCCGCCTCCGTCGTGTCAGCCTATCTGAGATTG  328
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||.|||||..|.||||||||||
Sbjct  294  GCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGATAAGCCTCTTAGCCGGCGCCTCCGCCGAGTCAGTTTGTCTGAGATTG  367

Query  329  GCTTTGGGAAACTGGAGACCTACATTAAGCTGGACAAACTGGGCGAGGGTACCTATGCCACCGTCTACAAAGGC  402
            |||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  368  GCTTTGGAAAACTGGAGACCTACATCAAGCTAGACAAGCTGGGTGAGGGTACCTATGCCACTGTCTACAAAGGC  441

Query  403  AAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTGGCACTCAAGGAGATCAGACTGGAACATGAAGAGGGGGCACCCTGCAC  476
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct  442  AAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTAGCACTTAAGGAGATCAGACTGGAACACGAAGAAGGGGCACCCTGTAC  515

Query  477  CGCCATCCGGGAAGTGTCCCTGCTCAAGGACCTCAAACACGCCAACATCGTTACGCTACATGACATTATCCACA  550
            .||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  516  TGCTATCCGGGAAGTATCCCTGCTTAAGGACCTCAAGCATGCCAACATCGTCACACTACATGACATTATCCACA  589

Query  551  CGGAGAAGTCCCTCACCCTTGTCTTTGAGTACCTGGACAAGGACCTGAAGCAGTACCTGGATGACTGTGGGAAC  624
            |.||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  590  CAGAGAAGTCCCTCACACTTGTCTTTGAATACTTGGACAAGGACCTGAAGCAGTACCTGGATGACTGTGGAAAT  663

Query  625  ATCATCAACATGCACAACGTGAAACTGTTCCTGTTCCAGCTGCTCCGTGGCCTGGCCTACTGCCACCGGCAGAA  698
            .||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  664  GTCATCAACATGCACAATGTGAAACTGTTCCTGTTCCAGTTGCTCCGTGGCCTGGCCTACTGCCACAGGCAGAA  737

Query  699  GGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAGAACCTGCTCATCAACGAGAGGGGAGAGCTCAAGCTGGCTGACTTTG  772
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct  738  GGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAGAACCTACTCATCAACGAGAGGGGAGAGCTCAAACTGGCAGATTTTG  811

Query  773  GCCTGGCCCGAGCCAAGTCAATCCCAACAAAGACATACTCCAATGAGGTGGTGACACTGTGGTACCGGCCCCCT  846
            |||||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  GCCTGGCTCGTGCCAAGTCAATTCCTACTAAAACATACTCCAACGAAGTGGTGACACTGTGGTACCGGCCCCCT  885

Query  847  GACATCCTGCTTGGGTCCACGGACTACTCCACTCAGATTGACATGTGGGGTGTGGGCTGCATCTTCTATGAGAT  920
            ||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  886  GACATCCTACTTGGGTCCACAGACTACTCTACCCAAATTGACATGTGGGGTGTAGGCTGCATCTTCTATGAGAT  959

Query  921  GGCCACAGGCCGTCCCCTCTTTCCGGGCTCCACGGTGGAGGAACAGCTACACTTCATCTTCCGTATCTTAGGAA  994
            ||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct  960  GGCCACCGGCCGGCCCCTCTTCCCAGGCTCCACAGTGGAAGAACAGCTGCACTTCATCTTCCGCATTTTGGGAA  1033

Query  995  CCCCAACTGAGGAGACGTGGCCAGGCATCCTGTCCAACGAGGAGTTCAAGACATACAACTACCCCAAGTACCGA  1068
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|..||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  CCCCAACTGAGGAGACATGGCCAGGTATCCTGTCCAATGAGGAGTTTAGAACATACAACTACCCCAAGTACCGA  1107

Query 1069  GCCGAGGCCCTTTTGAGCCACGCACCCCGACTTGATAGCGACGGGGCCGACCTCCTCACCAAGCTGTTGCAGTT  1142
            ||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1108  GCCGAGGCCCTTCTGAGCCATGCACCCCGACTTGATAGCGATGGAGCTGACCTCCTCACCAAGCTGCTGCAGTT  1181

Query 1143  TGAGGGTCGAAATCGGATCTCCGCAGAGGATGCCATGAAACATCCATTCTTCCTCAGTCTGGGGGAGCGGATCC  1216
            |||||||||.|||||||||||.||.||||||||||.|||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||
Sbjct 1182  TGAGGGTCGCAATCGGATCTCTGCTGAGGATGCCAGGAAACATCCATTCTTTCTCAGCTTGGGGGAGCGGATCC  1255

Query 1217  ACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATTTGCACTAAAGGAGATTCAGCTACAAAAGGAGGCCAGCCTTCGGTCT  1290
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||.|.|||||||.
Sbjct 1256  ACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATTTGCACTAAAGGAGGTACAGCTACAAAAGGAGGCCAACATTCGGTCC  1329

Query 1291  TCGTCGATGCCTGACTCAGGCAGGCCAGCTTTCCGCGTGGTGGACACCGAGTTC  1344
            .|.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1330  ACTTCTATGCCTGACTCAGGCAGGCCAGCTTTCCGTGTGGTGGATACCGAGTTC  1383