Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473400
• Subject: XM_011543920.3
• Aligned Length: 1729
• Identities: 1326
• Gaps: 401

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCACTCTATGGCCGTGCTCGAGACCATGTCACCCATCCTTCAATTCTGGGCACACGCCCTGGCCGACCCAT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGCTGGGCCCATCACTGCAGCTGTACCTGAGAAGATCTGCAATGGAGCCTTCTGCTCCTGCAGTGGGGCTTTTC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CCCTAGATCCCAACAATCCATCGTTAGGGCCCTTGCCCTCAATCAGCCACCTAAATCTGAGAACTCAGATCGCC  222

Query    1  ATGGATCGGATGAAGAAGATCAAACGGCAGCTGTCAATGA----------------------------------  40
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                  
Sbjct  223  ATGGATCGGATGAAGAAGATCAAACGGCAGCTGTCAATGACACTCCGAGGTGGCCGAGGCATAGACAAGACCAA  296

Query   41  --------------------------------------------------------------------------  40
                                                                                      
Sbjct  297  TGGTGCCCCTGAGCAGATAGGCCTGGATGAGAGTGGTGGTGGTGGCGGCAGTGACCCTGGAGAGGCCCCCACAC  370

Query   41  ------------------------------------CACTCAGCTCTGCACCAGAGATTGTGCACGAGGACTTG  78
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTGCTGCTCCTGGGGAACTTCGTTCTGCACGGGGCCCACTCAGCTCTGCACCAGAGATTGTGCACGAGGACTTG  444

Query   79  AAGATGGGGTCTGATGGGGAGAGTGACCAGGCTTCAGCCACGTCCTCGGATGAGGTGCAGTCTCCAGTGAGAGT  152
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGATGGGGTCTGATGGGGAGAGTGACCAGGCTTCAGCCACGTCCTCGGATGAGGTGCAGTCTCCAGTGAGAGT  518

Query  153  GCGTATGCGCAACCATCCCCCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAGCGCCTATCACTACCAGCTGACA  226
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCGTATGCGCAACCATCCCCCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAGCGCCTATCACTACCAGCTGACA  592

Query  227  TCCGGCTGCCTGAGGGCTACCTGGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGACAAGCCCCTCAGCCGCCGC  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCGGCTGCCTGAGGGCTACCTGGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGACAAGCCCCTCAGCCGCCGC  666

Query  301  CTCCGTCGTGTCAGCCTATCTGAGATTGGCTTTGGGAAACTGGAGACCTACATTAAGCTGGACAAACTGGGCGA  374
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCCGTCGTGTCAGCCTATCTGAGATTGGCTTTGGGAAACTGGAGACCTACATTAAGCTGGACAAACTGGGCGA  740

Query  375  GGGTACCTATGCCACCGTCTACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTGGCACTCAAGGAGATCAGAC  448
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGGTACCTATGCCACCGTCTACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTGGCACTCAAGGAGATCAGAC  814

Query  449  TGGAACATGAAGAGGGGGCACCCTGCACCGCCATCCGGGAAGTGTCCCTGCTCAAGGACCTCAAACACGCCAAC  522
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGAACATGAAGAGGGGGCACCCTGCACCGCCATCCGGGAAGTGTCCCTGCTCAAGGACCTCAAACACGCCAAC  888

Query  523  ATCGTTACGCTACATGACATTATCCACACGGAGAAGTCCCTCACCCTTGTCTTTGAGTACCTGGACAAGGACCT  596
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATCGTTACGCTACATGACATTATCCACACGGAGAAGTCCCTCACCCTTGTCTTTGAGTACCTGGACAAGGACCT  962

Query  597  GAAGCAGTACCTGGATGACTGTGGGAACATCATCAACATGCACAACGTGAAACTGTTCCTGTTCCAGCTGCTCC  670
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAAGCAGTACCTGGATGACTGTGGGAACATCATCAACATGCACAACGTGAAACTGTTCCTGTTCCAGCTGCTCC  1036

Query  671  GTGGCCTGGCCTACTGCCACCGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAGAACCTGCTCATCAACGAG  744
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTGGCCTGGCCTACTGCCACCGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAGAACCTGCTCATCAACGAG  1110

Query  745  AGGGGAGAGCTCAAGCTGGCTGACTTTGGCCTGGCCCGAGCCAAGTCAATCCCAACAAAGACATACTCCAATGA  818
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGGGGAGAGCTCAAGCTGGCTGACTTTGGCCTGGCCCGAGCCAAGTCAATCCCAACAAAGACATACTCCAATGA  1184

Query  819  GGTGGTGACACTGTGGTACCGGCCCCCTGACATCCTGCTTGGGTCCACGGACTACTCCACTCAGATTGACATGT  892
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGTGGTGACACTGTGGTACCGGCCCCCTGACATCCTGCTTGGGTCCACGGACTACTCCACTCAGATTGACATGT  1258

Query  893  GGGGTGTGGGCTGCATCTTCTATGAGATGGCCACAGGCCGTCCCCTCTTTCCGGGCTCCACGGTGGAGGAACAG  966
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGGGTGTGGGCTGCATCTTCTATGAGATGGCCACAGGCCGTCCCCTCTTTCCGGGCTCCACGGTGGAGGAACAG  1332

Query  967  CTACACTTCATCTTCCGTATCTTAGGAACCCCAACTGAGGAGACGTGGCCAGGCATCCTGTCCAACGAGGAGTT  1040
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTACACTTCATCTTCCGTATCTTAGGAACCCCAACTGAGGAGACGTGGCCAGGCATCCTGTCCAACGAGGAGTT  1406

Query 1041  CAAGACATACAACTACCCCAAGTACCGAGCCGAGGCCCTTTTGAGCCACGCACCCCGACTTGATAGCGACGGGG  1114
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAGACATACAACTACCCCAAGTACCGAGCCGAGGCCCTTTTGAGCCACGCACCCCGACTTGATAGCGACGGGG  1480

Query 1115  CCGACCTCCTCACCAAGCTGTTGCAGTTTGAGGGTCGAAATCGGATCTCCGCAGAGGATGCCATGAAACATCCA  1188
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCGACCTCCTCACCAAGCTGTTGCAGTTTGAGGGTCGAAATCGGATCTCCGCAGAGGATGCCATGAAACATCCA  1554

Query 1189  TTCTTCCTCAGTCTGGGGGAGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATTTGCACTAAAGGAGATTCA  1262
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTCTTCCTCAGTCTGGGGGAGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATTTGCACTAAAGGAGATTCA  1628

Query 1263  GCTACAAAAGGAGGCCAGCCTTCGGTCTTCGTCGATGCCTGACTCAGGCAGGCCAGCTTTCCGCGTGGTGGACA  1336
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||.||    ||||||||
Sbjct 1629  GCTACAAAAGGAGGCCAGCCTTCGGTCTTCGTCGATGCCTGACTCAG----------TTGCC----GGTGGACA  1688

Query 1337  ------CCGAGTTC-------------  1344
                  ||  ||.|             
Sbjct 1689  GCATGGCC--GTGCCAGCCTCCCACAC  1713