Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473400
• Subject: XM_011543922.1
• Aligned Length: 1636
• Identities: 1326
• Gaps: 308

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCGCGTCCCCTCCCGCTGCGGACGGGTCCTTTGGTACATGCAGTCCGAGGTCCTCAGGATATAGCCGTGA  74

Query    1  -------------------------------------------------------ATGGATCGGATGAAGAAGA  19
                                                                   |||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTAAACACAGAAATCTACCCTGGCGGAGCTGATCTTCTAGTTGTGGCGATCGCCATGGATCGGATGAAGAAGA  148

Query   20  TCAAACGGCAGCTGTCAATGA-----------------------------------------------------  40
            |||||||||||||||||||||                                                     
Sbjct  149  TCAAACGGCAGCTGTCAATGACACTCCGAGGTGGCCGAGGCATAGACAAGACCAATGGTGCCCCTGAGCAGATA  222

Query   41  --------------------------------------------------------------------------  40
                                                                                      
Sbjct  223  GGCCTGGATGAGAGTGGTGGTGGTGGCGGCAGTGACCCTGGAGAGGCCCCCACACGTGCTGCTCCTGGGGAACT  296

Query   41  -----------------CACTCAGCTCTGCACCAGAGATTGTGCACGAGGACTTGAAGATGGGGTCTGATGGGG  97
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCGTTCTGCACGGGGCCCACTCAGCTCTGCACCAGAGATTGTGCACGAGGACTTGAAGATGGGGTCTGATGGGG  370

Query   98  AGAGTGACCAGGCTTCAGCCACGTCCTCGGATGAGGTGCAGTCTCCAGTGAGAGTGCGTATGCGCAACCATCCC  171
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAGTGACCAGGCTTCAGCCACGTCCTCGGATGAGGTGCAGTCTCCAGTGAGAGTGCGTATGCGCAACCATCCC  444

Query  172  CCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAGCGCCTATCACTACCAGCTGACATCCGGCTGCCTGAGGGCTA  245
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAGCGCCTATCACTACCAGCTGACATCCGGCTGCCTGAGGGCTA  518

Query  246  CCTGGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGACAAGCCCCTCAGCCGCCGCCTCCGTCGTGTCAGCCTAT  319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTGGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGACAAGCCCCTCAGCCGCCGCCTCCGTCGTGTCAGCCTAT  592

Query  320  CTGAGATTGGCTTTGGGAAACTGGAGACCTACATTAAGCTGGACAAACTGGGCGAGGGTACCTATGCCACCGTC  393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGAGATTGGCTTTGGGAAACTGGAGACCTACATTAAGCTGGACAAACTGGGCGAGGGTACCTATGCCACCGTC  666

Query  394  TACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTGGCACTCAAGGAGATCAGACTGGAACATGAAGAGGGGGC  467
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTGGCACTCAAGGAGATCAGACTGGAACATGAAGAGGGGGC  740

Query  468  ACCCTGCACCGCCATCCGGGAAGTGTCCCTGCTCAAGGACCTCAAACACGCCAACATCGTTACGCTACATGACA  541
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACCCTGCACCGCCATCCGGGAAGTGTCCCTGCTCAAGGACCTCAAACACGCCAACATCGTTACGCTACATGACA  814

Query  542  TTATCCACACGGAGAAGTCCCTCACCCTTGTCTTTGAGTACCTGGACAAGGACCTGAAGCAGTACCTGGATGAC  615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTATCCACACGGAGAAGTCCCTCACCCTTGTCTTTGAGTACCTGGACAAGGACCTGAAGCAGTACCTGGATGAC  888

Query  616  TGTGGGAACATCATCAACATGCACAACGTGAAACTGTTCCTGTTCCAGCTGCTCCGTGGCCTGGCCTACTGCCA  689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGTGGGAACATCATCAACATGCACAACGTGAAACTGTTCCTGTTCCAGCTGCTCCGTGGCCTGGCCTACTGCCA  962

Query  690  CCGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAGAACCTGCTCATCAACGAGAGGGGAGAGCTCAAGCTGG  763
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAGAACCTGCTCATCAACGAGAGGGGAGAGCTCAAGCTGG  1036

Query  764  CTGACTTTGGCCTGGCCCGAGCCAAGTCAATCCCAACAAAGACATACTCCAATGAGGTGGTGACACTGTGGTAC  837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGACTTTGGCCTGGCCCGAGCCAAGTCAATCCCAACAAAGACATACTCCAATGAGGTGGTGACACTGTGGTAC  1110

Query  838  CGGCCCCCTGACATCCTGCTTGGGTCCACGGACTACTCCACTCAGATTGACATGTGGGGTGTGGGCTGCATCTT  911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGGCCCCCTGACATCCTGCTTGGGTCCACGGACTACTCCACTCAGATTGACATGTGGGGTGTGGGCTGCATCTT  1184

Query  912  CTATGAGATGGCCACAGGCCGTCCCCTCTTTCCGGGCTCCACGGTGGAGGAACAGCTACACTTCATCTTCCGTA  985
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTATGAGATGGCCACAGGCCGTCCCCTCTTTCCGGGCTCCACGGTGGAGGAACAGCTACACTTCATCTTCCGTA  1258

Query  986  TCTTAGGAACCCCAACTGAGGAGACGTGGCCAGGCATCCTGTCCAACGAGGAGTTCAAGACATACAACTACCCC  1059
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTTAGGAACCCCAACTGAGGAGACGTGGCCAGGCATCCTGTCCAACGAGGAGTTCAAGACATACAACTACCCC  1332

Query 1060  AAGTACCGAGCCGAGGCCCTTTTGAGCCACGCACCCCGACTTGATAGCGACGGGGCCGACCTCCTCACCAAGCT  1133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGTACCGAGCCGAGGCCCTTTTGAGCCACGCACCCCGACTTGATAGCGACGGGGCCGACCTCCTCACCAAGCT  1406

Query 1134  GTTGCAGTTTGAGGGTCGAAATCGGATCTCCGCAGAGGATGCCATGAAACATCCATTCTTCCTCAGTCTGGGGG  1207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTTGCAGTTTGAGGGTCGAAATCGGATCTCCGCAGAGGATGCCATGAAACATCCATTCTTCCTCAGTCTGGGGG  1480

Query 1208  AGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATTTGCACTAAAGGAGATTCAGCTACAAAAGGAGGCCAGC  1281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATTTGCACTAAAGGAGATTCAGCTACAAAAGGAGGCCAGC  1554

Query 1282  CTTCGGTCTTCGTCGATGCCTGACTCAGGCAGGCCAGCTTTCCGCGTGGTGGACA------CCGAGTTC-----  1344
            ||||||||||||||||||||||||||||          ||.||    ||||||||      ||  ||.|     
Sbjct 1555  CTTCGGTCTTCGTCGATGCCTGACTCAG----------TTGCC----GGTGGACAGCATGGCC--GTGCCAGCC  1612

Query 1345  --------  1344
                    
Sbjct 1613  TCCCACAC  1620