Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000473531
Subject:
NM_001322971.2
Aligned Length:
1317
Identities:
994
Gaps:
321

Alignment

Query    1  ATGTTTTCCAAACTGGCACATTTGCAGAGGTTTGCTGTACTTAGTCGCGGAGTTCATTCTTCAGTGGCTTCTGC  74
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTTTCCAAACTAGCACATTTGCAGAGGTTTGCTGTACTTAGTCGCGGAGTTCATTCTTCAGTGGCTTCTGC  74

Query   75  TACATCTGTTGCAACTAAAAAAACAGTCCAAGGCCCTCCAACCTCTGATGACATTTTTGAAAGGGAATATAAGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TACATCTGTTGCAACTAAAAAAACAGTCCAAGGCCCTCCAACCTCTGATGACATTTTTGAAAGGGAATATAAGT  148

Query  149  ATGGTGCACACAACTACCATCCTTTACCTGTAGCCCTGGAGAGAGGAAAAGGTATTTACTTATGGGATGTAGAA  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                         
Sbjct  149  ATGGTGCACACAACTACCATCCTTTACCTGTAGCCCTGGAGAGAGGAAA-------------------------  197

Query  223  GGCAGAAAATATTTTGACTTCCTGAGTTCTTACAGTGCTGTCAACCAAGGGCATTGTCACCCCAAGATTGTGAA  296
                                                                                      
Sbjct  198  --------------------------------------------------------------------------  197

Query  297  TGCTCTGAAGAGTCAAGTGGACAAATTGACCTTAACATCTAGAGCTTTCTATAATAACGTACTTGGTGAATATG  370
                                                                                      
Sbjct  198  --------------------------------------------------------------------------  197

Query  371  AGGAGTATATTACTAAACTTTTCAACTACCACAAAGTTCTTCCTATGAATACAGGAGTGGAGGCTGGAGAGACT  444
                                                                                      
Sbjct  198  --------------------------------------------------------------------------  197

Query  445  GCCTGTAAACTAGCTCGTAAGTGGGGCTATACCGTGAAGGGCATTCAGAAATACAAAGCAAAGATTGTTTTTGC  518
                                                                                      
Sbjct  198  --------------------------------------------------------------------------  197

Query  519  AGCTGGGAACTTCTGGGGTAGGACGTTGTCTGCTATCTCCAGTTCCACAGACCCAACCAGTTACGATGGTTTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  198  AGCTGGGAACTTCTGGGGTAGGACGTTGTCTGCTATCTCCAGTTCCACAGACCCAACCAGTTACGATGGTTTTG  271

Query  593  GACCATTTATGCCGGGATTCGACATCATTCCCTATAATGATCTGCCCGCACTGGAGCGTGCTCTTCAGGATCCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  272  GACCATTTATGCCGGGATTCGACATCATTCCCTATAATGATCTGCCCGCACTGGAGCGTGCTCTTCAGGATCCA  345

Query  667  AATGTGGCTGCGTTCATGGTAGAACCAATTCAGGGTGAAGCAGGCGTTGTTGTTCCGGATCCAGGTTACCTAAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  346  AATGTGGCTGCGTTCATGGTAGAACCAATTCAGGGTGAAGCAGGCGTTGTTGTTCCGGATCCAGGTTACCTAAT  419

Query  741  GGGAGTGCGAGAGCTCTGCACCAGGCACCAGGTTCTCTTTATTGCTGATGAAATACAGACAGGATTGGCCAGAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  420  GGGAGTGCGAGAGCTCTGCACCAGGCACCAGGTTCTCTTTATTGCTGATGAAATACAGACAGGATTGGCCAGAA  493

Query  815  CTGGTAGATGGCTGGCTGTTGATTATGAAAATGTCAGACCTGATATAGTCCTCCTTGGAAAGGCCCTTTCTGGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  494  CTGGTAGATGGCTGGCTGTTGATTATGAAAATGTCAGACCTGATATAGTCCTCCTTGGAAAGGCCCTTTCTGGG  567

Query  889  GGCTTATACCCTGTGTCTGCAGTGCTGTGTGATGATGACATCATGCTGACCATTAAGCCAGGGGAGCATGGGTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  568  GGCTTATACCCTGTGTCTGCAGTGCTGTGTGATGATGACATCATGCTGACCATTAAGCCAGGGGAGCATGGGTC  641

Query  963  CACATACGGTGGCAATCCACTAGGCTGCCGAGTGGCCATCGCAGCCCTTGAGGTTTTAGAAGAAGAAAACCTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  642  CACATACGGTGGCAATCCACTAGGCTGCCGAGTGGCCATCGCAGCCCTTGAGGTTTTAGAAGAAGAAAACCTTG  715

Query 1037  CTGAAAATGCAGACAAATTGGGCATTATCTTGAGAAATGAACTCATGAAGCTACCTTCTGATGTTGTAACTGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  716  CTGAAAATGCAGACAAATTGGGCATTATCTTGAGAAATGAACTCATGAAGCTACCTTCTGATGTTGTAACTGCC  789

Query 1111  GTAAGAGGAAAAGGATTATTAAACGCTATTGTCATTAAAGAAACCAAAGATTGGGATGCTTGGAAGGTGTGTCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  790  GTAAGAGGAAAAGGATTATTAAACGCTATTGTCATTAAAGAAACCAAAGATTGGGATGCTTGGAAGGTGTGTCT  863

Query 1185  ACGACTTCGAGATAATGGACTTCTGGCCAAGCCAACCCATGGCGACATTATCAGGTTTGCGCCTCCGCTGGTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  864  ACGACTTCGAGATAATGGACTTCTGGCCAAGCCAACCCATGGCGACATTATCAGGTTTGCGCCTCCGCTGGTGA  937

Query 1259  TCAAGGAGGATGAGCTTCGAGAGTCCATTGAAATTATTAACAAGACCATCTTATCTTTC  1317
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  938  TCAAGGAGGATGAGCTTCGAGAGTCCATTGAAATTATTAACAAGACCATCTTGTCTTTC  996