Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473531
• Subject: NM_016978.2
• Aligned Length: 1317
• Identities: 1111
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTTTTCCAAACTGGCACATTTGCAGAGGTTTGCTGTACTTAGTCGCGGAGTTCATTCTTCAGTGGCTTCTGC  74
            |||.||||.|||||.|||..|.||||||...||||||..||..|.||.|||||.||..|.|||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGCTTTCTAAACTAGCAAGTCTGCAGACCATTGCTGCTCTGCGCCGAGGAGTCCACACCTCAGTCGCCTCTGC  74

Query   75  TACATCTGTTGCAACTAAAAAAACAGTCCAAGGCCCTCCAACCTCTGATGACATTTTTGAAAGGGAATATAAGT  148
            .||.||||||||.||.||.||.||||..||||||||.|||.||||.||..|||||||||||.||||||.|||.|
Sbjct   75  CACGTCTGTTGCCACAAAGAAGACAGAGCAAGGCCCACCATCCTCCGAGTACATTTTTGAACGGGAATCTAAAT  148

Query  149  ATGGTGCACACAACTACCATCCTTTACCTGTAGCCCTGGAGAGAGGAAAAGGTATTTACTTATGGGATGTAGAA  222
            |||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.||||||||.|||
Sbjct  149  ATGGTGCACACAATTACCATCCTTTGCCTGTAGCCCTGGAGAGAGGAAAAGGCATTTATATGTGGGATGTGGAA  222

Query  223  GGCAGAAAATATTTTGACTTCCTGAGTTCTTACAGTGCTGTCAACCAAGGGCATTGTCACCCCAAGATTGTGAA  296
            |||||..|.||.||.||.|||||||||.||||..|||||||||.||||||.||.||.|||||.|||||..|..|
Sbjct  223  GGCAGGCAGTACTTCGATTTCCTGAGTGCTTATGGTGCTGTCAGCCAAGGACACTGCCACCCAAAGATCATAGA  296

Query  297  TGCTCTGAAGAGTCAAGTGGACAAATTGACCTTAACATCTAGAGCTTTCTATAATAACGTACTTGGTGAATATG  370
            |||..||||||||||.||||||||..||||.|||||||||.|.|||||||||||.||.||.|||||||||||.|
Sbjct  297  TGCCATGAAGAGTCAGGTGGACAAGCTGACATTAACATCTCGGGCTTTCTATAACAATGTCCTTGGTGAATACG  370

Query  371  AGGAGTATATTACTAAACTTTTCAACTACCACAAAGTTCTTCCTATGAATACAGGAGTGGAGGCTGGAGAGACT  444
            |||||||.||.||.||.||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGAGTACATCACCAAGCTTTTCAACTACAACAAAGTTCTCCCTATGAATACAGGAGTGGAGGCTGGAGAGACT  444

Query  445  GCCTGTAAACTAGCTCGTAAGTGGGGCTATACCGTGAAGGGCATTCAGAAATACAAAGCAAAGATTGTTTTTGC  518
            ||.|||||.||.||||||...||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCATGTAAGCTCGCTCGTCGTTGGGGCTACACCGTGAAAGGCATCCAGAAATACAAAGCAAAGATTGTTTTTGC  518

Query  519  AGCTGGGAACTTCTGGGGTAGGACGTTGTCTGCTATCTCCAGTTCCACAGACCCAACCAGTTACGATGGTTTTG  592
            .|.|||||||||.||||||.|.||..|.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  519  TGATGGGAACTTTTGGGGTCGAACACTATCTGCAATCTCCAGTTCCACAGATCCGACCAGTTATGATGGCTTTG  592

Query  593  GACCATTTATGCCGGGATTCGACATCATTCCCTATAATGATCTGCCCGCACTGGAGCGTGCTCTTCAGGATCCA  666
            ||||.||.|||||.||.||.||.|.|||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GACCCTTCATGCCAGGCTTTGAAACCATCCCATATAACGATCTGCCCGCACTGGAGCGTGCTCTTCAGGATCCA  666

Query  667  AATGTGGCTGCGTTCATGGTAGAACCAATTCAGGGTGAAGCAGGCGTTGTTGTTCCGGATCCAGGTTACCTAAT  740
            |||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||||.|||||.|.
Sbjct  667  AATGTTGCTGCCTTCATGGTGGAGCCCATCCAGGGTGAAGCAGGCGTTATCGTTCCGGATCCAGGATACCTGAC  740

Query  741  GGGAGTGCGAGAGCTCTGCACCAGGCACCAGGTTCTCTTTATTGCTGATGAAATACAGACAGGATTGGCCAGAA  814
            .|||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGAGTTCGGGAACTCTGCACCAGGCACCAGGTCCTGTTTATTGCTGATGAAATACAGACAGGATTGGCCAGAA  814

Query  815  CTGGTAGATGGCTGGCTGTTGATTATGAAAATGTCAGACCTGATATAGTCCTCCTTGGAAAGGCCCTTTCTGGG  888
            |||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct  815  CTGGTAGATGGCTGGCTGTGGATCATGAGAATGTCAGACCTGATATGGTTCTTCTTGGGAAGGCCCTTTCTGGC  888

Query  889  GGCTTATACCCTGTGTCTGCAGTGCTGTGTGATGATGACATCATGCTGACCATTAAGCCAGGGGAGCATGGGTC  962
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||
Sbjct  889  GGTTTATACCCTGTGTCTGCAGTGCTGTGTGACGATGAGATAATGCTGACCATTAAACCAGGCGAGCACGGCTC  962

Query  963  CACATACGGTGGCAATCCACTAGGCTGCCGAGTGGCCATCGCAGCCCTTGAGGTTTTAGAAGAAGAAAACCTTG  1036
            |||||||||.||.||.|||||||||||||||.|.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct  963  CACATACGGCGGAAACCCACTAGGCTGCCGAATTGCCATTGCGGCTCTTGAGGTTTTAGAAGAGGAGAATCTTG  1036

Query 1037  CTGAAAATGCAGACAAATTGGGCATTATCTTGAGAAATGAACTCATGAAGCTACCTTCTGATGTTGTAACTGCC  1110
            ||||.|||||||||||..|||||..||||.||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||..|.
Sbjct 1037  CTGAGAATGCAGACAAGATGGGCGCTATCCTGAGGAAGGAGCTCATGAAGCTGCCCTCTGACGTTGTGACCTCA  1110

Query 1111  GTAAGAGGAAAAGGATTATTAAACGCTATTGTCATTAAAGAAACCAAAGATTGGGATGCTTGGAAGGTGTGTCT  1184
            ||.|||||.|||||.||..||||.||.||||||||.|.||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1111  GTGAGAGGGAAAGGGTTGCTAAATGCCATTGTCATCAGAGAAACCAAAGACTGTGATGCTTGGAAGGTGTGCCT  1184

Query 1185  ACGACTTCGAGATAATGGACTTCTGGCCAAGCCAACCCATGGCGACATTATCAGGTTTGCGCCTCCGCTGGTGA  1258
            .||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||.||||.|||||.||.||||
Sbjct 1185  GCGACTTCGAGATAACGGGCTTCTGGCCAAGCCAACCCACGGTGATATCATCAGGCTTGCCCCTCCCCTTGTGA  1258

Query 1259  TCAAGGAGGATGAGCTTCGAGAGTCCATTGAAATTATTAACAAGACCATCTTATCTTTC  1317
            ||||||||||||||.|.||.||||||.|.||.||.||.||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 1259  TCAAGGAGGATGAGATCCGGGAGTCCGTGGAGATCATCAACAAGACTATCTTGTCCTTC  1317