Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000473586
Subject:
NR_002944.2
Aligned Length:
1355
Identities:
955
Gaps:
396

Alignment

Query    1  -----------------------------------------------------------ATGTCTAAGTCAGAG  15
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct    1  TTTCTGCCCGTGGACACCGCCGAAGAAGCATCGTTAAAGTCTCTCTTCACCCTGCCGTCATGTCTAAGTCAGAG  74

Query   16  TCTCCTAAAGAGCCCGAACAGCTGAGGAAGCTCTTCATTGGAGGGTTGAGCTTTGAAACAACTGATGAGAGCCT  89
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTCCTAAAGAGCCCGAACAGCTGAGGAAGCTCTTCATTGGAGGGTTGAGCTTTGAAACAACTGATGAGAGCCT  148

Query   90  GAGGAGCCATTTTGAGCAATGGGGAACGCTCACGGACTGTGTGGTAATGAGAGATCCAAACACCAAGCGCTCCA  163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAGGAGCCATTTTGAGCAATGGGGAACGCTCACGGACTGTGTGGTAATGAGAGATCCAAACACCAAGCGCTCCA  222

Query  164  GGGGCTTTGGGTTTGTCACATATGCCACTGTGGAGGAGGTGGATGCAGCTATGAATGCAAGGCCACACAAGGTG  237
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGGCTTTGGGTTTGTCACGTATGCCACTGTGGAGGAGGTGGATGCAGCTATGAATGCAAGGCCACACAAGGTG  296

Query  238  GATGGAAGAGTTGTGGAACCAAAGAGAGCTGTCTCCAGAGAAGATTCTCAAAGACCAGGTGCCCACTTAACTGT  311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATGGAAGAGTTGTGGAACCAAAGAGAGCTGTCTCCAGAGAAGATTCTCAAAGACCAGGTGCCCACTTAACTGT  370

Query  312  GAAAAAGATATTTGTTGGTGGCATTAAAGAAGACACTGAAGAACATCACCTAAGAGATTATTTTGAACAGTATG  385
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAAAAAGATATTTGTTGGTGGCATTAAAGAAGACACTGAAGAACATCACCTAAGAGATTATTTTGAACAGTATG  444

Query  386  GAAAAATTGAAGTGATTGAAATCATGACTGACCGAGGCAGTGGCAAGAAAAGGGGCTTTGCCTTTGTAACCTTT  459
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAAAATTGAAGTGATTGAAATCATGACTGACCGAGGCAGTGGCAAGAAAAGGGGCTTTGCCTTTGTAACCTTT  518

Query  460  GACGACCATGACTCCGTGGATAAGATTGTCATTCAGAAATACCATACTGTGAATGGCCACAACTGTGAAGTTAG  533
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACGACCATGACTCCGTGGATAAGACTGTCATTCAGAAATACCATACTGTGAATGGCCACAACTGTGAAGTTAG  592

Query  534  AAAAGCCCTGTCAAAGCAAGAGATGGCTAGTGCTTCATCCAGCCAAAGAGGTCGAAGTGGTTCTGGAAACTTTG  607
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAAAGCCCTGTCAAAGCAAGAGATGGCTAGTGCTTCATCCAGCCAAAGAGGTCGAAGTGGTTCTGGAAACTTTG  666

Query  608  GTGGTGGTCGTGGAGGTGGTTTCGGTGGGAATGACAACTTCGGTCGTGGAGGAAACTTCAGTGGTCGTGGTGGC  681
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGGTGGTCGTGGAGGTGGTTTCGGTGGGAATGACAACTTCGGTCGTGGAGGAAACTTCAGTGGTCGTGGTGGC  740

Query  682  TTTGGTGGCAGCCGTGGTGGTGGTGGATATGGTGGCAGTGGGGATGGCTATAATGGATTTGGTAATGATGGAAG  755
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTTGGTGGCAGCCATGGTGGTGGTGGATATGGTGGCAGTGGGGATGGCTATAATGGATTTGGTAATGATGGAAG  814

Query  756  CAATTTTGGAGGTGGTGGAAGCTACAATGATTTTGGGAATTACAACAATCAGTCTTCAAATTTTGGACCCATGA  829
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAATTTTGGAGGTGGTGGAAGCTACAATGATTTTGGCAATTACAACAATCAGTCTTCAAATTTTGGACCCATGA  888

Query  830  AGGGAGGAAATTTTGGAGGCAGAAGCTCTGGCCCCTATGGCGGTGGAGGCCAATACTTTGCAAAACCACGAAAC  903
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGGGAGGAAATTTTGGAGGCAGAAGCTCTGGCCCCTATGGCGGTGGAGGCCAATACTTTGCAAAACCACGAAAC  962

Query  904  CAAGGTGGCTATGGCGGTTCCAGCAGCAGCAGTAGCTATGGCAGTGGCAGAAGATTT-----------------  960
            ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
Sbjct  963  CAA-GTGGCTATGGCGGTTCCAGCAGCAGCAGTAGCTATGGCAGTGGCAGAAGATTTTAATTAGGAAACAAAGC  1035

Query  961  --------------------------------------------------------------------------  960
                                                                                      
Sbjct 1036  TTAGCAGGAGAGGAGAGCCAGAGAAGTGACAGGGAAGCTACAGGTTACAATAGATTTGTGAACTCAGCCAAGCA  1109

Query  961  --------------------------------------------------------------------------  960
                                                                                      
Sbjct 1110  CAGTGGTGGCAGGGCCTAGCTGCTACAAAGAAGACATGTTTTAGACAAATACTCATGTGTATGGGCAAAAAACT  1183

Query  961  --------------------------------------------------------------------------  960
                                                                                      
Sbjct 1184  CGAGGACTGTATTTGTGACTAATTGTATAACAGGTTATTTTAGTTTCTGTTCTGTGGAAAGTGTAAAGCATTCC  1257

Query  961  --------------------------------------------------------------------------  960
                                                                                      
Sbjct 1258  AACAAAGGGTTTTAACGTAGATTTCTTTTTGCACCCCATGCTGTTGATTGCTAAATGTAATAGTCTGATCGTGA  1331

Query  961  -----------------------  960
                                   
Sbjct 1332  TGCTGAATAAATGTCTTTTTTTT  1354