Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473586
• Subject: XR_245923.2
• Aligned Length: 1401
• Identities: 960
• Gaps: 441

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------------------AT  2
                                                                                    ||
Sbjct    1  GTCAGCTTGCTCCTTTCTGCCCGTGGACGCCGCCGAAGAAGCATCGTTAAAGTCTCTCTTCACCCTGCCGTCAT  74

Query    3  GTCTAAGTCAGAGTCTCCTAAAGAGCCCGAACAGCTGAGGAAGCTCTTCATTGGAGGGTTGAGCTTTGAAACAA  76
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTCTAAGTCAGAGTCTCCTAAAGAGCCCGAACAGCTGAGGAAGCTCTTCATTGGAGGGTTGAGCTTTGAAACAA  148

Query   77  CTGATGAGAGCCTGAGGAGCCATTTTGAGCAATGGGGAACGCTCACGGACTGTGTGGTAATGAGAGATCCAAAC  150
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGATGAGAGCCTGAGGAGCCATTTTGAGCAATGGGGAACGCTCACGGACTGTGTGGTAATGAGAGATCCAAAC  222

Query  151  ACCAAGCGCTCCAGGGGCTTTGGGTTTGTCACATATGCCACTGTGGAGGAGGTGGATGCAGCTATGAATGCAAG  224
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACCAAGCGCTCCAGGGGCTTTGGGTTTGTCACATATGCCACTGTGGAGGAGGTGGATGCAGCTATGAATGCAAG  296

Query  225  GCCACACAAGGTGGATGGAAGAGTTGTGGAACCAAAGAGAGCTGTCTCCAGAGAAGATTCTCAAAGACCAGGTG  298
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCCACACAAGGTGGATGGAAGAGTTGTGGAACCAAAGAGAGCTGTCTCCAGAGAAGATTCTCAAAGACCAGGTG  370

Query  299  CCCACTTAACTGTGAAAAAGATATTTGTTGGTGGCATTAAAGAAGACACTGAAGAACATCACCTAAGAGATTAT  372
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCACTTAACTGTGAAAAAGATATTTGTTGGTGGCATTAAAGAAGACACTGAAGAACATCACCTAAGAGATTAT  444

Query  373  TTTGAACAGTATGGAAAAATTGAAGTGATTGAAATCATGACTGACCGAGGCAGTGGCAAGAAAAGGGGCTTTGC  446
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTGAACAGTATGGAAAAATTGAAGTGATTGAAATCATGACTGACCGAGGCAGTGGCAAGAAAAGGGGCTTTGC  518

Query  447  CTTTGTAACCTTTGACGACCATGACTCCGTGGATAAGATTGTCATTCAGAAATACCATACTGTGAATGGCCACA  520
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTTGTAACCTTTGACGACCATGACTCCGTGGATAAGATTGTCATTCAGAAATACCATACTGTGAATGGCCACA  592

Query  521  ACTGTGAAGTTAGAAAAGCCCTGTCAAAGCAAGAGATGGCTAGTGCTTCATCCAGCCAAAGAGGTCGAAGTGGT  594
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTGTGAAGTTAGAAAAGCCCTGTCAAAGCAAGAGATGGCTAGTGCTTCATCCAGCCAAAGAGGTCGAAGTGGT  666

Query  595  TCTGGAAACTTTGGTGGTGGTCGTGGAGGTGGTTTCGGTGGGAATGACAACTTCGGTCGTGGAGGAAACTTCAG  668
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTGGAAACTTTGGTGGTGGTCGTGGAGGTGGTTTCGGTGGGAATGACAACTTCGGTCGTGGAGGAAACTTCAG  740

Query  669  TGGTCGTGGTGGCTTTGGTGGCAGCCGTGGTGGTGGTGGATATGGTGGCAGTGGGGATGGCTATAATGGATTTG  742
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGTCGTGGTGGCTTTGGTGGCAGCCGTGGTGGTGGTGGATATGGTGGCAGTGGGGATGGCTATAATGGATTTG  814

Query  743  GTAATGA-------------------------------------------------------------------  749
            |||||||                                                                   
Sbjct  815  GTAATGATGGTGGTTATGGAGGAGGCGGCCCTGGTTACTCTGGAGGAAGCAGAGGCTATGGAAGTGGTGGACAG  888

Query  750  --------------------------------------------------------------------------  749
                                                                                      
Sbjct  889  GGTTATGGAAACCAGGGCAGTGGCTATGGCGGGAGTGGCAGCTATGACAGCTATAACAACGGAGGCGGAGGCGG  962

Query  750  ---------------TGGAAGCAATTTTGGAGGTGGTGGAAGCTACAATGATTTTGGGAATTACAACAATCAGT  808
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTTGGCGGTGGTAGTGGAAGCAATTTTGGAGGTGGTGGAAGCTACAATGATTTTGGGAATTACAACAATCAGT  1036

Query  809  CTTCAAATTTTGGACCCATGAAGGGAGGAAATTTTGGAGGCAGAAGCTCTGGCCCCTATGGCGGTGGAGGCCAA  882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTTCAAATTTTGGACCCATGAAGGGAGGAAATTTTGGAGGCAGAAGCTCTGGCCCCTATGGCGGTGGAGGCCAA  1110

Query  883  TACTTTGCAAAACCACGAAACCAAGGTGGCTATGGCGGTTCCAGCAGCAGCAGTAGCTATGGCAGTGGCAGAAG  956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TACTTTGCAAAACCACGAAACCAAGGTGGCTATGGCGGTTCCAGCAGCAGCAGTAGCTATGGCAGTGGCAGAAG  1184

Query  957  ATTT----------------------------------------------------------------------  960
            ||||                                                                      
Sbjct 1185  ATTTTAATTAGGGAGGAGTCTGCTACTAGTCTTATCAGCTCTTAAAAACAGAAACTCATCTGTCCAAGTTCGTG  1258

Query  961  --------------------------------------------------------------------------  960
                                                                                      
Sbjct 1259  GCAGAAAGGAACGTCCTTGTGAAGACCTTTATCTGAGCCACTGTACTTCGTTATCACTGCCATGCAGTTTACAT  1332

Query  961  ---------------------------------------------------------------------  960
                                                                                 
Sbjct 1333  GAGCTGTTCTGCAGCTCAAATTCCATTTTGTGAATGGGTTTTTTTTTTTAATAAACTGTATTTAACTTA  1401