Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473795
• Subject: NM_001350719.2
• Aligned Length: 2415
• Identities: 2332
• Gaps: 72

Alignment

Query    1  ATGACAAACCAGGAAAAATGGGCCCACCTCAGCCCTTCGGAATTTTCCCAACTTCAGAAATATGCTGAGTATTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACAAACCAGGAAAAATGGGCCCACCTCAGCCCTTCGGAATTTTCCCAACTTCAGAAATATGCTGAGTATTC  74

Query   75  TACAAAGAAATTAAAGGATGTTCTTGAAGAATTCCATGGTAATGGTGTGCTTGCAAAGTATAATCCTGAAGGG-  147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct   75  TACAAAGAAATTAAAGGATGTTCTTGAAGAATTCCATGGTAATGGTGTGCTTGCAAAGTATAATCCTGAAGGGA  148

Query  148  --------------------ACAATAGATTTTGAAGGTTTCAAACTATTCATGAAGACATTCCTGGAAGCCGAG  201
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AACAAGACATTCTTAACCAAACAATAGATTTTGAAGGTTTCAAACTATTCATGAAGACATTCCTGGAAGCCGAG  222

Query  202  CTTCCTGATGATTTCACTGCACACCTTTTCATGTCATTTAGCAACAAGTTTCCTCATTCTAGTCCAATGGTAAA  275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTCCTGATGATTTCACTGCACACCTTTTCATGTCATTTAGCAACAAGTTTCCTCATTCTAGTCCAATGGTAAA  296

Query  276  AAGTAAGCCTGCTCTCCTATCAGGCGGTCTGAGAATGAATAAAGGTGCCATCACCCCTCCCCGAACTACTTCTC  349
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  AAGTAAGCCTGCTCTCCTATCAGGCGGTCTGAGAATGAATAAAGGTGCCATCACCCCTCCCCGGACTACTTCTC  370

Query  350  CTGCAAATACGTGTTCCCCAGAAGTAATCCATCTGAAGGACATTGTCTGTTACCTGTCTCTGCTTGAAAGAGGA  423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGCAAATACGTGTTCCCCAGAAGTAATCCATCTGAAGGACATTGTCTGTTACCTGTCTCTGCTTGAAAGAGGA  444

Query  424  AGACCTGAGGATAAGCTTGAGTTTATGTTTCGCCTTTATGACACGGATGGGAATGGCTTCCTGGACAGCTCGGA  497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGACCTGAGGATAAGCTTGAGTTTATGTTTCGCCTTTATGACACGGATGGGAATGGCTTCCTGGACAGCTCGGA  518

Query  498  GCTAGAAAATATCATCAGTCAGATGATGCATGTTGCAGAATACCTTGAGTGGGATGTCACTGAACTTAATCCAA  571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTAGAAAATATCATCAGTCAGATGATGCATGTTGCAGAATACCTTGAGTGGGATGTCACTGAACTTAATCCAA  592

Query  572  TCCTCCATGAAATGATGGAAGAAATTGACTATGATCATGATGGAACCGTGTCTCTGGAGGAATGGATTCAAGGA  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCTCCATGAAATGATGGAAGAAATTGACTATGATCATGATGGAACCGTGTCTCTGGAGGAATGGATTCAAGGA  666

Query  646  GGAATGACAACGATTCCACTTCTTGTGCTCCTGGGCTTAGAAAATAACGTGAAAGGATGATGGACAGCACGTGT  719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGAATGACAACGATTCCACTTCTTGTGCTCCTGGGCTTAGAAAATAACGTG-AAGGATGATGGACAGCACGTGT  739

Query  720  GGCGACTG-AGCACTTTAACAAACCTG-CTA-TGCA--CTTTG-CTG-ACATGCTGATT-GCGTGGGGAAGCAG  785
            |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  740  GGCGACTGAAGCACTTTAACAAACCTGCCTATTGCAACCTTTGCCTGAACATGCTGATTGGCGTGGGGAAGCAG  813

Query  786  G--CTCTGCTGTTCCTTCTGC-AGTACACAGTCCATGAGCGCTGTGTGGCTCGAGCACCTCCCTCTTGCATCAA  856
            |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  GGCCTCTGCTGTTCCTTCTGCAAGTACACAGTCCATGAGCGCTGTGTGGCTCGAGCACCTCCCTCTTGCATCAA  887

Query  857  GACCTATGTGAAGTCCAAAAGGAACACTGATGTCATGCACCATTACTGGGTTGAAGGTAACTGCCCAACCAAGT  930
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  GACCTATGTGAAGTCCAAAAGGAACACTGATGTCATGCACCATTACTGGGTTGAAGGTAACTGCCCAACCAAGT  961

Query  931  GTGATAAGTGCCACAAAACTGTTAAATGTTACCAGGGCCTGACAGGACTGCATTGTGTTTGGTGTCAGATCACA  1004
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  GTGATAAGTGCCACAAAACTGTTAAATGTTACCAGGGCCTGACAGGACTGCATTGTGTTTGGTGTCAGATCACA  1035

Query 1005  CTGCATAATAAATGTGCTTCTCATCTAAAACCTGAATGTGACTGTGGACCTTTGAAGGACCATATTTTACCACC  1078
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  CTGCATAATAAATGTGCTTCTCATCTAAAACCTGAATGTGACTGTGGACCTTTGAAGGACCATATTTTACCACC  1109

Query 1079  CACAACAATCTGTCCAGTGGTACTGCAGACTCTGCCCACTTCAGGAGTTTCAGTTCCTGAGGAAAGACAATCAA  1152
            ||||||||||||||||||||||||                                    ||||||||||||||
Sbjct 1110  CACAACAATCTGTCCAGTGGTACT------------------------------------GGAAAGACAATCAA  1147

Query 1153  CAGTGAAAAAGGAAAAGAGTGGTTCCCAGCAGCCAAACAAAGTGATTGACAAGAATAAAATGCAAAGAGCCAAC  1226
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148  CAGTGAAAAAGGAAAAGAGTGGTTCCCAGCAGCCAAACAAAGTGATTGACAAGAATAAAATGCAAAGAGCCAAC  1221

Query 1227  TCTGTTACTGTAGATGGACAAGGCCTGCAGGTCACTCCTGTGCCTGGTACTCACCCACTTTTAGTTTTTGTGAA  1300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1222  TCTGTTACTGTAGATGGACAAGGCCTGCAGGTCACTCCTGTGCCTGGTACTCACCCACTTTTAGTTTTTGTGAA  1295

Query 1301  CCCCAAAAGTGGTGGAAAACAAGGAGAACGAATTTACAGAAAATTCCAGTATCTATTAAATCCTCGTCAGGTTT  1374
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1296  CCCCAAAAGTGGTGGAAAACAAGGAGAACGAATTTACAGAAAATTCCAGTATCTATTAAATCCTCGTCAGGTTT  1369

Query 1375  ACAGTCTTTCTGGAAATGGACCAATGCCAGGGTTAAACTTTTTCCGTGATGTTCCTGACTTCAGAGTGTTAGCC  1448
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1370  ACAGTCTTTCTGGAAATGGACCAATGCCAGGGTTAAACTTTTTCCGTGATGTTCCTGACTTCAGAGTGTTAGCC  1443

Query 1449  TGTGGTGGAGATGGAACCGTGGGCTGGGTTTTGGATTGCATAGAAAAGGCCAATGTAGGCAAGCATCCTCCAGT  1522
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1444  TGTGGTGGAGATGGAACCGTGGGCTGGGTTTTGGATTGCATAGAAAAGGCCAATGTAGGCAAGCATCCTCCAGT  1517

Query 1523  TGCGATTCTGCCTCTTGGGACTGGCAATGATCTAGCAAGATGCCTGCGATGGGGAGGAGGTTACGAAGGTGAGG  1596
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1518  TGCGATTCTGCCTCTTGGGACTGGCAATGATCTAGCAAGATGCCTGCGATGGGGAGGAGGTTACGAAGGTGAGA  1591

Query 1597  ATCTGATGAAAATTTTAAAAGACATTGNAAACAGCACAGAAATCATG-TGGACAGGTGGAAGTTTGAAAGTCAT  1669
            ||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1592  ATCTGATGAAAATTCTAAAAGACATTGAAAACAGCACAGAAATCATGTTGGACAGGTGGAAGTTTG-AAGTCAT  1664

Query 1670  ACNTAATGACAAGNATGAGAAAGGAGACCCAGTGCCTANCAGTATCATCAATAATTACTTTTCCATTGGCGTGG  1743
            ||.|||||||||..|||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1665  ACCTAATGACAAAGATGAGAAAGGAGACCCAGTGCCTTACAGTATCATCAATAATTACTTTTCCATTGGCGTGG  1738

Query 1744  ATGCCTCCATGNCACACAGATTCCACATCATGAGAGAAAAACACCCNAGAGAAATTCAACAGTAGAATGAAGAA  1817
            ||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1739  ATGCCTCCATTGCACACAGATTCCACATCATGAGAGAAAAACACCC-AGAGAAATTCAACAGTAGAATGAAGAA  1811

Query 1818  CAAATTTTGGTATTTTGAGTTTGGCACATCTGAAACTTTCTCAGCCACCTGCAAGAAGCTACATGAATCTGTAG  1891
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1812  CAAATTTTGGTATTTTGAGTTTGGCACATCTGAAACTTTCTCAGCCACCTGCAAGAAGCTACATGAATCTGTAG  1885

Query 1892  AAATAGAATGTGATGGAGTACAGATAGATTTAATAAACATCTCTCTGGAAGGAATTGCTATTTTGAATATACCA  1965
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1886  AAATAGAATGTGATGGAGTACAGATAGATTTAATAAACATCTCTCTGGAAGGAATTGCTATTTTGAATATACCA  1959

Query 1966  AGCATGCATGGAGGATCCAATCTTTGGGGAGAGTCTAAGAAAAGACGAAGCCATCGACGAATAGAGAAAAAAGG  2039
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1960  AGCATGCATGGAGGATCCAATCTTTGGGGAGAGTCTAAGAAAAGACGAAGCCATCGACGAATAGAGAAAAAAGG  2033

Query 2040  GTCTGACAAAAGGACCACCGTCACAGATGCCAAAGAGTTGAAGTTTGCAAGTCAAGATCTCAGTGACCAGCTGC  2113
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2034  GTCTGACAAAAGGACCACCGTCACAGATGCCAAAGAGTTGAAGTTTGCAAGTCAAGATCTCAGTGACCAGCTGC  2107

Query 2114  TGGAGGTGGTCGGCTTGGAAGGAGCCATGGAGATGGGGCAAATATACACAGGCCTGAAAAGTGCTGGCCGGCGG  2187
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2108  TGGAGGTGGTCGGCTTGGAAGGAGCCATGGAGATGGGGCAAATATACACAGGCCTGAAAAGTGCTGGCCGGCGG  2181

Query 2188  CTGGCTCAGTGCTCCTGCGTGGTCATCAGGACGAGCAAGTCTCTGCCAATGCAAATTGATGGGGAGCCATGGAT  2261
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2182  CTGGCTCAGTGCTCCTGCGTGGTCATCAGGACGAGCAAGTCTCTGCCAATGCAAATTGATGGGGAGCCATGGAT  2255

Query 2262  GCAGACCCCATGCACAATAAAAATTACACACAAGAACCAAGCCCCAATGCTGATGGGCCCGCCTCCAAAAACCG  2335
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2256  GCAGACCCCATGCACAATAAAAATTACACACAAGAACCAAGCCCCAATGCTGATGGGCCCGCCTCCAAAAACCG  2329

Query 2336  GTTTATTCTGCTCCCTCGTCAAAAGGACAAGAAACCGAAGCAAGGAA  2382
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2330  GTTTATTCTGCTCCCTCGTCAAAAGGACAAGAAACCGAAGCAAGGAA  2376