Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000473886
- Subject:
- NM_001102406.2
- Aligned Length:
- 3732
- Identities:
- 3255
- Gaps:
- 477
Alignment
Query 1 ATGAATAATCAAAAAGTGGTAGCTGTGCTACTGCAAGAGTGCAAGCAAGTGCTGGATCAGCTCTTGTTGGAAGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAATAATCAAAAAGTGGTAGCTGTGCTACTGCAAGAGTGCAAGCAAGTGCTGGATCAGCTCTTGTTGGAAGC 74
Query 75 GCCAGATGTGTCGGAAGAGGACAAGAGCGAGGACCAGCGCTGCAGAGCTTTACTCCCCAGCGAGTTAAGGACCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCCAGATGTGTCGGAAGAGGACAAGAGCGAGGACCAGCGCTGCAGAGCTTTACTCCCCAGCGAGTTAAGGACCC 148
Query 149 TGATCCAGGAGGCAAAGGAAATGAAGTGGCCCTTCGTGCCTGAAAAGTGGCAGTACAAACAAGCCGTGGGCCCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGATCCAGGAGGCAAAGGAAATGAAGTGGCCCTTCGTGCCTGAAAAGTGGCAGTACAAACAAGCCGTGGGCCCA 222
Query 223 GAGGACAAAACAAACCTGAAGGATGTGATTGGCGCCGGGTTGCAGCAGTTACTGGCGTCCCTGAGGGCCTCCAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAGGACAAAACAAACCTGAAGGATGTGATTGGCGCCGGGTTGCAGCAGTTACTGGCGTCCCTGAGGGCCTCCAT 296
Query 297 CCTCGCTCGGGACTGTGCGGCTGCGGCGGCTATTGTGTTCTTGGTGGACCGGTTCCTGTATGGGCTCGACGTCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCTCGCTCGGGACTGTGCGGCTGCGGCGGCTATTGTGTTCTTGGTGGACCGGTTCCTGTATGGGCTCGACGTCT 370
Query 371 CTGGAAAACTTCTGCAGGTCGCCAAAGGTCTCCACAAGTTGCAGCCAGCCACGCCAATTGCCCCGCAGGTGGTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTGGAAAACTTCTGCAGGTCGCCAAAGGTCTCCACAAGTTGCAGCCAGCCACGCCAATTGCCCCGCAGGTGGTT 444
Query 445 ATTCGCCAAGCCCGAATCTCCGTGAACTCAGGAAAACTTTTAAAAGCAGAGTATATTCTGAGCAGTCTAATAAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATTCGCCAAGCCCGAATCTCCGTGAACTCAGGAAAACTTTTAAAAGCAGAGTATATTCTGAGCAGTCTAATAAG 518
Query 519 CAACAATGGAGCAACGGGTACCTGGCTGTACAGAAATGAAAGTGACAAGGTCCTGGTGCAGTCGGTCTGTATAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAACAATGGAGCAACGGGTACCTGGCTGTACAGAAATGAAAGTGACAAGGTCCTGGTGCAGTCGGTCTGTATAC 592
Query 593 AGATCAGAGGGCAGATTCTGCAAAAGCTGGGGATGTGGTACGAAGCAGCAGAGTTAATATGGGCCTCCATTGTA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGATCAGAGGGCAGATTCTGCAAAAGCTGGGGATGTGGTACGAAGCAGCAGAGTTAATATGGGCCTCCATTGTA 666
Query 667 GGATATTTGGCACTTCCTCAGCCGGATAAAAAGGGCCTCTCCACGTCGCTAGGTATACTGGCAGACATCTTTGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGATATTTGGCACTTCCTCAGCCGGATAAAAAGGGCCTCTCCACGTCGCTAGGTATACTGGCAGACATCTTTGT 740
Query 741 TTCCATGAGCAAGAACGATTATGAAAAGTTTAAAAACAATCCACAAATTAATTTGAGCCTGCTGAAGGAGTTTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTCCATGAGCAAGAACGATTATGAAAAGTTTAAAAACAATCCACAAATTAATTTGAGCCTGCTGAAGGAGTTTG 814
Query 815 ACCACCATTTGCTGTCCGCTGCAGAAGCCTGCAAGCTGGCAGCTGCCTTCAGTGCCTATACGCCGCTCTTCGTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACCACCATTTGCTGTCCGCTGCAGAAGCCTGCAAGCTGGCAGCTGCCTTCAGTGCCTATACGCCGCTCTTCGTG 888
Query 889 CTCACAGCTGTGAATATCCGTGGCACGTGTTTATTGTCCTACAGTAGTTCAAATGACTGTCCTCCAGAATTGAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTCACAGCTGTGAATATCCGTGGCACGTGTTTATTGTCCTACAGTAGTTCAAATGACTGTCCTCCAGAATTGAA 962
Query 963 AAACTTACATCTGTGTGAAGCCAAAGAGGCCTTTGAGATTGGCCTCCTCACCAAGAGAGATGATGAGCCTGTTA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AAACTTACATCTGTGTGAAGCCAAAGAGGCCTTTGAGATTGGCCTCCTCACCAAGAGAGATGATGAGCCTGTTA 1036
Query 1037 CTGGAAAACAGGAGCTTCACAGCTTTGTCAAAGCTGCTTTCGGTCTCACCACAGTGCACAGAAGGCTCCATGGG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGGAAAACAGGAGCTTCACAGCTTTGTCAAAGCTGCTTTCGGTCTCACCACAGTGCACAGAAGGCTCCATGGG 1110
Query 1111 GAGACAGGGACGGTCCATGCAGCAAGTCAGCTCTGTAAGGAAGCAATGGGGAAGCTGTACAATTTCAGCACTTC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAGACAGGGACGGTCCATGCAGCAAGTCAGCTCTGTAAGGAAGCAATGGGGAAGCTGTACAATTTCAGCACTTC 1184
Query 1185 CTCCAGAAGTCAGGACAGAGAAGCTCTGTCTCAAGAAGTTATGTCTGTGATTGCCCAGGTGAAGGAACATTTAC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTCCAGAAGTCAGGACAGAGAAGCTCTGTCTCAAGAAGTTATGTCTGTGATTGCCCAGGTGAAGGAACATTTAC 1258
Query 1259 AAGTTCAAAGCTTCTCAAATGTAGATGACAGATCTTATGTTCCCGAGAGTTTCGAGTGCAGGTTGGATAAACTT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAGTTCAAAGCTTCTCAAATGTAGATGACAGATCTTATGTTCCCGAGAGTTTCGAGTGCAGGTTGGATAAACTT 1332
Query 1333 ATCTTGCATGGGCAAGGGGATTTCCAAAAAATCCTTGACACCTATTCACAGCACCATACTTCGGTGTGTGAAGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATCTTGCATGGGCAAGGGGATTTCCAAAAAATCCTTGACACCTATTCACAGCACCATACTTCGGTGTGTGAAGT 1406
Query 1407 ATTTGAAAGTGATTGTGGAAACAACAAAAATGAACAGAAAGATGCAAAAACAGGAGTCTGCATCACTGCTCTAA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ATTTGAAAGTGATTGTGGAAACAACAAAAATGAACAGAAAGATGCAAAAACAGGAGTCTGCATCACTGCTCTAA 1480
Query 1481 AAACAGAAATAAAAAACATAGATACTGTGAGTACTACTCAAGAAAAGCCACATTGTCAAAGAGACACAGGAATA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AAACAGAAATAAAAAACATAGATACTGTGAGTACTACTCAAGAAAAGCCACATTGTCAAAGAGACACAGGAATA 1554
Query 1555 TCTTCCTCCCTAATGGGTAAGAATGTTCAGAGGGAACTCAGAAGGGGAGGAAGGAGAAACTGGACCCATTCTGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TCTTCCTCCCTAATGGGTAAGAATGTTCAGAGGGAACTCAGAAGGGGAGGAAGGAGAAACTGGACCCATTCTGA 1628
Query 1629 TGCATTTCGAGTCTCCTTGGATCAAGATGTGGAGACTGAGACTGAGCCATCGGACTACAGCAATGGTGAGGGAG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGCATTTCGAGTCTCCTTGGATCAAGATGTGGAGACTGAGACTGAGCCATCGGACTACAGCAATGGTGAGGGAG 1702
Query 1703 CTGTTTTCAACAAGTCTCTGAGTGGCAGCCAGACTTCCAGTGCTTGGAGCAACTTATCAGGGTTTAGTTCCTCT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CTGTTTTCAACAAGTCTCTGAGTGGCAGCCAGACTTCCAGTGCTTGGAGCAACTTATCAGGGTTTAGTTCCTCT 1776
Query 1777 GCAAGCTGGGAGGAAGTGAATTATCACGTTGACGACAGGTCAGCCAGAAAAGAGCCTGGCAAAGAACATCTGGT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GCAAGCTGGGAGGAAGTGAATTATCACGTTGACGACAGGTCAGCCAGAAAAGAGCCTGGCAAAGAACATCTGGT 1850
Query 1851 GGACACTCAGTGTTCCACTGCCTTGTCTGAGGAGCTAGAGAATGACAGGGAAGGCAGAGCTATGCATTCATTGC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GGACACTCAGTGTTCCACTGCCTTGTCTGAGGAGCTAGAGAATGACAGGGAAGGCAGAGCTATGCATTCATTGC 1924
Query 1925 ATTCACAGCTTCATGATCTCTCTCTTCAGGAACCCAACAATGACAATTTGGAGCCTTCTCAAAATCAGCCACAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ATTCACAGCTTCATGATCTCTCTCTTCAGGAACCCAACAATGACAATTTGGAGCCTTCTCAAAATCAGCCACAG 1998
Query 1999 CAACAGATGCCCTTGACACCCTTCTCGCCTCATAATACCCCAGGCATTTTCTTGGCCCCTGGTGCAGGGCTTCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CAACAGATGCCCTTGACACCCTTCTCGCCTCATAATACCCCAGGCATTTTCTTGGCCCCTGGTGCAGGGCTTCT 2072
Query 2073 AGAAGGAGCTCCAGAAGGTATCCAGGAAGTCAGAAATATGGGACCCAGAAATACTTCTGCTCACTCCAGACCCT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGAAGGAGCTCCAGAAGGTATCCAGGAAGTCAGAAATATGGGACCCAGAAATACTTCTGCTCACTCCAGACCCT 2146
Query 2147 CATATCGTTCTGCTTCTTGGTCTTCTGATTCTGGTAGGCCCAAGAATATGGGCACACATCCTTCAGTCCAAAAA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CATATCGTTCTGCTTCTTGGTCTTCTGATTCTGGTAGGCCCAAGAATATGGGCACACATCCTTCAGTCCAAAAA 2220
Query 2221 GAAGAAGCCTTTGAAATAATTGTTGAGTTTCCAGAAACCAACTGCGATGTCAAAGACAGGCAGGGGAAAGAGCA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GAAGAAGCCTTTGAAATAATTGTTGAGTTTCCAGAAACCAACTGCGATGTCAAAGACAGGCAGGGGAAAGAGCA 2294
Query 2295 GGGAGAAGAAATTAGTGAAAGAGGCGCAGGCCCTACATTTAAAGCTAGTCCCTCCTGGGTTGACCCAGAAGGAG 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GGGAGAAGAAATTAGTGAAAGAGGCGCAGGCCCTACATTTAAAGCTAGTCCCTCCTGGGTTGACCCAGAAGGAG 2368
Query 2369 AAACAGCAGAAAGCACTGAAGATGCACCCTTAGACTTTCACAGGGTCCTGCACAATTCTCTGGGAAACATTTCC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 AAACAGCAGAAAGCACTGAAGATGCACCCTTAGACTTTCACAGGGTCCTGCACAATTCTCTGGGAAACATTTCC 2442
Query 2443 ATGCTGCCATGTAGCTCCTTCACCCCTAATTGGCCTGTTCAAAATCCTGACTCCAGAAAAAGTGGTGGCCCAGT 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ATGCTGCCATGTAGCTCCTTCACCCCTAATTGGCCTGTTCAAAATCCTGACTCCAGAAAAAGTGGTGGCCCAGT 2516
Query 2517 CGCAGAGCAGGGCATCGACCCTGATGCCTCCACAGTGGATGAGGAGGGGCAACTGCTCGACAGCATGGATGTTC 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CGCAGAGCAGGGCATCGACCCTGATGCCTCCACAGTGGATGAGGAGGGGCAACTGCTCGACAGCATGGATGTTC 2590
Query 2591 CCTGCACAAATGGGCACGGCTCTCATAGACTGTGCATTCTGAGACAGCCGCCTGGTCAGAGGGCGGAGACCCCC 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CCTGCACAAATGGGCACGGCTCTCATAGACTGTGCATTCTGAGACAGCCGCCTGGTCAGAGGGCGGAGACCCCC 2664
Query 2665 AATTCCTCTGTAAGCGGTAACATCCTCTTCCCTGTCCTCAGCGAGGACTGCACTACCACAGAGGAAGGAAATCA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 AATTCCTCTGTAAGCGGTAACATCCTCTTCCCTGTCCTCAGCGAGGACTGCACTACCACAGAGGAAGGAAATCA 2738
Query 2739 GCCTGGAAACATGCTAAACTGCAGCCAGAACTCCAGCTCATCCTCAGTGTGGTGGCTGAAATCACCTGCATTTT 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GCCTGGAAACATGCTAAACTGCAGCCAGAACTCCAGCTCATCCTCAGTGTGGTGGCTGAAATCACCTGCATTTT 2812
Query 2813 CCAGTGGTTCTTCTGAGGGGGACAGCCCTTGGTCCTATCTGAATTCCAGTGGGAGTTCTTGGGTTTCATTGCCG 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CCAGTGGTTCTTCTGAGGGGGACAGCCCTTGGTCCTATCTGAATTCCAGTGGGAGTTCTTGGGTTTCATTGCCG 2886
Query 2887 GGAAAGATGAGGAAAGAGATCCTTGAGGCTCGCACCTTGCAACCTGATGACTTTGAAAAGCTGTTGGCAGGAGT 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 GGAAAGATGAGGAAAGAGATCCTTGAGGCTCGCACCTTGCAACCTGATGACTTTGAAAAGCTGTTGGCAGGAGT 2960
Query 2961 GAGGCATGATTGGCTGTTTCAGAGACTAGAGAATACGGGGGTTTTTAAGCCCAGTCAACTCCACCGAGCACATA 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 GAGGCATGATTGGCTGTTTCAGAGACTAGAGAATACGGGGGTTTTTAAGCCCAGTCAACTCCACCGAGCACATA 3034
Query 3035 GTGCTCTTTTGTTAAAATATTCAAAAAAATCTGAACTGTGGACGGCCCAGGAAACTATTGTCTATTTGGGGGAC 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 GTGCTCTTTTGTTAAAATATTCAAAAAAATCTGAACTGTGGACGGCCCAGGAAACTATTGTCTATTTGGGGGAC 3108
Query 3109 TACTTGACTGTGAAG-AAAAAGGCAGACAAAGAAATGCTTTTTGGGTTCATCATCTTCATCAAGAAGAAATTCT 3181
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 TACTTGACTGTGAAGAAAAAAGGCAGACAAAGAAATGCTTTTTGGGTTCATCATCTTCATCAAGAAGAAATTCT 3182
Query 3182 GGGGAGGTATGTTGGGAAAGACTATAAGGAGCAGAAGGGGCTCTGGCACCACTTCACTGATGTGGAGCGACAGA 3255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 GGGGAGGTATGTTGGGAAAGACTATAAGGAGCAGAAGGGGCTCTGGCACCACTTCACTGATGTGGAGCGACAGA 3256
Query 3256 -------------------------------------------------------------------------- 3255
Sbjct 3257 TGACCGCACAGCACTATGTGACAGAATTTAACAAGAGACTCTATGAACAAAACATTCCCACCCAGATATTCTAC 3330
Query 3256 -------------------------------------------------------------------------- 3255
Sbjct 3331 ATCCCATCCACAATACTACTGATTTTAGAGGACAAGACAATAAAGGGATGTATCAGTGTGGAGCCTTACATACT 3404
Query 3256 -------------------------------------------------------------------------- 3255
Sbjct 3405 GGGAGAATTTGTAAAATTGTCAAATAACACGAAAGTGGTGAAAACAGAATACAAAGCCACAGAATATGGCTTGG 3478
Query 3256 -------------------------------------------------------------------------- 3255
Sbjct 3479 CCTATGGCCATTTTTCTTATGAGTTTTCTAATCATAGAGATGTTGTGGTCGATTTACAAGGTTGGGTAACCGGT 3552
Query 3256 -------------------------------------------------------------------------- 3255
Sbjct 3553 AATGGAAAAGGACTCATCTACCTCACAGATCCCCAGATTCACTCCGTTGATCAGAAAGTTTTCACTACCAATTT 3626
Query 3256 -------------------------------------------------------------------------- 3255
Sbjct 3627 TGGAAAGAGAGGAATTTTTTACTTCTTTAATAACCAGCATGTGGAATGTAATGAAATCTGCCATCGTCTTTCTT 3700
Query 3256 -------------------------------- 3255
Sbjct 3701 TGACTAGACCTTCAATGGAGAAACCATGCACA 3732