Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473886
• Subject: NM_001253884.1
• Aligned Length: 3732
• Identities: 3021
• Gaps: 711

Alignment

Query    1  ATGAATAATCAAAAAGTGGTAGCTGTGCTACTGCAAGAGTGCAAGCAAGTGCTGGATCAGCTCTTGTTGGAAGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCCAGATGTGTCGGAAGAGGACAAGAGCGAGGACCAGCGCTGCAGAGCTTTACTCCCCAGCGAGTTAAGGACCC  148
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct    1  -----ATGTGTCGGAAGAGGACAAGAGCGAGGACCAGCGCTGCAGA----------------------------  41

Query  149  TGATCCAGGAGGCAAAGGAAATGAAGTGGCCCTTCGTGCCTGAAAAGTGGCAGTACAAACAAGCCGTGGGCCCA  222
                                                                                      
Sbjct   42  --------------------------------------------------------------------------  41

Query  223  GAGGACAAAACAAACCTGAAGGATGTGATTGGCGCCGGGTTGCAGCAGTTACTGGCGTCCCTGAGGGCCTCCAT  296
                                                                 |||||||||||||||||||||
Sbjct   42  -----------------------------------------------------GGCGTCCCTGAGGGCCTCCAT  62

Query  297  CCTCGCTCGGGACTGTGCGGCTGCGGCGGCTATTGTGTTCTTGGTGGACCGGTTCCTGTATGGGCTCGACGTCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   63  CCTCGCTCGGGACTGTGCGGCTGCGGCGGCTATTGTGTTCTTGGTGGACCGGTTCCTGTATGGGCTCGACGTCT  136

Query  371  CTGGAAAACTTCTGCAGGTCGCCAAAGGTCTCCACAAGTTGCAGCCAGCCACGCCAATTGCCCCGCAGGTGGTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  137  CTGGAAAACTTCTGCAGGTCGCCAAAGGTCTCCACAAGTTGCAGCCAGCCACGCCAATTGCCCCGCAGGTGGTT  210

Query  445  ATTCGCCAAGCCCGAATCTCCGTGAACTCAGGAAAACTTTTAAAAGCAGAGTATATTCTGAGCAGTCTAATAAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  211  ATTCGCCAAGCCCGAATCTCCGTGAACTCAGGAAAACTTTTAAAAGCAGAGTATATTCTGAGCAGTCTAATAAG  284

Query  519  CAACAATGGAGCAACGGGTACCTGGCTGTACAGAAATGAAAGTGACAAGGTCCTGGTGCAGTCGGTCTGTATAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  285  CAACAATGGAGCAACGGGTACCTGGCTGTACAGAAATGAAAGTGACAAGGTCCTGGTGCAGTCGGTCTGTATAC  358

Query  593  AGATCAGAGGGCAGATTCTGCAAAAGCTGGGGATGTGGTACGAAGCAGCAGAGTTAATATGGGCCTCCATTGTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  359  AGATCAGAGGGCAGATTCTGCAAAAGCTGGGGATGTGGTACGAAGCAGCAGAGTTAATATGGGCCTCCATTGTA  432

Query  667  GGATATTTGGCACTTCCTCAGCCGGATAAAAAGGGCCTCTCCACGTCGCTAGGTATACTGGCAGACATCTTTGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  433  GGATATTTGGCACTTCCTCAGCCGGATAAAAAGGGCCTCTCCACGTCGCTAGGTATACTGGCAGACATCTTTGT  506

Query  741  TTCCATGAGCAAGAACGATTATGAAAAGTTTAAAAACAATCCACAAATTAATTTGAGCCTGCTGAAGGAGTTTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  507  TTCCATGAGCAAGAACGATTATGAAAAGTTTAAAAACAATCCACAAATTAATTTGAGCCTGCTGAAGGAGTTTG  580

Query  815  ACCACCATTTGCTGTCCGCTGCAGAAGCCTGCAAGCTGGCAGCTGCCTTCAGTGCCTATACGCCGCTCTTCGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  581  ACCACCATTTGCTGTCCGCTGCAGAAGCCTGCAAGCTGGCAGCTGCCTTCAGTGCCTATACGCCGCTCTTCGTG  654

Query  889  CTCACAGCTGTGAATATCCGTGGCACGTGTTTATTGTCCTACAGTAGTTCAAATGACTGTCCTCCAGAATTGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  655  CTCACAGCTGTGAATATCCGTGGCACGTGTTTATTGTCCTACAGTAGTTCAAATGACTGTCCTCCAGAATTGAA  728

Query  963  AAACTTACATCTGTGTGAAGCCAAAGAGGCCTTTGAGATTGGCCTCCTCACCAAGAGAGATGATGAGCCTGTTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  729  AAACTTACATCTGTGTGAAGCCAAAGAGGCCTTTGAGATTGGCCTCCTCACCAAGAGAGATGATGAGCCTGTTA  802

Query 1037  CTGGAAAACAGGAGCTTCACAGCTTTGTCAAAGCTGCTTTCGGTCTCACCACAGTGCACAGAAGGCTCCATGGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  803  CTGGAAAACAGGAGCTTCACAGCTTTGTCAAAGCTGCTTTCGGTCTCACCACAGTGCACAGAAGGCTCCATGGG  876

Query 1111  GAGACAGGGACGGTCCATGCAGCAAGTCAGCTCTGTAAGGAAGCAATGGGGAAGCTGTACAATTTCAGCACTTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  877  GAGACAGGGACGGTCCATGCAGCAAGTCAGCTCTGTAAGGAAGCAATGGGGAAGCTGTACAATTTCAGCACTTC  950

Query 1185  CTCCAGAAGTCAGGACAGAGAAGCTCTGTCTCAAGAAGTTATGTCTGTGATTGCCCAGGTGAAGGAACATTTAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  951  CTCCAGAAGTCAGGACAGAGAAGCTCTGTCTCAAGAAGTTATGTCTGTGATTGCCCAGGTGAAGGAACATTTAC  1024

Query 1259  AAGTTCAAAGCTTCTCAAATGTAGATGACAGATCTTATGTTCCCGAGAGTTTCGAGTGCAGGTTGGATAAACTT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025  AAGTTCAAAGCTTCTCAAATGTAGATGACAGATCTTATGTTCCCGAGAGTTTCGAGTGCAGGTTGGATAAACTT  1098

Query 1333  ATCTTGCATGGGCAAGGGGATTTCCAAAAAATCCTTGACACCTATTCACAGCACCATACTTCGGTGTGTGAAGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099  ATCTTGCATGGGCAAGGGGATTTCCAAAAAATCCTTGACACCTATTCACAGCACCATACTTCGGTGTGTGAAGT  1172

Query 1407  ATTTGAAAGTGATTGTGGAAACAACAAAAATGAACAGAAAGATGCAAAAACAGGAGTCTGCATCACTGCTCTAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173  ATTTGAAAGTGATTGTGGAAACAACAAAAATGAACAGAAAGATGCAAAAACAGGAGTCTGCATCACTGCTCTAA  1246

Query 1481  AAACAGAAATAAAAAACATAGATACTGTGAGTACTACTCAAGAAAAGCCACATTGTCAAAGAGACACAGGAATA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1247  AAACAGAAATAAAAAACATAGATACTGTGAGTACTACTCAAGAAAAGCCACATTGTCAAAGAGACACAGGAATA  1320

Query 1555  TCTTCCTCCCTAATGGGTAAGAATGTTCAGAGGGAACTCAGAAGGGGAGGAAGGAGAAACTGGACCCATTCTGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321  TCTTCCTCCCTAATGGGTAAGAATGTTCAGAGGGAACTCAGAAGGGGAGGAAGGAGAAACTGGACCCATTCTGA  1394

Query 1629  TGCATTTCGAGTCTCCTTGGATCAAGATGTGGAGACTGAGACTGAGCCATCGGACTACAGCAATGGTGAGGGAG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1395  TGCATTTCGAGTCTCCTTGGATCAAGATGTGGAGACTGAGACTGAGCCATCGGACTACAGCAATGGTGAGGGAG  1468

Query 1703  CTGTTTTCAACAAGTCTCTGAGTGGCAGCCAGACTTCCAGTGCTTGGAGCAACTTATCAGGGTTTAGTTCCTCT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1469  CTGTTTTCAACAAGTCTCTGAGTGGCAGCCAGACTTCCAGTGCTTGGAGCAACTTATCAGGGTTTAGTTCCTCT  1542

Query 1777  GCAAGCTGGGAGGAAGTGAATTATCACGTTGACGACAGGTCAGCCAGAAAAGAGCCTGGCAAAGAACATCTGGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1543  GCAAGCTGGGAGGAAGTGAATTATCACGTTGACGACAGGTCAGCCAGAAAAGAGCCTGGCAAAGAACATCTGGT  1616

Query 1851  GGACACTCAGTGTTCCACTGCCTTGTCTGAGGAGCTAGAGAATGACAGGGAAGGCAGAGCTATGCATTCATTGC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1617  GGACACTCAGTGTTCCACTGCCTTGTCTGAGGAGCTAGAGAATGACAGGGAAGGCAGAGCTATGCATTCATTGC  1690

Query 1925  ATTCACAGCTTCATGATCTCTCTCTTCAGGAACCCAACAATGACAATTTGGAGCCTTCTCAAAATCAGCCACAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1691  ATTCACAGCTTCATGATCTCTCTCTTCAGGAACCCAACAATGACAATTTGGAGCCTTCTCAAAATCAGCCACAG  1764

Query 1999  CAACAGATGCCCTTGACACCCTTCTCGCCTCATAATACCCCAGGCATTTTCTTGGCCCCTGGTGCAGGGCTTCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1765  CAACAGATGCCCTTGACACCCTTCTCGCCTCATAATACCCCAGGCATTTTCTTGGCCCCTGGTGCAGGGCTTCT  1838

Query 2073  AGAAGGAGCTCCAGAAGGTATCCAGGAAGTCAGAAATATGGGACCCAGAAATACTTCTGCTCACTCCAGACCCT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1839  AGAAGGAGCTCCAGAAGGTATCCAGGAAGTCAGAAATATGGGACCCAGAAATACTTCTGCTCACTCCAGACCCT  1912

Query 2147  CATATCGTTCTGCTTCTTGGTCTTCTGATTCTGGTAGGCCCAAGAATATGGGCACACATCCTTCAGTCCAAAAA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1913  CATATCGTTCTGCTTCTTGGTCTTCTGATTCTGGTAGGCCCAAGAATATGGGCACACATCCTTCAGTCCAAAAA  1986

Query 2221  GAAGAAGCCTTTGAAATAATTGTTGAGTTTCCAGAAACCAACTGCGATGTCAAAGACAGGCAGGGGAAAGAGCA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1987  GAAGAAGCCTTTGAAATAATTGTTGAGTTTCCAGAAACCAACTGCGATGTCAAAGACAGGCAGGGGAAAGAGCA  2060

Query 2295  GGGAGAAGAAATTAGTGAAAGAGGCGCAGGCCCTACATTTAAAGCTAGTCCCTCCTGGGTTGACCCAGAAGGAG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2061  GGGAGAAGAAATTAGTGAAAGAGGCGCAGGCCCTACATTTAAAGCTAGTCCCTCCTGGGTTGACCCAGAAGGAG  2134

Query 2369  AAACAGCAGAAAGCACTGAAGATGCACCCTTAGACTTTCACAGGGTCCTGCACAATTCTCTGGGAAACATTTCC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2135  AAACAGCAGAAAGCACTGAAGATGCACCCTTAGACTTTCACAGGGTCCTGCACAATTCTCTGGGAAACATTTCC  2208

Query 2443  ATGCTGCCATGTAGCTCCTTCACCCCTAATTGGCCTGTTCAAAATCCTGACTCCAGAAAAAGTGGTGGCCCAGT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209  ATGCTGCCATGTAGCTCCTTCACCCCTAATTGGCCTGTTCAAAATCCTGACTCCAGAAAAAGTGGTGGCCCAGT  2282

Query 2517  CGCAGAGCAGGGCATCGACCCTGATGCCTCCACAGTGGATGAGGAGGGGCAACTGCTCGACAGCATGGATGTTC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2283  CGCAGAGCAGGGCATCGACCCTGATGCCTCCACAGTGGATGAGGAGGGGCAACTGCTCGACAGCATGGATGTTC  2356

Query 2591  CCTGCACAAATGGGCACGGCTCTCATAGACTGTGCATTCTGAGACAGCCGCCTGGTCAGAGGGCGGAGACCCCC  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2357  CCTGCACAAATGGGCACGGCTCTCATAGACTGTGCATTCTGAGACAGCCGCCTGGTCAGAGGGCGGAGACCCCC  2430

Query 2665  AATTCCTCTGTAAGCGGTAACATCCTCTTCCCTGTCCTCAGCGAGGACTGCACTACCACAGAGGAAGGAAATCA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2431  AATTCCTCTGTAAGCGGTAACATCCTCTTCCCTGTCCTCAGCGAGGACTGCACTACCACAGAGGAAGGAAATCA  2504

Query 2739  GCCTGGAAACATGCTAAACTGCAGCCAGAACTCCAGCTCATCCTCAGTGTGGTGGCTGAAATCACCTGCATTTT  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2505  GCCTGGAAACATGCTAAACTGCAGCCAGAACTCCAGCTCATCCTCAGTGTGGTGGCTGAAATCACCTGCATTTT  2578

Query 2813  CCAGTGGTTCTTCTGAGGGGGACAGCCCTTGGTCCTATCTGAATTCCAGTGGGAGTTCTTGGGTTTCATTGCCG  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2579  CCAGTGGTTCTTCTGAGGGGGACAGCCCTTGGTCCTATCTGAATTCCAGTGGGAGTTCTTGGGTTTCATTGCCG  2652

Query 2887  GGAAAGATGAGGAAAGAGATCCTTGAGGCTCGCACCTTGCAACCTGATGACTTTGAAAAGCTGTTGGCAGGAGT  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2653  GGAAAGATGAGGAAAGAGATCCTTGAGGCTCGCACCTTGCAACCTGATGACTTTGAAAAGCTGTTGGCAGGAGT  2726

Query 2961  GAGGCATGATTGGCTGTTTCAGAGACTAGAGAATACGGGGGTTTTTAAGCCCAGTCAACTCCACCGAGCACATA  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2727  GAGGCATGATTGGCTGTTTCAGAGACTAGAGAATACGGGGGTTTTTAAGCCCAGTCAACTCCACCGAGCACATA  2800

Query 3035  GTGCTCTTTTGTTAAAATATTCAAAAAAATCTGAACTGTGGACGGCCCAGGAAACTATTGTCTATTTGGGGGAC  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2801  GTGCTCTTTTGTTAAAATATTCAAAAAAATCTGAACTGTGGACGGCCCAGGAAACTATTGTCTATTTGGGGGAC  2874

Query 3109  TACTTGACTGTGAAG-AAAAAGGCAGACAAAGAAATGCTTTTTGGGTTCATCATCTTCATCAAGAAGAAATTCT  3181
            ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2875  TACTTGACTGTGAAGAAAAAAGGCAGACAAAGAAATGCTTTTTGGGTTCATCATCTTCATCAAGAAGAAATTCT  2948

Query 3182  GGGGAGGTATGTTGGGAAAGACTATAAGGAGCAGAAGGGGCTCTGGCACCACTTCACTGATGTGGAGCGACAGA  3255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2949  GGGGAGGTATGTTGGGAAAGACTATAAGGAGCAGAAGGGGCTCTGGCACCACTTCACTGATGTGGAGCGACAGA  3022

Query 3256  --------------------------------------------------------------------------  3255
                                                                                      
Sbjct 3023  TGACCGCACAGCACTATGTGACAGAATTTAACAAGAGACTCTATGAACAAAACATTCCCACCCAGATATTCTAC  3096

Query 3256  --------------------------------------------------------------------------  3255
                                                                                      
Sbjct 3097  ATCCCATCCACAATACTACTGATTTTAGAGGACAAGACAATAAAGGGATGTATCAGTGTGGAGCCTTACATACT  3170

Query 3256  --------------------------------------------------------------------------  3255
                                                                                      
Sbjct 3171  GGGAGAATTTGTAAAATTGTCAAATAACACGAAAGTGGTGAAAACAGAATACAAAGCCACAGAATATGGCTTGG  3244

Query 3256  --------------------------------------------------------------------------  3255
                                                                                      
Sbjct 3245  CCTATGGCCATTTTTCTTATGAGTTTTCTAATCATAGAGATGTTGTGGTCGATTTACAAGGTTGGGTAACCGGT  3318

Query 3256  --------------------------------------------------------------------------  3255
                                                                                      
Sbjct 3319  AATGGAAAAGGACTCATCTACCTCACAGATCCCCAGATTCACTCCGTTGATCAGAAAGTTTTCACTACCAATTT  3392

Query 3256  --------------------------------------------------------------------------  3255
                                                                                      
Sbjct 3393  TGGAAAGAGAGGAATTTTTTACTTCTTTAATAACCAGCATGTGGAATGTAATGAAATCTGCCATCGTCTTTCTT  3466

Query 3256  --------------------------------  3255
                                            
Sbjct 3467  TGACTAGACCTTCAATGGAGAAACCATGCACA  3498