Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474119
• Subject: NM_178374.3
• Aligned Length: 1088
• Identities: 965
• Gaps: 22

Alignment

Query    1  ATGGAAGAGTTGAGTCAGGCCCTGGCTAGTAGCTTTTCTGTGTCTCAAGATCTGAACAGCACAGCTGCCCCACA  74
            ||||||||..||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGGAAGAACTGAGCCAAGCCCTGGCTAGTAGCTTTTCTGTGTCTCAAGAACTGAACAGCACAGCTGCCCCCCA  74

Query   75  CCCCCGCCTATCCCAGTACAAGTCCAAGTACAGTTCCTTGGAGCAGAGTGAGCGCCGCCGGAGGTTACTGGAAC  148
            |||.|||||.|..||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||...|.|||||||.|
Sbjct   75  CCCACGCCTGTGTCAATACAAGTCCAAGTACAGTTCCTTGGAGCAGAGTGAGCGGCGGCGCCAGCTACTGGAGC  148

Query  149  TGCAGAAATCCAAGCGGCTGGATTATGTGAACCATGCCAGAAGACTGGCTGAAGATGACTGGACAGGGATGGAG  222
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  TGCAGAAATCCAAGCGGTTGGATTATGTGAACCATGCCAGAAGACTGGCTGAAGATGACTGGACAGGTATGGAG  222

Query  223  AGTGAGGAA---GAAAATAAGAAAGATGATGAAGAAATGGACATTGACACTGTCAAGAAGTTACCAAAACACTA  293
            ||||.||||   |||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||.||..|||||||||||||||||.|||
Sbjct  223  AGTGGGGAAGAGGAAAACAAGAAAGATGAAGAGGAAATGGACATAGACCCTAGCAAGAAGTTACCAAAACGCTA  296

Query  294  TGCTAATCAATTGATGCTTTCTGAGTGGTTAATTGACGTTCCTTCAGATTTGGGGCAGGAATGGATTGTGGTCG  367
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  297  TGCTAATCAATTGATGCTTTCTGAGTGGTTAATTGACGTCCCTTCAGATTTGGGGCAAGAATGGATTGTGGTTG  370

Query  368  TGTGCCCTGTTGGAAAAAGAGCCCTTATCGTGGCCTCCAGGGGTTCTACCAGTGCCTACACCAAGAGTGGCTAC  441
            ||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  TGTGTCCTGTTGGGAAAAGAGCCCTTATCGTGGCCTCCAGGGGTTCAACAAGTGCCTACACTAAGAGTGGCTAC  444

Query  442  TGTGTCAACAGGTTTTCTTCACTTCTGCCAGGAGGCAACAGGCGAAACT---CAACAGCAAAAGACTACACCAT  512
            ||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||||   |||||||.||||||||||||||
Sbjct  445  TGTGTCAATAGGTTTTCTTCCCTTCTGCCCGGAGGCAACAGGAGAAACTCAACAACAGCCAAAGACTACACCAT  518

Query  513  TCTAGATTGCATTTACAATGAGGTAAACCAGACCTACTACGTTCTGGATGTGATGTGCTGGCGGGGACACCCTT  586
            |||.|||||||||||||.||||||.||.|||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  TCTGGATTGCATTTACAGTGAGGTGAATCAGACATACTATGTTTTGGATGTGATGTGCTGGCGGGGACATCCTT  592

Query  587  TTTATGATTGCCAGACTGATTTCCGATTCTACTGGATGCATTCAAAGTTACCAGAAGAAGAAGGACTGGGAGAG  660
            |||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  593  TTTATGACTGTCAGACTGATTTCCGATTCTACTGGATGCATTCAAAGTTACCAGAAGAAGAAGGGCTTGGAGAG  666

Query  661  AAAACCAAGCTTAATCCTTTTAAATTTGTGGGGCTAAAGAACTTCCCTTGCACTCCCGAAAGCCTGTGTGATGT  734
            |||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.||
Sbjct  667  AAAACCAAGATTAATCCTTTTAAGTTTGTGGGGCTAAAGAATTTCCCGTGTACCCCTGAGAGCCTGTGTGAGGT  740

Query  735  GCTATCTATGGATTTCCCTTTTGAGGTAGATGGACTTCTCTTCTACCACAAACAGACCCACTACAGCCCCGGAA  808
            |||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  741  GCTGTCTATGGATTTTCCTTTTGAGGTAGATGGGCTGCTCTTCTACCATAAACAGACCCACTATAGCCCTGGGA  814

Query  809  GCACTCCCTTGGTGGGCTGGCTGCGCCCCTACATGGTGTCAGATGTCCTTGGTGTAGCTGTGCCGGCTGGCCCG  882
            |.|||||..|||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||.||.||||||||.
Sbjct  815  GTACTCCTCTGGTGGGTTGGCTGCGCCCCTACATGGTGTCAGATATTCTGGGTGTAGCTGTTCCAGCTGGCCCA  888

Query  883  CTGACCACCAAGCCAGACTATGCTGGGCACCAGCTCCAGCAGATTATGGAGCACAAGAAGAGCCAGAAGGAAGG  956
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||.|||||   ||||||.
Sbjct  889  CTGACCACCAAGCCAGAATACGCTGGGCACCAGCTCCAACAGATTATTGAGCACAAGAGGAGCC---AGGAAGA  959

Query  957  CATGAAGGAGAAACTCACACACAAGGCCTCTGAGAATGGGCACTATGAATTGGAGCACCTGTCTACTCCCAAGT  1030
            ||..|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||..||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  CACAAAGGAGAAACTCACACACAAGGCTTCTGAGAATGGCCACTATGAGCTGGAGCACCTGTCTACTCCCAAGT  1033

Query 1031  T--GAAGGGTTCTTCCCATAGCCCAGACCACCCTGGATGCCTCATGGAGAAT  1080
            |  |||  .|.||.||||.|||.|.||        || ||||||||||.||.
Sbjct 1034  TAAGAA--ATCCTCCCCACAGCTCTGA--------GA-GCCTCATGGACAAC  1074