Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474364
• Subject: NM_001166138.1
• Aligned Length: 1197
• Identities: 1079
• Gaps: 42

Alignment

Query    1  ------------------------------AT------------GGAAGTAACAGCTAGCAGTCGCCACTATGT  32
                                          ||            |||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTGCCTGTTGGAGACCCCAATCCGCATGAGCGTCCTCTCGGAGGTAACAGCTAGCAGTCGCCACTATGT  74

Query   33  TGACAGGCTATTTGACCCTGATCCCCAGAAAGTTCTACAAGGTGTCATAGACATGAAAAATGCTGTAATTGGAA  106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGACAGGCTATTTGACCCTGATCCCCAGAAAGTTCTCCAAGGTGTCATAGACATGAAAAATGCTGTAATTGGAA  148

Query  107  ACAACAAGCAGAAAGCCAATCTCATTGTTTTAGGAGCTGTTCCAAGATTGTTGTACTTGCTTCAGCAAGAAACC  180
            ||||.||.|||||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  149  ACAATAAACAGAAAGCCAACCTCATCGTTCTAGGAGCGGTTCCAAGATTGTTGTATTTGCTTCAACAAGAAACC  222

Query  181  TCAAGCACAGAGCTGAAAACTGAATGTGCAGTGGTGTTGGGAAGTCTTGCTATGGGTACTGAAAACAATGTCAA  254
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct  223  TCAAGTACAGAGCTGAAAACTGAATGTGCAGTGGTGTTAGGGAGTCTTGCGATGGGCACAGAAAACAATGTCAA  296

Query  255  GTCTCTACTGGACTGCCATATTATCCCTGCCTTATTGCAAGGACTACTGTCCCCAGACCTGAAGTTTATTGAAG  328
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  GTCTCTACTAGACTGCCATATTATCCCTGCCTTACTACAAGGACTACTGTCCCCAGACCTGAAGTTCATTGAAG  370

Query  329  CTTGCCTCCGATGCCTGCGTACCATCTTCACCAGTCCTGTCACTCCAGAGGAGCTACTGTATACAGATGCCACA  402
            ||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  371  CTTGCCTCCGATGCCTCCGGACAATCTTCACCAGCCCTGTCACTCCAGAGGAGCTACTGTATACAGATGCTACG  444

Query  403  GTGATACCACACCTCATGGCACTGCTTAGCAGGTCCCGCTATACCCAGGAGTACATCTGTCAGATCTTCTCACA  476
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  445  GTGATACCACACCTCATGGCACTGCTGAGCAGGTCCCGCTACACCCAGGAGTATATCTGCCAGATCTTCTCACA  518

Query  477  CTGCTGTAAAGGGCCAGATCATCAAACAATTTTATTTAACCACGGTGCAGTTCAGAATATTGCTCACCTACTAA  550
            |||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||||
Sbjct  519  CTGTTGCAAAGGGCCAGATCATCAAACAATTTTGTTTAACCATGGGGCAGTGCAGAACATTGCTCATCTCCTAA  592

Query  551  CCTCACTGTCCTACAAAGTTCGAATGCAAGCACTGAAATGTTTCTCAGTTTTAGCTTTTGAAAACCCCCAGGTA  624
            ||||||..||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct  593  CCTCACCCTCTTACAAAGTTCGAATGCAAGCACTGAAATGCTTCTCTGTTTTAGCCTTTGAGAATCCCCAAGTA  666

Query  625  TCGATGACCCTGGTAAATGTTTTGGTTGATGGAGAATTGTTACCACAGATTTTTGTGAAGATGTTACAGAGGGA  698
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCGATGACCCTGGTAAACGTTTTGGTTGATGGGGAGTTGTTACCACAGATATTTGTGAAGATGTTACAGAGGGA  740

Query  699  TAAGCCTATTGAGATGCAGCTCACATCAGCAAAATGTTTAACTTACATGTGTAGAGCTGGAGCAATTCGGACAG  772
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  TAAGCCTATTGAGATGCAGCTCACGTCAGCAAAATGTTTAACTTACATGTGCAGAGCTGGAGCAATTCGCACAG  814

Query  773  ATGATAACTGTATTGTATTAAAGACATTACCTTGTTTGGTTCGAATGTGCAGTAAGGAGAGATTACTAGAGGAG  846
            ||||.|.|||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  815  ATGACAGCTGTATTGTATTAAAAACTTTGCCTTGTTTGGTTCGAATGTGCAGTAAGGAGAGGTTACTAGAGGAG  888

Query  847  AGAGTTGAAGGAGCTGAGACACTTGCCTATCTGATTGAACCAGATGTTGAGCTACAGAGAATCGCTAGCATAAC  920
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGAGTTGAAGGAGCTGAGACCCTCGCCTATCTGATTGAGCCAGATGTTGAGCTGCAGAGAATCGCTAGCATAAC  962

Query  921  TGATCACCTCATTGCCATGCTTGCTGATTATTTCAAGTATCCCAGCTCAGTGAGTGCCATCACTGATATTAAAA  994
            .||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  963  CGACCACCTCATTGCCATGCTGGCTGACTATTTCAAGTATCCCAGCTCAGTGAGCGCCATCACTGACATTAAAA  1036

Query  995  GGCTTGATCATGATTTAAAACATGCTCACGAACTCCGCCAGGCTGCATTCAAGCTCTATGCCTCTCTTGGAGCA  1068
            |||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGCTTGATCATGACTTAAAACATGCCCATGAGCTCCGCCAGGCTGCGTTCAAGCTCTATGCCTCTCTTGGAGCA  1110

Query 1069  AATGATGAAGACATCCGGAAGAAGGTGAGTCTGGGAGAGGGGCGTCCCCCAGTCCTGACAGCCAGCAGGCAGGG  1142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AATGATGAAGACATCCGGAAGAAGGTGAGTCTGGGAGAGGGGCGTCCCCCAGTCCTGACAGCCAGCAGGCAGGG  1184

Query 1143  AGTGACGTCAACC  1155
            |||||||||||||
Sbjct 1185  AGTGACGTCAACC  1197