Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474480
• Subject: XM_005274550.5
• Aligned Length: 3709
• Identities: 3604
• Gaps: 99

Alignment

Query    1  ATGCGGAGCAGGAGCAATTCCGGGGTCCGCTTGGACGGGTACGCGCGGCTGGTGCAGCAAACCATCCTGTGTTA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCGGAGCAGGAGCAATTCCGGGGTCCGCTTGGACGGGTACGCGCGGCTGGTGCAGCAAACCATCCTGTGTTA  74

Query   75  CCAGAATCCCGTCACGGGGCTGCTGTCAGCCAGCCATGAGCAGAAGGATGCCTGGGTGCGGGATAACATCTACA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGAATCCCGTCACGGGGCTGCTGTCAGCCAGCCATGAGCAGAAGGATGCCTGGGTGCGGGATAACATCTACA  148

Query  149  GTATCCTGGCCGTGTGGGGCCTGGGCATGGCCTACCGTAAGAATGCAGACCGCGATGAGGACAAGGCCAAGGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTATCCTGGCCGTGTGGGGCCTGGGCATGGCCTACCGTAAGAATGCAGACCGCGATGAGGACAAGGCCAAGGCC  222

Query  223  TACGAGCTGGAGCAGAACGTGGTGAAGCTGATGCGAGGTCTTCTCCAGTGCATGATGAGACAGGTGGCCAAAGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TACGAGCTGGAGCAGAACGTGGTGAAGCTGATGCGAGGTCTTCTCCAGTGCATGATGAGACAGGTGGCCAAAGT  296

Query  297  GGAGAAGTTCAAACACACTCAGAGCACCAAGGACAGCCTGCACGCCAAGTACAACACCGCCACCTGTGGCACGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAGAAGTTCAAACACACTCAGAGCACCAAGGACAGCCTGCACGCCAAGTACAACACCGCCACCTGTGGCACGG  370

Query  371  TGGTGGGCGACGACCAGTGGGGCCACCTCCAGGTGGATGCCACCTCTCTCTTCCTCCTGTTCCTGGCCCAGATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGTGGGCGACGACCAGTGGGGCCACCTCCAGGTGGATGCCACCTCTCTCTTCCTCCTGTTCCTGGCCCAGATG  444

Query  445  ACCGCCTCAGGCTTACGTATCATTTTCACTCTCGATGAGGTGGCCTTCATACAGAATCTTGTCTTTTACATAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACCGCCTCAGGCTTACGTATCATTTTCACTCTCGATGAGGTGGCCTTCATACAGAATCTTGTCTTTTACATAGA  518

Query  519  AGCTGCATATAAAGTCGCTGATTATGGAATGTGGGAGCGTGGAGATAAGACTAATCAGGGCATCCCGGAATTGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCTGCATATAAAGTCGCTGATTATGGAATGTGGGAGCGTGGAGATAAGACTAATCAGGGCATCCCGGAATTGA  592

Query  593  ATGCAAGCTCCGTAGGAATGGCCAAGGCAGCTCTTGAGGCAATTGATGAACTGGACCTTTTTGGAGCCCATGGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGCAAGCTCCGTAGGAATGGCCAAGGCAGCTCTTGAGGCAATTGATGAACTGGACCTTTTTGGAGCCCATGGA  666

Query  667  GGACGCAAGTCAGTGATTCATGTTCTGCCAGATGAGGTCGAGCACTGCCAGTCTTATTCTTGTTCTCCATGCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct  667  GGACGCAAGTCAGTGATTCATGTTCTGCCAGATGAGGTCGAGCACTGCCAGTC-TATTC-TGTTCTCCATGCTG  738

Query  741  CCCAAGAAGCGTCGACATCTAAAGAAATTGATGCTGGACTTCTTTCCATTATTTCCTTCCCGGCCTTTGCAGTG  814
             ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  -CCAAG-AGCGTCGACATCTAAAGAAATTGATGCTGGACTTCTTTCCATTATTTCCTTCCCGGCCTTTGCAGTG  810

Query  815  GAAGATGTAAACCTTGTAAATGTGACCAAAAATGAAATTATTTCTAAGCTCCAGGGGCGTTATGGATGCTGTCG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  GAAGATGTAAACCTTGTAAATGTGACCAAAAATGAAATTATTTCTAAGCTCCAGGGGCGTTATGGATGCTGTCG  884

Query  889  CTTCCTTCGAGATGGTTATAAAACTCCAAGAGAGGACCCTAATCGACTGCATTATGACCCTGCTGAACTCAAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  885  CTTCCTTCGAGATGGTTATAAAACTCCAAGAGAGGACCCTAATCGACTGCATTATGACCCTGCTGAACTCAAGC  958

Query  963  TCTTCGAAAACATTGAATGTGAGTGGCCTGTGTTTTGGACATATTTTATAATAGATGGAGTCTTCAGTGGTGAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959  TCTTCGAAAACATTGAATGTGAGTGGCCTGTGTTTTGGACATATTTTATAATAGATGGAGTCTTCAGTGGTGAT  1032

Query 1037  GCTGTTCAGGTCCAAGAATACCGAGAGGCCCTGGAGGGAATACTCATCAGAGGCAAGAATGGGATCCGCCTGGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  GCTGTTCAGGTCCAAGAATACCGAGAGGCCCTGGAGGGAATACTCATCAGAGGCAAGAATGGGATCCGCCTGGT  1106

Query 1111  GCCTGAACTCTACGCTGTCCCGCCTAACAAGGTAGATGAAGAGTACAAGAATCCTCACACAGTAGACCGAGTTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107  GCCTGAACTCTACGCTGTCCCGCCTAACAAGGTAGATGAAGAGTACAAGAATCCTCACACAGTAGACCGAGTTC  1180

Query 1185  CTATGGGGAAGGTGCCTCATCTGTGGGGCCAATCCTTGTACATCCTCAGCTCGCTGTTGGCAGAGGGATTCCTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181  CTATGGGGAAGGTGCCTCATCTGTGGGGCCAATCCTTGTACATCCTCAGCTCGCTGTTGGCAGAGGGATTCCTT  1254

Query 1259  GCCGCTGGTGAAATCGATCCCTTAAATAGAAGATTTTCCACTTCAGTCAAACCTGATGTTGTAGTACAAGTTAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255  GCCGCTGGTGAAATCGATCCCTTAAATAGAAGATTTTCCACTTCAGTCAAACCTGATGTTGTAGTACAAGTTAC  1328

Query 1333  TGTTTTGGCAGAAAACAATCACATTAAGGACTTATTGAGGAAACACGGGGTGAACGTCCAGAGTATCGCGGACA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329  TGTTTTGGCAGAAAACAATCACATTAAGGACTTATTGAGGAAACACGGGGTGAACGTCCAGAGTATCGCGGACA  1402

Query 1407  TTCATCCAATTCAAGTCCAGCCGGGCCGGATTCTTAGTCACATATATGCCAAGCTTGGACGGAATAAGAATATG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403  TTCATCCAATTCAAGTCCAGCCGGGCCGGATTCTTAGTCACATATATGCCAAGCTTGGACGGAATAAGAATATG  1476

Query 1481  AATTTGAGTGGGCGACCGTATCGACATATTGGTGTCCTTGGAACCTCTAAACTATATGTGATTAGGAACCAAAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477  AATTTGAGTGGGCGACCGTATCGACATATTGGTGTCCTTGGAACCTCTAAACTATATGTGATTAGGAACCAAAT  1550

Query 1555  CTTTACTTTTACACCCCAGTTCACCGACGAGCATCACTTCTACCTGGCCCTCGACAATGAGATGATCGTGGAGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551  CTTTACTTTTACACCCCAGTTCACCGACCAGCATCACTTCTACCTGGCCCTCGACAATGAGATGATCGTGGAGA  1624

Query 1629  TGCTAAGGATCGAGCTGGCCTACCTGTGCACCTGCTGGAGGATGACGGGCAGACCCACACTCACCTTCCCCATC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625  TGCTAAGGATCGAGCTGGCCTACCTGTGCACCTGCTGGAGGATGACGGGCAGACCCACACTCACCTTCCCCATC  1698

Query 1703  AGTCGCACCATGCTCACAAATGATGGCTCAGACATTCATTCTGCTGTGCTCTCCACAATTAGAAAACTAGAGGA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699  AGTCGCACCATGCTCACAAATGATGGCTCAGACATTCATTCTGCTGTGCTCTCCACAATTAGAAAACTAGAGGA  1772

Query 1777  TGGATATTTTGGAGGAGCCAGAGTAAAATTAGGGAACCTTTCGGAATTTCTCACCACATCGTTCTACACATATC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773  TGGATATTTTGGAGGAGCCAGAGTAAAATTAGGGAACCTTTCGGAATTTCTCACCACATCGTTCTACACATATC  1846

Query 1851  TGACTTTTCTGGATCCAGACTGTGATGAGAAGTTGTTTGACAATGCCAGCGAAGGGACTTTCAGTCCTGATAGT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847  TGACTTTTCTGGATCCAGACTGTGATGAGAAGTTGTTTGACAATGCCAGCGAAGGGACTTTCAGTCCTGATAGT  1920

Query 1925  GATTCAGATTTGGTAGGATATCTGGAAGACACCTGTAATCAAGAAAGCCAAGACGAACTTGACCATTATATCAA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921  GATTCAGATTTGGTAGGATATCTGGAAGACACCTGTAATCAAGAAAGCCAAGACGAACTTGACCATTATATCAA  1994

Query 1999  CCACCTTCTGCAAAGCACATCGTTGAGGTCCTATCTGCCTCCTCTTTGTAAGAACACAGAAGACCGCCATGTCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995  CCACCTTCTGCAAAGCACATCGTTGAGGTCCTATCTGCCTCCTCTTTGTAAGAACACAGAAGACCGCCATGTCT  2068

Query 2073  TCAGTGCTATCCACTCCACGCGGGACATACTTTCTGTGATGGCAAAAGCAAAGGGTTTGGAAGTTCCATTTGTT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069  TCAGTGCTATCCACTCCACGCGGGACATACTTTCTGTGATGGCAAAAGCAAAGGGTTTGGAAGTTCCATTTGTT  2142

Query 2147  CCCATGACTTTGCCGACTAAAGTTCTAAGTGCCCACCGTAAATCACTGAATCTTGTTGATTCTCCTCAGCCACT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2143  CCCATGACTTTGCCGACTAAAGTTCTAAGTGCCCACCGTAAATCACTGAATCTTGTTGATTCTCCTCAGCCACT  2216

Query 2221  CCTAGAAAAGGTTCCTGAAAGTGACTTTCAGTGGCCCAGAGATGACCATAGTGACGTGGACTGTGAGAAGCTGG  2294
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2217  CCTAGAAAAGGTTCCTGAAAGTGACTTTCAGTGGCCCAGAGATGACCATGGTGACGTGGACTGTGAGAAGCTGG  2290

Query 2295  TTGAGCAGCTAAAAGATTGTTCGAACCTACAGGACCAAGCAGACATTCTGTACATTCTTTATGTCATAAAGGGT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2291  TTGAGCAGCTAAAAGATTGTTCGAACCTACAGGACCAAGCAGACATTCTGTACATTCTTTATGTCATAAAGGGT  2364

Query 2369  CCCAGCTGGGACACAAATCTCTCTGGACAGCACGGGGTCACCGTTCAAAACCTTCTTGGTGAGCTCTATGGGAA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2365  CCCAGCTGGGACACAAATCTCTCTGGACAGCACGGGGTCACCGTTCAAAACCTTCTTGGTGAGCTCTATGGGAA  2438

Query 2443  AGCCGGCTTGAACCAGGAGTGGGGTCTGATTCGCTACATCTCAGGCCTTCTCAGGAAGAAAGTGGAGGTCCTGG  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2439  AGCCGGCTTGAACCAGGAGTGGGGTCTGATTCGCTACATCTCAGGCCTTCTCAGGAAGAAAGTGGAGGTCCTGG  2512

Query 2517  CTGAGGCCTGCACAGACCTGCTTTCGCACCAGAAGCAGCTCACCGTGGGCCTGCCGCCCGAGCCCCGGGAGAAG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2513  CTGAGGCCTGCACAGACCTGCTTTCGCACCAGAAGCAGCTCACCGTGGGCCTGCCGCCCGAGCCCCGGGAGAAG  2586

Query 2591  ATCATCTCTGCGCCCCTTCCCCCAGAGGAGCTCACAAAACTCATCTACGAGGCCAGTGGGCAGGACATCAGCAT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2587  ATCATCTCTGCGCCCCTTCCCCCAGAGGAGCTCACAAAACTCATCTACGAGGCCAGTGGGCAGGACATCAGCAT  2660

Query 2665  TGCCGTCCTCACGCAGGAGATTGTGGTTTACCTGGCCATGTATGTCAGGGCGCAGCCCAGCCTCTTTGTGGAGA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2661  TGCCGTCCTCACGCAGGAGATTGTGGTTTACCTGGCCATGTATGTCAGGGCGCAGCCCAGCCTCTTTGTGGAGA  2734

Query 2739  TGCTGAGACTCCGGATTGGACTGATCATTCAGGTGATGGCCACGGAGCTGGCACGGAGCCTGAACTGCTCAGGA  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2735  TGCTGAGACTCCGGATTGGACTGATCATTCAGGTGATGGCCACGGAGCTGGCACGGAGCCTGAACTGCTCAGGA  2808

Query 2813  GAAGAGGCTTCTGAAAGTTTGATGAACCTCAGCCCTTTCGATATGAAAAATCTCCTGCACCATATTCTAAGTGG  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2809  GAAGAGGCTTCTGAAAGTTTGATGAACCTCAGCCCTTTCGATATGAAAAATCTCCTGCACCATATTCTAAGTGG  2882

Query 2887  GAAAGAGTTTGGCGTTGAAAGAAGTGTGCGCCCTATCCACTC--TCACAATCAGCCCTA-CATCT-CAT-CACG  2955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  .||||..|||||||| ||||| ||| ||||
Sbjct 2883  GAAAGAGTTTGGCGTTGAAAGAAGTGTGCGCCCTATCCACTCCTCCACATCCAGCCCTACCATCTCCATCCACG  2956

Query 2956  AGGT--GTCATA-CGGAGTCA-CAAAACTGAGAGGAGTGGCATT-ACAGACTGA-GAGTGAAATGAAACAGATG  3023
            ||||  |.|||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
Sbjct 2957  AGGTGGGCCATACCGGAGTCACCAAAACTGAGAGGAGTGGCATTAACAGACTGAGGAGTGAAATGAAACA----  3026

Query 3024  ACTAGGCGGTTTAGTGCTGATGAACAGTTCTTTTCTGTGGGCCAGGCCGCGTCCAGCAGTGCGCATTCCTCCAA  3097
                                                                                      
Sbjct 3027  --------------------------------------------------------------------------  3026

Query 3098  GTCTGCGAGGTCCAGCACCCCATCCTCGCCCACTGGCACGTCATCCTCAGACTCGGGAGGACATCACATCGGCT  3171
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3027  ------GAGGTCCAGCACCCCATCCTCGCCCACTGGCACGTCATCCTCAGACTCGGGAGGACATCACATCGGCT  3094

Query 3172  GGGGTGAGCGGCAGGGCCAGTGGCTGCGCAGGAGAAGGCTGGATGGGGCCATCAACAGGGTCCCCGTGGGATTC  3245
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3095  GGGGTGAGCGGCAGGGCCAGTGGCTGCGCAGGAGAAGGCTGGATGGGGCCATCAACAGGGTCCCCGTGGGATTC  3168

Query 3246  TACCAGAGGGTGTGGAAGATCCTCCAGAAGTGCCACGGTCTCTCCATCGATGGTTATGTCCTCCCATCCTCGAC  3319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3169  TACCAGAGGGTGTGGAAGATCCTCCAGAAGTGCCACGGTCTCTCCATCGATGGTTATGTCCTCCCATCCTCGAC  3242

Query 3320  GACCCGAGAGATGACCCCGCATGAGATCAAGTTTGCTGTCCATGTCGAATCGGTGCTGAACCGCGTGCCGCAGC  3393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3243  GACCCGAGAGATGACCCCGCATGAGATCAAGTTTGCTGTCCATGTCGAATCGGTGCTGAACCGCGTGCCGCAGC  3316

Query 3394  CCGAGTACCGGCAGCTGCTGGTGGAAGCCATCATGGTGCTGACGCTGCTCTCGGACACGGAGATGACCAGCATC  3467
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3317  CCGAGTACCGGCAGCTGCTGGTGGAAGCCATCATGGTGCTGACGCTGCTCTCGGACACGGAGATGACCAGCATC  3390

Query 3468  GGGGGCATCATCCACGTGGACCAGATCGTGCAGATGGCCAGTCAGCTGTTCTTGCAGGACCAGGTGTCAATTGG  3541
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3391  GGGGGCATCATCCACGTGGACCAGATCGTGCAGATGGCCAGTCAGCTGTTCTTGCAGGACCAGGTGTCAATTGG  3464

Query 3542  TGCCATGGACACCCTGGAGAAAGACCAAGCCACAGGAATCTGCCACTTCTTTTATGACAGCGCTCCGAGTGGGG  3615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3465  TGCCATGGACACCCTGGAGAAAGACCAAGCCACAGGAATCTGCCACTTCTTTTATGACAGCGCTCCGAGTGGGG  3538

Query 3616  CTTATGGGACGATGACCTACCTAACAAGAGCAGTGGCTTCTTATTTGCAGGAATTGTTGCCCAATTCGGGCTGC  3689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3539  CTTATGGGACGATGACCTACCTAACAAGAGCAGTGGCTTCTTATTTGCAGGAATTGTTGCCCAATTCGGGCTGC  3612

Query 3690  CAGATGCAA  3698
            |||||||||
Sbjct 3613  CAGATGCAA  3621