Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474480
- Subject:
- XM_006724498.4
- Aligned Length:
- 3733
- Identities:
- 3142
- Gaps:
- 585
Alignment
Query 1 ATGCGGAGCAGGAGCAATTCCGGGGTCCGCTTGGACGGGTACGCGCGGCTGGTGCAGCAAACCATCCTGTGTTA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCAGAATCCCGTCACGGGGCTGCTGTCAGCCAGCCATGAGCAGAAGGATGCCTGGGTGCGGGATAACATCTACA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GTATCCTGGCCGTGTGGGGCCTGGGCATGGCCTACCGTAAGAATGCAGACCGCGATGAGGACAAGGCCAAGGCC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TACGAGCTGGAGCAGAACGTGGTGAAGCTGATGCGAGGTCTTCTCCAGTGCATGATGAGACAGGTGGCCAAAGT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GGAGAAGTTCAAACACACTCAGAGCACCAAGGACAGCCTGCACGCCAAGTACAACACCGCCACCTGTGGCACGG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TGGTGGGCGACGACCAGTGGGGCCACCTCCAGGTGGATGCCACCTCTCTCTTCCTCCTGTTCCTGGCCCAGATG 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 ACCGCCTCAGGCTTACGTATCATTTTCACTCTCGATGAGGTGGCCTTCATACAGAATCTTGTCTTTTACATAGA 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 AGCTGCATATAAAGTCGCTGATTATGGAATGTGGGAGCGTGGAGATAAGACTAATCAGGGCATCCCGGAATTGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------------------------ATGTGGGAGCGTGGAGATAAGACTAATCAGGGCATCCCGGAATTGA 46
Query 593 ATGCAAGCTCCGTAGGAATGGCCAAGGCAGCTCTTGAGGCAATTGATGAACTGGACCTTTTTGGAGCCCATGGA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 47 ATGCAAGCTCCGTAGGAATGGCCAAGGCAGCTCTTGAGGCAATTGATGAACTGGACCTTTTTGGAGCCCATGGA 120
Query 667 GGACGCAAGTCAGTGATTCATGTTCTGCCAGATGAGGTCGAGCACTGCCAGTCTTATTCTTGTTCTCCATGCTG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 121 GGACGCAAGTCAGTGATTCATGTTCTGCCAGATGAGGTCGAGCACTGCCAGTC-TATTC-TGTTCTCCATGCTG 192
Query 741 CCCAAGAAGCGTCGACATCTAAAGAAATTGATGCTGGACTTCTTTCCATTATTTCCTTCCCGGCCTTTGCAGTG 814
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 193 -CCAAG-AGCGTCGACATCTAAAGAAATTGATGCTGGACTTCTTTCCATTATTTCCTTCCCGGCCTTTGCAGTG 264
Query 815 GAAGATGTAAACCTTGTAAATGTGACCAAAAATGAAATTATTTCTAAGCTCCAGGGGCGTTATGGATGCTGTCG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 265 GAAGATGTAAACCTTGTAAATGTGACCAAAAATGAAATTATTTCTAAGCTCCAGGGGCGTTATGGATGCTGTCG 338
Query 889 CTTCCTTCGAGATGGTTATAAAACTCCAAGAGAGGACCCTAATCGACTGCATTATGACCCTGCTGAACTCAAGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 339 CTTCCTTCGAGATGGTTATAAAACTCCAAGAGAGGACCCTAATCGACTGCATTATGACCCTGCTGAACTCAAGC 412
Query 963 TCTTCGAAAACATTGAATGTGAGTGGCCTGTGTTTTGGACATATTTTATAATAGATGGAGTCTTCAGTGGTGAT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 413 TCTTCGAAAACATTGAATGTGAGTGGCCTGTGTTTTGGACATATTTTATAATAGATGGAGTCTTCAGTGGTGAT 486
Query 1037 GCTGTTCAGGTCCAAGAATACCGAGAGGCCCTGGAGGGAATACTCATCAGAGGCAAGAATGGGATCCGCCTGGT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 487 GCTGTTCAGGTCCAAGAATACCGAGAGGCCCTGGAGGGAATACTCATCAGAGGCAAGAATGGGATCCGCCTGGT 560
Query 1111 GCCTGAACTCTACGCTGTCCCGCCTAACAAGGTAGATGAAGAGTACAAGAATCCTCACACAGTAGACCGAGTTC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 561 GCCTGAACTCTACGCTGTCCCGCCTAACAAGGTAGATGAAGAGTACAAGAATCCTCACACAGTAGACCGAGTTC 634
Query 1185 CTATGGGGAAGGTGCCTCATCTGTGGGGCCAATCCTTGTACATCCTCAGCTCGCTGTTGGCAGAGGGATTCCTT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 635 CTATGGGGAAGGTGCCTCATCTGTGGGGCCAATCCTTGTACATCCTCAGCTCGCTGTTGGCAGAGGGATTCCTT 708
Query 1259 GCCGCTGGTGAAATCGATCCCTTAAATAGAAGATTTTCCACTTCAGTCAAACCTGATGTTGTAGTACAAGTTAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 709 GCCGCTGGTGAAATCGATCCCTTAAATAGAAGATTTTCCACTTCAGTCAAACCTGATGTTGTAGTACAAGTTAC 782
Query 1333 TGTTTTGGCAGAAAACAATCACATTAAGGACTTATTGAGGAAACACGGGGTGAACGTCCAGAGTATCGCGGACA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 783 TGTTTTGGCAGAAAACAATCACATTAAGGACTTATTGAGGAAACACGGGGTGAACGTCCAGAGTATCGCGGACA 856
Query 1407 TTCATCCAATTCAAGTCCAGCCGGGCCGGATTCTTAGTCACATATATGCCAAGCTTGGACGGAATAAGAATATG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 857 TTCATCCAATTCAAGTCCAGCCGGGCCGGATTCTTAGTCACATATATGCCAAGCTTGGACGGAATAAGAATATG 930
Query 1481 AATTTGAGTGGGCGACCGTATCGACATATTGGTGTCCTTGGAACCTCTAAACTATATGTGATTAGGAACCAAAT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 931 AATTTGAGTGGGCGACCGTATCGACATATTGGTGTCCTTGGAACCTCTAAACTATATGTGATTAGGAACCAAAT 1004
Query 1555 CTTTACTTTTACACCCCAGTTCACCGACGAGCATCACTTCTACCTGGCCCTCGACAATGAGATGATCGTGGAGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1005 CTTTACTTTTACACCCCAGTTCACCGACCAGCATCACTTCTACCTGGCCCTCGACAATGAGATGATCGTGGAGA 1078
Query 1629 TGCTAAGGATCGAGCTGGCCTACCTGTGCACCTGCTGGAGGATGACGGGCAGACCCACACTCACCTTCCCCATC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 TGCTAAGGATCGAGCTGGCCTACCTGTGCACCTGCTGGAGGATGACGGGCAGACCCACACTCACCTTCCCCATC 1152
Query 1703 AGTCGCACCATGCTCACAAATGATGGCTCAGACATTCATTCTGCTGTGCTCTCCACAATTAGAAAACTAGAGGA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1153 AGTCGCACCATGCTCACAAATGATGGCTCAGACATTCATTCTGCTGTGCTCTCCACAATTAGAAAACTAGAGGA 1226
Query 1777 TGGATATTTTGGAGGAGCCAGAGTAAAATTAGGGAACCTTTCGGAATTTCTCACCACATCGTTCTACACATATC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1227 TGGATATTTTGGAGGAGCCAGAGTAAAATTAGGGAACCTTTCGGAATTTCTCACCACATCGTTCTACACATATC 1300
Query 1851 TGACTTTTCTGGATCCAGACTGTGATGAGAAGTTGTTTGACAATGCCAGCGAAGGGACTTTCAGTCCTGATAGT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1301 TGACTTTTCTGGATCCAGACTGTGATGAGAAGTTGTTTGACAATGCCAGCGAAGGGACTTTCAGTCCTGATAGT 1374
Query 1925 GATTCAGATTTGGTAGGATATCTGGAAGACACCTGTAATCAAGAAAGCCAAGACGAACTTGACCATTATATCAA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1375 GATTCAGATTTGGTAGGATATCTGGAAGACACCTGTAATCAAGAAAGCCAAGACGAACTTGACCATTATATCAA 1448
Query 1999 CCACCTTCTGCAAAGCACATCGTTGAGGTCCTATCTGCCTCCTCTTTGTAAGAACACAGAAGACCGCCATGTCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1449 CCACCTTCTGCAAAGCACATCGTTGAGGTCCTATCTGCCTCCTCTTTGTAAGAACACAGAAGACCGCCATGTCT 1522
Query 2073 TCAGTGCTATCCACTCCACGCGGGACATACTTTCTGTGATGGCAAAAGCAAAGGGTTTGGAAGTTCCATTTGTT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1523 TCAGTGCTATCCACTCCACGCGGGACATACTTTCTGTGATGGCAAAAGCAAAGGGTTTGGAAGTTCCATTTGTT 1596
Query 2147 CCCATGACTTTGCCGACTAAAGTTCTAAGTGCCCACCGTAAATCACTGAATCTTGTTGATTCTCCTCAGCCACT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1597 CCCATGACTTTGCCGACTAAAGTTCTAAGTGCCCACCGTAAATCACTGAATCTTGTTGATTCTCCTCAGCCACT 1670
Query 2221 CCTAGAAAAGGTTCCTGAAAGTGACTTTCAGTGGCCCAGAGATGACCATAGTGACGTGGACTGTGAGAAGCTGG 2294
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1671 CCTAGAAAAGGTTCCTGAAAGTGACTTTCAGTGGCCCAGAGATGACCATGGTGACGTGGACTGTGAGAAGCTGG 1744
Query 2295 TTGAGCAGCTAAAAGATTGTTCGAACCTACAGGACCAAGCAGACATTCTGTACATTCTTTATGTCATAAAGGGT 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1745 TTGAGCAGCTAAAAGATTGTTCGAACCTACAGGACCAAGCAGACATTCTGTACATTCTTTATGTCATAAAGGGT 1818
Query 2369 CCCAGCTGGGACACAAATCTCTCTGGACAGCACGGGGTCACCGTTCAAAACCTTCTTGGTGAGCTCTATGGGAA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1819 CCCAGCTGGGACACAAATCTCTCTGGACAGCACGGGGTCACCGTTCAAAACCTTCTTGGTGAGCTCTATGGGAA 1892
Query 2443 AGCCGGCTTGAACCAGGAGTGGGGTCTGATTCGCTACATCTCAGGCCTTCTCAGGAAGAAAGTGGAGGTCCTGG 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1893 AGCCGGCTTGAACCAGGAGTGGGGTCTGATTCGCTACATCTCAGGCCTTCTCAGGAAGAAAGTGGAGGTCCTGG 1966
Query 2517 CTGAGGCCTGCACAGACCTGCTTTCGCACCAGAAGCAGCTCACCGTGGGCCTGCCGCCCGAGCCCCGGGAGAAG 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1967 CTGAGGCCTGCACAGACCTGCTTTCGCACCAGAAGCAGCTCACCGTGGGCCTGCCGCCCGAGCCCCGGGAGAAG 2040
Query 2591 ATCATCTCTGCGCCCCTTCCCCCAGAGGAGCTCACAAAACTCATCTACGAGGCCAGTGGGCAGGACATCAGCAT 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 ATCATCTCTGCGCCCCTTCCCCCAGAGGAGCTCACAAAACTCATCTACGAGGCCAGTGGGCAGGACATCAGCAT 2114
Query 2665 TGCCGTCCTCACGCAGGAGATTGTGGTTTACCTGGCCATGTATGTCAGGGCGCAGCCCAGCCTCTTTGTGGAGA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2115 TGCCGTCCTCACGCAGGAGATTGTGGTTTACCTGGCCATGTATGTCAGGGCGCAGCCCAGCCTCTTTGTGGAGA 2188
Query 2739 TGCTGAGACTCCGGATTGGACTGATCATTCAGGTGATGGCCACGGAGCTGGCACGGAGCCTGAACTGCTCAGGA 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2189 TGCTGAGACTCCGGATTGGACTGATCATTCAGGTGATGGCCACGGAGCTGGCACGGAGCCTGAACTGCTCAGGA 2262
Query 2813 GAAGAGGCTTCTGAAAGTTTGATGAACCTCAGCCCTTTCGATATGAAAAATCTCCTGCACCATATTCTAAGTGG 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2263 GAAGAGGCTTCTGAAAGTTTGATGAACCTCAGCCCTTTCGATATGAAAAATCTCCTGCACCATATTCTAAGTGG 2336
Query 2887 GAAAGAGTTTGGCGTTGAAAGAAGTGTGCGCCCTATCCACTC--TCACAATCAGCCCTA-CATCT-CAT-CACG 2955
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| .||||..|||||||| ||||| ||| ||||
Sbjct 2337 GAAAGAGTTTGGCGTTGAAAGAAGTGTGCGCCCTATCCACTCCTCCACATCCAGCCCTACCATCTCCATCCACG 2410
Query 2956 AGGT--GTCATA-CGGAGTCA-CAAAACTGAGAGGAGTGGCATT-ACAGACTGA-GAGTGAAATGAAACAGATG 3023
|||| |.|||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2411 AGGTGGGCCATACCGGAGTCACCAAAACTGAGAGGAGTGGCATTAACAGACTGAGGAGTGAAATGAAACAGATG 2484
Query 3024 ACTAGGCGGTTTAGTGCTGATGAACAGTTCTTTTCTGTGGGCCAGGCCGCGTCCAGCAGTGCGCATTCCTCCAA 3097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2485 ACTAGGCGGTTTAGTGCTGATGAACAGTTCTTTTCTGTGGGCCAGGCCGCGTCCAGCAGTGCGCATTCCTCCAA 2558
Query 3098 GTCTGCG------------------------AGGTCCAGCACCCCATCCTCGCCCACTGGCACGTCATCCTCAG 3147
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2559 GTCTGCGGTAACAGTGCCTCGGGATTATTGTAGGTCCAGCACCCCATCCTCGCCCACTGGCACGTCATCCTCAG 2632
Query 3148 ACTCGGGAGGACATCACATCGGCTGGGGTGAGCGGCAGGGCCAGTGGCTGCGCAGGAGAAGGCTGGATGGGGCC 3221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2633 ACTCGGGAGGACATCACATCGGCTGGGGTGAGCGGCAGGGCCAGTGGCTGCGCAGGAGAAGGCTGGATGGGGCC 2706
Query 3222 ATCAACAGGGTCCCCGTGGGATTCTACCAGAGGGTGTGGAAGATCCTCCAGAAGTGCCACGGTCTCTCCATCGA 3295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2707 ATCAACAGGGTCCCCGTGGGATTCTACCAGAGGGTGTGGAAGATCCTCCAGAAGTGCCACGGTCTCTCCATCGA 2780
Query 3296 TGGTTATGTCCTCCCATCCTCGACGACCCGAGAGATGACCCCGCATGAGATCAAGTTTGCTGTCCATGTCGAAT 3369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2781 TGGTTATGTCCTCCCATCCTCGACGACCCGAGAGATGACCCCGCATGAGATCAAGTTTGCTGTCCATGTCGAAT 2854
Query 3370 CGGTGCTGAACCGCGTGCCGCAGCCCGAGTACCGGCAGCTGCTGGTGGAAGCCATCATGGTGCTGACGCTGCTC 3443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2855 CGGTGCTGAACCGCGTGCCGCAGCCCGAGTACCGGCAGCTGCTGGTGGAAGCCATCATGGTGCTGACGCTGCTC 2928
Query 3444 TCGGACACGGAGATGACCAGCATCGGGGGCATCATCCACGTGGACCAGATCGTGCAGATGGCCAGTCAGCTGTT 3517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2929 TCGGACACGGAGATGACCAGCATCGGGGGCATCATCCACGTGGACCAGATCGTGCAGATGGCCAGTCAGCTGTT 3002
Query 3518 CTTGCAGGACCAGGTGTCAATTGGTGCCATGGACACCCTGGAGAAAGACCAAGCCACAGGAATCTGCCACTTCT 3591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3003 CTTGCAGGACCAGGTGTCAATTGGTGCCATGGACACCCTGGAGAAAGACCAAGCCACAGGAATCTGCCACTTCT 3076
Query 3592 TTTATGACAGCGCTCCGAGTGGGGCTTATGGGACGATGACCTACCTAACAAGAGCAGTGGCTTCTTATTTGCAG 3665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3077 TTTATGACAGCGCTCCGAGTGGGGCTTATGGGACGATGACCTACCTAACAAGAGCAGTGGCTTCTTATTTGCAG 3150
Query 3666 GAATTGTTGCCCAATTCGGGCTGCCAGATGCAA 3698
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3151 GAATTGTTGCCCAATTCGGGCTGCCAGATGCAA 3183