Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474480
- Subject:
- XR_002958777.1
- Aligned Length:
- 3998
- Identities:
- 3339
- Gaps:
- 653
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GACTTTGGGGCTAGCGTTTAGAAAAGTCTCGACCTCCTCCGGCCCGGTCCCATCCCAAGAACCGACTAAGGCTG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TGAGTGTCCGGGAACCAGACCCGCTTGGAGGCCACAGCCCCGACGTCCCGCGCCCACGCGGCAGATCGGGCGCT 148
Query 1 ----------------------ATGCGGAGCAGGAGCAATTCCGGGGTCCGCTTGGACGGGTACGCGCGGCTGG 52
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCGGCCTGGGAGCCTCGGGGAGATGCGGAGCAGGAGCAATTCCGGGGTCCGCTTGGACGGGTACGCGCGGCTGG 222
Query 53 TGCAGCAAACCATCCTGTGTTACCAGAATCCCGTCACGGGGCTGCTGTCAGCCAGCCATGAGCAGAAGGATGCC 126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TGCAGCAAACCATCCTGTGTTACCAGAATCCCGTCACGGGGCTGCTGTCAGCCAGCCATGAGCAGAAGGATGCC 296
Query 127 TGGGTGCGGGATAACATCTACAGTATCCTGGCCGTGTGGGGCCTGGGCATGGCCTACCGTAAGAATGCAGACCG 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGGGTGCGGGATAACATCTACAGTATCCTGGCCGTGTGGGGCCTGGGCATGGCCTACCGTAAGAATGCAGACCG 370
Query 201 CGATGAGGACAAGGCCAAGGCCTACGAGCTGGAGCAGAACGTGGTGAAGCTGATGCGAGGTCTTCTCCAGTGCA 274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CGATGAGGACAAGGCCAAGGCCTACGAGCTGGAGCAGAACGTGGTGAAGCTGATGCGAGGTCTTCTCCAGTGCA 444
Query 275 TGATGAGACAGGTGGCCAAAGTGGAGAAGTTCAAACACACTCAGAGCACCAAGGACAGCCTGCACGCCAAGTAC 348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGATGAGACAGGTGGCCAAAGTGGAGAAGTTCAAACACACTCAGAGCACCAAGGACAGCCTGCACGCCAAGTAC 518
Query 349 AACACCGCCACCTGTGGCACGGTGGTGGGCGACGACCAGTGGGGCCACCTCCAGGTGGATGCCACCTCTCTCTT 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AACACCGCCACCTGTGGCACGGTGGTGGGCGACGACCAGTGGGGCCACCTCCAGGTGGATGCCACCTCTCTCTT 592
Query 423 CCTCCTGTTCCTGGCCCAGATGACCGCCTCAGGCTTACGTATCATTTTCACTCTCGATGAGGTGGCCTTCATAC 496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCTCCTGTTCCTGGCCCAGATGACCGCCTCAGGCTTACGTATCATTTTCACTCTCGATGAGGTGGCCTTCATAC 666
Query 497 AGAATCTTGTCTTTTACATAGAAGCTGCATATAAAGTCGCTGATTATGGAATGTGGGAGCGTGGAGATAAGACT 570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGAATCTTGTCTTTTACATAGAAGCTGCATATAAAGTCGCTGATTATGGAATGTGGGAGCGTGGAGATAAGACT 740
Query 571 AATCAGGGCATCCCGGAATTGAATGCAAGCTCCGTAGGAATGGCCAAGGCAGCTCTTGAGGCAATTGATGAACT 644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AATCAGGGCATCCCGGAATTGAATGCAAGCTCCGTAGGAATGGCCAAGGCAGCTCTTGAGGCAATTGATGAACT 814
Query 645 GGACCTTTTTGGAGCCCATGGAGGACGCAAGTCAGTGATTCATGTTCTGCCAGATGAGGTCGAGCACTGCCAGT 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGACCTTTTTGGAGCCCATGGAGGACGCAAGTCAGTGATTCATGTTCTGCCAGATGAGGTCGAGCACTGCCAGT 888
Query 719 CTTATTCTTGTTCTCCATGCTGCCCAAGAAGCGTCGACATCTAAAGAAATTGATGCTGGACTTCTTTCCATTAT 792
| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 C-TATTC-TGTTCTCCATGCTG-CCAAG-AGCGTCGACATCTAAAGAAATTGATGCTGGACTTCTTTCCATTAT 958
Query 793 TTCCTTCCCGGCCTTTGCAGTGGAAGATGTAAACCTTGTAAATGTGACCAAAAATGAAATTATTTCTAAGCTCC 866
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 TTCCTTCCCGGCCTTTGCAGTGGAAGATGTAAACCTTGTAAATGTGACCAAAAATGAAATTATTTCTAAGCTCC 1032
Query 867 AGGGGCGTTATGGATGCTGTCGCTTCCTTCGAGATGGTTATAAAACTCCAAGAGAGGACCCTAATCGACTGCAT 940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033 AGGGGCGTTATGGATGCTGTCGCTTCCTTCGAGATGGTTATAAAACTCCAAGAGAGGACCCTAATCGACTGCAT 1106
Query 941 TATGACCCTGCTGAACTCAAGCTCTTCGAAAACATTGAATGTGAGTGGCCTGTGTTTTGGACATATTTTATAAT 1014
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107 TATGACCCTGCTGAACTCAAGCTCTTCGAAAACATTGAATGTGAGTGGCCTGTGTTTTGGACATATTTTATAAT 1180
Query 1015 AGATGGAGTCTTCAGTGGTGATGCTGTTCAGGTCCAAGAATACCGAGAGGCCCTGGAGGGAATACTCATCAGAG 1088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181 AGATGGAGTCTTCAGTGGTGATGCTGTTCAGGTCCAAGAATACCGAGAGGCCCTGGAGGGAATACTCATCAGAG 1254
Query 1089 GCAAGAATGGGATCCGCCTGGTGCCTGAACTCTACGCTGTCCCGCCTAACAAGGTAGATGAAGAGTACAAGAAT 1162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 GCAAGAATGGGATCCGCCTGGTGCCTGAACTCTACGCTGTCCCGCCTAACAAGGTAGATGAAGAGTACAAGAAT 1328
Query 1163 CCTCACACAGTAGACCGAGTTCCTATGGGGAAGGTGCCTCATCTGTGGGGCCAATCCTTGTACATCCTCAGCTC 1236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329 CCTCACACAGTAGACCGAGTTCCTATGGGGAAGGTGCCTCATCTGTGGGGCCAATCCTTGTACATCCTCAGCTC 1402
Query 1237 GCTGTTGGCAGAGGGATTCCTTGCCGCTGGTGAAATCGATCCCTTAAATAGAAGATTTTCCACTTCAGTCAAAC 1310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403 GCTGTTGGCAGAGGGATTCCTTGCCGCTGGTGAAATCGATCCCTTAAATAGAAGATTTTCCACTTCAGTCAAAC 1476
Query 1311 CTGATGTTGTAGTACAAGTTACTGTTTTGGCAGAAAACAATCACATTAAGGACTTATTGAGGAAACACGGGGTG 1384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 CTGATGTTGTAGTACAAGTTACTGTTTTGGCAGAAAACAATCACATTAAGGACTTATTGAGGAAACACGGGGTG 1550
Query 1385 AACGTCCAGAGTATCGCGGACATTCATCCAATTCAAGTCCAGCCGGGCCGGATTCTTAGTCACATATATGCCAA 1458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 AACGTCCAGAGTATCGCGGACATTCATCCAATTCAAGTCCAGCCGGGCCGGATTCTTAGTCACATATATGCCAA 1624
Query 1459 GCTTGGACGGAATAAGAATATGAATTTGAGTGGGCGACCGTATCGACATATTGGTGTCCTTGGAACCTCTAAAC 1532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625 GCTTGGACGGAATAAGAATATGAATTTGAGTGGGCGACCGTATCGACATATTGGTGTCCTTGGAACCTCTAAAC 1698
Query 1533 TATATGTGATTAGGAACCAAATCTTTACTTTTACACCCCAGTTCACCGACGAGCATCACTTCTACCTGGCCCTC 1606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699 TATATGTGATTAGGAACCAAATCTTTACTTTTACACCCCAGTTCACCGACCAGCATCACTTCTACCTGGCCCTC 1772
Query 1607 GACAATGAGATGATCGTGGAGATGCTAAGGATCGAGCTGGCCTACCTGTGCACCTGCTGGAGGATGACGGGCAG 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773 GACAATGAGATGATCGTGGAGATGCTAAGGATCGAGCTGGCCTACCTGTGCACCTGCTGGAGGATGACGGGCAG 1846
Query 1681 ACCCACACTCACCTTCCCCATCAGTCGCACCATGCTCACAAATGATGGCTCAGACATTCATTCTGCTGTGCTCT 1754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847 ACCCACACTCACCTTCCCCATCAGTCGCACCATGCTCACAAATGATGGCTCAGACATTCATTCTGCTGTGCTCT 1920
Query 1755 CCACAATTAGAAAACTAGAGGATGGATATTTTGGAGGAGCCAGAGTAAAATTAGGGAACCTTTCGGAATTTCTC 1828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 CCACAATTAGAAAACTAGAGGATGGATATTTTGGAGGAGCCAGAGTAAAATTAGGGAACCTTTCGGAATTTCTC 1994
Query 1829 ACCACATCGTTCTACACATATCTGACTTTTCTGGATCCAGACTGTGATGAGAAGTTGTTTGACAATGCCAGCGA 1902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 ACCACATCGTTCTACACATATCTGACTTTTCTGGATCCAGACTGTGATGAGAAGTTGTTTGACAATGCCAGCGA 2068
Query 1903 AGGGACTTTCAGTCCTGATAGTGATTCAGATTTGGTAGGATATCTGGAAGACACCTGTAATCAAGAAAGCCAAG 1976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069 AGGGACTTTCAGTCCTGATAGTGATTCAGATTTGGTAGGATATCTGGAAGACACCTGTAATCAAGAAAGCCAAG 2142
Query 1977 ACGAACTTGACCATTATATCAACCACCTTCTGCAAAGCACATCGTTGAGGTCCTATCTGCCTCCTCTTTGTAAG 2050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2143 ACGAACTTGACCATTATATCAACCACCTTCTGCAAAGCACATCGTTGAGGTCCTATCTGCCTCCTCTTTGTAAG 2216
Query 2051 AACACAGAAGACCGCCATGTCTTCAGTGCTATCCACTCCACGCGGGACATACTTTCTGTGATGGCAAAAGCAAA 2124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2217 AACACAGAAGACCGCCATGTCTTCAGTGCTATCCACTCCACGCGGGACATACTTTCTGTGATGGCAAAAGCAAA 2290
Query 2125 GGGTTTGGAAGTTCCATTTGTTCCCATGACTTTGCCGACTAAAGTTCTAAGTGCCCACCGTAAATCACTGAATC 2198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2291 GGGTTTGGAAGTTCCATTTGTTCCCATGACTTTGCCGACTAAAGTTCTAAGTGCCCACCGTAAATCACTGAATC 2364
Query 2199 TTGTTGATTCTCCTCAGCCACTCCTAGAAAAGGTTCCTGAAAGTGACTTTCAGTGGCCCAGAGATGACCATAGT 2272
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2365 TTGTTGATTCTCCTCAGCCACTCCTAGAAAAGGTTCCTGAAAGTGACTTTCAGTGGCCCAGAGATGACCATGGT 2438
Query 2273 GACGTGGACTGTGAGAAGCTGGTTGAGCAGCTAAAAGATTGTTCGAACCTACAGGACCAAGCAGACATTCTGTA 2346
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2439 GACGTGGACTGTGAGAAGCTGGTTGAGCAGCTAAAAGATTGTTCGAACCTACAGGACCAAGCAGACATTCTGTA 2512
Query 2347 CATTCTTTATGTCATAAAGGGTCCCAGCTGGGACACAAATCTCTCTGGACAGCACGGGGTCACCGTTCAAAACC 2420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2513 CATTCTTTATGTCATAAAGGGTCCCAGCTGGGACACAAATCTCTCTGGACAGCACGGGGTCACCGTTCAAAACC 2586
Query 2421 TTCTTGGTGAGCTCTATGGGAAAGCCGGCTTGAACCAGGAGTGGGGTCTGATTCGCTACATCTCAGGCCTTCTC 2494
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2587 TTCTTGGTGAGCTCTATGGGAAAGCCGGCTTGAACCAGGAGTGGGGTCTGATTCGCTACATCTCAGGCCTTCTC 2660
Query 2495 AGGAAGAAAGTGGAGGTCCTGGCTGAGGCCTGCACAGACCTGCTTTCGCACCAGAAGCAGCTCACCGTGGGCCT 2568
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2661 AGGAAGAAAGTGGAGGTCCTGGCTGAGGCCTGCACAGACCTGCTTTCGCACCAGAAGCAGCTCACCGTGGGCCT 2734
Query 2569 GCCGCCCGAGCCCCGGGAGAAGATCATCTCTGCGCCCCTTCCCCCAGAGGAGCTCACAAAACTCATCTACGAGG 2642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2735 GCCGCCCGAGCCCCGGGAGAAGATCATCTCTGCGCCCCTTCCCCCAGAGGAGCTCACAAAACTCATCTACGAGG 2808
Query 2643 CCAGTGGGCAGGACATCAGCATTGCCGTCCTCACGCAGGAGATTGTGGTTTACCTGGCCATGTATGTCAGGGCG 2716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2809 CCAGTGGGCAGGACATCAGCATTGCCGTCCTCACGCAGGAGATTGTGGTTTACCTGGCCATGTATGTCAGGGCG 2882
Query 2717 CAGCCCAGCCTCTTTGTGGAGATGCTGAGACTCCGGATTGGACTGATCATTCAGGTGATGGCCACGGAGCTGGC 2790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2883 CAGCCCAGCCTCTTTGTGGAGATGCTGAGACTCCGGATTGGACTGATCATTCAGGTGATGGCCACGGAGCTGGC 2956
Query 2791 ACGGAGCCTGAACTGCTCAGGAGAAGAGGCTTCTGAAAGTTTGATGAACCTCAGCCCTTTCGATATGAAAAATC 2864
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2957 ACGGAGCCTGAACTGCTCAGGAGAAGAGGCTTCTGAAAGTTTGATGAACCTCAGCCCTTTCGATATGAAAAATC 3030
Query 2865 TCCTGCACCATATTCTAAGTGGGAAAGAGTTTGGCGTTGAAAGAAGT--------------------------- 2911
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3031 TCCTGCACCATATTCTAAGTGGGAAAGAGTTTGGCGTTGAAAGAAGTGATACGAGGTCTCACCATGCTGCCCAG 3104
Query 2912 -------------------------------------------------------------------------- 2911
Sbjct 3105 GCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAGTCTTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAG 3178
Query 2912 ------------------GTGCGCCCTATCCACTC--TCACAATCAGCCCTA-CATCT-CAT-CACGAGGT--G 2960
||||||||||||||||| .||||..|||||||| ||||| ||| |||||||| |
Sbjct 3179 CCACCGTGCCTGGCCTCGGTGCGCCCTATCCACTCCTCCACATCCAGCCCTACCATCTCCATCCACGAGGTGGG 3252
Query 2961 TCATA-CGGAGTCA-CAAAACTGAGAGGAGTGGCATT-ACAGACTGA-GAGTGAAATGAAACAGATGACTAGGC 3030
.|||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3253 CCATACCGGAGTCACCAAAACTGAGAGGAGTGGCATTAACAGACTGAGGAGTGAAATGAAACA----------- 3315
Query 3031 GGTTTAGTGCTGATGAACAGTTCTTTTCTGTGGGCCAGGCCGCGTCCAGCAGTGCGCATTCCTCCAAGTCTGCG 3104
|
Sbjct 3316 -------------------------------------------------------------------------G 3316
Query 3105 AGGTCCAGCACCCCATCCTCGCCCACTGGCACGTCATCCTCAGACTCGGGAGGACATCACATCGGCTGGGGTGA 3178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3317 AGGTCCAGCACCCCATCCTCGCCCACTGGCACGTCATCCTCAGACTCGGGAGGACATCACATCGGCTGGGGTGA 3390
Query 3179 GCGGCAGGGCCAGTGGCTGCGCAGGAGAAGGCTGGATGGGGCCATCAACAGGGTCCCCGTGGGATTCTACCAGA 3252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3391 GCGGCAGGGCCAGTGGCTGCGCAGGAGAAGGCTGGATGGGGCCATCAACAGGGTCCCCGTGGGATTCTACCAGA 3464
Query 3253 GGGTGTGGAAGATCCTCCAGAAGTGCCACGGTCTCTCCATCGATGGTTATGTCCTCCCATCCTCGACGACCCGA 3326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3465 GGGTGTGGAAGATCCTCCAGAAGTGCCACGGTCTCTCCATCGATGGTTATGTCCTCCCATCCTCGACGACCCGA 3538
Query 3327 GAGATGACCCCGCATGAGATCAAGTTTGCTGTCCATGTCGAATCGGTGCTGAACCGCGTGCCGCAGCCCGAGTA 3400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3539 GAGATGACCCCGCATGAGATCAAGTTTGCTGTCCATGTCGAATCGGTGCTGAACCGCGTGCCGCAGCCCGAGTA 3612
Query 3401 CCGGCAGCTGCTGGTGGAAGCCATCATGGTGCTGACGCTGCTCTCGGACACGGAGATGACCAGCATCGGGGGCA 3474
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3613 CCGGCAGCTGCTGGTGGAAGCCATCATGGTGCT----------------------------------------- 3645
Query 3475 TCATCCACGTGGACCAGATCGTGCAGATGGCCAGTCAGCTGTTCTTGCAGGACCAGGTGTCAATTGGTGCCATG 3548
Sbjct 3646 -------------------------------------------------------------------------- 3645
Query 3549 GACACCCTGGAGAAAGACCAAGCCACAGGAATCTGCCACTTCTTTTATGACAGCGCTCCGAGTGGGGCTTATGG 3622
Sbjct 3646 -------------------------------------------------------------------------- 3645
Query 3623 GACGATGACCTACCTAACAAGAGCAGTGGCTTCTTATTTGCAGGAATTGTTGCCCAATTCGGGCTGCCAGATGC 3696
Sbjct 3646 -------------------------------------------------------------------------- 3645
Query 3697 AA 3698
Sbjct 3646 -- 3645