Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474489
• Subject: NM_001305437.1
• Aligned Length: 1086
• Identities: 890
• Gaps: 42

Alignment

Query    1  ------------------------------------ATGTCTTCCTTAAGTGGAAAAGTCCAAACCGTTTTGGG  38
                                                |||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.||||
Sbjct    1  ATGAGTTCAAAGAAAATCCCTGAGACACTATCAGGAATGTCTTCCTTAAGTGGGAAAGTACAAACAGTTCTGGG  74

Query   39  CCTTGTAGAGCCAAGCAAACTGGGCCGTACCCTGACCCATGAACACCTGGCCATGACCTTTGACTGCTGTTACT  112
            |||||||||.||.|||.|||||||.||.|||||||||||.||.||.|||.|.||||||||||||.|.|.|||||
Sbjct   75  CCTTGTAGAACCCAGCCAACTGGGACGCACCCTGACCCACGAGCATCTGACAATGACCTTTGACAGTTTTTACT  148

Query  113  GTCCACCTCCCCCGTGCCAGGAAGCTATTTCCAAAGAACCTATCGTGATGAAAAATTTATATTGGATTCAGAAA  186
            |.||||||||.||.|||||.||||..|..|||||.|||||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct  149  GCCCACCTCCTCCATGCCACGAAGTCACCTCCAAGGAACCTATCATGATGAAAAATCTATTTTGGATTCAGAAA  222

Query  187  AACGCCTATTCCCATAAAGAAAACCTTCAATTAAATCAGGAGACAGAAGCCATAAAGGAAGAACTGTTGTATTT  260
            |||.|||||||||||..|||.||||||||.||.|||||||||..||.||||||||..|||||.|||||||||||
Sbjct  223  AACCCCTATTCCCATCGAGAGAACCTTCAGTTGAATCAGGAGGTAGGAGCCATAAGAGAAGAGCTGTTGTATTT  296

Query  261  TAAAGCTAATGGTGGAGGGGCTTTGGTGGAAAACACAACCACTGGGATTAGCCGAGACACACAGACGTTGAAGA  334
            .||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.||.||.||||||.|.|||.|.|||...||.|||.|||||.
Sbjct  297  CAAGGCTAAGGGCGGAGGAGCCTTGGTGGAGAATACGACAACTGGGCTCAGCAGGGACGTGCATACGCTGAAGT  370

Query  335  GGCTTGCAGAAGAGACTGGCGTCCATATCATATCTGGAGCCGGGTTTTATGTGGATGCAACTCACTCCTCAGAG  408
            ||||.|||||..|||||||.|||||.||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||..|||..
Sbjct  371  GGCTGGCAGAGCAGACTGGAGTCCACATCATAGCTGGAGCTGGGTTTTATGTTGATGCAACTCACTCTGCAGCA  444

Query  409  ACCAGGGCCATGTCAGTGGAGCAGCTTACCGATGTCCTTATGAATGAAATTCTCCATGGAGCTGATGGAACCAG  482
            |||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  ACCAGAGCCATGTCAGTGGAGCAGCTTACAGATGTCCTTATTAATGAAATTCTCCATGGAGCTGATGGCACCAG  518

Query  483  TATCAAGTGTGGCATTATTGGAGAAATTGGTTGCTCCTGGCCTTTGACTGAGAGTGAAAGAAAGGTTCTCCAGG  556
            .|||||||||||..||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.||..|||
Sbjct  519  CATCAAGTGTGGAGTTATTGGAGAAATTGGCTGCTCCTGGCCTTTGACTGACAGCGAGAGAAAGATACTTGAGG  592

Query  557  CCACAGCTCATGCCCAGGCTCAGCTTGGTTGTCCTGTTATTATCCATCCTGGACGGAGCTCCAGG-GCACCATT  629
            |.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||.| ||||| ||||||||
Sbjct  593  CTACAGCTCACGCCCAGGCTCAGCTTGGCTGTCCTGTCATCATCCATCCTGGACGGAAC-CCAGGTGCACCATT  665

Query  630  CCAGATTATCCGAATATTGCAAGAAGCAGGCGCAGACATCTCCAAAACAGTCATGTCACACCTGGATAGGACTA  703
            ||||||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct  666  CCAGATAATCCGTATACTGCAAGAAGCAGGAGCAGACATCTCCAAAACAGTCATGTCCCACCTTGACAGGACTA  739

Query  704  TTCTTGATAAGAAAGAGCTCTTGGAGTTTGCTCAGCTTGGCTGCTACTTGGAATATGATCTCTTTGGTACTGAA  777
            |..||||||||||||||||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  740  TATTTGATAAGAAAGAGCTGCTGGAGTTTGCTCAACTTGGCTGCTACTTGGAATACGATCTCTTTGGTACGGAA  813

Query  778  CTACTTCATTACCAACTCGGCCCAGATATTGACATGCCTGATGATAACAAAAGAATTAGAAGGGTGCGTCTCCT  851
            ||.|||.|||||||..|..|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|.|.||
Sbjct  814  CTCCTTAATTACCAGTTGAGCCCAGATATTGATATGCCTGATGATAACAAAAGAATTAGAAGGGTCCATTTTCT  887

Query  852  GGTGGAAGAGGGCTGTGAAGATCGAATTCTGGTAGCACATGACATACATACGAAAACC--CGGCTGATGAAATA  923
            .|||||.|||||||.|||||||||.|||||..|.||||||||||||||.||  |||.|  |||.|||||||.||
Sbjct  888  AGTGGATGAGGGCTATGAAGATCGGATTCTCATGGCACATGACATACACAC--AAAGCATCGGTTGATGAAGTA  959

Query  924  TGGAGGTCACGGCTATTCTCATATACTCACCAATGTTGTTCCTAAAATGTTGCTGAGAGGCATAACTGAGAATG  997
            .||||||||||||||.||.||.||.||.|||||..||||||||||.|||.|.||.|||||..|.|||||||..|
Sbjct  960  CGGAGGTCACGGCTACTCACACATCCTTACCAACATTGTTCCTAAGATGCTCCTTAGAGGTCTGACTGAGAGGG  1033

Query  998  TGCTTGATAAGATTCTAATAGAGAACCCTAAGCAATGGCTAACTTTCAAA  1047
            |||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1034  TGCTTGACAAGATACTCATAGAAAACCCTAAACAATGGCTGACTTTTAAA  1083