Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474559
- Subject:
- XM_005271904.4
- Aligned Length:
- 1608
- Identities:
- 1131
- Gaps:
- 477
Alignment
Query 1 ATGCTACTGCTGTGGGTGTCGGTGGTCGCAGCCTTGGCGCTGGCGGTACTGGCCCCCGGAGCAGGGGAGCAGAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GCGGAGAGCAGCCAAAGCGCCCAATGTGGTGCTGGTCGTGAGCGACTCCTTCGATGGAAGGTTAACATTTCATC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CAGGAAGTCAGGTAGTGAAACTTCCTTTTATCAACTTTATGAAGACACGTGGGACTTCCTTTCTGAATGCCTAC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ACAAACTCTCCAATTTGTTGCCCATCACGCGCAGCAATGTGGAGTGGCCTCTTCACTCACTTAACAGAATCTTG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GAATAATTTTAAGGGTCTAGATCCAAATTATACAACATGGATGGATGTCATGGAGAGGCATGGCTACCGAACAC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AGAAATTTGGGAAACTGGACTATACTTCAGGACATCACTCCATTAGTAATCGTGTGGAAGCGTGGACAAGAGAT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GTTGCTTTCTTACTCAGACAAGAAGGCAGGCCCATGGTTAATCTTATCCGTAACAGGACTAAAGTCAGAGTGAT 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------ATGGTTAATCTTATCCGTAACAGGACTAAAGTCAGAGTGAT 41
Query 519 GGAAAGGGATTGGCAGAATACAGACAAAGCAGTAAACTGGTTAAGAAAGGAAGCAATTAATTACACTGAACCAT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 GGAAAGGGATTGGCAGAATACAGACAAAGCAGTAAACTGGTTAAGAAAGGAAGCAATTAATTACACTGAACCAT 115
Query 593 TTGTTATTTACTTGGGATTAAATTTACCACACCCTTACCCTTCACCATCTTCTGGAGAAAATTTTGGATCTTCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 116 TTGTTATTTACTTGGGATTAAATTTACCACACCCTTACCCTTCACCATCTTCTGGAGAAAATTTTGGATCTTCA 189
Query 667 ACATTTCACACATCTCTTTATTGGCTTGAAAAAGTGTCTCATGATGCCATCAAAATCCCAAAGTGGTCACCTTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 190 ACATTTCACACATCTCTTTATTGGCTTGAAAAAGTGTCTCATGATGCCATCAAAATCCCAAAGTGGTCACCTTT 263
Query 741 GTCAGAAATGCACCCTGTAGATTATTACTCTTCTTATACAAAAAACTGCACTGGAAGATTTACAAAAAAAGAAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 264 GTCAGAAATGCACCCTGTAGATTATTACTCTTCTTATACAAAAAACTGCACTGGAAGATTTACAAAAAAAGAAA 337
Query 815 TTAAGAATATTAGAGCATTTTATTATGCTATGTGTGCTGAGACAGATGCCATGCTTGGTGAAATTATTTTGGCC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 338 TTAAGAATATTAGAGCATTTTATTATGCTATGTGTGCTGAGACAGATGCCATGCTTGGTGAAATTATTTTGGCC 411
Query 889 CTTCATCAATTAGATCTTCTTCAGAAAACTATTGTCATATACTCCTCAGACCATGGAGAGCTGGCCATGGAACA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 412 CTTCATCAATTAGATCTTCTTCAGAAAACTATTGTCATATACTCCTCAGACCATGGAGAGCTGGCCATGGAACA 485
Query 963 TCGACAGTTTTATAAAATGAGCATGTACGAGGCTAGTGCACATGTTCCGCTTTTGATGATGGGACCAGGAATTA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 486 TCGACAGTTTTATAAAATGAGCATGTACGAGGCTAGTGCACATGTTCCGCTTTTGATGATGGGACCAGGAATTA 559
Query 1037 AAGCCGGCCTACAAGTATCAAATGTGGTTTCTCTTGTGGATATTTACCCTACCATGCTTGATATTGCTGGAATT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 560 AAGCCGGCCTACAAGTATCAAATGTGGTTTCTCTTGTGGATATTTACCCTACCATGCTTGATATTGCTGGAATT 633
Query 1111 CCTCTGCCTCAGAACCTGAGTGGATACTCTTTGTTGCCGTTATCATCAGAAACATTTAAGAATGAACATAAAGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 634 CCTCTGCCTCAGAACCTGAGTGGATACTCTTTGTTGCCGTTATCATCAGAAACATTTAAGAATGAACATAAAGT 707
Query 1185 CAAAAACCTGCATCCACCCTGGATTCTGAGTGAATTCCATGGATGTAATGTGAATGCCTCCACCTACATGCTTC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 708 CAAAAACCTGCATCCACCCTGGATTCTGAGTGAATTCCATGGATGTAATGTGAATGCCTCCACCTACATGCTTC 781
Query 1259 GAACTAACCACTGGAAATATATAGCCTATTCGGATGGTGCATCAATATTGCCTCAACTCTTTGATCTTTCCTCG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 782 GAACTAACCACTGGAAATATATAGCCTATTCGGATGGTGCATCAATATTGCCTCAACTCTTTGATCTTTCCTCG 855
Query 1333 GATCCAGATGAATTAACAAATGTTGCTGTAAAATTTCCAGAAATTACTTATTCTTTGGATCAGAAGCTTCATTC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 856 GATCCAGATGAATTAACAAATGTTGCTGTAAAATTTCCAGAAATTACTTATTCTTTGGATCAGAAGCTTCATTC 929
Query 1407 CATTATAAACTACCCTAAAGTTTCTGCTTCTGTCCACCAGTATAATAAAGAGCAGTTTATCAAGTGGAAACAAA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 930 CATTATAAACTACCCTAAAGTTTCTGCTTCTGTCCACCAGTATAATAAAGAGCAGTTTATCAAGTGGAAACAAA 1003
Query 1481 GTATAGGACAGAATTATTCAAACGTTATAGCAAATCTTAGGTGGCACCAAGACTGGCAGAAGGAACCAAGGAAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1004 GTATAGGACAGAATTATTCAAACGTTATAGCAAATCTTAGGTGGCACCAAGACTGGCAGAAGGAACCAAGGAAG 1077
Query 1555 TATGAAAATGCAATTGATCAGTGGCTTAAAACCCATATGAATCCAAGAGCAGTT 1608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078 TATGAAAATGCAATTGATCAGTGGCTTAAAACCCATATGAATCCAAGAGCAGTT 1131