Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474590
- Subject:
- XM_006719751.4
- Aligned Length:
- 3276
- Identities:
- 3255
- Gaps:
- 18
Alignment
Query 1 ATGATGGATTCTCCGAAGATTGGAAATGGTTTGCCAGTGATTGGACCAGGGACTGATATAGGGATATCTTCACT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATGGATTCTCCGAAGATTGGAAATGGTTTGCCAGTGATTGGACCAGGGACTGATATAGGGATATCTTCACT 74
Query 75 CCACATGGTGGGGTATTTGGGAAAAAATTTTGATTCAGCTAAAGTTCCATCAGATGAGTATTGCCCTGCTTGTA 148
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCACATG------------------AATTTTGATTCAGCTAAAGTTCCATCAGATGAGTATTGCCCTGCTTGTA 130
Query 149 GAGAGAAGGGAAAGTTAAAAGCCTTAAAGACTTACCGAATTAGTTTTCAAGAATCTATCTTTTTGTGTGAGGAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 131 GAGAGAAGGGAAAGTTAAAAGCCTTAAAGACTTACCGAATTAGTTTTCAAGAATCTATCTTTTTGTGTGAGGAT 204
Query 223 CTGCAGTGCATCTATCCTTTGGGCTCTAAATCACTTAATAACCTAATTTCTCCTGATTTGGAAGAATGTCACAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 205 CTGCAGTGCATCTATCCTTTGGGCTCTAAATCACTTAATAACCTAATTTCTCCTGATTTGGAAGAATGTCACAC 278
Query 297 TCCACATAAGCCTCAGAAAAGGAAGAGCTTAGAAAGCAGCTATAAGGATTCACTTCTTTTAGCAAATTCCAAAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 279 TCCACATAAGCCTCAGAAAAGGAAGAGCTTAGAAAGCAGCTATAAGGATTCACTTCTTTTAGCAAATTCCAAAA 352
Query 371 AGACTAGAAATTATATTGCTATTGACGGTGGAAAAGTTTTGAACAGCAAACATAATGGAGAAGTATATGACGAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 353 AGACTAGAAATTATATTGCTATTGACGGTGGAAAAGTTTTGAACAGCAAACATAATGGAGAAGTATATGACGAA 426
Query 445 ACCTCGTCAAACTTACCTGATAGTAGTGGTCAACAGAATCCAATTAGGACAGCTGATTCCTTGGAGCGGAATGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 427 ACCTCGTCAAACTTACCTGATAGTAGTGGTCAACAGAATCCAATTAGGACAGCTGATTCCTTGGAGCGGAATGA 500
Query 519 GATTTTGGAAGCTGATACTGTTGACATGGCTACTACAAAAGATCCTGCTACAGTTGATGTCTCTGGAACTGGCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 501 GATTTTGGAAGCTGATACTGTTGACATGGCTACTACAAAAGATCCTGCTACAGTTGATGTCTCTGGAACTGGCA 574
Query 593 GACCTTCCCCTCAAAATGAAGGATGTACATCTAAGCTGGAAATGCCACTGGAGAGCAAATGTACATCATTTCCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 575 GACCTTCCCCTCAAAATGAAGGATGTACATCTAAACTGGAAATGCCACTGGAGAGCAAATGTACATCATTTCCC 648
Query 667 CAGGCTTTATGTGTCCAGTGGAAAAATGCTTATGCTCTCTGTTGGTTAGACTGTATCCTGTCAGCTTTGGTGCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 649 CAGGCTTTATGTGTCCAGTGGAAAAATGCTTATGCTCTCTGTTGGTTAGACTGTATCCTGTCAGCTTTGGTGCA 722
Query 741 CTCGGAAGAGTTAAAGAACACCGTGACTGGACTGTGCTCGAAGGAGGAATCTATATTCTGGCGGTTGCTTACAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 723 CTCGGAAGAGTTAAAGAACACCGTGACTGGACTGTGCTCGAAGGAGGAATCTATATTCTGGCGGTTGCTTACAA 796
Query 815 AATATAATCAAGCAAATACACTTCTATATACCAGTCAATTGAGTGGTGTTAAAGATGGAGATTGTAAAAAACTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 797 AATATAATCAAGCAAATACACTTCTATATACCAGTCAATTGAGTGGTGTTAAAGATGGAGATTGTAAAAAACTT 870
Query 889 ACCTCAGAAATATTTGCAGAGATAGAGACCTGTCTGAATGAAGTTAGAGATGAAATTTTTATTAGCCTTCAGCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 871 ACCTCAGAAATATTTGCAGAGATAGAGACCTGTCTGAATGAAGTTAGAGATGAAATTTTTATTAGCCTTCAGCC 944
Query 963 CCAGCTTAGATGCACATTAGGTGATATGGAAAGCCCTGTGTTTGCATTTCCCCTGCTCTTAAAACTAGAAACCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 945 CCAGCTTAGATGCACATTAGGTGATATGGAAAGCCCTGTGTTTGCATTTCCCCTGCTCTTAAAACTAGAAACCC 1018
Query 1037 ACATTGAAAAGCTCTTCCTATATTCTTTTTCTTGGGACTTTGAATGTTCGCAGTGTGGACACCAATATCAAAAC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 ACATTGAAAAGCTCTTCCTATATTCTTTTTCTTGGGACTTTGAATGTTCGCAGTGTGGACACCAATATCAAAAC 1092
Query 1111 AGGCATATGAAGAGTCTGGTCACCTTTACAAATGTCATCCCTGAGTGGCACCCACTTAATGCTGCCCATTTTGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1093 AGGCATATGAAGAGTCTGGTCACCTTTACAAATGTCATCCCTGAGTGGCACCCACTTAATGCTGCCCATTTTGG 1166
Query 1185 TCCATGTAACAATTGCAACAGTAAATCACAAATAAGAAAAATGGTATTAGAAAAAGTATCTCCCATATTCATGT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1167 TCCATGTAACAATTGCAACAGTAAATCACAAATAAGAAAAATGGTATTAGAAAAAGTATCTCCCATATTCATGT 1240
Query 1259 TGCACTTTGTAGAAGGCTTACCACAGAATGACTTGCAGCACTATGCATTTCATTTTGAAGGCTGTCTTTATCAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1241 TGCACTTTGTAGAAGGCTTACCACAGAATGACTTGCAGCACTATGCATTTCATTTTGAAGGCTGTCTTTATCAG 1314
Query 1333 ATAACTTCTGTAATTCAGTATCGAGCAAATAATCATTTTATAACATGGATTTTAGATGCTGATGGAAGTTGGCT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1315 ATAACTTCTGTAATTCAGTATCGAGCAAATAATCATTTTATAACATGGATTTTAGATGCTGATGGAAGTTGGCT 1388
Query 1407 GGAATGTGATGACTTAAAAGGCCCATGTTCTGAAAGGCACAAGAAATTTGAAGTTCCTGCTTCAGAGATACATA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1389 GGAATGTGATGACTTAAAAGGCCCATGTTCTGAAAGGCACAAGAAATTTGAAGTTCCTGCTTCAGAGATACATA 1462
Query 1481 TTGTTATTTGGGAAAGAAAAATATCCCAAGTGACAGATAAAGAAGCTGCCTGCCTTCCACTTAAAAAGACTAAT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1463 TTGTTATTTGGGAAAGAAAAATATCCCAAGTGACAGATAAAGAAGCTGCCTGCCTTCCACTTAAAAAGACTAAT 1536
Query 1555 GACCAACACGCTCTCAGTAATGAGAAACCAGTATCTTCAACATCGTGTTCTGTGGGTGATGCTGCCTCAGCTGA 1628
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1537 GACCAACACGCTCTCAGTAATGAGAAACCAGTATCTTTAACATCGTGTTCTGTGGGTGATGCTGCCTCAGCTGA 1610
Query 1629 AACAGCCTCAGTAACTCACCCTAAAGATATATCAGTTGCCCCTCGTACTCTTTCACAGGACACAGCTGTAACTC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1611 AACAGCCTCAGTAACTCACCCTAAAGATATATCAGTTGCCCCTCGTACTCTTTCACAGGACACAGCTGTAACTC 1684
Query 1703 ATGGAGATCATTTACTTTCAGGTCCAAAAGGTTTGGTTGACAATATTTTACCTCTGACACTTGAAGAAACTATC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1685 ATGGAGATCATTTACTTTCAGGTCCAAAAGGTTTGGTTGACAATATTTTACCTCTGACACTTGAAGAAACTATC 1758
Query 1777 CAGAAAACAGCCTCAGTTTCACAGTTAAATTCTGAAGCTTTCCTGTTAGAAAATAAACCTGTAGCAGAAAATAC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1759 CAGAAAACAGCCTCAGTTTCACAGTTAAATTCTGAAGCTTTCCTGTTAGAAAATAAACCTGTAGCAGAAAATAC 1832
Query 1851 AGGAATTCTCAAAACCAATACTTTGCTATCACAAGAATCACTAATGGCTTCTTCAGTATCAGCTCCATGTAATG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1833 AGGAATTCTCAAAACCAATACTTTGCTATCACAAGAATCACTAATGGCTTCTTCAGTATCAGCTCCATGTAATG 1906
Query 1925 AAAAGCTTATTCAAGACCAATTTGTGGACATAAGTTTTCCATCCCAAGTTGTAAATACAAACATGCAGTCAGTA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1907 AAAAGCTTATTCAAGACCAATTTGTGGACATAAGTTTTCCATCCCAAGTTGTAAATACAAACATGCAGTCAGTA 1980
Query 1999 CAGCTGAATACAGAAGATACTGTAAATACTAAATCTGTGAATAATACTGATGCTACTGGTCTTATACAGGGAGT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 CAGCTGAATACAGAAGATACTGTAAATACTAAATCTGTGAATAATACTGATGCTACTGGTCTTATACAGGGAGT 2054
Query 2073 GAAGTCAGTAGAAATTGAGAAGGACGCTCAGTTAAAACAATTCCTTACACCAAAAACTGAACAATTAAAACCAG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2055 GAAGTCAGTAGAAATTGAGAAGGACGCTCAGTTAAAACAATTCCTTACACCAAAAACTGAACAATTAAAACCAG 2128
Query 2147 AACGTGTCACATCTCAGGTATCTAATTTGAAGAAAAAAGAAACTACAGCAGATTCTCAAACCACAACATCTAAG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2129 AACGTGTCACATCTCAGGTATCTAATTTGAAGAAAAAAGAAACTACAGCAGATTCTCAAACCACAACATCTAAG 2202
Query 2221 TCATTACAGAATCAGTCTCTGAAAGAAAATCAGAAGAAGCCATTTGTGGGAAGTTGGGTTAAAGGCTTAATAAG 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2203 TCATTACAGAATCAGTCTCTGAAAGAAAATCAGAAGAAGCCATTTGTGGGAAGTTGGGTTAAAGGCTTAATAAG 2276
Query 2295 CAGGGGTGCTTCTTTTATGCCACTCTGTGTTTCAGCTCATAATAGAAACACTATAACTGATTTACAACCTTCAG 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2277 CAGGGGTGCTTCTTTTATGCCACTCTGTGTTTCAGCTCATAATAGAAACACTATAACTGATTTACAACCTTCAG 2350
Query 2369 TTAAAGGGGTAAATAATTTTGGTGGCTTTAAAACTAAAGGTATAAACCAGAAGGCCAGCCACGTATCCAAGAAA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2351 TTAAAGGGGTAAATAATTTTGGTGGCTTTAAAACTAAAGGTATAAACCAGAAGGCCAGCCACGTATCCAAGAAA 2424
Query 2443 GCTCGTAAGAGTGCAAGTAAGCCTCCTCCCATCAGTAAGCCACCAGCAGGCCCTCCATCGTCTAATGGCACAGC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2425 GCTCGTAAGAGTGCAAGTAAGCCTCCTCCCATCAGTAAGCCACCAGCAGGCCCTCCATCGTCTAATGGCACAGC 2498
Query 2517 TGCCCACCCACATGCTCATGCTGCTTCAGAAGTTTTGGAAAAGTCTGGAAGCACCTCATGTGGAGCTCAACTCA 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2499 TGCCCACCCACATGCTCATGCTGCTTCAGAAGTTTTGGAAAAGTCTGGAAGCACCTCATGTGGAGCTCAACTCA 2572
Query 2591 ACCACAGTTCTTATGGGAATGGTATTTCTTCAGCAAACCATGAAGACTTGGTGGAAGGTCAGATTCATAAACTT 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2573 ACCACAGTTCTTATGGGAATGGTATTTCTTCAGCAAACCATGAAGACTTGGTGGAAGGTCAGATTCATAAACTT 2646
Query 2665 CGTCTAAAACTTCGTAAAAAGCTAAAGGCAGAAAAGAAGAAATTAGCTGCTCTTATGTCTTCCCCGCAAAGCAG 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2647 CGTCTAAAACTTCGTAAAAAGCTAAAGGCAGAAAAGAAGAAATTAGCTGCTCTTATGTCTTCCCCGCAAAGCAG 2720
Query 2739 AACAGTTCGAAGTGAAAATCTAGAACAGGTGCCCCAGGATGGGTCTCCAAATGATTGTGAATCAATAGAGGACT 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2721 AACAGTTCGAAGTGAAAATCTAGAACAGGTGCCCCAGGATGGGTCTCCAAATGATTGTGAATCAATAGAGGACT 2794
Query 2813 TGTTAAATGAGCTACCATATCCAATTGATATTGCCAATGAGTCTGCATGCACCACTGTTCCTGGTGTTTCCCTG 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2795 TGTTAAATGAGCTACCATATCCAATTGATATTGCCAGTGAGTCTGCATGCACCACTGTTCCTGGTGTTTCCCTG 2868
Query 2887 TACAGTAGTCAAACTCATGAAGAAATTTTAGCGGAATTATTGTCTCCTACACCTGTTTCAACAGAGCTGTCAGA 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2869 TACAGTAGTCAAACTCATGAAGAAATTTTAGCGGAATTATTGTCTCCTACACCTGTTTCAACAGAGCTGTCAGA 2942
Query 2961 AAATGGGGAAGGTGACTTTAGGTATTTGGGAATGGGAGATAGTCATATCCCACCACCAGTACCAAGTGAATTCA 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2943 AAATGGGGAAGGTGACTTTAGGTATTTGGGAATGGGAGATAGTCATATCCCACCACCAGTACCAAGTGAATTCA 3016
Query 3035 ATGATGTTTCCCAGAACACACATCTGAGACAGGACCATAATTATTGTAGCCCCACCAAGAAAAATCCATGTGAA 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3017 ATGATGTTTCCCAGAACACACATCTGAGACAGGACCATAATTATTGTAGCCCCACCAAGAAAAATCCATGTGAA 3090
Query 3109 GTTCAGCCAGACTCTCTGACAAATAATGCCTGCGTTAGAACATTAAACTTGGAGAGTCCGATGAAGACTGATAT 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3091 GTTCAGCCAGACTCTCTGACAAATAATGCCTGCGTTAGAACATTAAACTTGGAGAGTCCGATGAAGACTGATAT 3164
Query 3183 TTTCGATGAGTTTTTTTCCTCCTCAGCATTAAATGCTTTAGCAAATGACACATTAGACCTACCTCATTTCGATG 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3165 TTTCGATGAGTTTTTTTCCTCCTCAGCATTAAATGCTTTAGCAAATGACACATTAGACCTACCTCATTTCGATG 3238
Query 3257 AATATCTGTTTGAGAATTAT 3276
||||||||||||||||||||
Sbjct 3239 AATATCTGTTTGAGAATTAT 3258