Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474660
- Subject:
- XR_922951.2
- Aligned Length:
- 3125
- Identities:
- 2006
- Gaps:
- 1119
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GCGCTCTCTGCACCCGCTCTGCCGCGCGCGTGCGTGCTGGGTGCGGGTGCGGGTGCGGGGTTGGGCCTGCGCAT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CGGGTGAGACGCTGGCTGCTTGCGGCTAGTGGATGGTAATTGCCTGCCTCGCGCTAGCAGGAAGCTGCTCTGTT 148
Query 1 ----------ATGAAACAATTGCCTGCGGCAACAGTTCGACTCCTTTCAAGTTCTCAGATCATCACTTCGGTGG 64
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAAAGCGAAAATGAAACAATTGCCTGCGGCAACAGTTCGACTCCTTTCAAGTTCTCAGATCATCACTTCGGTGG 222
Query 65 TCAGTGTTGTAAAAGAGCTTATTGAAAACTCCTTGGATGCTGGTGCCACAAGCGTAGATGTTAAACTGGAGAAC 138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCAGTGTTGTAAAAGAGCTTATTGAAAACTCCTTGGATGCTGGTGCCACAAGCGTAGATGTTAAACTGGAGAAC 296
Query 139 TATGGATTTGATAAAATTGAGGTGCGAGATAACGGGGAGGGTATCAAGGCTGTTGATGCACCTGTAATGGCAAT 212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TATGGATTTGATAAAATTGAGGTGCGAGATAACGGGGAGGGTATCAAGGCTGTTGATGCACCTGTAATGGCAAT 370
Query 213 GAAGTACTACACCTCAAAAATAAATAGTCATGAAGATCTTGAAAATTTGACAACTTACGGTTTTCGTGGAGAAG 286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GAAGTACTACACCTCAAAAATAAATAGTCATGAAGATCTTGAAAATTTGACAACTTACGGTTTTCGTGGAGAAG 444
Query 287 CCTTGGGGTCAATTTGTTGTATAGCTGAGGTTTTAATTACAACAAGAACGGCTGCTGATAATTTTAGCACCCAG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCTTGGGGTCAATTTGTTGTATAGCTGAGGTTTTAATTACAACAAGAACGGCTGCTGATAATTTTAGCACCCAG 518
Query 361 TATGTTTTAGATGGCAGTGGCCACATACTTTCTCAGAAACCTTCACATCTTGGTCAAGGTACAACTGTAACTGC 434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TATGTTTTAGATGGCAGTGGCCACATACTTTCTCAGAAACCTTCACATCTTGGTCAAGGTACAACTGTAACTGC 592
Query 435 TTTAAGATTATTTAAGAATCTACCTGTAAGAAAGCAGTTTTACTCAACTGCAAAAAAATGTAAAGATGAAATAA 508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTTAAGATTATTTAAGAATCTACCTGTAAGAAAGCAGTTTTACTCAACTGCAAAAAAATGTAAAGATGAAATAA 666
Query 509 AAAAGATCCAAGATCTCCTCATGAGCTTTGGTATCCTTAAACCTGACTTAAGGATTGTCTTTGTACATAACAAG 582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAAAGATCCAAGATCTCCTCATGAGCTTTGGTATCCTTAAACCTGACTTAAGGATTGTCTTTGTACATAACAAG 740
Query 583 GCAGTTATTTGGCAGAAAAGCAGAGTATCAGATCACAAGATGGCTCTCATGTCAGTTCTGGGGACTGCTGTTAT 656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCAGTTATTTGGCAGAAAAGCAGAGTATCAGATCACAAGATGGCTCTCATGTCAGTTCTGGGGACTGCTGTTAT 814
Query 657 GAACAATATGGAATCCTTTCAGTACCACTCTGAAGAATCTCAGATTTATCTCAGTGGATTTCTTCCAAAGTGTG 730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GAACAATATGGAATCCTTTCAGTACCACTCTGAAGAATCTCAGATTTATCTCAGTGGATTTCTTCCAAAGTGTG 888
Query 731 ATGCAGACCACTCTTTCACTAGTCTTTCAACACCAGAAAGAAGTTTCATCTTCATAAACAGTCGACCAGTACAT 804
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATGCAGACCACTCTTTCACTAGTCTTTCAACACCAGAAAGAAGTTTCATCTTCATAAACAGTCGACCAGTACAT 962
Query 805 CAAAAAGATATCTTAAAGTTAATCCGACATCATTACAATCTGAAATGCCTAAAGGAATCTACTCGTTTGTATCC 878
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAAAAAGATATCTTAAAGTTAATCCGACATCATTACAATCTGAAATGCCTAAAGGAATCTACTCGTTTGTATCC 1036
Query 879 TGTTTTCTTTCTGAAAATCGATGTTCCTACAGCTGATGTTGATGTAAATTTAACACCAGATAAAAGCCAAGTAT 952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGTTTTCTTTCTGAAAATCGATGTTCCTACAGCTGATGTTGATGTAAATTTAACACCAGATAAAAGCCAAGTAT 1110
Query 953 TATTACAAAATAAGGAATCTGTTTTAATTGCTCTTGAAAATCTGATGACGACTTGTTATGGACCATTACCTAGT 1026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TATTACAAAATAAGGAATCTGTTTTAATTGCTCTTGAAAATCTGATGACGACTTGTTATGGACCATTACCTAGT 1184
Query 1027 ACAAATTCTTATGAAAATAATAAAACAGATGTTTCCGCAGCTGACATCGTTCTTAGTAAAACAGCAGAAACAGA 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ACAAATTCTTATGAAAATAATAAAACAGATGTTTCCGCAGCTGACATCGTTCTTAGTAAAACAGCAGAAACAGA 1258
Query 1101 TGTGCTTTTTAATAAAGTGGAATCATCTGGAAAGAATTATTCAAATGTTGATACTTCAGTCATTCCATTCCAAA 1174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGTGCTTTTTAATAAAGTGGAATCATCTGGAAAGAATTATTCAAATGTTGATACTTCAGTCATTCCATTCCAAA 1332
Query 1175 ATGATATGCATAATGATGAATCTGGAAAAAACACTGATGATTGTTTAAATCACCAGATAAGTATTGGTGACTTT 1248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATGATATGCATAATGATGAATCTGGAAAAAACACTGATGATTGTTTAAATCACCAGATAAGTATTGGTGACTTT 1406
Query 1249 GGTTATGGTCATTGTAGTAGTGAAATTTCTAACATTGATAAAAACACTAAGAATGCATTTCAGGACATTTCAAT 1322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGTTATGGTCATTGTAGTAGTGAAATTTCTAACATTGATAAAAACACTAAGAATGCATTTCAGGACATTTCAAT 1480
Query 1323 GAGTAATGTATCATGGGAGAACTCTCAGACGGAATATAGTAAAACTTGTTTTATAAGTTCCGTTAAGCACACCC 1396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GAGTAATGTATCATGGGAGAACTCTCAGACGGAATATAGTAAAACTTGTTTTATAAGTTCCGTTAAGCACACCC 1554
Query 1397 AGTCAGAAAATGGCAATAAAGACCATATAGATGAGAGTGGGGAAAATGAGGAAGAAGCAGGTCTTGAAAACTCT 1470
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGTCAGAAAATGGCAATAAAGACCATATAGATGAGAGTGGGGAAAATGAGGAAGAAGCAGGTCTTGAAAACTCT 1628
Query 1471 TCGGAAATTTCTGCAGATGAGTGGAGCAGGGGAAATATACTTAAAAATTCAGTGGGAGAGAATATTGAACCTGT 1544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TCGGAAATTTCTGCAGATGAGTGGAGCAGGGGAAATATACTTAAAAATTCAGTGGGAGAGAATATTGAACCTGT 1702
Query 1545 GAAAATTTTAGTGCCTGAAAAAAGTTTACCATGTAAAGTAAGTAATAATAATTATCCAATCCCTGAACAAATGA 1618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GAAAATTTTAGTGCCTGAAAAAAGTTTACCATGTAAAGTAAGTAATAATAATTATCCAATCCCTGAACAAATGA 1776
Query 1619 ATCTTAATGAAGATTCATGTAACAAAAAATCAAATGTAATAGATAATAAATCTGGAAAAGTTACAGCTTATGAT 1692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ATCTTAATGAAGATTCATGTAACAAAAAATCAAATGTAATAGATAATAAATCTGGAAAAGTTACAGCTTATGAT 1850
Query 1693 TTACTTAGCAATCGAGTAATCAAGAAACCCATGTCAGCAAGTGCTCTTTTTGTTCAAGATCATCGTCCTCAGTT 1766
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TTACTTAGCAATCGAGTAATCAAGAAACCCATGTCAGCAAGTGCTCTTTTTGTTCAAGATCATCGTCCTCAGTT 1924
Query 1767 TCTCATAGAAAATCCTAAGACTAGTTTAGAGGATGCAACACTACAAATTGAAGAACTGTGGAAGACATTGAGTG 1840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TCTCATAGAAAATCCTAAGACTAGTTTAGAGGATGCAACACTACAAATTGAAGAACTGTGGAAGACATTGAGTG 1998
Query 1841 AAGAGGAAAAACTGA----------------------------------------------------------- 1855
|||||||||||||||
Sbjct 1999 AAGAGGAAAAACTGAAATATGAAGAGAAGGCTACTAAAGACTTGGAACGATACAATAGTCAAATGAAGAGAGCC 2072
Query 1856 -------------------------------------------------------------------------- 1855
Sbjct 2073 ATTGAACAGGAGTCACAAATGTCACTAAAAGATGGCAGAAAAAAGATAAAACCCACCAGCGCATGGAATTTGGC 2146
Query 1856 ---------------------------ATCT------------------------------------------- 1859
||||
Sbjct 2147 CCAGAAGCACAAGTTAAAAACCTCATTATCTAATCAACCAAAACTTGATGAACTCCTTCAGTCCCAAATTGAAA 2220
Query 1860 ----------------------------------------------------------------TTTTA----- 1864
|||||
Sbjct 2221 AAAGAAGGAGTCAAAATATTAAAATGGTACAGATCCCCTTTTCTATGAAAAACTTAAAAATAAATTTTAAGAAA 2294
Query 1865 --------------------------------------------------------------------ATGG-- 1868
||||
Sbjct 2295 CAAAACAAAGTTGACTTAGAAGAGAAGGATGAACCTTGCTTGATCCACAATCTCAGGTTTCCTGATGCATGGCT 2368
Query 1869 --------------------------------ATCTCAT---------------------TATTT--------- 1880
||| ||| |||||
Sbjct 2369 AATGACATCCAAAACAGAGGTAATGTTATTAAATC-CATATAGAGTAGAAGAAGCCCTGCTATTTAAAAGACTT 2441
Query 1881 ---------------------------------------------------------AGACGTTTTATATAAAA 1897
|||||||||||||||||
Sbjct 2442 CTTGAGAATCATAAACTTCCTGCAGAGCCACTGGAAAAGCCAATTATGTTAACAGAGAGACGTTTTATATAAAA 2515
Query 1898 TGACAGCAGATGACCAAAGATACAGTGGATCAACTTACCTGTCTGATCCTCGTCTTACAGCGAATGGTTTCAAG 1971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2516 TGACAGCAGATGACCAAAGATACAGTGGATCAACTTACCTGTCTGATCCTCGTCTTACAGCGAATGGTTTCAAG 2589
Query 1972 ATAAAATTGATACCAGGAGTTTCAATTACTGAAAAT-------------------------------------- 2007
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2590 ATAAAATTGATACCAGGAGTTTCAATTACTGAAAATTACTTGGAAATAGAAGGAATGGCTAATTGTCTCCCATT 2663
Query 2008 -------------------------------------------------------------------------- 2007
Sbjct 2664 CTATGGAGTAGCAGATTTAAAAGAAATTCTTAATGCTATATTAAACAGAAATGCAAAGGAAGTTTATGAATGTA 2737
Query 2008 -------------------------------------------------------------------------- 2007
Sbjct 2738 GACCTCGCAAAGTGATAAGTTATTTAGAGGGAGAAGCAGTGCGTCTATCCAGACAATTACCCATGTACTTATCA 2811
Query 2008 -------------------------------------------------------------------------- 2007
Sbjct 2812 AAAGAGGACATCCAAGACATTATCTACAGAATGAAGCACCAGTTTGGAAATGAAATTAAAGAGTGTGTTCATGG 2885
Query 2008 -------------------------------------------------------------------------- 2007
Sbjct 2886 TCGCCCATTTTTTCATCATTTAACCTATCTTCCAGAAACTACATGATTAAATATGTTTAAGAAGATTAGTTACC 2959
Query 2008 -------------------------------------------------------------------------- 2007
Sbjct 2960 ATTGAAATTGGTTCTGTCATAAAACAGCATGAGTCTGGTTTTAAATTATCTTTGTATTATGTGTCACATGGTTA 3033
Query 2008 -------------------------------------------------------------------------- 2007
Sbjct 3034 TTTTTTAAATGAGGATTCACTGACTTGTTTTTATATTGAAAAAAGTTCCACGTATTGTAGAAAACGTAAATAAA 3107
Query 2008 ----------------- 2007
Sbjct 3108 CTAATATAGACTATTCA 3124