Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000474743
Subject:
NM_001184826.2
Aligned Length:
1281
Identities:
1158
Gaps:
33

Alignment

Query    1  ATGGGGCCCCTCCCAGCCCCTTCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||..|||||.||||||||.||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCCGCCCACCACTGCCGAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTCCTGGCTACTTCTGGTACAAAGGGGAAATGACGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTATATCGTATATAGTTGATGGTAAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296
            ||||||||||||||||.|||.|||.||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGACGAGA  296

Query  297  AACAGTATATTCCAACGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGAAGGATGCAGGAACCTACACCTTACACA  370
            |||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCATAAAGCGAGGTGATGAGACTAGAGAAGAAATTCGACATTTCACCTTCACCTTATACTTGGAGACTCCCAAG  444
            ||||||||.|||.|||||.||||||||.||.||.|.|||.||||||||||||||||.||.||||||||||.|||
Sbjct  371  TCATAAAGGGAGATGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCTAAG  444

Query  445  CCCTACATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC  518
            ||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||.||||||||
Sbjct  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGACCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGACCCTGAGAC  518

Query  519  TCTGGACGCAAGCTACCTATGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTGTGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA  592
            ||..||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||.||||||||.|||
Sbjct  519  TCCAGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGAAGCTGTCCGAAA  592

Query  593  CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
            |||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666

Query  667  GTGAGTGCCAGTCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATCCCCTACATCACCATCAA  740
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  740

Query  741  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814

Query  815  TTTGGTGGCTAAACGGTCAGAGCCTCCCCGTCAGTCCCGGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATT  888
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888

Query  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACAGGACCGATATGGTGGCCTCCGCAG  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  962

Query  963  TAACCCAGTCATCCTAAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036
            |.|||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036

Query 1037  CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTC-ACGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAATTAATGG  1109
            ||||||||..||||.|||||||||| ||| .||||.|||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1037  CAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTG-TTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGA  1109

Query 1110  GAAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTAGAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCT  1183
            .||||||||||.|.|||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1110  AAAGTTTCAGCTACCAGGACAAAAGCTCTTTATCCGCCATATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGTTTGCT  1183

Query 1184  CTGTTCATAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGACAGTCAAAGTCTCTG--GTCCCTGCCATG  1255
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||  | ||||.     
Sbjct 1184  CTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTGAAG-CCCTA-----  1251

Query 1256  GAGACCTGACAGAGTCTCAGTCA  1278
                                   
Sbjct 1252  -----------------------  1251