Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474743
- Subject:
- XM_017027002.2
- Aligned Length:
- 1292
- Identities:
- 914
- Gaps:
- 307
Alignment
Query 1 ATGGGGCCCCTCCCAGCCCCTTCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT 74
||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT 74
Query 75 AAACTTCTGGAACCCGCCCACCACTGCCGAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG 148
||||||||||||.||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AAACTTCTGGAATCCGCCCACAACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG 148
Query 149 ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTCCTGGCTACTTCTGGTACAAAGGGGAAATGACGGAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|.||||||||||||.|||||||..||
Sbjct 149 ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATTTGGTACAAAGGGCAAATGACATAC 222
Query 223 CTCTACCATTACATTATATCGTATATAGTTGATGGTAAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA 296
||||||||||||||||.|||.|||.||||.||.|||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAAGAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA 296
Query 297 AACAGTATATTCCAACGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGAAGGATGCAGGAACCTACACCTTACACA 370
||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 297 AAGAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACGCAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA 370
Query 371 TCATAAAGCGAGGTGATGAGACTAGAGAAGAAATTCGACATTTCACCTTCACCTTATACTTGGAGACTCCCAAG 444
|||||||||||.|.||||.||||.|||.||.||.|.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 371 TCATAAAGCGACGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCCAAG 444
Query 445 CCCTACATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC 518
||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||..|||||.|||||||||||.|||
Sbjct 445 CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGATCTTAACCTGTGATCCTGCGAC 518
Query 519 TCTGGACGCAAGCTACCTATGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTGTGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA 592
||..|.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCCAGCCGCAAGCTACCAGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA 592
Query 593 CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA 666
|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCAACAGGACCCTCTTTATATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA 666
Query 667 GTGAGTGCCAGTCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATCCCCTACATCACCATCAA 740
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCC------------------------------- 709
Query 741 CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA 814
Sbjct 710 -------------------------------------------------------------------------- 709
Query 815 TTTGGTGGCTAAACGGTCAGAGCCTCCCCGTCAGTCCCGGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATT 888
Sbjct 710 -------------------------------------------------------------------------- 709
Query 889 CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACAGGACCGATATGGTGGCCTCCGCAG 962
Sbjct 710 -------------------------------------------------------------------------- 709
Query 963 TAACCCAGTCATCCTAAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT 1036
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 710 --------------------------ATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT 757
Query 1037 CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTCACGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAATTAATGGG 1110
||||||||||||||.||||||||||||||.|.||.||||||||||.||||.|.||||.||||||||||||||||
Sbjct 758 CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCCGAGTCTAACCCACGGGCACAATATTCTTGGACAATTAATGGG 831
Query 1111 AAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTAGAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC 1184
||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.||||.|||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 832 AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATAACTACAAAGCATAGTGGGCTCTATGCTTGCTC 905
Query 1185 TGTTCATAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGACAGTCAAAGTCTCTGG--------TCCCTG 1250
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||| ||||.|
Sbjct 906 TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATCACAGTCAAAGTCTCTGGTAAGTGGATCCCAG 979
Query 1251 CCATGGAGACC-TGACA-----GAGTCTCAGTCA 1278
||| || ||.|| ||.|
Sbjct 980 -CAT-----CCTTGGCAATAGGGATT-------- 999