Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000475004
- Subject:
- XM_011521198.1
- Aligned Length:
- 1256
- Identities:
- 1115
- Gaps:
- 133
Alignment
Query 1 ATGGCTGGTCCCTTCTCCCGTCTGCTGTCCGCCCGCCCGGGACTCAGGCTCCTGGCTTTGGCCGGAGCGGGGTC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TCTAGCCGCTGGGTTTCTGCTCCGACCGGAACCTGTACGAGCTGCCAGTGAACGACGGAGGCT--GTATCC--- 143
|.||...|| |||.||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------ATGGTTACTGGGTACCCCCT 20
Query 144 CCCGAGCGCTGAGTACCCAGACCTCCGAAAGCACAACAACTGCATGGCCAGTCACCTGACCCCAGCAGTCTATG 217
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 21 CCCCAGCGCTGAGTACCCAGACCTCCGAAAGCACAACAACTGCATGGCCAGTCACCTGACCCCAGCAGTCTATG 94
Query 218 CACGGCTCTGCGACAAGACCACACCCACTGGTTGGACGCTAGATCAGTGTATCCAGACTGGCGTGGACAACCCT 291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 95 CACGGCTCTGCGACAAGACCACACCCACTGGTTGGACGCTAGATCAGTGTATCCAGACTGGCGTGGACAACCCT 168
Query 292 GGCCACCCCTTCATCAAGACTGTGGGCATGGTGGCTGGAGATGAGGAGACCTATGAGGTATTTGCTGACCTGTT 365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 169 GGCCACCCCTTCATCAAGACTGTGGGCATGGTGGCTGGAGATGAGGAGACCTATGAGGTATTTGCTGACCTGTT 242
Query 366 TGACCCTGTGATCCAAGAGCGACACAATGGATATGACCCCCGGACAATGAAGCACACCACGGATCTAGATGCCA 439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 243 TGACCCTGTGATCCAAGAGCGACACAATGGATATGACCCCCGGACAATGAAGCACACCACGGATCTAGATGCCA 316
Query 440 GTAAAATCCGTTCTGGCTACTTTGATGAGAGGTATGTATTGTCCTCTAGAGTCAGAACTGGCCGAAGCATCCGA 513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 GTAAAATCCGTTCTGGCTACTTTGATGAGAGGTATGTATTGTCCTCTAGAGTCAGAACTGGCCGAAGCATCCGA 390
Query 514 GGACTCAGTCTGCCTCCAGCTTGCACTCGAGCAGAGCGACGAGAGGTGGAACGTGTTGTGGTGGATGCACTGAG 587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 391 GGACTCAGTCTGCCTCCAGCTTGCACTCGAGCAGAGCGACGAGAGGTGGAACGTGTTGTGGTGGATGCACTGAG 464
Query 588 TGGCCTGAAGGGTGACCTGGCTGGACGTTACTATAGGCTCAGTGAGATGACAGAGGCTGAACAGCAGCAGCTTA 661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 465 TGGCCTGAAGGGTGACCTGGCTGGACGTTACTATAGGCTCAGTGAGATGACAGAGGCTGAACAGCAGCAGCTTA 538
Query 662 TTGATGACCACTTTCTGTTTGATAAGCCTGTGTCCCCGTTGCTGACTGCAGCAGGAATGGCTCGAGACTGGCCA 735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 TTGATGACCACTTTCTGTTTGATAAGCCTGTGTCCCCGTTGCTGACTGCAGCAGGAATGGCTCGAGACTGGCCA 612
Query 736 GATGCTCGTGGAATTTGGCACAACAATGAGAAGAGCTTCCTGATCTGGGTGAATGAGGAGGATCATACACGGGT 809
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 613 GATGCTCGTGGAATTTGGCACAACAATGAGAAGAGCTTCCTGATCTGGGTGAATGAGGAGGATCATACACGGGT 686
Query 810 GATCTCCATGGAGAAGGGTGGTAACATGAAGAGAGTGTTTGAAAGATTCTGCCGAGGCCTCAAAGAGGTGGAGA 883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 687 GATCTCCATGGAGAAGGGTGGTAACATGAAGAGAGTGTTTGAAAGATTCTGCCGAGGCCTCAAAGAGGTGGAGA 760
Query 884 GACTTATCCAAGAACGTGGCTGGGAGTTCATGTGGAATGAGCGTTTGGGATACATCTTGACCTGTCCATCTAAC 957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 761 GACTTATCCAAGAACGTGGCTGGGAGTTCATGTGGAATGAGCGTTTGGGATACATCTTGACCTGTCCATCTAAC 834
Query 958 CTGGGCACTGGACTTCGGGCAGGAGTGCACATCAAACTGCCCCTGCTAAGCAAAGATAGCCGCTTCCCAAAGAT 1031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 CTGGGCACTGGACTTCGGGCAGGAGTGCACATCAAACTGCCCCTGCTAAGCAAAGATAGCCGCTTCCCAAAGAT 908
Query 1032 CCTGGAGAACCTAAGACTCCAAAAGCGTGGTACTGGAGGAGTGGACACTGCTGCCACAGGCGGTGTCTTTGATA 1105
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 909 CCTGGAGAACCTAAGACTCCAAAAACGTGGTACTGGAGGAGTGGACACTGCTGCTACAGGCGGTGTCTTTGATA 982
Query 1106 TTTCTAATTTGGACCGACTAGGCAAATCAGAGGTGGAGCTGGTGCAACTGGTCATCGATGGAGTAAACTATTTG 1179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 983 TTTCTAATTTGGACCGACTAGGCAAATCAGAGGTGGAGCTGGTGCAACTGGTCATCGATGGAGTAAACTATTTG 1056
Query 1180 ATTGATTGTGAACGGCGTCTGGAGAGAGGCCAGGATATCCGCATCCCCACACCTGTCATCCACACCAAGCAT 1251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1057 ATTGATTGTGAACGGCGTCTGGAGAGAGGCCAGGATATCCGCATCCCCACACCTGTCATCCACACCAAGCAT 1128