Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475171
• Subject: NM_001254949.2
• Aligned Length: 3084
• Identities: 1785
• Gaps: 1296

Alignment

Query    1  ATGAATCTTTTCAACCTGGACCGTTTTCGCTTTGAGAAAAGGAATAAGATTGAGGAAGCGCCCGAAGCAACCCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCAACCTTCCCAGCCTGGCCCTTCTTCACCAATTTCTCTTAGTGCTGAAGAGGAGAATGCTGAAGGGGAAGTTA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GCAGGGCAAACACTCCTGATTCAGATATAACTGAAAAAACAGAAGATTCTAGTGTTCCAGAAACTCCAGATAAT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GAAAGAAAAGCAAGTATATCATATTTCAAAAATCAAAGAGGAATACAGTATATTGATTTGTCTTCTGATAGTGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AGATGTCGTTTCCCCAAATTGCTCCAATACAGTTCAAGAGAAAACATTCAACAAAGATACAGTGATTATAGTTT  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CTGAGCCATCTGAAGATGAAGAGTCCCAAGGCCTTCCTACCATGGCACGTAGAAATGATGATATTTCAGAACTG  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  GAAGACCTTTCGGAATTGGAAGACCTTAAAGATGCTAAACTTCAGACTTTGAAGGAACTTTTTCCACAAAGAAG  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  TGACAATGATTTACTTAAGTTGATTGAATCAACAAGCACTATGGATGGAGCAATTGCTGCTGCCTTGCTGATGT  592
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  593  TTGGTGATGCAGGTGGTGGGCCCAGGAAAAGAAAATTATCTTCTTCTTCAGAGCCATATGAGGAAGATGAATTT  666
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  667  AATGATGATCAATCTATAAAAAAGACAAGACTGGATCATGGAGAGGAATCAAATGAGTCTGCAGAATCTAGCAA  740
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  741  TAATTGGGAAAAGCAGGAAAGTATTGTACTGAAATTGCAAAAGGAATTTCCCAATTTTGATAAACAGGAACTTA  814
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  815  GAGAAGTACTCAAGGAACATGAATGGATGTACACAGAAGCTTTAGAATCTCTAAAAGTGTTTGCAGAAGACCAA  888
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  889  GATATGCAATATGCATCACAAAGTGAGGTTCCAAATGGAAAAGAAGTTTCTTCAAGAAGTCAAAATTACCCTAA  962
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  963  AAATGCAACTAAAACAAAACTAAAACAGAAATTTTCAATGAAAGCACAAAATGGCTTTAACAAGAAACGTAAAA  1036
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 1037  AAAATGTTTTTAATCAAAAGAGAGTTGTTGAAGACTCTGAATATGATTCAGGTTCTGATGTCGGTAGTTCACTA  1110
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 1111  GATGAGGACTATAGTAGTGGTGAAGAAGTGATGGAGGATGGCTATAAAGGTAAAATTCTTCACTTCCTTCAAGA  1184
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 1185  TGCTTCAATTGGTGAACTTACTTTGATTCCTCAGTGTTCTCAGAAAAAGGCTCAGAAGATAACAGAACTCCGGC  1258
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 1259  CCTTTAATAGTTGGGAGGCTCTGTTCACAAAGATGTCCAAAACTAATGGCTTATCAGAAGATTTGATATGGCAC  1332
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------ATGTCCAAAACTAATGGCTTATCAGAAGATTTGATATGGCAC  42

Query 1333  TGTAAAACACTGATCCAAGAAAGAGATGTAGTTATAAGGCTTATGAACAAATGTGAAGACATTTCAAATAAATT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   43  TGTAAAACACTGATCCAAGAAAGAGATGTAGTTATAAGGCTTATGAACAAATGTGAAGACATTTCAAATAAATT  116

Query 1407  GACCAAACAAGTTACCATGCTTACTGGAAATGGAGGTGGATGGAACATAGAACAACCTTCCATTCTAAACCAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  117  GACCAAACAAGTTACCATGCTTACTGGAAATGGAGGTGGATGGAACATAGAACAACCTTCCATTCTAAACCAAA  190

Query 1481  GTTTGTCACTCAAGCCCTATCAGAAGGTTGGTTTGAATTGGCTGGCATTGGTACATAAACATGGACTTAATGGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  191  GTTTGTCACTCAAGCCCTATCAGAAGGTTGGTTTGAATTGGCTGGCATTGGTACATAAACATGGACTTAATGGC  264

Query 1555  ATTTTGGCAGATGAAATGGGCCTAGGAAAAACTATTCAAGCCATTGCATTTCTGGCATACCTCTATCAGGAGGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  265  ATTTTGGCAGATGAAATGGGCCTAGGAAAAACTATTCAAGCCATTGCATTTCTGGCATACCTCTATCAGGAGGG  338

Query 1629  TAATAATGGTCCTCATTTGATCGTTGTTCCAGCTTCAACTATAGATAACTGGTTAAGGGAAGTTAATTTATGGT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  339  TAATAATGGTCCTCATTTGATCGTTGTTCCAGCTTCAACTATAGATAACTGGTTAAGGGAAGTTAATTTATGGT  412

Query 1703  GCCCTACTTTGAAGGTCCTCTGTTACTATGGTTCTCAAGAAGAACGTAAACAAATTAGATTTAACATTCATAGT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  413  GCCCTACTTTGAAGGTCCTCTGTTACTATGGTTCTCAAGAAGAACGTAAACAAATTAGATTTAACATTCATAGT  486

Query 1777  AGATATGAAGATTACAATGTAATTGTGACCACATATAACTGTGCGATCAGCAGTTCTGATGATCGTAGTCTGTT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  487  AGATATGAAGATTACAATGTAATTGTGACCACATATAACTGTGCGATCAGCAGTTCTGATGACCGTAGTCTGTT  560

Query 1851  TCGACGGCTGAAACTTAATTACGCAATTTTTGATGAGGGCCATATGCTGAAGAATATGGGCTCCATTCGCTACC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  561  TCGACGGCTGAAACTTAATTACGCAATTTTTGATGAGGGCCATATGCTGAAGAATATGGGCTCCATTCGCTACC  634

Query 1925  AGCACCTTATGACAATTAATGCAAATAACCGTTTGCTGCTCACAGGCACACCTGTACAGAACAATCTGTTAGAA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  635  AGCACCTTATGACAATTAATGCAAATAACCGTTTGCTGCTCACAGGCACACCTGTACAGAACAATCTGTTAGAA  708

Query 1999  CTCATGTCGCTGTTGAATTTTGTTATGCCACACATGTTTAGTAGTAGCACCAGTGAAATACGAAGAATGTTTTC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  709  CTCATGTCGCTGTTGAATTTTGTTATGCCACACATGTTTAGTAGTAGCACCAGTGAAATACGAAGAATGTTTTC  782

Query 2073  CTCTAAGACAAAATCAGCAGATGAGCAAAGCATATATGAAAAGGAGAGAATAGCACATGCAAAACAAATTATAA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  783  CTCTAAGACAAAATCAGCAGATGAGCAAAGCATATATGAAAAGGAGAGAATAGCACATGCAAAACAAATTATAA  856

Query 2147  AGCCATTTATTCTCAGAAGAGTAAAAGAAGAGGTTCTCAAGCAGTTACCCCCCAAGAAAGATCGAATTGAGTTG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  857  AGCCATTTATTCTCAGAAGAGTAAAAGAAGAGGTTCTCAAGCAGTTACCCCCCAAGAAAGATCGAATTGAGTTG  930

Query 2221  TGTGCAATGTCGGAGAAGCAGGAGCAACTCTATTTGGGTCTTTTCAACAGATTGAAAAAATCTATCAATAACTT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  931  TGTGCAATGTCGGAGAAGCAGGAGCAACTCTATTTGGGTCTTTTCAACAGATTGAAAAAATCTATCAATAACTT  1004

Query 2295  GGTCACAGAAAAAAACACAGAAATGTGCAATGTCATGATGCAGTTGAGGAAAATGGCCAATCATCCTTTATTAC  2368
            |      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1005  G------GAAAAAAACACAGAAATGTGCAATGTCATGATGCAGTTGAGGAAAATGGCCAATCATCCTTTATTAC  1072

Query 2369  ATCGCCAATATTACACAGCTGAAAAACTCAAGGAAATGTCTCAGCTTATGCTAAAGGAACCTACACATTGTGAG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073  ATCGCCAATATTACACAGCTGAAAAACTCAAGGAAATGTCTCAGCTTATGCTAAAGGAACCTACACATTGTGAG  1146

Query 2443  GCTAACCCTGACCTGATCTTTGAAGATATGGAAGTTATGACAGACTTCGAACTACATGTACTTTGTAAACAGTA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1147  GCTAACCCTGACCTGATCTTTGAAGATATGGAAGTTATGACAGACTTCGAACTACATGTACTTTGTAAACAGTA  1220

Query 2517  CCGACACATTAATAACTTTCAGTTAGACATGGACTTGATTTTAGATTCTGGAAAATTTCGAGTTTTAGGATGCA  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1221  CCGACACATTAATAACTTTCAGTTAGACATGGACTTGATTTTAGATTCTGGAAAATTTCGAGTTTTAGGATGCA  1294

Query 2591  TCTTGTCTGAATTGAAACAGAAGGGTGATAGAGTTGTGTTATTTAGCCAATTTACCATGATGCTGGATATCTTA  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1295  TCTTGTCTGAATTGAAACAGAAGGGTGATAGAGTTGTGTTATTTAGCCAATTTACCATGATGCTGGATATCTTA  1368

Query 2665  GAGGTTCTATTAAAACATCATCAGCATAGGTACCTCAGATTAGATGGAAAGACTCAGATTTCTGAAAGGATTCA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1369  GAGGTTCTATTAAAACATCATCAGCATAGGTACCTCAGATTAGATGGAAAGACTCAGATTTCTGAAAGGATTCA  1442

Query 2739  TCTAATTGATGAGTTTAATACCGATATGGATATCTTTGTGTTTCTGCTATCAACAAAAGCTGGTGGATTAGGAA  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1443  TCTAATTGATGAGTTTAATACCGATATGGATATCTTTGTGTTTCTGCTATCAACAAAAGCTGGTGGATTAGGAA  1516

Query 2813  TAAATCTGACTTCAGCAAATGTTGTTATACTTCACGATATTGACTGTAATCCTTATAATGACAAACAAGCAGAA  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1517  TAAATCTGACTTCAGCAAATGTTGTTATACTTCACGATATTGACTGTAATCCTTATAATGACAAACAAGCAGAA  1590

Query 2887  GATAGATGCCATAGAGTAGGCCAGACTAAAGAAGCACTAGTTATAAAACTAATAAGCCAAGGGACGATTGAAGA  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1591  GATAGATGCCATAGAGTAGGCCAGACTAAAGAAGTACTAGTTATAAAACTAATAAGCCAAGGGACGATTGAAGA  1664

Query 2961  ATCCATGCTAAAAATTAACCAACAGAAATTGAAACTAGAACAGGATATGACTACAGTAGATGAAGGTGATGAAG  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1665  ATCCATGCTAAAAATTAACCAACAGAAATTGAAACTAGAACAGGATATGACTACAGTAGATGAAGGTGATGAAG  1738

Query 3035  GGAGTATGCCAGCAGATATAGCCACATTACTAAAAACATCAATGGGCCTG  3084
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1739  GGAGTATGCCAGCAGATATAGCCACATTACTAAAAACATCAATGGGCCTG  1788