Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475171
• Subject: NM_020159.5
• Aligned Length: 3084
• Identities: 3072
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGAATCTTTTCAACCTGGACCGTTTTCGCTTTGAGAAAAGGAATAAGATTGAGGAAGCGCCCGAAGCAACCCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAATCTTTTCAACCTGGACCGTTTTCGCTTTGAGAAAAGGAATAAGATTGAGGAAGCGCCCGAAGCAACCCC  74

Query   75  TCAACCTTCCCAGCCTGGCCCTTCTTCACCAATTTCTCTTAGTGCTGAAGAGGAGAATGCTGAAGGGGAAGTTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCAACCTTCCCAGCCTGGCCCTTCTTCACCAATTTCTCTTAGTGCTGAAGAGGAGAATGCTGAAGGGGAAGTTA  148

Query  149  GCAGGGCAAACACTCCTGATTCAGATATAACTGAAAAAACAGAAGATTCTAGTGTTCCAGAAACTCCAGATAAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAGGGCAAACACTCCTGATTCAGATATAACTGAAAAAACAGAAGATTCTAGTGTTCCAGAAACTCCAGATAAT  222

Query  223  GAAAGAAAAGCAAGTATATCATATTTCAAAAATCAAAGAGGAATACAGTATATTGATTTGTCTTCTGATAGTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAAGAAAAGCAAGTATATCATATTTCAAAAATCAAAGAGGAATACAGTATATTGATTTGTCTTCTGATAGTGA  296

Query  297  AGATGTCGTTTCCCCAAATTGCTCCAATACAGTTCAAGAGAAAACATTCAACAAAGATACAGTGATTATAGTTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGATGTCGTTTCCCCAAATTGCTCCAATACAGTTCAAGAGAAAACATTCAACAAAGATACAGTGATTATAGTTT  370

Query  371  CTGAGCCATCTGAAGATGAAGAGTCCCAAGGCCTTCCTACCATGGCACGTAGAAATGATGATATTTCAGAACTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGAGCCATCTGAAGATGAAGAGTCCCAAGGCCTTCCTACCATGGCACGTAGAAATGATGATATTTCAGAACTG  444

Query  445  GAAGACCTTTCGGAATTGGAAGACCTTAAAGATGCTAAACTTCAGACTTTGAAGGAACTTTTTCCACAAAGAAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAGACCTTTCGGAATTGGAAGACCTTAAAGATGCTAAACTTCAGACTTTGAAGGAACTTTTTCCACAAAGAAG  518

Query  519  TGACAATGATTTACTTAAGTTGATTGAATCAACAAGCACTATGGATGGAGCAATTGCTGCTGCCTTGCTGATGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGACAATGATTTACTTAAGTTGATTGAATCAACAAGCACTATGGATGGAGCAATTGCTGCTGCCTTGCTGATGT  592

Query  593  TTGGTGATGCAGGTGGTGGGCCCAGGAAAAGAAAATTATCTTCTTCTTCAGAGCCATATGAGGAAGATGAATTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGGTGATGCAGGTGGTGGGCCCAGGAAAAGAAAATTATCTTCTTCTTCAGAGCCATATGAGGAAGATGAATTT  666

Query  667  AATGATGATCAATCTATAAAAAAGACAAGACTGGATCATGGAGAGGAATCAAATGAGTCTGCAGAATCTAGCAA  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  667  AATGATGATCAATCTATAAAAAAGACAAGACTGGATCATGGAGAGGAATCAAATGAGTCTGCAGAATCTAGCAG  740

Query  741  TAATTGGGAAAAGCAGGAAAGTATTGTACTGAAATTGCAAAAGGAATTTCCCAATTTTGATAAACAGGAACTTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAATTGGGAAAAGCAGGAAAGTATTGTACTGAAATTGCAAAAGGAATTTCCCAATTTTGATAAACAGGAACTTA  814

Query  815  GAGAAGTACTCAAGGAACATGAATGGATGTACACAGAAGCTTTAGAATCTCTAAAAGTGTTTGCAGAAGACCAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGAAGTACTCAAGGAACATGAATGGATGTACACAGAAGCTTTAGAATCTCTAAAAGTGTTTGCAGAAGACCAA  888

Query  889  GATATGCAATATGCATCACAAAGTGAGGTTCCAAATGGAAAAGAAGTTTCTTCAAGAAGTCAAAATTACCCTAA  962
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATATGCAATATGTATCACAAAGTGAGGTTCCAAATGGAAAAGAAGTTTCTTCAAGAAGTCAAAATTACCCTAA  962

Query  963  AAATGCAACTAAAACAAAACTAAAACAGAAATTTTCAATGAAAGCACAAAATGGCTTTAACAAGAAACGTAAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAATGCAACTAAAACAAAACTAAAACAGAAATTTTCAATGAAAGCACAAAATGGCTTTAACAAGAAACGTAAAA  1036

Query 1037  AAAATGTTTTTAATCAAAAGAGAGTTGTTGAAGACTCTGAATATGATTCAGGTTCTGATGTCGGTAGTTCACTA  1110
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAAATGTTTTTAATCCAAAGAGAGTTGTTGAAGACTCTGAATATGATTCAGGTTCTGATGTCGGTAGTTCACTA  1110

Query 1111  GATGAGGACTATAGTAGTGGTGAAGAAGTGATGGAGGATGGCTATAAAGGTAAAATTCTTCACTTCCTTCAAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GATGAGGACTATAGTAGTGGTGAAGAAGTGATGGAGGATGGCTATAAAGGTAAAATTCTTCACTTCCTTCAAGA  1184

Query 1185  TGCTTCAATTGGTGAACTTACTTTGATTCCTCAGTGTTCTCAGAAAAAGGCTCAGAAGATAACAGAACTCCGGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCTTCAATTGGTGAACTTACTTTGATTCCTCAGTGTTCTCAGAAAAAGGCTCAGAAGATAACAGAACTCCGGC  1258

Query 1259  CCTTTAATAGTTGGGAGGCTCTGTTCACAAAGATGTCCAAAACTAATGGCTTATCAGAAGATTTGATATGGCAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCTTTAATAGTTGGGAGGCTCTGTTCACAAAGATGTCCAAAACTAATGGCTTATCAGAAGATTTGATATGGCAC  1332

Query 1333  TGTAAAACACTGATCCAAGAAAGAGATGTAGTTATAAGGCTTATGAACAAATGTGAAGACATTTCAAATAAATT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TGTAAAACACTGATCCAAGAAAGAGATGTAGTTATAAGGCTTATGAACAAATGTGAAGACATTTCAAATAAATT  1406

Query 1407  GACCAAACAAGTTACCATGCTTACTGGAAATGGAGGTGGATGGAACATAGAACAACCTTCCATTCTAAACCAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1407  GACCAAACAAGTTACCATGCTTACTGGAAATGGAGGTGGATGGAACATAGAACAACCTTCCATTCTAAACCAAA  1480

Query 1481  GTTTGTCACTCAAGCCCTATCAGAAGGTTGGTTTGAATTGGCTGGCATTGGTACATAAACATGGACTTAATGGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTTTGTCACTCAAGCCCTATCAGAAGGTTGGTTTGAATTGGCTGGCATTGGTACATAAACATGGACTTAATGGC  1554

Query 1555  ATTTTGGCAGATGAAATGGGCCTAGGAAAAACTATTCAAGCCATTGCATTTCTGGCATACCTCTATCAGGAGGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATTTTGGCAGATGAAATGGGCCTAGGAAAAACTATTCAAGCCATTGCATTTCTGGCATACCTCTATCAGGAGGG  1628

Query 1629  TAATAATGGTCCTCATTTGATCGTTGTTCCAGCTTCAACTATAGATAACTGGTTAAGGGAAGTTAATTTATGGT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TAATAATGGTCCTCATTTGATCGTTGTTCCAGCTTCAACTATAGATAACTGGTTAAGGGAAGTTAATTTATGGT  1702

Query 1703  GCCCTACTTTGAAGGTCCTCTGTTACTATGGTTCTCAAGAAGAACGTAAACAAATTAGATTTAACATTCATAGT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCCCTACTTTGAAGGTCCTCTGTTACTATGGTTCTCAAGAAGAACGTAAACAAATTAGATTTAACATTCATAGT  1776

Query 1777  AGATATGAAGATTACAATGTAATTGTGACCACATATAACTGTGCGATCAGCAGTTCTGATGATCGTAGTCTGTT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1777  AGATATGAAGATTACAATGTAATTGTGACCACATATAACTGTGCGATCAGCAGTTCTGATGACCGTAGTCTGTT  1850

Query 1851  TCGACGGCTGAAACTTAATTACGCAATTTTTGATGAGGGCCATATGCTGAAGAATATGGGCTCCATTCGCTACC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TCGACGGCTGAAACTTAATTACGCAATTTTTGATGAGGGCCATATGCTGAAGAATATGGGCTCCATTCGCTACC  1924

Query 1925  AGCACCTTATGACAATTAATGCAAATAACCGTTTGCTGCTCACAGGCACACCTGTACAGAACAATCTGTTAGAA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGCACCTTATGACAATTAATGCAAATAACCGTTTGCTGCTCACAGGCACACCTGTACAGAACAATCTGTTAGAA  1998

Query 1999  CTCATGTCGCTGTTGAATTTTGTTATGCCACACATGTTTAGTAGTAGCACCAGTGAAATACGAAGAATGTTTTC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTCATGTCGCTGTTGAATTTTGTTATGCCACACATGTTTAGTAGTAGCACCAGTGAAATACGAAGAATGTTTTC  2072

Query 2073  CTCTAAGACAAAATCAGCAGATGAGCAAAGCATATATGAAAAGGAGAGAATAGCACATGCAAAACAAATTATAA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CTCTAAGACAAAATCAGCAGATGAGCAAAGCATATATGAAAAGGAGAGAATAGCACATGCAAAACAAATTATAA  2146

Query 2147  AGCCATTTATTCTCAGAAGAGTAAAAGAAGAGGTTCTCAAGCAGTTACCCCCCAAGAAAGATCGAATTGAGTTG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGCCATTTATTCTCAGAAGAGTAAAAGAAGAGGTTCTCAAGCAGTTACCCCCCAAGAAAGATCGAATTGAGTTG  2220

Query 2221  TGTGCAATGTCGGAGAAGCAGGAGCAACTCTATTTGGGTCTTTTCAACAGATTGAAAAAATCTATCAATAACTT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TGTGCAATGTCGGAGAAGCAGGAGCAACTCTATTTGGGTCTTTTCAACAGATTGAAAAAATCTATCAATAACTT  2294

Query 2295  GGTCACAGAAAAAAACACAGAAATGTGCAATGTCATGATGCAGTTGAGGAAAATGGCCAATCATCCTTTATTAC  2368
            |      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  G------GAAAAAAACACAGAAATGTGCAATGTCATGATGCAGTTGAGGAAAATGGCCAATCATCCTTTATTAC  2362

Query 2369  ATCGCCAATATTACACAGCTGAAAAACTCAAGGAAATGTCTCAGCTTATGCTAAAGGAACCTACACATTGTGAG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2363  ATCGCCAATATTACACAGCTGAAAAACTCAAGGAAATGTCTCAGCTTATGCTAAAGGAACCTACACATTGTGAG  2436

Query 2443  GCTAACCCTGACCTGATCTTTGAAGATATGGAAGTTATGACAGACTTCGAACTACATGTACTTTGTAAACAGTA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2437  GCTAACCCTGACCTGATCTTTGAAGATATGGAAGTTATGACAGACTTCGAACTACATGTACTTTGTAAACAGTA  2510

Query 2517  CCGACACATTAATAACTTTCAGTTAGACATGGACTTGATTTTAGATTCTGGAAAATTTCGAGTTTTAGGATGCA  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2511  CCGACACATTAATAACTTTCAGTTAGACATGGACTTGATTTTAGATTCTGGAAAATTTCGAGTTTTAGGATGCA  2584

Query 2591  TCTTGTCTGAATTGAAACAGAAGGGTGATAGAGTTGTGTTATTTAGCCAATTTACCATGATGCTGGATATCTTA  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2585  TCTTGTCTGAATTGAAACAGAAGGGTGATAGAGTTGTGTTATTTAGCCAATTTACCATGATGCTGGATATCTTA  2658

Query 2665  GAGGTTCTATTAAAACATCATCAGCATAGGTACCTCAGATTAGATGGAAAGACTCAGATTTCTGAAAGGATTCA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2659  GAGGTTCTATTAAAACATCATCAGCATAGGTACCTCAGATTAGATGGAAAGACTCAGATTTCTGAAAGGATTCA  2732

Query 2739  TCTAATTGATGAGTTTAATACCGATATGGATATCTTTGTGTTTCTGCTATCAACAAAAGCTGGTGGATTAGGAA  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2733  TCTAATTGATGAGTTTAATACCGATATGGATATCTTTGTGTTTCTGCTATCAACAAAAGCTGGTGGATTAGGAA  2806

Query 2813  TAAATCTGACTTCAGCAAATGTTGTTATACTTCACGATATTGACTGTAATCCTTATAATGACAAACAAGCAGAA  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2807  TAAATCTGACTTCAGCAAATGTTGTTATACTTCACGATATTGACTGTAATCCTTATAATGACAAACAAGCAGAA  2880

Query 2887  GATAGATGCCATAGAGTAGGCCAGACTAAAGAAGCACTAGTTATAAAACTAATAAGCCAAGGGACGATTGAAGA  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2881  GATAGATGCCATAGAGTAGGCCAGACTAAAGAAGTACTAGTTATAAAACTAATAAGCCAAGGGACGATTGAAGA  2954

Query 2961  ATCCATGCTAAAAATTAACCAACAGAAATTGAAACTAGAACAGGATATGACTACAGTAGATGAAGGTGATGAAG  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2955  ATCCATGCTAAAAATTAACCAACAGAAATTGAAACTAGAACAGGATATGACTACAGTAGATGAAGGTGATGAAG  3028

Query 3035  GGAGTATGCCAGCAGATATAGCCACATTACTAAAAACATCAATGGGCCTG  3084
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3029  GGAGTATGCCAGCAGATATAGCCACATTACTAAAAACATCAATGGGCCTG  3078