Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000475266
- Subject:
- XM_005248014.5
- Aligned Length:
- 2103
- Identities:
- 1560
- Gaps:
- 540
Alignment
Query 1 ATGAGTG---------------CAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCAC 59
|||.|.| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGGTGCCAGGGGGAGACACAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCAC 74
Query 60 GGCGATCCTGTGCAACACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACA 133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGCGATCCTGTGCAACACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACA 148
Query 134 TCAAGTGCTTCGTCTGTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTAC 207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCAAGTGCTTCGTCTGTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTAC 222
Query 208 ATCTGCACGCTGGACTACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGT 281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATCTGCACGCTGGACTACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGT 296
Query 282 GGTGTCGGCGCTGGGCAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCG 355
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGTGTCGGCGCTGGGCAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCG 370
Query 356 GGGACCGAGTGACCTTCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGC 429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGGACCGAGTGACCTTCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGC 444
Query 430 GCGCACCTGTCCCAGGGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGC 503
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCGCACCTGTCCCAGGGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGC 518
Query 504 CTTGGACAAGCACTGGCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCA 577
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTTGGACAAGCACTGGCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCA 592
Query 578 GCAAGGATGGGCTGCCCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAA 651
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCAAGGATGGGCTGCCCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAA 666
Query 652 TACATCACGGGGCGCGTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGG 725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TACATCACGGGGCGCGTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGG 740
Query 726 CCAGATGTTTGCAGAAGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAG 799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCAGATGTTTGCAGAAGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAG 814
Query 800 CCAGAACTGAAGACAGAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACC 873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCAGAACTGAAGACAGAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACC 888
Query 874 TCAGGGTCTCCGAGCCGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCT 947
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCAGGGTCTCCGAGCCGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCT 962
Query 948 TCCTAAAAGTAAGGCCATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTG 1021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TCCTAAAAGTAAGGCCATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTG 1036
Query 1022 CAGGGGACAGGCAGAGCTACGG---------------------------------CGAGGGGGATCAGGATGAC 1062
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGGGGACAGGCAGAGCTACGGCGAGTCCCCTCAGTTGCTCTCGCCAACGCCGACCGAGGGGGATCAGGATGAC 1110
Query 1063 CGGTCCTACAAGCAGTGCCGGACCTCCAGCCCAAGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGAC 1136
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CGGTCCTACAAGCAGTGTCGGACCTCCAGCCCAAGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGAC 1184
Query 1137 CTCACGGTCACCACAGCACTACAGCCGTC--------------------------------------------- 1165
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTCACGGTCACCACAGCACTACAGCCGTCCAGCTGGTACTGTGAGTGTGGGTACCAGTAGCTGCCTCTCCCTGT 1258
Query 1166 -------------------------------------------------------------------------- 1165
Sbjct 1259 CCCAACACCCAAGCCCTACATCCGTGTTCAGACATCATTACATCCCCTACTTCCGAGGCAGTGAAAGTGGCCGG 1332
Query 1166 -------------------------------------------------------------------------- 1165
Sbjct 1333 AGCACCCCCAGCCTCTCCGTGCTCTCTGACAGCAAGCCGCCCCCCTCCACCTACCAGCAGGCACCTCGCCACTT 1406
Query 1166 -------------------------------------------------------------------------- 1165
Sbjct 1407 CCACGTCCCAGACACTGGCGTAAAAGATAACATCTATAGGAAACCCCCTATCTACAGACAGCATGGTCCTGTAG 1480
Query 1166 -------------------------------------------------------------------------- 1165
Sbjct 1481 CCCAATCCCAAATTTCCAAGCTCTCTGGCCTGGTATCAGTCTTGTCCTTGGTGGTGCAGGAGGCAGGGTACGGC 1554
Query 1166 ----------------------------------CAGCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGATGGAAGCTTGGA 1205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AAAAGACAGACGGGCCCGAGCCCGCCGCCCGCTGCAGCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGATGGAAGCTTGGA 1628
Query 1206 CCAGGATAACAGGAAGCAGAAGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGACCAATTCTCCAG 1279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CCAGGATAACAGGAAGCAGAAGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGACCAATTCTCCAG 1702
Query 1280 ACCTGGACACCCAGTCCTTGTCCCACAGCAGCGGGACCGACAGAGACCCTCTCCAAAGGATGGCAGGGGACAGC 1353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACCTGGACACCCAGTCCTTGTCCCACAGCAGCGGGACCGACAGAGACCCTCTCCAAAGGATGGCAGGGGACAGC 1776
Query 1354 TTTCACTCAC---------------------------------------------------------------- 1363
||||||||||
Sbjct 1777 TTTCACTCACGATTCCCCTATTCCAAATCTGACCCTCTCCCAGGACATGGAAAGAATGGCTTGGACCAGCGGAA 1850
Query 1364 -----------------------------------------------------AATACAAGATCTATCCGTATG 1384
|||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TGCCAATCTGGCCCCCTGTGGAGCAGACCCGGATGCCAGCTGGGGCATGCGAGAATACAAGATCTATCCGTATG 1924
Query 1385 ACTCCCTCATCGTCACAAACCGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACGAGACTGGAGAGACAC 1458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ACTCCCTCATCGTCACAAACCGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACGAGACTGGAGAGACAC 1998
Query 1459 TTGTCGCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCTGGCCCTCTGGAAGAG 1532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TTGTCGCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCTGGCCCTCTGGAAGAG 2072
Query 1533 GAATGACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTTGTTC 1563
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GAATGACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTTGTTC 2103