Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475266
• Subject: XM_005248031.4
• Aligned Length: 1611
• Identities: 1366
• Gaps: 234

Alignment

Query    1  ATGAGTG---------------CAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCAC  59
            |||.|.|               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGGTGCCAGGGGGAGACACAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCAC  74

Query   60  GGCGATCCTGTGCAACACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACA  133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCGATCCTGTGCAACACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACA  148

Query  134  TCAAGTGCTTCGTCTGTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTAC  207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAAGTGCTTCGTCTGTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTAC  222

Query  208  ATCTGCACGCTGGACTACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGT  281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATCTGCACGCTGGACTACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGT  296

Query  282  GGTGTCGGCGCTGGGCAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCG  355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTGTCGGCGCTGGGCAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCG  370

Query  356  GGGACCGAGTGACCTTCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGC  429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGACCGAGTGACCTTCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGC  444

Query  430  GCGCACCTGTCCCAGGGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGC  503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCGCACCTGTCCCAGGGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGC  518

Query  504  CTTGGACAAGCACTGGCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCA  577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTGGACAAGCACTGGCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCA  592

Query  578  GCAAGGATGGGCTGCCCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAA  651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCAAGGATGGGCTGCCCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAA  666

Query  652  TACATCACGGGGCGCGTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGG  725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TACATCACGGGGCGCGTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGG  740

Query  726  CCAGATGTTTGCAGAAGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAG  799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCAGATGTTTGCAGAAGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAG  814

Query  800  CCAGAACTGAAGACAGAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACC  873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCAGAACTGAAGACAGAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACC  888

Query  874  TCAGGGTCTCCGAGCCGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCT  947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCAGGGTCTCCGAGCCGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCT  962

Query  948  TCCTAAAAGTAAGGCCATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTG  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCCTAAAAGTAAGGCCATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTG  1036

Query 1022  CAGGGGACAGGCAGAGCTACGG---------------------------------CGAGGGGGATCAGGATGAC  1062
            ||||||||||||||||||||||                                 |||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGGGGACAGGCAGAGCTACGGCGAGTCCCCTCAGTTGCTCTCGCCAACGCCGACCGAGGGGGATCAGGATGAC  1110

Query 1063  CGGTCCTACAAGCAGTGCCGGACCTCCAGCCCAAGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGAC  1136
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGGTCCTACAAGCAGTGTCGGACCTCCAGCCCAAGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGAC  1184

Query 1137  CTCACGGTCACCACAGCACTACAGCCGTCCAGCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGATGGAAGCTTGGACCAGG  1210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTCACGGTCACCACAGCACTACAGCCGTCCAGCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGATGGAAGCTTGGACCAGG  1258

Query 1211  ATAACAGGAAGCAGAAGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGACCAATTCTCCAGACCTG  1284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATAACAGGAAGCAGAAGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGACCAATTCTCCAGACCTG  1332

Query 1285  GACACCCAGTCCTTGTCCCACAGCAGCGGGACCGACAGAGACCCTCTCCAAAGGATGGCAGGGGACAGCTTTCA  1358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GACACCCAGTCCTTGTCCCACAGCAGCGGGACCGACAGAGACCCTCTCCAAAGGATGGCAGGGGACAGCTTTCA  1406

Query 1359  CTCACAATACAAGATCTATCCGTATGACTCCCTCATCGTCACAAACCGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACG  1432
            |||||...|...|.|||.|                                                       
Sbjct 1407  CTCACGTGAGTGGTTCTTT-------------------------------------------------------  1425

Query 1433  TGGACCGGACGAGACTGGAGAGACACTTGTCGCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAG  1506
                                                                                      
Sbjct 1426  --------------------------------------------------------------------------  1425

Query 1507  TTTGACCGCCTGGCCCTCTGGAAGAGGAATGACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTTGTTC  1563
                                                                     
Sbjct 1426  ---------------------------------------------------------  1425