Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000475266
- Subject:
- XM_006503913.1
- Aligned Length:
- 1975
- Identities:
- 1360
- Gaps:
- 416
Alignment
Query 1 ATGAGTGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCACGGCGATCCTGTGCAA 74
|||||.|||||||||||||||||||||||||....|||.|||||||||.||.|||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1 ATGAGCGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCATGCCCCACTGGAGAAGCCGGCCAGCACTGCGATCCTGTGTAA 74
Query 75 CACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACATCAAGTGCTTCGTCT 148
.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||||.||||||.||.|
Sbjct 75 TACCTGTGGGAATGTGTGCAAGGGAGAGGTGCTGCGTGTGCAGAACAAGTACTTCCACATCAGGTGCTTTGTGT 148
Query 149 GTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTACATCTGCACGCTGGAC 222
|.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.|||.||||.|||||.|..|||
Sbjct 149 GCAAAGCGTGTGGCTGTGACCTGGCTGAGGGTGGCTTCTTCGTGAGGCAGGGTGAGCACATTTGCACACGTGAC 222
Query 223 TACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGTGGTGTCGGCGCTGGG 296
||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||.||||..||||||||.||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 223 TACCAGCGGCTCTATGGCACTCGCTGCTTCAGCTGTGACCGCTTCATTGAAGGCGAAGTGGTGTCGGCGCTTGG 296
Query 297 CAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCGGGGACCGAGTGACCT 370
.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 297 GAAGACCTACCACCCTGACTGCTTCGTGTGTGCTGTCTGCAGGCTGCCCTTTCCTCCTGGGGACCGTGTGACCT 370
Query 371 TCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGCGCGCACCTGTCCCAG 444
|||||||||||||.||.|||||||||||||||||||..|||..||.|.||||||.|||.||.|||.||.|||||
Sbjct 371 TCAACGGGAAGGAGTGTATGTGCCAGAAGTGTTCCCCACCCACATTGCTGGGCAACAGTGCTCACGTGGCCCAG 444
Query 445 GGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGCCTTGGACAAGCACTG 518
||||||||.||||||||||||||.|||..|||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 445 GGCCTCCGGAGTTGTGGGGGCTGTGGCTTAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTGGCTTTGGACAAGCACTG 518
Query 519 GCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCAGCAAGGATGGGCTGC 592
||||.||||.||.||.||||||||||..||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 GCACCTGGGATGCTTCAAGTGCAAGACTTGTGGGAAACTCCTCAATGCAGAGTACATCAGCAAGGACGGGCTGC 592
Query 593 CCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAATACATCACGGGGCGC 666
||||||||||.|||||.||||||..||||||.|||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 593 CCTACTGCGAGGCTGATTATCACAGCAAGTTTGGCATCCGCTGCGACGGCTGTGAGAAGTACATCACGGGCCGG 666
Query 667 GTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGGCCAGATGTTTGCAGA 740
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 667 GTGCTAGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCATGTGCGCTATGCGTCAGGTGCGGCCAGATGTTCTCAGA 740
Query 741 AGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAGCCAGAACTGAAGACA 814
.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 741 GGGCGAGGAGATGTACCTGCAAGGCTCCTCCATCTGGCATCCGGCATGTCGACAGGCAGCCAGGACTGAAGACA 814
Query 815 GAAACA---------------------------------------------------------AGGAAACCAGA 831
..|.|| ||||||||||.
Sbjct 815 AGAGCAAGATGCACAGCTCTGTTTGCAGCCAGCCCTGCCCGGGCACCCTGCCCTGTGCCTTACAGGAAACCAGG 888
Query 832 ACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACCTCAGGGTCTCCGAGCCGTGTGATTTATGCCAA 905
|||||.||.||||||||..|.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 889 ACTTCTTCGGAGAGCATTGTCTCCGTGCCTGCCTCCAGCACGTCAGGGTCCCCGAGCCGTGTGATCTACGCAAA 962
Query 906 GCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCTTCCTAAAAGTAAGGCCATCTATGACATCGACC 979
||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||..||.||.|||||..|||||||||
Sbjct 963 GCTTGGCGATGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCTGCTCTTCCCAAAAACAAAGCGATCTACAACATCGACC 1036
Query 980 GCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTGC---AGGGGACAGGCAGAGCTACGGC------ 1044
|||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|| .|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1037 GCCCCGACATGATCTCCTATTCGCCCTACATTAGCCACTCGGCCGTGGGGGACAGGCAGAGCTATGGCGAGTCA 1110
Query 1045 ---------------------------GAGGGGGATCAGGATGACCGGTCCTACAAGCAGTGCCGGACCTCCAG 1091
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1111 CCTCAGTTGCTCTCACCAACGCCGACTGAGGGGGATCAGGATGATCGGTCCTACAAGCAGTGCAGGACCTCCAG 1184
Query 1092 CCCAAGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGACCTCACGGTCACCACAGCACTACAGCCGT- 1164
|||.|||||..|.||.||.||.||||||||.|.||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1185 CCCCAGCTCTGCCGGCTCAGTCAGCCTCGGACACTACACCCCAACCTCACGGTCACCCCAGCACTACAGTCGTC 1258
Query 1165 -------------------------------------------------------------------------- 1164
Sbjct 1259 CAGCTGGTACTGTGAGTGTTGGTACCAGTAGCTGTCTGTCCCTGTCCCAACACCCAAGCCCTACATCCGTGTTC 1332
Query 1165 -------------------------------------------------------------------------- 1164
Sbjct 1333 AGACATCATTACATCCCCTACTTCCGAGGCAGCGAAAGTGGCCGTAGCACCCCGAGTCTCTCAGTGCACTCCGA 1406
Query 1165 ----------------------------------------------------CCAGCTGCCAGGCGATCGGATG 1186
||||||||||||||||.|||.|
Sbjct 1407 CAGCAGACCTCCTTCCTCTACCTACCAGCAGGCTCCGAGACACTTCCACGTCCCAGCTGCCAGGCGATTGGACG 1480
Query 1187 GGGAGGATGGAAGCTTGGACCAGGATAACAGGAAGCAGAAGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGAC 1260
.||||||..|.|||||.||||||||.|.||||| ||||||..|.|||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGGAGGACAGCAGCTTTGACCAGGACAGCAGGA---AGAAGACAACCTGGCTGCTTCTCAAGGGGGATGCAGAC 1551
Query 1261 ACAAGGACCAATTCTCCAGACCTGGACACCCAGTCCTTGTCCCACAGCAGCGGGACCGA-CAGAGACCCTCTCC 1333
||.||.||.||.||||||||||||||||..|||||..||||||.||||||||||||.|| ||| ||.|||||||
Sbjct 1552 ACCAGAACTAACTCTCCAGACCTGGACAGTCAGTCGCTGTCCCTCAGCAGCGGGACTGACCAG-GAACCTCTCC 1624
Query 1334 AAAGGATGGCAGGGGACAGCTTTCACTCAC-------------------------------------------- 1363
||||.|||||||||||||||.|..||||||
Sbjct 1625 AAAGAATGGCAGGGGACAGCCTCTACTCACGCTTTCCTTATTCCAAACCTGACACTCTTCCAGGACCCAGGAAG 1698
Query 1364 -------------------------------------------------------------------------A 1364
|
Sbjct 1699 GATGGCCTGGACCTCCGGAATGCCAACCTGGCCCCTTGTGGAGCAGACCCGGATGCCAGCTGGGGCACGCGAGA 1772
Query 1365 ATACAAGATCTATCCGTATGACTCCCTCATCGTCACAAACCGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACC 1438
.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773 GTATAAGATATATCCCTATGATTCCCTCATCGTAACAAACCGAATTCGTGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACC 1846
Query 1439 GGACGAGACTGGAGAGACACTTGTCGCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGAC 1512
||||..|.||||||||||||.|.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847 GGACACGGCTGGAGAGACACCTATCACCTGAGGAGTTCCAAGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGAC 1920
Query 1513 CGCCTGGCCCTCTGGAAGAGGAATGACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTTGTTC 1563
|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|..|||||
Sbjct 1921 CGCCTGGCCCTGTGGAAGAGGAATGACCTCAAGAAGAAAGCCTTGCTGTTC 1971