Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000475266
• Subject: XM_006503923.1
• Aligned Length: 1600
• Identities: 1360
• Gaps: 41

Alignment

Query    1  ATGAGTGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCACGGCGATCCTGTGCAA  74
            |||||.|||||||||||||||||||||||||....|||.|||||||||.||.|||||||.|||||||||||.||
Sbjct    1  ATGAGCGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCATGCCCCACTGGAGAAGCCGGCCAGCACTGCGATCCTGTGTAA  74

Query   75  CACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACATCAAGTGCTTCGTCT  148
            .||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||||.||||||.||.|
Sbjct   75  TACCTGTGGGAATGTGTGCAAGGGAGAGGTGCTGCGTGTGCAGAACAAGTACTTCCACATCAGGTGCTTTGTGT  148

Query  149  GTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTACATCTGCACGCTGGAC  222
            |.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.|||.||||.|||||.|..|||
Sbjct  149  GCAAAGCGTGTGGCTGTGACCTGGCTGAGGGTGGCTTCTTCGTGAGGCAGGGTGAGCACATTTGCACACGTGAC  222

Query  223  TACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGTGGTGTCGGCGCTGGG  296
            ||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||.||||..||||||||.||.||.||||||||||||||.||
Sbjct  223  TACCAGCGGCTCTATGGCACTCGCTGCTTCAGCTGTGACCGCTTCATTGAAGGCGAAGTGGTGTCGGCGCTTGG  296

Query  297  CAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCGGGGACCGAGTGACCT  370
            .||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  297  GAAGACCTACCACCCTGACTGCTTCGTGTGTGCTGTCTGCAGGCTGCCCTTTCCTCCTGGGGACCGTGTGACCT  370

Query  371  TCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGCGCGCACCTGTCCCAG  444
            |||||||||||||.||.|||||||||||||||||||..|||..||.|.||||||.|||.||.|||.||.|||||
Sbjct  371  TCAACGGGAAGGAGTGTATGTGCCAGAAGTGTTCCCCACCCACATTGCTGGGCAACAGTGCTCACGTGGCCCAG  444

Query  445  GGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGCCTTGGACAAGCACTG  518
            ||||||||.||||||||||||||.|||..|||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  445  GGCCTCCGGAGTTGTGGGGGCTGTGGCTTAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTGGCTTTGGACAAGCACTG  518

Query  519  GCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCAGCAAGGATGGGCTGC  592
            ||||.||||.||.||.||||||||||..||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  GCACCTGGGATGCTTCAAGTGCAAGACTTGTGGGAAACTCCTCAATGCAGAGTACATCAGCAAGGACGGGCTGC  592

Query  593  CCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAATACATCACGGGGCGC  666
            ||||||||||.|||||.||||||..||||||.|||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct  593  CCTACTGCGAGGCTGATTATCACAGCAAGTTTGGCATCCGCTGCGACGGCTGTGAGAAGTACATCACGGGCCGG  666

Query  667  GTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGGCCAGATGTTTGCAGA  740
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||
Sbjct  667  GTGCTAGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCATGTGCGCTATGCGTCAGGTGCGGCCAGATGTTCTCAGA  740

Query  741  AGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAGCCAGAACTGAAGACA  814
            .|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  741  GGGCGAGGAGATGTACCTGCAAGGCTCCTCCATCTGGCATCCGGCATGTCGACAGGCAGCCAGGACTGAAGACA  814

Query  815  GAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACCTCAGGGTCTCCGAGC  888
            ..|.||||||||||||.|||||.||.||||||||..|.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  815  AGAGCAAGGAAACCAGGACTTCTTCGGAGAGCATTGTCTCCGTGCCTGCCTCCAGCACGTCAGGGTCCCCGAGC  888

Query  889  CGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCTTCCTAAAAGTAAGGC  962
            ||||||||.||.||.||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||..||.||
Sbjct  889  CGTGTGATCTACGCAAAGCTTGGCGATGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCTGCTCTTCCCAAAAACAAAGC  962

Query  963  CATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTGC---AGGGGACAGGC  1033
            .|||||..||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||   .||||||||||
Sbjct  963  GATCTACAACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTATTCGCCCTACATTAGCCACTCGGCCGTGGGGGACAGGC  1036

Query 1034  AGAGCTACGGC---------------------------------GAGGGGGATCAGGATGACCGGTCCTACAAG  1074
            |||||||.|||                                 |||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1037  AGAGCTATGGCGAGTCACCTCAGTTGCTCTCACCAACGCCGACTGAGGGGGATCAGGATGATCGGTCCTACAAG  1110

Query 1075  CAGTGCCGGACCTCCAGCCCAAGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGACCTCACGGTCACC  1148
            ||||||.|||||||||||||.|||||..|.||.||.||.||||||||.|.||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGTGCAGGACCTCCAGCCCCAGCTCTGCCGGCTCAGTCAGCCTCGGACACTACACCCCAACCTCACGGTCACC  1184

Query 1149  ACAGCACTACAGCCGTCCAGCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGATGGAAGCTTGGACCAGGATAACAGGAAGC  1222
            .|||||||||||.|||||||||||||||||||.|||.|.||||||..|.|||||.||||||||.|.|||||   
Sbjct 1185  CCAGCACTACAGTCGTCCAGCTGCCAGGCGATTGGACGTGGAGGACAGCAGCTTTGACCAGGACAGCAGGA---  1255

Query 1223  AGAAGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGACCAATTCTCCAGACCTGGACACCCAGTCC  1296
            ||||||..|.|||||||.|.||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||..|||||.
Sbjct 1256  AGAAGACAACCTGGCTGCTTCTCAAGGGGGATGCAGACACCAGAACTAACTCTCCAGACCTGGACAGTCAGTCG  1329

Query 1297  TTGTCCCACAGCAGCGGGACCGA-CAGAGACCCTCTCCAAAGGATGGCAGGGGACAGCTTTCACTCACAATACA  1369
            .||||||.||||||||||||.|| ||| ||.|||||||||||.|||||||||||||||.|..|||||||.||.|
Sbjct 1330  CTGTCCCTCAGCAGCGGGACTGACCAG-GAACCTCTCCAAAGAATGGCAGGGGACAGCCTCTACTCACAGTATA  1402

Query 1370  AGATCTATCCGTATGACTCCCTCATCGTCACAAACCGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACG  1443
            ||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1403  AGATATATCCCTATGATTCCCTCATCGTAACAAACCGAATTCGTGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACA  1476

Query 1444  AGACTGGAGAGACACTTGTCGCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCT  1517
            .|.||||||||||||.|.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477  CGGCTGGAGAGACACCTATCACCTGAGGAGTTCCAAGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCT  1550

Query 1518  GGCCCTCTGGAAGAGGAATGACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTTGTTC  1563
            ||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|..|||||
Sbjct 1551  GGCCCTGTGGAAGAGGAATGACCTCAAGAAGAAAGCCTTGCTGTTC  1596